Category:ScientificClassification/LBSC 190522: Difference between revisions

No edit summary
No edit summary
Line 22: Line 22:
! 目  
! 目  
! モデル生物
! モデル生物
! Species
! Species (Structure)
! FA, LCB
! FA, LCB
! References
! References
! Species
! Species (Structure)
! FA, LCB
! FA, LCB
! References
! References
! Species
! Species (Structure)
! FA, LCB
! FA, LCB
! References
! References
! Series
! Major series
|-
|-
|rowspan="3"| 真正細菌 Bacteria
|rowspan="3"| 真正細菌 Bacteria
Line 41: Line 41:
| rowspan="3"| [[File:Bacteria.png]]
| rowspan="3"| [[File:Bacteria.png]]
<!--GalCer-->
<!--GalCer-->
| (&alpha;-GalCer) Bacteroides fragilis
| Bacteroides fragilis (&alpha;-GalCer)
|
| br-h17:0,br-d17:0
| {{PMID|23874157}}
| {{PMID|23874157}}
<!--GlcCer-->
<!--GlcCer-->
Line 59: Line 59:
| 藍色細菌
| 藍色細菌
<!--GalCer-->
<!--GalCer-->
| (&alpha;-GalCer) Bacteroides fragilis {{PMID|23874157}}
|
|
|
|
|
Line 77: Line 77:
| 大腸菌
| 大腸菌
<!--GalCer-->
<!--GalCer-->
| (&beta;-GalCer) Cystobacter fuscus {{DOI|10.1515/znb-1985-1224}}
| Cystobacter fuscus (&beta;-GalCer)
|
| br-h17:0,br-d19:1
|
| {{DOI|10.1515/znb-1985-1224}}
<!--GlcCer-->
<!--GlcCer-->
|
|
Line 85: Line 85:
|
|
<!--GSL-->
<!--GSL-->
|
| Sphingomonas paucimobilis (GlcA &alpha;-Cer)
|
| h14:0, d18:0
|
| {{PMID8288520}}
|
|
|-
|-
Line 102: Line 102:
|
|
<!--GlcCer-->
<!--GlcCer-->
| Giardia lamblia {{PMID|20335568}}
| Giardia lamblia ()
|
| 記述なし
|
| {{PMID|20335568}}
<!--GSL-->
<!--GSL-->
|
|
Line 119: Line 119:
|
|
<!--GlcCer-->
<!--GlcCer-->
| Leishmania amazonensis PMID 8514804; Plasmodium falciparum {{PMID|15153110}}
| Leishmania amazonensis ();Plasmodium falciparum ()
|
| 記述なし;h10:0,h120,d18:0,d20:0
|
| {{PMID|8514804}};{{PMID|15153110}}
<!--GSL-->
<!--GSL-->
|
| Leishmania amazonensis (GaI &beta;l- 3Gal &alpha;1-4Gal &beta;1-4Glc &beta;1-Cer);Plasmodium falciparum (trihexosylceramide);Trypanosoma brucei (GM3, GM1, GD1a, GD1b)
|
| 記述なし;h12:0,h14:0,d18:0,d20:0;記述なし
|
| {{PMID|8514804}};{{PMID|15153110}};{{PMID|15040678}}
|
| Globo;a-series;b-series
|-
|-
| 繊毛虫門 Ciliophora
| 繊毛虫門 Ciliophora
Line 138: Line 138:
|
|
<!--GlcCer-->
<!--GlcCer-->
| Leishmania amazonensis PMID  8514804; Plasmodium falciparum {{PMID|15153110}}
|
|
|
|
|
Line 158: Line 158:
|
|
<!--GlcCer-->
<!--GlcCer-->
| Pseudococcomyxa chodatii {{DOI|10.1016/j.chemphyslip.2009.06.049}}
| Pseudococcomyxa chodatii ()
|
| h16:0,h18:0,t18:0,t18:1
|
| {{DOI|10.1016/j.chemphyslip.2009.06.049}}
<!--GSL-->
<!--GSL-->
|
| Chlorella kessleri (Gal alpha1-4-Gal beta1-4-Glc beta-1Cer)
|
| 記述なし
|
| {{PMID|2211899}}
|
| Globo
|-
|-
| ストレプト植物門 Streptophyta
| ストレプト植物門 Streptophyta
