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2025-06-09T03:34:37Z

Editor: /* 日本脂質生化学会会則 */

==日本脂質生化学会会則==

;第1条名称
:本会を日本脂質生化学会（The Japanese Conference on the Biochemistry of Lipids, JCBL）と称する。

;第2条目的
:本会は脂質の領域における化学的、生化学的研究の発展と向上を図り、あわせて研究者相互の連絡および親睦を深めることを目的とする。

;第3条事業
:本会は、第2条の目的を達成するために、次の事業をおこなう。
::（１）研究集会の開催
::（２）その他、本会の目的を達成するために必要な事業

;第4条会員
:本会の会員には次の種類がある。
::（１）正会員は、脂質の化学的、生化学的研究に従事し、本会で定めた会費を納入する者。
::（２）学生会員は、大学院または大学等に在籍し、脂質の化学的、生化学的研究に関連する分野を専攻する者で、正会員1名の推薦をうけて本会に登録を行い、本会で定めた会費を納入する者。
::（３）賛助会員は、本会の目的に賛同し、本会を維持することに協力し、本会で定めた会費を納入する者。
::（４）名誉会員は、幹事会の推薦により、総会の承認で決定される。名誉会員の会費は免除される。

;第5条役員、幹事、名誉会長
:（１）本会は、その運営のために、役員として会長1名、庶務幹事1名、会計幹事1名、会計監査1名をおき、役員会を構成する。
:（２）本会の運営上の重要事項について役員会の諮問に応ずるものとして幹事をおく。
:（３）役員および幹事は幹事会を構成し、会務の一切を処理する。幹事会は決定事項を総会に報告し、その承認を得るものとする。
:（４）名誉会長をおくことができる。名誉会長・名誉会員は幹事会に出席して意見を述べることができる。
:（５）会長、庶務幹事、会計幹事、会計監査の任期は2年とし、幹事の任期は4年とする、重任はさまたげない。

;第6条総会
:総会は、会長がこれを招集し、次の事項を審議し、決定または承認する。決定または承認は、総会出席者の半数以上の合意を必要とする。
::（１）予算および決算に関する事項
::（２）幹事会の提案事項
::（３）幹事会の決定に関する承認事項
::（４）その他

;第7条経理
:本会を運営するために、次の如く経理をおこなう。
::（１）本会の事業年度は、毎年1月1日より12月31日とし、予算および決算を会報に掲載する。
::（２）経理は、会計監査によって監査される。
::（３）当該年度の経理状況は、総会に報告され、その承認を得るものとする。
::（４）本会の経費は、会費および寄附金による。

;第8条事務局
:本会は会務に関する事務をおこなうために本会との間で結んだ契約の下に事務局を置くことができる。事務局を置いた場合、庶務幹事は事務局とも連携して会員に便宜を供する。

;第9条委員会
:本会に関わる活動のために各種委員会を設置できる。各委員会に委員長を一名置く。

;第10条細則
:本会則に沿って本会を運営する際に必要な事項は細則に定める。細則は本会の委員が起案し、幹事会の承認をもって発効される。発効された細則は総会に報告する。

;附則
:（１）本会則は、総会の承認を経て変更することができる。
:（２）本会の会費は、幹事会で決定し、総会の承認を得るものとする。

;(平成14年6月14日改訂)
;(平成17年6月2日改訂)
;(平成23年5月12日改訂)
;(令和7年6月９日改訂　幹事会承認)

History

2025-06-03T02:07:58Z

Editor: /* 研究費の獲得 */

このページは第50回日本脂質生化学会(2008年6月5日, 徳島)における会長講演　「第50回年会を迎えた日本脂質生化学会：更なる発展を目指して」（国立医薬品食品衛生研究所西島正弘）の講演資料および第61回日本脂質生化学会(2019年7月4日, 札幌)における講演「脂質生化学研究の草分け、山川民夫先生逝く」（東大・御茶ノ水大名誉教授脊山洋右）の講演資料を元に作成されています。

==脂質生化学会発足前後　　（脂質生化学研究　１９６２から）==
;１９５８年のこと
:日本生化学会総会（安田守雄主催）で“脂質”のシンポジウム（世話人：山川民夫、原一郎）
:複合脂質の構造、分離・精製、生理作用、脂質と臨床
:“脂質生化学”上下２巻の発行

;International Conferences on the Biochemical Problems of Lipids（ICBL)の歴史
:１９５３年　第１回International Conference on the Biochemical Problems of Lipids（ブリュッセル） R. Ruyssen（会長）のもとに88名が集まる
:１９５５年　第２回International Conference on the Biochemistry of Lipids（ゲント）
:１９６０年にJournal of Lipid Researchが創刊。第６回ICBL（マルセイユ）安田守雄、船橋三郎、原一郎が参加

;関西地区のリピド研究会
:１９５７年に第１回が刀根山病院で開催（大阪市大丹羽充氏が世話人）
[[Image:History-脂質生化学者の集い.png|脂質生化学者の集い|thumb]]
; 呼びかけの言葉
:“私たちは近い将来にリピドは生化学の中心課題の一つに浮かび上がってくるに違いない、すでにそのきざしが現れてきていると信じます。‥‥私たちがいろいろな問題を研究していて、リピドが何か重要な役目を果たしていると感じていながら、方法論や実験技術や基礎組織が不十分で手を出せないでいることはないでしょうか。‥‥リピドの重要性を認めて関心をもたれる方が集まって、‥‥余り形式ばらないで語り合うことにしたらどうでしょう。そして一応方向が決まったら、最近のリピドの問題の紹介、研究発表、実験技術や経験の交換、討論などもしたいと思います。‥‥学会の真似事にならないように‥‥”

==日本脂質生化学会の発足==
[[Image:History-脂質生化学研究会第一回.png|第１回研究集会|thumb]]
[[Image:History-脂質生化学研究会第二回.png|第2回研究集会|thumb]]
[[Image:History-脂質生化学研究序.png|脂質生化学研究 1962序より|thumb]]

# １９５９年に文部省科研費で総合研究“リン脂質の酵素化学的研究”が採択（代表者：船橋三郎；分担者：山川民夫、丸尾文治、野田万次郎、藤野安彦、原一郎、福場博保）
# １９６０年１０月３１日　本郷郵便局横の向上会館でリピドの研究会の発足を決定
# １９６１年６月１７日　第１回研究集会が日本化学会図書館講堂で開催
# １９６２年　第2回研究集会が藤沢薬品本社講堂で開催。　刀根山病院の谷氏、小倉氏、山村氏当が担当
* 第１回、第２回ともに参加者は約２００名で盛会であった

==開催地と実行委員==

{| class="wikitable"
! 開催数 || 開催年 || 開催地 || 会長 || 実行委員
|-
| 0 || 1960 || 東京 || ||
|-
| 1 || 1961 || 東京 ||　安田守雄 ||
|-
| 2 || 1961 || 大阪 || ||　谷、小倉、山村
|-
| 3 || 1962 || 東京 || ||
|-
| 4 || 1962 || || ||
|-
| 5 || 1963 || 仙台 || ||　奥井　誠一、箱守　仙一郎
|-
| 6 || 1964 || 東京 || ||　木村　雄吉
|-
| 7 || 1965 || 大津 || ||　堀　太郎
|-
| 8 || 1966 || 広島 || 　||　数野　太郎
|-
| 9 || 1967 || 東京　||　||　安田　守雄
|-
| 10 || 1968 || 東京　||　||　山川　民夫
|-
| 11 || 1969 || 札幌　||　||　大野　公吉
|-
| 12 || 1970 || 群馬　||　||　山添　三郎
|-
| 13 || 1971 || 静岡　||　||　舟橋　三郎、松本　亮
|-
| 14 || 1972 || 大阪　||　||　斉藤　国彦
|-
| 15 || 1973 || 東京　||　||　野島　庄七
|-
| 16 || 1974 || 松本　||　||　武富　保、橋本　隆、金井　正光
|-
| 17 || 1975 || 倉敷　||　||　山崎　三省、日下　喬史、市原　守介
|-
| 18 || 1976 || 東京　||　原　一郎　||　児島　英也、植田　伸夫
|-
| 19 || 1977 || 京都　||　||　野田　万次郎
|-
| 20 || 1978 || 東京　||　||　原　一郎、金子　弘、村松　敏夫
|-
| 21 || 1979 || 富山　||　||　長谷　純一
|-
| 22 || 1980 || 岐阜　||　||　高橋　善弥太
|-
| 23 || 1981 || 東大阪　||　||　林　陽　
|-
| 24 || 1982 || 仙台　||　||　金田　尚志
|-
| 25 || 1983 || 札幌　||　||　坂上　利夫
|-
| 26 || 1984 || 新潟　||　||　小野　輝夫、矢野　郁也
|-
| 27 || 1985 || 東京　||　山川　民夫　||　内藤　周幸
|-
| 28 || 1986 || 名古屋　||　||　池沢　宏郎
|-
| 29 || 1987 || 徳島　||　||　山本　尚三
|-
| 30 || 1988 || 東京　||　||　和久　敬蔵
|-
| 31 || 1989 || 神戸　||　||　藤野　安彦
|-
| 32 || 1990 || 東京　||　||　秦　葭哉
|-
| 33 || 1991 || 京都　||　||　鬼頭　誠
|-
| 34 || 1992 || 大阪　||　||　山本　章
|-
| 35 || 1993 || 東京　||　野島　庄七　||　赤松　穣
|-
| 36 || 1994 || 札幌　||　||　牧田　章
|-
| 37 || 1995 || 横浜　||　||　飯田　静夫
|-
| 38 || 1996 || 岐阜　||　||　野澤　義則
|-
| 39 || 1997 || 東京　||　||　井上　圭三
|-
| 40 || 1998 || 大阪　||　||　矢野　郁也
|-
| 41 || 1999 || 鎌倉　||　脊山　洋右　||　玉井　洋一
|-
| 42 || 2000 || 九州　||　||　古賀　洋介
|-
| 43 || 2001 || 帯広　||　||　中野　益男
|-
| 44 || 2002 || 東京　||　||　西島　正弘
|-
| 45 || 2003 || 仙台　||　||　宮澤　陽夫
|-
| 46 || 2004 || 熊本　||　||　堀内　正公
|-
| 47 || 2005 || 金沢　||　西島　正弘　||　吉本　谷博
|-
| 48 || 2006 || 東京　||　||　工藤　一郎
|-
| 49 || 2007 || 札幌　||　||　五十嵐　靖之
|-
| 50 || 2008 || 徳島　||　||　徳村　彰
|-
| 51 || 2009 || 名古屋　||　||　横山　信治
|-
| 52 || 2010 || 群馬　||　||　和泉　孝志
|-
| 53 || 2011 || 東京　||　和泉　孝志　||　平林　義雄
|-
| 54 || 2012 || 福岡　||　||　伊藤　信
|-
| 55 || 2013 || 宮城　||　||　青木　淳賢
|-
| 56 || 2014 || 大阪　||　||　岩森　正男
|-
| 57 || 2015 || 東京　||　||　新井　洋由
|-
| 58 || 2016 || 秋田　||　||　石井　聡
|-
| 59 || 2017 || 京都　||　新井　洋由　||　梅田　眞郷
|-
| 60 || 2018 || 東京　||　||　深見　希代子
|-
| 61 || 2019 || 札幌 ||　梅田　眞郷 || 木原　章雄
|-
| 62 || 2020 || 東京 || || 花田　賢太郎（オンライン開催）
|-
| 63 || 2021 || 香川 || || 上田　夏生（オンライン開催）
|-
| 64 || 2022 || 東京 || || 板部　洋之
|-
| 65 || 2023 || 熊本 || || 杉本　幸彦
|-
| 61 || 2024 || 静岡 || || 三浦　進司
|-
| 61 || 2025 || 東京 ||　花田　賢太郎 || 木原　章雄
|}

