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<noinclude>名前のインデクス {{{1}}} 値（文字列） {{{2}}} ページタイトル (FL/LB/..)</noinclude>
=Biosynthesis of Glycerophospholipid=
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グリセロリン脂質の生合成


<small>Note: words of less than 4 letters are excluded from the index.</small>
{| style="margin:0 0 0 0; text-align:center;"
{| width=100%
|-
|-
|align=left| {{#persist:FLindex/name {{PrevLetter|{{{1}}}}}|go to Index {{PrevLetter|{{{1}}}}}|Index/name|2|{{PrevLetter|{{{1}}}}};FL}}
|
|align=center| [[Index:{{{2}}}|<big>Back to Index</big>]]
|phosphatidyl glycerol phosphate<br/>[[Image:LBGPGP.png]]
|align=right| {{#persist:FLindex/name {{PrevLetter|{{{1}}}}}|go to Index {{NextLetter|{{{1}}}}}|Index/name|2|{{NextLetter|{{{1}}}}};FL}}
|
{|
|{{Map/ReactionRight|H2O|Pi|[http://metabolomics.jp/wiki/Enzyme:3.1.3.27 3.1.3.27]<ref name="3.1.3.27">PGおよびカルジオリピン(CL)の合成酵素はミトコンドリアに局在。真核細胞ではPGとCDP-DGにより合成されるが、細菌では2分子のPGが縮合してできる。</ref>}}
|phosphatidyl glycerol<br/>[[Image:LBGPG.png]]
|}
|-
|
|{{Map/ReactionUp|CMP|GP|[http://metabolomics.jp/wiki/Enzyme:2.7.8.5 2.7.8.5]<ref name="3.1.3.27"/>}}
|style="text-align:center;vertical-align:top;"|{{Map/ReactionDown35|CDP-DG|}}cardiolipin<br/>[[Image:LBGDPG.png]]
|-
| colspan="2"|
{| style="text-align:center; float:right;"
|phosphatidyl inositol<ref>PI は全リン脂質の5-10%を占める。</ref><br/>
[[Image:LBGPI.png]]<br/>PI{{#if:{{#get:R1}}{{#get:R2}}|({{#get:R1}}/{{#get:R2}})}}
|{{Map/ReactionLeft|CMP|Inositol|[http://metabolomics.jp/wiki/Enzyme:2.7.8.11 2.7.8.11]<ref>この酵素は小胞体膜状に存在するとされていたが、形質膜にも類似の酵素が存在する。</ref>}}
|CDP-diacyl glycerol<br/>[[Image:LBCDPDG.png]]<br/>CDP-DG{{#if:{{#get:R1}}{{#get:R2}}|({{#get:R1}}/{{#get:R2}})}}
|}
|style="vertical-align:bottom"|'''The Kennedy Pathway'''<ref>CholineからPCまでの経路。PC生成のおよそ70%を担う。[http://www.jbc.org/cgi/content/full/280/25/e22 Kennedy and Lehninger 179(2):957,1949 & Kennedy and Weiss 222(1):193,1956]</ref>
|-
|style="vertical-align:bottom"| ethanolamine<br/>[[Image:LBE.png]]
|{{Map/ReactionUpDown|PPi|CTP|[http://metabolomics.jp/wiki/Enzyme:2.7.7.41 2.7.7.41]<ref>Phosphatidate cytidylyltransferase (EC 2.7.7.41)は真核細胞ではミクロソームとミトコンドリアの両画分に存在。</ref>}}
|style="text-align:center"|　choline [[Image:LBC.png]]{{Map/ReactionDown35|ATP|[http://metabolomics.jp/wiki/Enzyme:2.7.1.32 2.7.1.32]}}
|-
| {{Map/ReactionDown35|ATP|[http://metabolomics.jp/wiki/Enzyme:2.7.1.82 2.7.1.82]}}
O-phospho ethanolamine<br/>[[Image:LBOPE.png]]
| {{Map/MetaboliteSource|phosphatidate}}<ref>PAは''sn''-グリセロール3リン酸のアシル化により''de-novo''合成される。真核細胞におけるアシル基の供与体はacyl-CoAである（細菌ではacyl carrier protein）。PAはDGのリン酸化によっても生成する。</ref>
PA{{#if:{{#get:R1}}{{#get:R2}}|({{#get:R1}}/{{#get:R2}})}}<br/>[[Image:LBGPA.png]]