Line 176: Line 176:
|
|
<!--GlcCer-->
<!--GlcCer-->
| Ginkgo biloba {{DOI|10.1007/BF02660230}}; Stenochlaena palustris(leaves) {{DOI|10.1016/S0031-9422(98)00352-5}}
| Ginkgo biloba (); Stenochlaena palustris ()
|
| h16:0,d18:2;h24:0,d18:2
|
| {{DOI|10.1007/BF02660230}};{{DOI|10.1016/S0031-9422(98)00352-5}}
<!--GSL-->
<!--GSL-->
|
|
Line 194: Line 194:
|
|
<!--GlcCer-->
<!--GlcCer-->
| Arabidopsis thaliana {{PMID|17340572}}
| Arabidopsis thaliana
| h24:1,d18:1
| {{PMID|17340572}}
<!--GSL-->
|
|
|
|
<!--GSL-->
|
|
|
|
|
| GIPC
|-
|-
|rowspan="3" colspan="2"| 菌界 Fungi
|rowspan="3" colspan="2"| 菌界 Fungi
Line 214: Line 214:
|
|
<!--GlcCer-->
<!--GlcCer-->
| Mucor hiemalis {{PMID|15155728}}
| Mucor hiemalis ()
|
| h16:0,h18:0,br-d19:2,d20:1
|
| {{PMID|15155728}}
<!--GSL-->
<!--GSL-->
|
| Mucor hiemalis (Gal &beta;1-6Gal &beta;-1Cer)
|
| h24:0,h25:0,h26:0,t18:0
|
| {{PMID|15155728}}
|
| Gala
|-
|-
| 子嚢菌門 Ascomycota  
| 子嚢菌門 Ascomycota  
Line 228: Line 228:
| 酵母、コウジカビ
| 酵母、コウジカビ
<!--GalCer-->
<!--GalCer-->
| Aspergillus oryzae {{PMID|25129050}}
| Aspergillus oryzae ()
|
| h18:0,br-d19:2
|
| {{PMID|25129050}}
<!--GlcCer-->
<!--GlcCer-->
| Aspergillus oryzae {{PMID|25129050}}
| Aspergillus oryzae ()
|
| h18:0,br-d19:2
|
| {{PMID|25129050}}
<!--GSL-->
<!--GSL-->
|
|
Line 250: Line 250:
|
|
<!--GlcCer-->
<!--GlcCer-->
| Cryptococcus neoformans {{PMID|17693597}}
| Cryptococcus neoformans ()
|
| h18:0,br-d19:2
|
| {{PMID|17693597}}
<!--GSL-->
<!--GSL-->
|
|
Line 263: Line 263:
|
|
|
|
| rowspan="2" | カイメン
| カイメン
| rowspan="2" | [[File:porifera.png]]
| [[File:porifera.png]]
<!--GalCer-->
<!--GalCer-->
| (&alpha;-GalCer) Agelas mauritianus {{DOI|10.1016/S0040-4039(00)73889-5}}; <br/> (&beta;-GalCer) Chondropsis sp. {{DOI|10.1351/pac198658030387}}
| Agelas mauritianus (&alpha;-GalCer);Chondropsis sp. (&beta;-GalCer)
|
|h24:0,br-t18:0;h24:0,br-d18:1
|
|{{DOI|10.1016/S0040-4039(00)73889-5}};{{DOI|10.1351/pac198658030387}}
<!--GlcCer-->
<!--GlcCer-->
| Halicona sp. {{DOI|10.1016/S0040-4020(01)89249-8}}
| Halicona sp.
|
| h22:0,t18:1
|
| {{DOI|10.1016/S0040-4020(01)89249-8}}
<!--GSL-->
<!--GSL-->
|Amphimedon viridis (GlcNAc &alpha;1-Cer;GlcNAc &beta;1-Cer)
|h22:0,br-t20:1;h22:0,br-t20:1,br-t19:0
|{{DOI:10.1016/S0040-4020(01)89249-8}}
|
|
|-
| 刺胞動物門 Cnidaria
|
|
|
|
|
|
|-
| クラゲ
| 刺胞動物門 Cnidaria
|
|
<!--GalCer-->
<!--GalCer-->
|
|

Revision as of 07:33, 22 May 2019

The table lists biological species from which sphingolipids were identified. Icons indicate representative species. The icons are used in sphingolipid references together with Synthesis.png for chemical synthesis.