<gallery>
Image:History-安田守雄.png | 安田守雄先生 1981年3月4日ご逝去
Image:History-原一郎.png | 原一郎先生 1991年3月8日ご逝去
Image:History-堀太郎.png | 堀太郎先生　1995年1月3日ご逝去
Image:History-高橋善彌太.png | 高橋善彌太先生 1996年4月14日ご逝去
Image:History-山添三郎.png | 山添三郎先生　2007年1月15日ご逝去
Image:History-山川民夫.png | 山川民夫先生 2018年10月7日ご逝去
</gallery>

==事務局の変遷==
{|
|-
|１９６１～１９６８　|| 東大農学部舟橋研　|| 会長　安田守雄
|-
|１９６９～１９７５　|| 東大医学部血清学教室（原一郎先生）　|| 会長　安田守雄
|-
| １９７６～１９９２　|| 帝京大学医学部生化学教室（植田伸夫先生） || 会長　原　一郎
|-
| || || 会長　山川民夫
|-
| １９９３～２００４ || 日本学会事務センター ||会長　野島庄七
|-
| || || 会長　脊山洋右
|-
| ２００５～２０１０ || コングレ||会長　西島正弘
|-
| ２０１１～２０１６ || コングレ(2011), 春恒社(2012-) || 会長　和泉孝志
|-
| ２０１７～２０１９ || 春恒社 || 会長　新井洋由
|-
| ２０１９～２０２４ || 春恒社 || 会長　梅田眞郷
|-
| ２０２５～　　　　|| 春恒社 ||| 会長　花田賢太郎
|}

==国際学会の開催==
[[Image:History-会員数.png|会員数・参加者数・演題数の推移|thumb]]
[[Image:History-会計.png|会計推移|thumb]]

* １９８８年　　第２９回ICBL東京　（野島庄七）
* １９８８年　　第３回臨床研コンファランス　（山川民夫））
* １９８９年　　第３回国際PAF会議（野島庄七）
* １９９６年　　糖脂質・スフィンゴ糖脂質に関するゴードン会議　（永井克孝）
* ２００１年　　第７回国際PAF会議：PLM2001　（和久敬蔵）
* ２００１年　　武田シンポジウム　（野島、井上、西島）
* ２００４年　　糖脂質・スフィンゴ糖脂質に関するゴードン会議　（鈴木明身）
* ２００６年　　FASEB Summer Research Conferences　（工藤一郎）
* ２００９年　　第４回 Phospholipse A2 and Lipid Mediators　（新井洋由）
* ２０１２年　　糖脂質・スフィンゴ糖脂質に関するゴードン会議　(五十嵐靖之）
* ２０１５年　　第６回 Phospholipse A2 and Lipid Mediators　（村上　誠）
* ２０１９年　　第６０回ICBL東京（有田　誠）

==研究費の獲得==
* １９５９年　文部省科研費で総合研究“リン脂質の酵素化学的研究”
* 平成９年～１４年　科学技術庁総合研究　「生体膜脂質の新しい機能の解析技術と制御技術の開発に関する研究」　総額８億円　２４人
* 平成１２年～１６年　文科省特定領域研究「スフィンゴ脂質による生体膜ドメイン形成と多機能シグナリング」
* 平成１７年～２２年　JSTさきがけ「代謝と機能」
* 平成２２年〜２７年　文部科学省科学研究費補助金新学術領域研究「生命応答を制御する脂質マシナリー」
* 平成２７年〜令和元年　文部科学省科学研究費補助金新学術領域研究「脂質クオリティが解き明かす生命現象」
* 平成３０年～令和３年　AMED 革新的先端研究開発支援事業「画期的医薬品等の創出をめざす脂質の生理活性と機能の解明」

===脂質データベース関連===
* 平成２２年～２６年　日本学術振興会科研費研究成果公開促進費「生理活性脂質データベース LipidBank」（５年）
* 平成２７年～２８年　日本学術振興会科研費研究成果公開促進費「生理活性脂質データベース LipidBank」（単年）
* 平成２８年～２９年　日本学術振興会科研費研究成果公開促進費「生理活性脂質データベース LipidBank」（単年）

History

2025-06-03T01:56:20Z

Editor: /* 事務局の変遷 */

このページは第50回日本脂質生化学会(2008年6月5日, 徳島)における会長講演　「第50回年会を迎えた日本脂質生化学会：更なる発展を目指して」（国立医薬品食品衛生研究所西島正弘）の講演資料および第61回日本脂質生化学会(2019年7月4日, 札幌)における講演「脂質生化学研究の草分け、山川民夫先生逝く」（東大・御茶ノ水大名誉教授脊山洋右）の講演資料を元に作成されています。

==脂質生化学会発足前後　　（脂質生化学研究　１９６２から）==
;１９５８年のこと
:日本生化学会総会（安田守雄主催）で“脂質”のシンポジウム（世話人：山川民夫、原一郎）
:複合脂質の構造、分離・精製、生理作用、脂質と臨床
:“脂質生化学”上下２巻の発行

;International Conferences on the Biochemical Problems of Lipids（ICBL)の歴史
:１９５３年　第１回International Conference on the Biochemical Problems of Lipids（ブリュッセル） R. Ruyssen（会長）のもとに88名が集まる
:１９５５年　第２回International Conference on the Biochemistry of Lipids（ゲント）
:１９６０年にJournal of Lipid Researchが創刊。第６回ICBL（マルセイユ）安田守雄、船橋三郎、原一郎が参加

;関西地区のリピド研究会
:１９５７年に第１回が刀根山病院で開催（大阪市大丹羽充氏が世話人）
[[Image:History-脂質生化学者の集い.png|脂質生化学者の集い|thumb]]
; 呼びかけの言葉
:“私たちは近い将来にリピドは生化学の中心課題の一つに浮かび上がってくるに違いない、すでにそのきざしが現れてきていると信じます。‥‥私たちがいろいろな問題を研究していて、リピドが何か重要な役目を果たしていると感じていながら、方法論や実験技術や基礎組織が不十分で手を出せないでいることはないでしょうか。‥‥リピドの重要性を認めて関心をもたれる方が集まって、‥‥余り形式ばらないで語り合うことにしたらどうでしょう。そして一応方向が決まったら、最近のリピドの問題の紹介、研究発表、実験技術や経験の交換、討論などもしたいと思います。‥‥学会の真似事にならないように‥‥”

==日本脂質生化学会の発足==
[[Image:History-脂質生化学研究会第一回.png|第１回研究集会|thumb]]
[[Image:History-脂質生化学研究会第二回.png|第2回研究集会|thumb]]
[[Image:History-脂質生化学研究序.png|脂質生化学研究 1962序より|thumb]]

# １９５９年に文部省科研費で総合研究“リン脂質の酵素化学的研究”が採択（代表者：船橋三郎；分担者：山川民夫、丸尾文治、野田万次郎、藤野安彦、原一郎、福場博保）
# １９６０年１０月３１日　本郷郵便局横の向上会館でリピドの研究会の発足を決定
# １９６１年６月１７日　第１回研究集会が日本化学会図書館講堂で開催
# １９６２年　第2回研究集会が藤沢薬品本社講堂で開催。　刀根山病院の谷氏、小倉氏、山村氏当が担当
* 第１回、第２回ともに参加者は約２００名で盛会であった