| O-phospho choline<br/>[[Image:LBOPC.png]]{{Map/ReactionDown35|CTP|[http://metabolomics.jp/wiki/Enzyme:2.7.7.15 2.7.7.15]}}
|-
|{{Map/ReactionDown35|CTP|[http://metabolomics.jp/wiki/Enzyme:2.7.7.14 2.7.7.14]}}CDP-ethanolamine<br/>[[Image:LBCDPE.png]]
|
{|
|{{Map/ReactionUp|ADP|ATP|[http://metabolomics.jp/wiki/Enzyme:2.7.1.107 2.7.1.107]}}
|{{Map/ReactionDown|H2O|Pi|[http://metabolomics.jp/wiki/Enzyme:3.1.3.4 3.1.3.4]<ref>PA phosphataseはすべての生物に存在。動物組織では膜たんぱく質と可溶性たんぱく質が存在。</ref>}}
|}
|CDP-choline<br/>[[Image:LBCDPC.png]]
|-
|colspan="3"|
{| style="margin:auto;"
|{{Map/ReactionDownFromRight|CMP|[http://metabolomics.jp/wiki/Enzyme:2.7.8.1 2.7.8.1]<ref>Choホスホトランスフェラーゼはミクロソームに局在する膜たんぱく質で逆反応も触媒。</ref>}}
|style="width:16em"| diacyl glycerol<br/>DG{{#if:{{#get:R1}}{{#get:R2}}|({{#get:R1}}/{{#get:R2}})}} {{Map/MetaboliteSink|Ether PL|Template:Map/Ether_phospholipid}} <br/>[[Image:LBDG.png]]
|{{Map/ReactionDownFromLeft|CMP|[http://metabolomics.jp/wiki/Enzyme:2.7.8.2 2.7.8.2]<ref>EthlAmineホスホトランスフェラーゼはミクロソームに局在する膜たんぱく質。</ref>}}
|}
|}
<hr>
|-
{{#lua:
  local key = stdin:match("%w+");
  local H = {};
  local I = {};
  for id, name in stdin:gmatch("&&(%w+).Common Name=&&(%S+)") do
    name = string.lower(name);
    for term in string.gmatch(name,"(%a+)") do
      if ((string.len(term) > 3) and
          (string.sub(term,0,1) == key)) then
        if (H[term] == nil) then
          H[term] = id; table.insert(I, term);
        else
          H[term] = H[term] .. ";" .. id;
        end
      end
    end
  end
  table.sort(I);
  local ret = "";
  for i=1,table.getn(I) do
    local k = I[i];
    ret = ret .. "* '''" .. k;
    for id in string.gmatch(H[k],"%w+") do
      ret = ret .. "'''&nbsp;&nbsp; [[" .. id .."]] &nbsp; ";
    end
    ret = ret .. "\n";
  end
  print(ret);
|
|
{{{1}}} {{#SearchLine:Common Name=||{{{2}}}%}}
{|
}}
|-
[[#top]]
|phosphatidyl ethanolamine
|{{Map/Glycerophospholipid/GetValues|head=PE|R1={{#get:R1}}|R2={{#get:R2}}}}
|}
[[Image:LBGPE.png]]<br/>PE{{#if:{{#get:R1}}{{#get:R2}}|({{#get:R1}}/{{#get:R2}})}}
|style="text-align:center"|methylation x 3<br/>{{Map/ReactionLongRight|3SAM|3SAH|[http://metabolomics.jp/wiki/Enzyme:2.1.1.17 2.1.1.17]<ref>多くの細菌はこの酵素を持たないが、一部のグラム陰性菌から脊椎動物まで幅広く保存されている。脊椎動物では肝臓で発現。</ref>}}
'''PEMT Pathway'''<ref>PC生成のおよそ30%。またホモシステインはこの遺伝子がないと半減する。</ref>
|
{|
|-
|phosphatidyl choline<br/>(lecithin) {{Map/MetaboliteSink|PL degradation|Template:Map/Phospholipid_degradation}}
|{{Map/Glycerophospholipid/GetValues|head=PC|R1={{#get:R1}}|R2={{#get:R2}}}}
|}
[[Image:LBGPC.png]]<br/>PC{{#if:{{#get:R1}}{{#get:R2}}|({{#get:R1}}/{{#get:R2}})}}
|-
|
{| style="margin:auto;"
|{{Map/ReactionUp|CO2||}}