ここに示す分類表にはスフィンゴ脂質が報告された生物が記載されており、アイコンは代表種を表します。スフィンゴ脂質関連の文献にはこれらのアイコンの他、化学合成を表すSynthesis.pngも使われます。

Domain Kingdom Phylum Class Order Model organism Icon Galactosylceramides (GalCer) Glucosylceramides (GlcCer) Glycosphingolipids (GSL)
ドメイン モデル生物 Species (Structure) FA, LCB References Species (Structure) FA, LCB References Species (Structure) FA, LCB References Major series
真正細菌 Bacteria バクテロイデス門 Bacteroidetes 腸内細菌 Bacteria.png Bacteroides fragilis (α-GalCer) br-h17:0,br-d17:0 PubMed
シアノバクテリア門 Cyanobacteria 藍色細菌
プロテオバクテリア門 Proteobacteria 大腸菌 Cystobacter fuscus (β-GalCer) br-h17:0,br-d19:1 DOI Sphingomonas paucimobilis (GlcA α-Cer) h14:0, d18:0 Template:PMID8288520
真核生物 Eukaryota 原生生物界 Protista メタモナーダ門 Metamonada 鞭毛虫 Protista.png Giardia lamblia () 記述なし PubMed
ユーグレノゾア門 Euglenozoa Leishmania amazonensis ();Plasmodium falciparum () 記述なし;h10:0,h120,d18:0,d20:0 PubMed;PubMed Leishmania amazonensis (GaI βl- 3Gal α1-4Gal β1-4Glc β1-Cer);Plasmodium falciparum (trihexosylceramide);Trypanosoma brucei (GM3, GM1, GD1a, GD1b) 記述なし;h12:0,h14:0,d18:0,d20:0;記述なし PubMed;PubMed;PubMed Globo;a-series;b-series
繊毛虫門 Ciliophora 繊毛虫
植物界 Plantae 緑藻植物門 Chlorophyta クロレラ Plantae.png Pseudococcomyxa chodatii () h16:0,h18:0,t18:0,t18:1 DOI Chlorella kessleri (Gal alpha1-4-Gal beta1-4-Glc beta-1Cer) 記述なし PubMed Globo
ストレプト植物門 Streptophyta 緑色植物 Ginkgo biloba (); Stenochlaena palustris () h16:0,d18:2;h24:0,d18:2 DOI;DOI
被子植物門 Angiosperm シロイヌナズナ Arabidopsis thaliana h24:1,d18:1 PubMed
菌界 Fungi 接合菌門 Zygomycota ケカビ、クモノスカビ Fungi.png Mucor hiemalis () h16:0,h18:0,br-d19:2,d20:1 PubMed Mucor hiemalis (Gal β1-6Gal β-1Cer) h24:0,h25:0,h26:0,t18:0 PubMed Gala
子嚢菌門 Ascomycota 酵母、コウジカビ Aspergillus oryzae () h18:0,br-d19:2 PubMed Aspergillus oryzae () h18:0,br-d19:2 PubMed
担子菌門 Basidiomycota キノコ Cryptococcus neoformans () h18:0,br-d19:2 PubMed
動物界 Animalia 海綿動物門 Porifera カイメン Porifera.png Agelas mauritianus (α-GalCer);Chondropsis sp. (β-GalCer) h24:0,br-t18:0;h24:0,br-d18:1 DOI;DOI Halicona sp. h22:0,t18:1 DOI Amphimedon viridis (GlcNAc α1-Cer;GlcNAc β1-Cer) h22:0,br-t20:1;h22:0,br-t20:1,br-t19:0 {{DOI:10.1016/S0040-4020(01)89249-8}}
刺胞動物門 Cnidaria クラゲ (α-GlcCer) Sarcophyton ehrenbergi PubMed;
(β-GlcCer) Metridium senile PubMed
    (旧口動物、冠輪)
(Protostomia, Lophotrochozoa)
扁形動物門 Platyhelminthes 吸虫綱 Trematoda ジストマ Fasciola hepatica/gigantia PubMed Fasciola hepatica/gigantia PubMed; Schistosoma mansoni PubMed Schisto
渦虫綱 Tubellaria プラナリア Platyhelminthes.png Fasciola hepatica/gigantia PubMed Fasciola hepatica/gigantia PubMed; Schistosoma mansoni PubMed Schisto
条虫綱 Cestoda サナダムシ Spirometra erinacei PubMed Fasciola hepatica/gigantia PubMed; Schistosoma mansoni PubMed Spirometo
外肛動物門 Bryozoa Pectinatella magnifica DOI