==開催地と実行委員==

{| class="wikitable"
! 開催数 || 開催年 || 開催地 || 会長 || 実行委員
|-
| 0 || 1960 || 東京 || ||
|-
| 1 || 1961 || 東京 ||　安田守雄 ||
|-
| 2 || 1961 || 大阪 || ||　谷、小倉、山村
|-
| 3 || 1962 || 東京 || ||
|-
| 4 || 1962 || || ||
|-
| 5 || 1963 || 仙台 || ||　奥井　誠一、箱守　仙一郎
|-
| 6 || 1964 || 東京 || ||　木村　雄吉
|-
| 7 || 1965 || 大津 || ||　堀　太郎
|-
| 8 || 1966 || 広島 || 　||　数野　太郎
|-
| 9 || 1967 || 東京　||　||　安田　守雄
|-
| 10 || 1968 || 東京　||　||　山川　民夫
|-
| 11 || 1969 || 札幌　||　||　大野　公吉
|-
| 12 || 1970 || 群馬　||　||　山添　三郎
|-
| 13 || 1971 || 静岡　||　||　舟橋　三郎、松本　亮
|-
| 14 || 1972 || 大阪　||　||　斉藤　国彦
|-
| 15 || 1973 || 東京　||　||　野島　庄七
|-
| 16 || 1974 || 松本　||　||　武富　保、橋本　隆、金井　正光
|-
| 17 || 1975 || 倉敷　||　||　山崎　三省、日下　喬史、市原　守介
|-
| 18 || 1976 || 東京　||　原　一郎　||　児島　英也、植田　伸夫
|-
| 19 || 1977 || 京都　||　||　野田　万次郎
|-
| 20 || 1978 || 東京　||　||　原　一郎、金子　弘、村松　敏夫
|-
| 21 || 1979 || 富山　||　||　長谷　純一
|-
| 22 || 1980 || 岐阜　||　||　高橋　善弥太
|-
| 23 || 1981 || 東大阪　||　||　林　陽　
|-
| 24 || 1982 || 仙台　||　||　金田　尚志
|-
| 25 || 1983 || 札幌　||　||　坂上　利夫
|-
| 26 || 1984 || 新潟　||　||　小野　輝夫、矢野　郁也
|-
| 27 || 1985 || 東京　||　山川　民夫　||　内藤　周幸
|-
| 28 || 1986 || 名古屋　||　||　池沢　宏郎
|-
| 29 || 1987 || 徳島　||　||　山本　尚三
|-
| 30 || 1988 || 東京　||　||　和久　敬蔵
|-
| 31 || 1989 || 神戸　||　||　藤野　安彦
|-
| 32 || 1990 || 東京　||　||　秦　葭哉
|-
| 33 || 1991 || 京都　||　||　鬼頭　誠
|-
| 34 || 1992 || 大阪　||　||　山本　章
|-
| 35 || 1993 || 東京　||　野島　庄七　||　赤松　穣
|-
| 36 || 1994 || 札幌　||　||　牧田　章
|-
| 37 || 1995 || 横浜　||　||　飯田　静夫
|-
| 38 || 1996 || 岐阜　||　||　野澤　義則
|-
| 39 || 1997 || 東京　||　||　井上　圭三
|-
| 40 || 1998 || 大阪　||　||　矢野　郁也
|-
| 41 || 1999 || 鎌倉　||　脊山　洋右　||　玉井　洋一
|-
| 42 || 2000 || 九州　||　||　古賀　洋介
|-
| 43 || 2001 || 帯広　||　||　中野　益男
|-
| 44 || 2002 || 東京　||　||　西島　正弘
|-
| 45 || 2003 || 仙台　||　||　宮澤　陽夫
|-
| 46 || 2004 || 熊本　||　||　堀内　正公
|-
| 47 || 2005 || 金沢　||　西島　正弘　||　吉本　谷博
|-
| 48 || 2006 || 東京　||　||　工藤　一郎
|-
| 49 || 2007 || 札幌　||　||　五十嵐　靖之
|-
| 50 || 2008 || 徳島　||　||　徳村　彰
|-
| 51 || 2009 || 名古屋　||　||　横山　信治
|-
| 52 || 2010 || 群馬　||　||　和泉　孝志
|-
| 53 || 2011 || 東京　||　和泉　孝志　||　平林　義雄
|-
| 54 || 2012 || 福岡　||　||　伊藤　信
|-
| 55 || 2013 || 宮城　||　||　青木　淳賢
|-
| 56 || 2014 || 大阪　||　||　岩森　正男
|-
| 57 || 2015 || 東京　||　||　新井　洋由
|-
| 58 || 2016 || 秋田　||　||　石井　聡
|-
| 59 || 2017 || 京都　||　新井　洋由　||　梅田　眞郷
|-
| 60 || 2018 || 東京　||　||　深見　希代子
|-
| 61 || 2019 || 札幌 ||　梅田　眞郷 || 木原　章雄
|-
| 62 || 2020 || 東京 || || 花田　賢太郎（オンライン開催）
|-
| 63 || 2021 || 香川 || || 上田　夏生（オンライン開催）
|-
| 64 || 2022 || 東京 || || 板部　洋之
|-
| 65 || 2023 || 熊本 || || 杉本　幸彦
|-
| 61 || 2024 || 静岡 || || 三浦　進司
|-
| 61 || 2025 || 東京 ||　花田　賢太郎 || 木原　章雄
|}

<gallery>
Image:History-安田守雄.png | 安田守雄先生 1981年3月4日ご逝去
Image:History-原一郎.png | 原一郎先生 1991年3月8日ご逝去
Image:History-堀太郎.png | 堀太郎先生　1995年1月3日ご逝去
Image:History-高橋善彌太.png | 高橋善彌太先生 1996年4月14日ご逝去
Image:History-山添三郎.png | 山添三郎先生　2007年1月15日ご逝去
Image:History-山川民夫.png | 山川民夫先生 2018年10月7日ご逝去
</gallery>

==事務局の変遷==
{|
|-
|１９６１～１９６８　|| 東大農学部舟橋研　|| 会長　安田守雄
|-
|１９６９～１９７５　|| 東大医学部血清学教室（原一郎先生）　|| 会長　安田守雄
|-
| １９７６～１９９２　|| 帝京大学医学部生化学教室（植田伸夫先生） || 会長　原　一郎
|-
| || || 会長　山川民夫
|-
| １９９３～２００４ || 日本学会事務センター ||会長　野島庄七
|-
| || || 会長　脊山洋右
|-
| ２００５～２０１０ || コングレ||会長　西島正弘
|-
| ２０１１～２０１６ || コングレ(2011), 春恒社(2012-) || 会長　和泉孝志
|-
| ２０１７～２０１９ || 春恒社 || 会長　新井洋由
|-
| ２０１９～２０２４ || 春恒社 || 会長　梅田眞郷
|-
| ２０２５～　　　　|| 春恒社 ||| 会長　花田賢太郎
|}

==国際学会の開催==
[[Image:History-会員数.png|会員数・参加者数・演題数の推移|thumb]]
[[Image:History-会計.png|会計推移|thumb]]

* １９８８年　　第２９回ICBL東京　（野島庄七）
* １９８８年　　第３回臨床研コンファランス　（山川民夫））
* １９８９年　　第３回国際PAF会議（野島庄七）
* １９９６年　　糖脂質・スフィンゴ糖脂質に関するゴードン会議　（永井克孝）
* ２００１年　　第７回国際PAF会議：PLM2001　（和久敬蔵）
* ２００１年　　武田シンポジウム　（野島、井上、西島）
* ２００４年　　糖脂質・スフィンゴ糖脂質に関するゴードン会議　（鈴木明身）
* ２００６年　　FASEB Summer Research Conferences　（工藤一郎）
* ２００９年　　第４回 Phospholipse A2 and Lipid Mediators　（新井洋由）
* ２０１２年　　糖脂質・スフィンゴ糖脂質に関するゴードン会議　(五十嵐靖之）
* ２０１５年　　第６回 Phospholipse A2 and Lipid Mediators　（村上　誠）
* ２０１９年　　第６０回ICBL東京（有田　誠）

==研究費の獲得==
* １９５９年　文部省科研費で総合研究“リン脂質の酵素化学的研究”
* 平成９年～１４年　科学技術庁総合研究　「生体膜脂質の新しい機能の解析技術と制御技術の開発に関する研究」　総額８億円　２４人
* 平成１２年～１６年　文科省特定領域研究「スフィンゴ脂質による生体膜ドメイン形成と多機能シグナリング」
* 平成１７年～２２年　JSTさきがけ「代謝と機能」
* 平成２２年〜２７年　文部科学省科学研究費補助金新学術領域研究「生命応答を制御する脂質マシナリー」
* 平成２７年〜３２年　文部科学省科学研究費補助金新学術領域研究「脂質クオリティが解き明かす生命現象」
* 平成２７年～　JST 戦略的創造研究推進事業及び AMED 革新的先端研究開発支援事業「画期的医薬品等の創出をめざす脂質の生理活性と機能の解明」

===脂質データベース関連===
* 平成２２年～２６年　日本学術振興会科研費研究成果公開促進費「生理活性脂質データベース LipidBank」（５年）
* 平成２７年～２８年　日本学術振興会科研費研究成果公開促進費「生理活性脂質データベース LipidBank」（単年）
* 平成２８年～２９年　日本学術振興会科研費研究成果公開促進費「生理活性脂質データベース LipidBank」（単年）