|{{Map/ReactionDown|Ser|ethanolamine|<ref>動物細胞ではPSはPCおよびPEから転移酵素によって生じる。細菌や酵母ではPSはCDP-DGとセリンから合成される。どの細胞でもPSが脱炭酸してPEを生じる。</ref>}}
|}
|colspan="4" rowspan="3"|
{| class="wikitable" style="margin:auto;"
! style="text-align:center"| Structure Specification
|-
|
<big> {{#formtag:form|action="/wiki/Template:Map/Glycerophospholipid"|
<!-----
Set the expression data for {{#formtag:select|name="GPLData"|
  {{#formtag:option|value="P0"|Day 0}}
  {{#formtag:option|value="P3"|Day 4}}
  {{#formtag:option|value="P5"|Day 5}}
  {{#formtag:option|value="P7"|Day 7}}
  {{#formtag:option|value="P10"|Day 10}}
  {{#formtag:option|value="P15"|Day 15}}
  {{#formtag:option|value="P27"|Day 27}}
}}.---->
Set the R1 moiety to {{#formtag:select|name="R1"|
  {{#formtag:option|value="-"|-}}
  {{#formtag:option|value="12:0" {{#ifeq:{{#get:R1}}|12:0|selected="yes"}}|12:0}}
  {{#formtag:option|value="14:0" {{#ifeq:{{#get:R1}}|14:0|selected="yes"}}|14:0}}
  {{#formtag:option|value="16:0" {{#ifeq:{{#get:R1}}|16:0|selected="yes"}}|16:0}}
  {{#formtag:option|value="16:1" {{#ifeq:{{#get:R1}}|16:1|selected="yes"}}|16:1}}
  {{#formtag:option|value="18:0" {{#ifeq:{{#get:R1}}|18:0|selected="yes"}}|18:0}}
  {{#formtag:option|value="18:1" {{#ifeq:{{#get:R1}}|18:1|selected="yes"}}|18:1}}
}}. <br/>Set the R2 moiety to {{#formtag:select|name="R2"|
  {{#formtag:option|value="-"|-}}
  {{#formtag:option|value="12:0" {{#ifeq:{{#get:R2}}|12:0|selected="yes"}}|12:0}}
  {{#formtag:option|value="14:0" {{#ifeq:{{#get:R2}}|14:0|selected="yes"}}|14:0}}
  {{#formtag:option|value="16:0" {{#ifeq:{{#get:R2}}|16:0|selected="yes"}}|16:0}}
  {{#formtag:option|value="18:0" {{#ifeq:{{#get:R2}}|18:0|selected="yes"}}|18:0}}
  {{#formtag:option|value="18:1" {{#ifeq:{{#get:R2}}|18:1|selected="yes"}}|18:1}}
  {{#formtag:option|value="18:2" {{#ifeq:{{#get:R2}}|18:2|selected="yes"}}|18:2}}
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  {{#formtag:option|value="20:3" {{#ifeq:{{#get:R2}}|20:3|selected="yes"}}|20:3}}
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  {{#formtag:option|value="22:0" {{#ifeq:{{#get:R2}}|22:0|selected="yes"}}|22:0}}
  {{#formtag:option|value="22:1" {{#ifeq:{{#get:R2}}|22:1|selected="yes"}}|22:1}}
  {{#formtag:option|value="22:2" {{#ifeq:{{#get:R2}}|22:2|selected="yes"}}|22:2}}
  {{#formtag:option|value="22:3" {{#ifeq:{{#get:R2}}|22:3|selected="yes"}}|22:3}}
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  {{#formtag:option|value="22:6" {{#ifeq:{{#get:R2}}|22:6|selected="yes"}}|22:6}} }}. <br/>{{#formtag:input|type="submit"}} }}</big>
|}
|-
|
{|
|-
|phosphatidyl serine
|{{Map/Glycerophospholipid/GetValues|head=PS|R1={{#get:R1}}|R2={{#get:R2}}}}
|}
[[Image:LBGPS.png]]<br/>PS({{#get:R1}}/{{#get:R2}})
|}
 