腕足動物門 Brachiopoda シャミセンガイ Brachiopoda.png Lingula unguis DOI Mollu
環形動物門 Annelida 貧毛綱 Oligochaeta ミミズ Annelida.png Pheretima aspergillum, P. hilgendorfi DOI Pheretima aspergillum, P. hilgendorfi DOI
ヒル綱 Hirudinea ヒル (β-GalCer) Hiruo nipponica DOI Isoneogala, Neogala
多毛綱 Polychaeta サシバゴカイ目 Phyllodocida Tylorrhynchus heterochetus DOI DOI GIPC
ケヤリ目 Sabellida Pseudopotamilla occelata DOI Gala, Lacto, GIPC
軟体動物門 Mollusca 二枚貝綱 Bivalvia 二枚貝 Hyriopsis schlegelii (egg PubMed), (sperm PubMed Hyriopsis schlegelii (egg PubMed), (sperm PubMed Mollu
腹足綱 Gastropoda 巻き貝 Mollusca.png Chlorostoma argyrostoma, C. turbinatum PubMed Neogala
(旧口動物、脱皮)
(Protostomia, Ecdysozoa)
線形動物門 Nematoda クロマドラ綱 Chromadorea 回虫 Nematoda.png Ascaris suum(adult) PubMed PubMed Arthro, GIPC
節足動物門 Arthropoda 昆虫綱 Insecta  ハエ Arthropoda.png Lucilia caesar(larvae) PubMed Arthro
甲殻亜門 軟甲綱 Crustacea Malacostraca エビ、カニ Euphausia superba PubMed, Erimacrus isenbeckii DOI, Macrobrachium nipponense PubMed, Arthro
甲殻亜門 鰓脚綱 Crustacea Branchiopoda カブトエビ、ミジンコ Artemia franciscana PubMed, PubMed Arthro, Fucosyl
多足亜門 ヤスデ綱 Myriapoda Diplopoda Parafontaria laminata, P. armigera PubMed Arthro
(新口動物)
(Deuterostomia)
棘皮動物門 Echinodermata ウミユリ綱 Crinoidea ヒトデ Echinodermata.png Comanthus japonica PubMed
ヒトデ綱 Asteroidea Culcita novaeguineae PubMed Asterias rubens PubMed
Protoreaster nodosus PubMed
Echino
クモヒトデ綱 Ophiuroidea Ophiocoma scolopendrina PubMed Echino
ウニ綱 Echinoidea Anthocidaris crassispina(egg) PubMed, PubMed Echino
ナマコ綱 Holothuroidea Bohadschia argus PubMed Cucumaria echinata DOI Echino
脊索動物門 Chordata ホヤ綱 Ascidiacea ホヤ Ascidia.png Botrillus leachii DOI
軟骨魚綱 Chondrichthyes エイ Chondrichthyes.png Carcharhinus plumbeus (brain) PubMed Squalus acanthias (rectal gland) PubMed
条鰭綱 Actinopterygii 硬骨魚 Actinopterygii.png Cyprinus carpio(brain) PubMed Theragra chalcogramm (brain) PubMed
両生綱 Amphibia カエル Amphibia.png Rana catesbeiana (brain) PubMed Bufo bufo japonicus (skin) PubMed
鳥綱 Aves トリ Aves.png Gallus gallus domesticus (sciatic nerve) PubMed Gallus gallus domesticus (lens) PubMed
哺乳綱 Mammalia 無盲腸目 Eulipotyphla モグラ Mammalia.png Suncus murinus (brain) PubMed
食肉目 Carnivora ネコ、イヌ Canis lupus familiaris (brain) PubMed Canis lupus familiaris (intestine) PubMed
奇蹄目 Perissodactyla ウマ Equus caballus (brain) PubMed Equus caballus (spleen) PubMed
鯨偶蹄目 Cetartiodactyla ウシ、ブタ Bos taurus (brain) PubMed Bos taurus (spleen) PubMed
兎目 Lagomorpha ウサギ Oryctolagus cuniculus (brain) PubMed Oryctolagus cuniculus (rabbit skin fibroblasts) PubMed
齧歯目 Rodentia ラット、マウス Rattus norvegicus (brain) PubMed Mus musculus (erythrocytes) PubMed
霊長目 Primates ヒト Primates.png Homo sapiens (brain) PubMed Homo sapiens (spleen, Gaucher’s disease) PubMed; Homo sapiens (blood) PubMed

This category currently contains no pages or media.