History

2025-06-03T01:51:34Z

Editor: /* 開催地と実行委員 */

このページは第50回日本脂質生化学会(2008年6月5日, 徳島)における会長講演　「第50回年会を迎えた日本脂質生化学会：更なる発展を目指して」（国立医薬品食品衛生研究所西島正弘）の講演資料および第61回日本脂質生化学会(2019年7月4日, 札幌)における講演「脂質生化学研究の草分け、山川民夫先生逝く」（東大・御茶ノ水大名誉教授脊山洋右）の講演資料を元に作成されています。

==脂質生化学会発足前後　　（脂質生化学研究　１９６２から）==
;１９５８年のこと
:日本生化学会総会（安田守雄主催）で“脂質”のシンポジウム（世話人：山川民夫、原一郎）
:複合脂質の構造、分離・精製、生理作用、脂質と臨床
:“脂質生化学”上下２巻の発行

;International Conferences on the Biochemical Problems of Lipids（ICBL)の歴史
:１９５３年　第１回International Conference on the Biochemical Problems of Lipids（ブリュッセル） R. Ruyssen（会長）のもとに88名が集まる
:１９５５年　第２回International Conference on the Biochemistry of Lipids（ゲント）
:１９６０年にJournal of Lipid Researchが創刊。第６回ICBL（マルセイユ）安田守雄、船橋三郎、原一郎が参加

;関西地区のリピド研究会
:１９５７年に第１回が刀根山病院で開催（大阪市大丹羽充氏が世話人）
[[Image:History-脂質生化学者の集い.png|脂質生化学者の集い|thumb]]
; 呼びかけの言葉
:“私たちは近い将来にリピドは生化学の中心課題の一つに浮かび上がってくるに違いない、すでにそのきざしが現れてきていると信じます。‥‥私たちがいろいろな問題を研究していて、リピドが何か重要な役目を果たしていると感じていながら、方法論や実験技術や基礎組織が不十分で手を出せないでいることはないでしょうか。‥‥リピドの重要性を認めて関心をもたれる方が集まって、‥‥余り形式ばらないで語り合うことにしたらどうでしょう。そして一応方向が決まったら、最近のリピドの問題の紹介、研究発表、実験技術や経験の交換、討論などもしたいと思います。‥‥学会の真似事にならないように‥‥”

==日本脂質生化学会の発足==
[[Image:History-脂質生化学研究会第一回.png|第１回研究集会|thumb]]
[[Image:History-脂質生化学研究会第二回.png|第2回研究集会|thumb]]
[[Image:History-脂質生化学研究序.png|脂質生化学研究 1962序より|thumb]]

# １９５９年に文部省科研費で総合研究“リン脂質の酵素化学的研究”が採択（代表者：船橋三郎；分担者：山川民夫、丸尾文治、野田万次郎、藤野安彦、原一郎、福場博保）
# １９６０年１０月３１日　本郷郵便局横の向上会館でリピドの研究会の発足を決定
# １９６１年６月１７日　第１回研究集会が日本化学会図書館講堂で開催
# １９６２年　第2回研究集会が藤沢薬品本社講堂で開催。　刀根山病院の谷氏、小倉氏、山村氏当が担当
* 第１回、第２回ともに参加者は約２００名で盛会であった

==開催地と実行委員==

{| class="wikitable"
! 開催数 || 開催年 || 開催地 || 会長 || 実行委員
|-
| 0 || 1960 || 東京 || ||
|-
| 1 || 1961 || 東京 ||　安田守雄 ||
|-
| 2 || 1961 || 大阪 || ||　谷、小倉、山村
|-
| 3 || 1962 || 東京 || ||
|-
| 4 || 1962 || || ||
|-
| 5 || 1963 || 仙台 || ||　奥井　誠一、箱守　仙一郎
|-
| 6 || 1964 || 東京 || ||　木村　雄吉
|-
| 7 || 1965 || 大津 || ||　堀　太郎
|-
| 8 || 1966 || 広島 || 　||　数野　太郎
|-
| 9 || 1967 || 東京　||　||　安田　守雄
|-
| 10 || 1968 || 東京　||　||　山川　民夫
|-
| 11 || 1969 || 札幌　||　||　大野　公吉
|-
| 12 || 1970 || 群馬　||　||　山添　三郎
|-
| 13 || 1971 || 静岡　||　||　舟橋　三郎、松本　亮
|-
| 14 || 1972 || 大阪　||　||　斉藤　国彦
|-
| 15 || 1973 || 東京　||　||　野島　庄七
|-
| 16 || 1974 || 松本　||　||　武富　保、橋本　隆、金井　正光
|-
| 17 || 1975 || 倉敷　||　||　山崎　三省、日下　喬史、市原　守介
|-
| 18 || 1976 || 東京　||　原　一郎　||　児島　英也、植田　伸夫
|-
| 19 || 1977 || 京都　||　||　野田　万次郎
|-
| 20 || 1978 || 東京　||　||　原　一郎、金子　弘、村松　敏夫
|-
| 21 || 1979 || 富山　||　||　長谷　純一
|-
| 22 || 1980 || 岐阜　||　||　高橋　善弥太
|-
| 23 || 1981 || 東大阪　||　||　林　陽　
|-
| 24 || 1982 || 仙台　||　||　金田　尚志
|-
| 25 || 1983 || 札幌　||　||　坂上　利夫
|-
| 26 || 1984 || 新潟　||　||　小野　輝夫、矢野　郁也
|-
| 27 || 1985 || 東京　||　山川　民夫　||　内藤　周幸
|-
| 28 || 1986 || 名古屋　||　||　池沢　宏郎
|-
| 29 || 1987 || 徳島　||　||　山本　尚三
|-
| 30 || 1988 || 東京　||　||　和久　敬蔵
|-
| 31 || 1989 || 神戸　||　||　藤野　安彦
|-
| 32 || 1990 || 東京　||　||　秦　葭哉
|-
| 33 || 1991 || 京都　||　||　鬼頭　誠
|-
| 34 || 1992 || 大阪　||　||　山本　章
|-
| 35 || 1993 || 東京　||　野島　庄七　||　赤松　穣
|-
| 36 || 1994 || 札幌　||　||　牧田　章
|-
| 37 || 1995 || 横浜　||　||　飯田　静夫
|-
| 38 || 1996 || 岐阜　||　||　野澤　義則
|-
| 39 || 1997 || 東京　||　||　井上　圭三
|-
| 40 || 1998 || 大阪　||　||　矢野　郁也
|-
| 41 || 1999 || 鎌倉　||　脊山　洋右　||　玉井　洋一
|-
| 42 || 2000 || 九州　||　||　古賀　洋介
|-
| 43 || 2001 || 帯広　||　||　中野　益男
|-
| 44 || 2002 || 東京　||　||　西島　正弘
|-
| 45 || 2003 || 仙台　||　||　宮澤　陽夫
|-
| 46 || 2004 || 熊本　||　||　堀内　正公
|-
| 47 || 2005 || 金沢　||　西島　正弘　||　吉本　谷博
|-
| 48 || 2006 || 東京　||　||　工藤　一郎
|-
| 49 || 2007 || 札幌　||　||　五十嵐　靖之
|-
| 50 || 2008 || 徳島　||　||　徳村　彰
|-
| 51 || 2009 || 名古屋　||　||　横山　信治
|-
| 52 || 2010 || 群馬　||　||　和泉　孝志
|-
| 53 || 2011 || 東京　||　和泉　孝志　||　平林　義雄
|-
| 54 || 2012 || 福岡　||　||　伊藤　信
|-
| 55 || 2013 || 宮城　||　||　青木　淳賢
|-
| 56 || 2014 || 大阪　||　||　岩森　正男
|-
| 57 || 2015 || 東京　||　||　新井　洋由
|-
| 58 || 2016 || 秋田　||　||　石井　聡
|-
| 59 || 2017 || 京都　||　新井　洋由　||　梅田　眞郷
|-
| 60 || 2018 || 東京　||　||　深見　希代子
|-
| 61 || 2019 || 札幌 ||　梅田　眞郷 || 木原　章雄
|-
| 62 || 2020 || 東京 || || 花田　賢太郎（オンライン開催）
|-
| 63 || 2021 || 香川 || || 上田　夏生（オンライン開催）
|-
| 64 || 2022 || 東京 || || 板部　洋之
|-
| 65 || 2023 || 熊本 || || 杉本　幸彦
|-
| 61 || 2024 || 静岡 || || 三浦　進司
|-
| 61 || 2025 || 東京 ||　花田　賢太郎 || 木原　章雄
|}

<gallery>
Image:History-安田守雄.png | 安田守雄先生 1981年3月4日ご逝去
Image:History-原一郎.png | 原一郎先生 1991年3月8日ご逝去
Image:History-堀太郎.png | 堀太郎先生　1995年1月3日ご逝去
Image:History-高橋善彌太.png | 高橋善彌太先生 1996年4月14日ご逝去
Image:History-山添三郎.png | 山添三郎先生　2007年1月15日ご逝去
Image:History-山川民夫.png | 山川民夫先生 2018年10月7日ご逝去
</gallery>

==事務局の変遷==
{|
|-
|１９６１～１９６８　|| 東大農学部舟橋研　|| 会長　安田守雄
|-
|１９６９～１９７５　|| 東大医学部血清学教室（原一郎先生）　|| 会長　安田守雄
|-
| １９７６～１９９２　|| 帝京大学医学部生化学教室（植田伸夫先生） || 会長　原　一郎
|-
| || || 会長　山川民夫
|-
| １９９３～２００４ || 日本学会事務センター ||会長　野島庄七
|-
| || || 会長　脊山洋右
|-
| ２００５～２０１０ || コングレ||会長　西島正弘
|-
| ２０１１～２０１６ || コングレ(2011), 春恒社(2012-) || 会長　和泉孝志
|-
| ２０１７～　　　　 || 春恒社 || 会長　新井洋由
|}