<references/>

Revision as of 02:05, 1 August 2009

Biosynthesis of Glycerophospholipid

グリセロリン脂質の生合成

phosphatidyl glycerol phosphate
LBGPGP.png
3.1.3.27[1]
Arrow3rr.png
H2O   Pi 		phosphatidyl glycerol
LBGPG.png
CMP
2.7.8.5[1]
GP
Arrow3lu.png
Arrow1ld35.png CDP-DG
cardiolipin
LBGDPG.png
phosphatidyl inositol[2]

LBGPI.png
PI

2.7.8.11[3]
Arrow3ll.png
CMP   Inositol 		CDP-diacyl glycerol
LBCDPDG.png
CDP-DG
The Kennedy Pathway[4]
ethanolamine
LBE.png
Arrow6rv.png
PPi

2.7.7.41[5]
CTP

　choline LBC.png
Arrow1ld35.png ATP
Arrow1ld35.png ATP

O-phospho ethanolamine
LBOPE.png

phosphatidate[6]

PA
LBGPA.png

O-phospho choline
LBOPC.png
Arrow1ld35.png CTP
Arrow1ld35.png CTP
CDP-ethanolamine
LBCDPE.png
ADP
2.7.1.107
ATP
Arrow3lu.png
Arrow3ld.png
H2O
3.1.3.4[7]
Pi
CDP-choline
LBCDPC.png

2.7.8.1[8]
CMP 		Arrow4rda.png
diacyl glycerol
DG ¤Ether PL
LBDG.png
Arrow4lda.png
2.7.8.2[9]
CMP
phosphatidyl ethanolamine
0 5 10 27 (days)

LBGPE.png
PE

methylation x 3
2.1.1.17[10]
Arrow3rr100.png
3SAM   3SAH

PEMT Pathway[11]

phosphatidyl choline
(lecithin) ¤PL degradation
0 5 10 27 (days)

LBGPC.png
PC

CO2
Arrow3lu.png
Arrow3ld.png
Ser
[12]
ethanolamine
Structure Specification

Set the R1 moiety to .
Set the R2 moiety to .
phosphatidyl serine
0 5 10 27 (days)

LBGPS.png
PS( / )

  1. ↑ 1.0 1.1 PGおよびカルジオリピン(CL)の合成酵素はミトコンドリアに局在。真核細胞ではPGとCDP-DGにより合成されるが、細菌では2分子のPGが縮合してできる。
  2. ↑ PI は全リン脂質の5-10%を占める。
  3. ↑ この酵素は小胞体膜状に存在するとされていたが、形質膜にも類似の酵素が存在する。
  4. ↑ CholineからPCまでの経路。PC生成のおよそ70%を担う。Kennedy and Lehninger 179(2):957,1949 & Kennedy and Weiss 222(1):193,1956
  5. ↑ Phosphatidate cytidylyltransferase (EC 2.7.7.41)は真核細胞ではミクロソームとミトコンドリアの両画分に存在。
  6. ↑ PAはsn-グリセロール3リン酸のアシル化によりde-novo合成される。真核細胞におけるアシル基の供与体はacyl-CoAである（細菌ではacyl carrier protein）。PAはDGのリン酸化によっても生成する。
  7. ↑ PA phosphataseはすべての生物に存在。動物組織では膜たんぱく質と可溶性たんぱく質が存在。
  8. ↑ Choホスホトランスフェラーゼはミクロソームに局在する膜たんぱく質で逆反応も触媒。
  9. ↑ EthlAmineホスホトランスフェラーゼはミクロソームに局在する膜たんぱく質。
  10. ↑ 多くの細菌はこの酵素を持たないが、一部のグラム陰性菌から脊椎動物まで幅広く保存されている。脊椎動物では肝臓で発現。
  11. ↑ PC生成のおよそ30%。またホモシステインはこの遺伝子がないと半減する。
  12. ↑ 動物細胞ではPSはPCおよびPEから転移酵素によって生じる。細菌や酵母ではPSはCDP-DGとセリンから合成される。どの細胞でもPSが脱炭酸してPEを生じる。
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