==国際学会の開催==
[[Image:History-会員数.png|会員数・参加者数・演題数の推移|thumb]]
[[Image:History-会計.png|会計推移|thumb]]

* １９８８年　　第２９回ICBL東京　（野島庄七）
* １９８８年　　第３回臨床研コンファランス　（山川民夫））
* １９８９年　　第３回国際PAF会議（野島庄七）
* １９９６年　　糖脂質・スフィンゴ糖脂質に関するゴードン会議　（永井克孝）
* ２００１年　　第７回国際PAF会議：PLM2001　（和久敬蔵）
* ２００１年　　武田シンポジウム　（野島、井上、西島）
* ２００４年　　糖脂質・スフィンゴ糖脂質に関するゴードン会議　（鈴木明身）
* ２００６年　　FASEB Summer Research Conferences　（工藤一郎）
* ２００９年　　第４回 Phospholipse A2 and Lipid Mediators　（新井洋由）
* ２０１２年　　糖脂質・スフィンゴ糖脂質に関するゴードン会議　(五十嵐靖之）
* ２０１５年　　第６回 Phospholipse A2 and Lipid Mediators　（村上　誠）
* ２０１９年　　第６０回ICBL東京（有田　誠）

==研究費の獲得==
* １９５９年　文部省科研費で総合研究“リン脂質の酵素化学的研究”
* 平成９年～１４年　科学技術庁総合研究　「生体膜脂質の新しい機能の解析技術と制御技術の開発に関する研究」　総額８億円　２４人
* 平成１２年～１６年　文科省特定領域研究「スフィンゴ脂質による生体膜ドメイン形成と多機能シグナリング」
* 平成１７年～２２年　JSTさきがけ「代謝と機能」
* 平成２２年〜２７年　文部科学省科学研究費補助金新学術領域研究「生命応答を制御する脂質マシナリー」
* 平成２７年〜３２年　文部科学省科学研究費補助金新学術領域研究「脂質クオリティが解き明かす生命現象」
* 平成２７年～　JST 戦略的創造研究推進事業及び AMED 革新的先端研究開発支援事業「画期的医薬品等の創出をめざす脂質の生理活性と機能の解明」

===脂質データベース関連===
* 平成２２年～２６年　日本学術振興会科研費研究成果公開促進費「生理活性脂質データベース LipidBank」（５年）
* 平成２７年～２８年　日本学術振興会科研費研究成果公開促進費「生理活性脂質データベース LipidBank」（単年）
* 平成２８年～２９年　日本学術振興会科研費研究成果公開促進費「生理活性脂質データベース LipidBank」（単年）

JCBL:DBmeeting

2025-06-03T01:43:28Z

Editor:

==About LipidBank==

{{Twocolumn|
"LipidBank" is an open, publicly free database of natural lipids including fatty acids, glycerolipids, sphingolipids, steroids, and various vitamins.

The database contains more than 6000 unique molecular structures (ChemDraw cdx format, MDL MOL format), their lipid names (common name, IUPAC), spectral information (mass, UV, IR, NMR and others), and most importantly, literature information.

The database lists natural lipids only, and all molecular information is manually curated and approved by experts in lipid research (see Informant in each record).

LipidBank is the official database of the Japanese Conference on the Biochemistry of Lipids (JCBL).

 '''Reference:''' 
Watanabe K., Yasugi E. and Oshima M. "How to search the glycolipid data in LIPIDBANK for Web: the newly developed lipid database in Japan" Trend Glycosci. and Glycotechnol. 12, 175-184, 2000. ([https://www.jstage.jst.go.jp/article/tigg1989/12/65/12_65_175/_article/-char/ja/ PDF])
|
LipidBankは、脂肪酸、グリセロ脂質、スフィンゴ脂質、ステロイド、各種ビタミンを含む天然脂質の公開データベースです。 

現在6000以上の天然物構造（ChemDraw cdx形式、MDL MOL形式）について、物質名（慣用名とIUPAC）、スペクトル情報（質量、UV, IR, NMRほか）に加えて、文献情報も掲載しています。 

このデータベースは天然物を対象としており、全データについて監修者がチェックしています。LipidBankは日本脂質生化学会の公式データベースです。 
 

文献： 
渡辺清博、八杉悦子、大島美恵子「糖脂質データを日本で新しく作成された生理活性脂質データベース[LIPIDBANK for Web]で検索してみよう」Trend Glycosci. and Glycotechnol. 12, 175-184, 2000.（[https://www.jstage.jst.go.jp/article/tigg1989/12/65/12_65_175/_article/-char/ja/ PDF]）
}}

==About JCBL (脂質生化学会について)==
* JCBL Membership rules [[Bylaws|会則]] (in Japanese)
* JCBL History [[History|歴史]] (in Japanese)
; 過去の大会ホームページ (2010-2021年)
*[[JCBL:52|52回大会 JCBL52]] 2010 和泉孝志（群馬）
*[[JCBL:53|53回大会 JCBL53]] 2011 平林義雄（東京）
*[[JCBL:54|54回大会 JCBL54]] 2012 伊東信　（福岡）
*[[JCBL:55|55回大会 JCBL55]] 2013 青木淳賢（宮城）
*[[JCBL:56|56回大会 JCBL56]] 2014 岩森正男（大阪）
*[[JCBL:57|57回大会 JCBL57]] 2015 新井洋由（東京）
*[[JCBL:58|58回大会 JCBL58]] 2016 石井聡　（秋田）
*[[JCBL:59|59回大会 JCBL59]] 2017 梅田眞郷（京都）
*[[JCBL:60|60回大会 JCBL60]] 2018 深見希代子（東京）
*[[JCBL:61|61回大会 JCBL61]] 2019 木原章雄（札幌）
*[[JCBL:62|62回大会 JCBL62]] 2020 花田賢太郎（東京）
*[[JCBL:63|63回大会 JCBL63]] 2021 上田夏生（香川）
以降はJCBLの[https://jcbl.jp/ 現行ホームページ]を御覧ください。

==History of LipidBank (歴史)==
{{Twocolumn|
===LIPID INFORMATION SERVICE (LIPIDBANK) (1984? - 1997)===
The project was started as a database in Japanese around 1984 with Grant-in-Aid for scientific research publication (Akira Hayashi). This database was succeeded in 1989 under the
committee of lipid information (President: Yoshitaka Nagai), organized by the members of The Japanese Conference on the Biochemistry of Lipids (JCBL). The actual construction of the database was managed by the JCBL committee of database construction (President: Akira Hayashi, Vice-president: Nobuo Ueta, Secretary: Kiyohiro Watanabe).

The database included 16 lipid classes: fatty acid, long chain aldehyde, long chain alcohol, long chain base, bile acid, glyceride, phospholipid, glycolipid, lipoprotein, lipopolysaccharide, steroid, prostanoid, ether type lipid, mycolic acid and wax.

Each record contained lipid name, biological activity, source, references, structure and spectra. About 2,700 records were collected and saved on floppy discs.
|
===脂質情報データベース (1984? - 1997)===
LipidBankの淵源は、1984年頃に獲得された科学研究費補助金（研究成果刊行費、代表者：林陽）により構築が開始された日本語のデータベース「脂質情報データベース」である。1989年に、このデータベースは日本脂質生化学会（JCBL）により構成された脂質情報作成委員会（委員長：永井克孝）が立ち上げたプロジェクトに引き継がれ、構築が本格化した。実務は脂質情報データベース構築委員会（委員長：林陽、副委員長：植田伸夫、システム構築と入力：渡邊清博）が担った。 

このデータベースは、脂質を16種類に分類して集積された（脂肪酸、長鎖アルデヒド、長鎖アルコール、長鎖塩基、胆汁酸、グリセリド、リン脂質、糖脂質、リポタンパク質、リポ多糖、ステロイド、プロスタノイド、エーテル型脂質、ミコール酸、ワックスなど）。 

各脂質の名称、生理活性、分布、文献、化学構造、スペクトルデータなどの情報が記載された。約2,700件のデータが集積され、フロッピーディスクで配布された。
}}

{{Twocolumn|
===LIPIDBANK for Web (1996 - 1999)===
The initial three-year project started as a joint research between the International Medical Center of Japan (current National Center for Global Health and Medicine) ([http://www.ncgm.go.jp/ NCGM]) and the Japan Science and Technology Corporation ([http://www.jst.go.jp/ JST]).

A new executive committee was organized (President: Shoshichi Nojima, Vice-president: Mieko Oshima, Secretary: Kiyohiro Watanabe and Etsuko Yasugi).

The committee decided to collect the data on 27 lipid classes in English. Molecules in each class were collected independently under 27 team leaders and 122 data informants.

The database became publicly available from October 1999. The database server was placed at the University of Tokyo where the office of JCBL was located. The total number of molecules was about 5400.

|
===生理活性脂質データベース (1996 - 1999)===

3年間の本プロジェクトは、国立国際医療センター（現：国立国際医療研究センター）([http://www.ncgm.go.jp/ NCGM]) と科学技術振興機構 ([http://www.jst.go.jp/ JST]) との共同研究として発足した。

新たに生理活性脂質データベース構築検討会(委員長：野島庄七、副委員長：大島美恵子、データ入力：渡邊清博、八杉悦子）が結成された。

脂質を27種類に分類して、それぞれの脂質化合物データを英語で集積した。脂質分野ごとに、各脂質を専門とする27名のデータベース構築責任者をおき、122名のデータ提供者によりデータが収載された。

1999年秋にJCBLの事務局があった東京大学にサーバーを設置し、インターネット上に公開された。5,400件の脂質化合物データが収録された。
}}

{{Twocolumn|
===Updating LIPIDBANK for Web (1999 - 2005)===
After adding one lipid class (lipid peroxides), 28 lipid classes were reorganized into 17 lipid groups.

The DERIVED LIPIDS group now includes fatty acid, long chain alcohol, long chain aldehyde, and long chain base and ceramide. The FAT-SOLUBLE VITAMIN group includes carotenoid, coenzyme Q, vitamin A, vitamin D, vitamin E, and vitamin K. The GLYCOLIPID group includes glycosphingolipid, glycoglycerolipid and others. The PHOSPHOLIPID group includes glycerophospholipid, PAF, and sphingophospholipid.

In 2004, JCBL officially established an executive committee (President: Yousuke Seyama, Secretary: Etsuko Yasugi) for updating the database.

|
===生理活性脂質データベースの維持・更新(1999 - 2005)===
新たに過酸化脂質の項目を加えて、17種類の脂質グループに分類して、28種類の脂質化合物について、データ集積をおこなった。

誘導脂質には、脂肪酸、長鎖アルコール、長鎖アルデヒド、長鎖塩基とセラミドが含まれる。脂溶性ビタミンは、カロテノイド、コエンザイムQ、ビタミンA、D、E、Kから構成されている。糖脂質にはスフィンゴ糖脂質とグリセロ糖脂質が、リン脂質にはグリセロリン脂質、PAF、スフィンゴリン脂質が含まれる。

2004年には、脂質データベース構築委員会（委員長：脊山洋右、データ入力：八杉悦子）がJCBLから公認された。
}}

{{Twocolumn|
===Renovating LIPIDBANK for Web (2006-2007)===
LIPIDBANK for Web became the official database of JCBL, to which all rights were delegated from NCGM and JST. The name of database changed to "LipidBank".

The Hopanoid group was removed and the number of category is now 16. The database system and its contents were updated and reorganized by the JCBL committee members (President: Masahiro Nishijima).

|
===生理活性脂質データベースの刷新(2006 - 2007)===
生理活性脂質データベースは2006年にNCGMとJSTから譲渡され、JCBL公認のデータベースとなった。データベースの名称を"LipidBank"と改めた。 

脂質項目のうちホパノイドを削除し、16種類の脂質グループとした。脂質データベース構築委員会（委員長：西島正弘）が、データベースのシステムと内容の維持・更新を担当。

}}

{{Twocolumn|
=== Linking with the Wiki version (2017-2022)===
With financial support from the AMED program "Studies on Specific Activities and Functions of Lipid Molecules to Develop Innovative Medical Technologies" (PS: YOKOYAMA Shinji), wiki-based database was updated for glycosphingolipid and others.

Categories in the original LipidBank were translated into static HTML pages due to security issues.
|
=== LipidBank Wiki との連携 (2017-2022)===
AMED革新的先端研究開発支援事業「画期的医薬品等の創出をめざす脂質の生理活性と機能の解明」（総括：横山信治）より支援を受け、スフィンゴ糖脂質を中心に情報を整理、更新。

旧LipidBankの各カテゴリーはセキュリティ脆弱性のためにコンテンツをHTML固定ページに変換。
}}

===Contact Address===
{{Twocolumn|
If you have questions or suggestions, please contact with:

::Masanori Arita
:::arita@nig.ac.jp
::National Institute of Genetics
|
ご意見やご質問は、下記へお寄せください。
 
::有田正規
:::arita@nig.ac.jp
::国立遺伝学研究所
}}

==Members of Executive Committee of Lipid Database (脂質データベース構築委員会メンバー）==
2025年 5月 27日
<center>
{| class="wikitable"
|-
! colspan="3" style="text-align:center"| 委員長: 青木淳賢 (Junken Aoki)
|-
| colspan="3" style="text-align:center"| 副委員長: 有田　正規 (Masanori Arita), 横山　和明 (Kazuaki Yokoyama)
|-
! colspan="3" style="text-align:center"| 委員
|-
| 有田　誠 (Makoto Arita) || 石川寿樹 (Toshiki Ishikawa) ||
|-
| 糸乗　前 (Saki Itonori) || 今井　博之 (Hiroyuki Imai) || 笠間　健嗣 (Takeshi Kasama)
|-
| 北　芳博 (Yoshihiro Kita) || 小林　哲幸 (Tetsuyuki Kobayashi) || 酒井　祥太 (Shota Sakai)
|-
| 中村　和生 (Kazuo Nakamura) || 八杉　悦子 (Etsuko Yasugi) ||
|-
! colspan="3" style="text-align:center"| 顧問
|-
| 大島　美恵子（Mieko Oshima) || 脊山　洋右（Yousuke Seyama) || 和泉　孝志 (Takashi Izumi)
|-
| 清水　孝雄 (Takao Shimizu) || 西島　正弘（Masahiro Nishijima）||
|}
</center>

==Funding (資金）==
{|
|-
|colspan="2"| <big>'''1989 - 1997'''</big>
|-
|LIPID INFORMATION SERVICE was funded by a Grant-in-Aid for Scientific Research (Grant-in-Aid for Publication of Scientific Research Results) from the Japan Society for the Promotion of Science.
|LIPID INFORMATION SERVICEが日本学術振興会([http://www.jsps.go.jp/ JSPS])科学研究費に採択される。
|-
|colspan="2"| <big>'''1996 - 2002'''</big>
|-
|LIPIDBANK for Web was funded by the Database Development Program of the Japan Science and Technology Agency (JST).
|LIPIDBANK for Webが科学技術振興機構([http://www.jst.go.jp/ JST])に採択される。
|-
|colspan="2"| <big>'''2003 - 2006''', '''2009 - 2016'''</big>
|-
|LIPIDBANK for Web was funded by a Grant-in-Aid for Scientific Research (Grant-in-Aid for Publication of Scientific Research Results) from the Japan Society for the Promotion of Science.
|日本学術振興会([http://www.jsps.go.jp/ JSPS])科学研究費の研究成果公開促進費データベース事業による更新。
|-
|colspan="2"| <big>'''2017 - 2022'''</big>
|-
|LIPIDBANK was funded by AMED-CREST in "Studies on Specific Activities and Functions of Lipid Molecules to Develop Innovative Medical Technologies".
|AMED革新的先端研究開発支援事業「画期的医薬品等の創出をめざす脂質の生理活性と機能の解明」（総括：横山信治）による更新。
|}

==Bylaws==
<pre>
日本脂質生化学会脂質データベース構築委員会　規約

（名称）
第1条　本会を日本脂質生化学会脂質データベース構築委員会（以下、委員会という。）と称する。
（設置）
第2条　委員会は、日本脂質生化学会が設置する。
（目的）
第3条　委員会は、脂質データベース“LipidBank”の構築・維持・更新を目的とし、脂質データの集積・更新、データベースシステムの構築・維持、
ならびにこれらに関連する業務をおこなう。
（委員会）
第4条　委員会の委員は、脂質・バイオインフォマティクスに造詣の深い日本脂質生化学会会員で構成され、日本脂質生化学会会長が任命する。
　２　委員会には委員長を置くこととし、原則として日本脂質生化学会会長が兼務するが、委員の中から任命することができる。
　３　委員会に副委員長を置くことができ、日本脂質生化学会会長が任命する。
　４　委員会に顧問を置くことができ、日本脂質生化学会会長が任命する。
　５　顧問は委員会に出席し、意見を述べることができる。
（事務局）
第5条　委員会に、会務に関する事務をおこなうために事務局を置く。事務局長は委員長が指名する。
（雑則）
第6条　この規約に定めるもののほか、必要な事項は別に定める。

附則
本規約は、総会の承認を経て変更することができる。

（平成17年10月1日制定）
（平成29年6月15日改訂）
</pre>

==構築委員会の歴史==
{| class="wikitable"
|-
| 第1回 || 1997年1月8日 || 国立国際医療センター研究所 || 生理活性脂質データベース構築委員会
|-
| 第10回 || 2004年3月25日 ||学士会分館 || 脂質情報データベース推進委員会
|-
| 第20回 || 2007年3月8日 || 東京大学　医学部 || 脂質データベース構築委員会
|-
| 第30回 || 2015年5月29日 || 東京大学　薬学部 || 脂質データベース構築委員会
|-
| 第34回 || 2019年7月5日 || 北海道大学 || 脂質データベース構築委員会
|-
|colspan="4"| 2020-2022 年はCOVID-19のために中止。
|-
| 第37回 || 2025年5月27日 || オンライン || 脂質データベース構築委員会
|}

History

2025-06-03T01:22:32Z

Editor:

このページは第50回日本脂質生化学会(2008年6月5日, 徳島)における会長講演　「第50回年会を迎えた日本脂質生化学会：更なる発展を目指して」（国立医薬品食品衛生研究所西島正弘）の講演資料および第61回日本脂質生化学会(2019年7月4日, 札幌)における講演「脂質生化学研究の草分け、山川民夫先生逝く」（東大・御茶ノ水大名誉教授脊山洋右）の講演資料を元に作成されています。

==脂質生化学会発足前後　　（脂質生化学研究　１９６２から）==
;１９５８年のこと
:日本生化学会総会（安田守雄主催）で“脂質”のシンポジウム（世話人：山川民夫、原一郎）
:複合脂質の構造、分離・精製、生理作用、脂質と臨床
:“脂質生化学”上下２巻の発行

;International Conferences on the Biochemical Problems of Lipids（ICBL)の歴史
:１９５３年　第１回International Conference on the Biochemical Problems of Lipids（ブリュッセル） R. Ruyssen（会長）のもとに88名が集まる
:１９５５年　第２回International Conference on the Biochemistry of Lipids（ゲント）
:１９６０年にJournal of Lipid Researchが創刊。第６回ICBL（マルセイユ）安田守雄、船橋三郎、原一郎が参加

;関西地区のリピド研究会
:１９５７年に第１回が刀根山病院で開催（大阪市大丹羽充氏が世話人）
[[Image:History-脂質生化学者の集い.png|脂質生化学者の集い|thumb]]
; 呼びかけの言葉
:“私たちは近い将来にリピドは生化学の中心課題の一つに浮かび上がってくるに違いない、すでにそのきざしが現れてきていると信じます。‥‥私たちがいろいろな問題を研究していて、リピドが何か重要な役目を果たしていると感じていながら、方法論や実験技術や基礎組織が不十分で手を出せないでいることはないでしょうか。‥‥リピドの重要性を認めて関心をもたれる方が集まって、‥‥余り形式ばらないで語り合うことにしたらどうでしょう。そして一応方向が決まったら、最近のリピドの問題の紹介、研究発表、実験技術や経験の交換、討論などもしたいと思います。‥‥学会の真似事にならないように‥‥”

==日本脂質生化学会の発足==
[[Image:History-脂質生化学研究会第一回.png|第１回研究集会|thumb]]
[[Image:History-脂質生化学研究会第二回.png|第2回研究集会|thumb]]
[[Image:History-脂質生化学研究序.png|脂質生化学研究 1962序より|thumb]]

# １９５９年に文部省科研費で総合研究“リン脂質の酵素化学的研究”が採択（代表者：船橋三郎；分担者：山川民夫、丸尾文治、野田万次郎、藤野安彦、原一郎、福場博保）
# １９６０年１０月３１日　本郷郵便局横の向上会館でリピドの研究会の発足を決定
# １９６１年６月１７日　第１回研究集会が日本化学会図書館講堂で開催
# １９６２年　第2回研究集会が藤沢薬品本社講堂で開催。　刀根山病院の谷氏、小倉氏、山村氏当が担当
* 第１回、第２回ともに参加者は約２００名で盛会であった

==開催地と実行委員==

{| class="wikitable"
! 開催数 || 開催年 || 開催地 || 会長 || 実行委員
|-
| 0 || 1960 || 東京 || ||
|-
| 1 || 1961 || 東京 ||　安田守雄 ||
|-
| 2 || 1961 || 大阪 || ||　谷、小倉、山村
|-
| 3 || 1962 || 東京 || ||
|-
| 4 || 1962 || || ||
|-
| 5 || 1963 || 仙台 || ||　奥井　誠一、箱守　仙一郎
|-
| 6 || 1964 || 東京 || ||　木村　雄吉
|-
| 7 || 1965 || 大津 || ||　堀　太郎
|-
| 8 || 1966 || 広島 || 　||　数野　太郎
|-
| 9 || 1967 || 東京　||　||　安田　守雄
|-
| 10 || 1968 || 東京　||　||　山川　民夫
|-
| 11 || 1969 || 札幌　||　||　大野　公吉
|-
| 12 || 1970 || 群馬　||　||　山添　三郎
|-
| 13 || 1971 || 静岡　||　||　舟橋　三郎、松本　亮
|-
| 14 || 1972 || 大阪　||　||　斉藤　国彦
|-
| 15 || 1973 || 東京　||　||　野島　庄七
|-
| 16 || 1974 || 松本　||　||　武富　保、橋本　隆、金井　正光
|-
| 17 || 1975 || 倉敷　||　||　山崎　三省、日下　喬史、市原　守介
|-
| 18 || 1976 || 東京　||　原　一郎　||　児島　英也、植田　伸夫
|-
| 19 || 1977 || 京都　||　||　野田　万次郎
|-
| 20 || 1978 || 東京　||　||　原　一郎、金子　弘、村松　敏夫
|-
| 21 || 1979 || 富山　||　||　長谷　純一
|-
| 22 || 1980 || 岐阜　||　||　高橋　善弥太
|-
| 23 || 1981 || 東大阪　||　||　林　陽　
|-
| 24 || 1982 || 仙台　||　||　金田　尚志
|-
| 25 || 1983 || 札幌　||　||　坂上　利夫
|-
| 26 || 1984 || 新潟　||　||　小野　輝夫、矢野　郁也
|-
| 27 || 1985 || 東京　||　山川　民夫　||　内藤　周幸
|-
| 28 || 1986 || 名古屋　||　||　池沢　宏郎
|-
| 29 || 1987 || 徳島　||　||　山本　尚三
|-
| 30 || 1988 || 東京　||　||　和久　敬蔵
|-
| 31 || 1989 || 神戸　||　||　藤野　安彦
|-
| 32 || 1990 || 東京　||　||　秦　葭哉
|-
| 33 || 1991 || 京都　||　||　鬼頭　誠
|-
| 34 || 1992 || 大阪　||　||　山本　章
|-
| 35 || 1993 || 東京　||　野島　庄七　||　赤松　穣
|-
| 36 || 1994 || 札幌　||　||　牧田　章
|-
| 37 || 1995 || 横浜　||　||　飯田　静夫
|-
| 38 || 1996 || 岐阜　||　||　野澤　義則
|-
| 39 || 1997 || 東京　||　||　井上　圭三
|-
| 40 || 1998 || 大阪　||　||　矢野　郁也
|-
| 41 || 1999 || 鎌倉　||　脊山　洋右　||　玉井　洋一
|-
| 42 || 2000 || 九州　||　||　古賀　洋介
|-
| 43 || 2001 || 帯広　||　||　中野　益男
|-
| 44 || 2002 || 東京　||　||　西島　正弘
|-
| 45 || 2003 || 仙台　||　||　宮澤　陽夫
|-
| 46 || 2004 || 熊本　||　||　堀内　正公
|-
| 47 || 2005 || 金沢　||　西島　正弘　||　吉本　谷博
|-
| 48 || 2006 || 東京　||　||　工藤　一郎
|-
| 49 || 2007 || 札幌　||　||　五十嵐　靖之
|-
| 50 || 2008 || 徳島　||　||　徳村　彰
|-
| 51 || 2009 || 名古屋　||　||　横山　信治
|-
| 52 || 2010 || 群馬　||　||　和泉　孝志
|-
| 53 || 2011 || 東京　||　和泉　孝志　||　平林　義雄
|-
| 54 || 2012 || 福岡　||　||　伊藤　信
|-
| 55 || 2013 || 宮城　||　||　青木　淳賢
|-
| 56 || 2014 || 大阪　||　||　岩森　正男
|-
| 57 || 2015 || 東京　||　||　新井　洋由
|-
| 58 || 2016 || 秋田　||　||　石井　聡
|-
| 59 || 2017 || 京都　||　新井　洋由　||　梅田　眞郷
|-
| 60 || 2018 || 東京　||　||　深見　希代子
|-
| 61 || 2019 || 札幌 ||　梅田　眞郷* || 木原　章雄
|}

<gallery>
Image:History-安田守雄.png | 安田守雄先生 1981年3月4日ご逝去
Image:History-原一郎.png | 原一郎先生 1991年3月8日ご逝去
Image:History-堀太郎.png | 堀太郎先生　1995年1月3日ご逝去
Image:History-高橋善彌太.png | 高橋善彌太先生 1996年4月14日ご逝去
Image:History-山添三郎.png | 山添三郎先生　2007年1月15日ご逝去
Image:History-山川民夫.png | 山川民夫先生 2018年10月7日ご逝去
</gallery>
（* ... 新井のPMDAセンター長就任に伴い交代。2020迄）

==事務局の変遷==
{|
|-
|１９６１～１９６８　|| 東大農学部舟橋研　|| 会長　安田守雄
|-
|１９６９～１９７５　|| 東大医学部血清学教室（原一郎先生）　|| 会長　安田守雄
|-
| １９７６～１９９２　|| 帝京大学医学部生化学教室（植田伸夫先生） || 会長　原　一郎
|-
| || || 会長　山川民夫
|-
| １９９３～２００４ || 日本学会事務センター ||会長　野島庄七
|-
| || || 会長　脊山洋右
|-
| ２００５～２０１０ || コングレ||会長　西島正弘
|-
| ２０１１～２０１６ || コングレ(2011), 春恒社(2012-) || 会長　和泉孝志
|-
| ２０１７～　　　　 || 春恒社 || 会長　新井洋由
|}

==国際学会の開催==
[[Image:History-会員数.png|会員数・参加者数・演題数の推移|thumb]]
[[Image:History-会計.png|会計推移|thumb]]

* １９８８年　　第２９回ICBL東京　（野島庄七）
* １９８８年　　第３回臨床研コンファランス　（山川民夫））
* １９８９年　　第３回国際PAF会議（野島庄七）
* １９９６年　　糖脂質・スフィンゴ糖脂質に関するゴードン会議　（永井克孝）
* ２００１年　　第７回国際PAF会議：PLM2001　（和久敬蔵）
* ２００１年　　武田シンポジウム　（野島、井上、西島）
* ２００４年　　糖脂質・スフィンゴ糖脂質に関するゴードン会議　（鈴木明身）
* ２００６年　　FASEB Summer Research Conferences　（工藤一郎）
* ２００９年　　第４回 Phospholipse A2 and Lipid Mediators　（新井洋由）
* ２０１２年　　糖脂質・スフィンゴ糖脂質に関するゴードン会議　(五十嵐靖之）
* ２０１５年　　第６回 Phospholipse A2 and Lipid Mediators　（村上　誠）
* ２０１９年　　第６０回ICBL東京（有田　誠）

==研究費の獲得==
* １９５９年　文部省科研費で総合研究“リン脂質の酵素化学的研究”
* 平成９年～１４年　科学技術庁総合研究　「生体膜脂質の新しい機能の解析技術と制御技術の開発に関する研究」　総額８億円　２４人
* 平成１２年～１６年　文科省特定領域研究「スフィンゴ脂質による生体膜ドメイン形成と多機能シグナリング」
* 平成１７年～２２年　JSTさきがけ「代謝と機能」
* 平成２２年〜２７年　文部科学省科学研究費補助金新学術領域研究「生命応答を制御する脂質マシナリー」
* 平成２７年〜３２年　文部科学省科学研究費補助金新学術領域研究「脂質クオリティが解き明かす生命現象」
* 平成２７年～　JST 戦略的創造研究推進事業及び AMED 革新的先端研究開発支援事業「画期的医薬品等の創出をめざす脂質の生理活性と機能の解明」

===脂質データベース関連===
* 平成２２年～２６年　日本学術振興会科研費研究成果公開促進費「生理活性脂質データベース LipidBank」（５年）
* 平成２７年～２８年　日本学術振興会科研費研究成果公開促進費「生理活性脂質データベース LipidBank」（単年）
* 平成２８年～２９年　日本学術振興会科研費研究成果公開促進費「生理活性脂質データベース LipidBank」（単年）

Lipidbank wiki:About

2025-06-03T01:18:54Z

Editor: Redirected page to JCBL:DBmeeting

#REDIRECT [[JCBL:DBmeeting]]

Category:LB

2025-06-03T01:17:24Z

Editor:

{{Huge|LipidBank Database}}
{{LB/Header}}
{{Twocolumn|
LipidBank Database is an official data resource of [https://web.jcbl.jp/ JCBL] (Japanese Conference of Biochemistry of Lipids) under the CC-BY4.0 license.
Database contents are curated by [[JCBL:DBmeeting|a committee under JCBL]]. For citing this resource, please use the following information. [[Image:Cc-by.png|100px]]
|
LipidBankデータベースは、CC-BY4.0ライセンスで公開する [https://web.jcbl.jp/ 日本脂質生化学会] の公式データベースです。内容はJCBLの[[JCBL:DBmeeting|構築委員会]]によって管理されています。
引用には以下の文献を利用してください。
}}
; References
* History: Yasugi E, Seyama Y "Lipid database "LipidBank" and international collaboration" Tanpakushitsu Kakusan Koso. 52(11), 1357-1362, 2007 (in Japanese; 日本語)
* Usage: Yasugi E, Watanabe K "LIPIDBANK for Web, the newly developed lipid database" Tanpakushitsu Kakusan Koso. 47(7), 837-841, 2002 (in Japanese; 日本語)
* Glycolipid: Watanabe K., Yasugi E. and Oshima M. "How to search the glycolipid data in LIPIDBANK for Web: the newly developed lipid database" Japan Trend Glycosci. and Glycotechnol. 12, 175-184, 2000
* LipidBank History & Committee page [[JCBL:DBmeeting]]

; Related projects
* [https://lipidbank.jp/ Original LipidBank classification]

<center>
{| class="wikitable"
|-
! colspan="3" | LipidBank Class Overview
|-
| align="left" style="vertical-align:top" width=33%|
[[:Category:LBF|LBF: Fatty acyls 脂肪酸アシル]]
 [[Image:LBF.png|100px]] 

;Links to the original LipidBank
:[https://lipidbank.jp/DFA.html fatty acids]
:[https://lipidbank.jp/DLL.html long-chain alcohol]
:[https://lipidbank.jp/DLD.html long-chain aldehyde]
:[https://lipidbank.jp/XPR.html eicosanoids]
:[https://lipidbank.jp/OPO.html lipid peroxide]
:[https://lipidbank.jp/WWA.html wax]
:[https://lipidbank.jp/MMA.html mycolic acid]

| align="left" style="vertical-align:top" width=33%|
[[:Category:LBG|LBG: Glycerolipids グリセロ脂質]]
 [[Image:LBG.png|100px]] 

* [[:Category:LBGA|LBGA: Archaeal Lipid (Ether-type) 古細菌の脂質]]

;Links to the original LipidBank
:[https://lipidbank.jp/NAG.html acylglycerols]
:[https://lipidbank.jp/PGP.html glycerophospholipid]
:[https://lipidbank.jp/EEA.html ether-type lipid]
:[https://lipidbank.jp/GGG.html glycoglycerolipid]

| align="left" style="vertical-align:top" width=33%|
[[:Category:LBS|LBS: Sphingolipids スフィンゴ脂質]] (new)
 [[Image:LBS.png|110px]] 

* [[:Category:LBSB|LBSB: long-chain base and ceramide]]
* [[:Category:LBSC|LBSC: cerebroside]]
* [[:Category:LBSG|LBSG: acidic glycosphingolipid]]
* [[:Category:LBSP|LBSP: phospho-sphingolipid]]

|-
| style="vertical-align:top"| Sterol Lipids
 [[File:Cholestane.png]] 
;Links to the original LipidBank
:[https://lipidbank.jp/SST.html steroid]
:[https://lipidbank.jp/BBA.html bile acid]
:[https://lipidbank.jp/VVD.html vitamin D]

| style="vertical-align:top"| Prenol Lipids
 <BIG>(</BIG> [[File:Isoprene.png]]<BIG>)</BIG>n 
;Links to the original LipidBank
:[https://lipidbank.jp/IIP.html isoprenoid]
:[https://lipidbank.jp/VCA.html carotenoid]
:[https://lipidbank.jp/VVA.html vitamin A]
:[https://lipidbank.jp/VVK.html vitamin K]
:[https://lipidbank.jp/VCQ.html coenzyme Q]

| style="vertical-align:top"| Others

;Links to the original LipidBank
:[https://lipidbank.jp/CLS.html lipopolysaccharide]
:[https://lipidbank.jp/ALA.html lipoamino acid]
:[https://lipidbank.jp/TLP.html lipoprotein]
:[https://lipidbank.jp/VVE.html vitamin E]
:[https://lipidbank.jp/NAG.html acylglycerols]

|}
</center>

{{Twocolumn|
Biogenic substances insoluble to water are collectively called as '''lipid'''. Lipid is generally classified into the following three types.
* '''Simple lipid''' ... fatty acid esters of alchohol such as glycerol and sphingoid base.
* '''Complex lipid''' ... glycosylated or phosphorylated version of the simple lipid.
* '''Derived lipid''' ... alcohols and fatty acids derived by hydrolyzing the simple lipid. Also includes sterols and polyketides.
|
水に溶けない生体成分を一般に脂質と呼び、以下の3つに分けられます。
* '''単純脂質''' ... アルコールと脂肪酸のエステルで、スフィンゴ骨格とグリセロ骨格のものに大別されます。
* '''複合脂質''' ... 単純脂質にリン酸や糖がついたものです。
* '''誘導脂質''' ... 単純脂質を分解して得られるアルコール、脂肪酸。ステロールやポリケチドもここに含めます。
}}

File:Cc-by.png

2025-06-03T01:16:09Z

Editor:

Category:LB

2025-06-03T01:12:31Z

Editor:

{{Huge|LipidBank Database}}
{{LB/Header}}
{{Twocolumn|
LipidBank Database is an official data resource of [https://web.jcbl.jp/ JCBL] (Japanese Conference of Biochemistry of Lipids) under the CC-BY4.0 license.
Database contents are curated by [[JCBL:DBmeeting|a committee under JCBL]]. For citing this resource, please use the following information.
|
LipidBankデータベースは、CC-BY4.0ライセンスで公開する [https://web.jcbl.jp/ 日本脂質生化学会] の公式データベースです。内容はJCBLの[[JCBL:DBmeeting|構築委員会]]によって管理されています。
引用には以下の文献を利用してください。
}}
; References
* History: Yasugi E, Seyama Y "Lipid database "LipidBank" and international collaboration" Tanpakushitsu Kakusan Koso. 52(11), 1357-1362, 2007 (in Japanese; 日本語)
* Usage: Yasugi E, Watanabe K "LIPIDBANK for Web, the newly developed lipid database" Tanpakushitsu Kakusan Koso. 47(7), 837-841, 2002 (in Japanese; 日本語)
* Glycolipid: Watanabe K., Yasugi E. and Oshima M. "How to search the glycolipid data in LIPIDBANK for Web: the newly developed lipid database" Japan Trend Glycosci. and Glycotechnol. 12, 175-184, 2000
* LipidBank History & Committee page [[JCBL:DBmeeting]]

; Related projects
* [https://lipidbank.jp/ Original LipidBank classification]

<center>
{| class="wikitable"
|-
! colspan="3" | LipidBank Class Overview
|-
| align="left" style="vertical-align:top" width=33%|
[[:Category:LBF|LBF: Fatty acyls 脂肪酸アシル]]
 [[Image:LBF.png|100px]] 

;Links to the original LipidBank
:[https://lipidbank.jp/DFA.html fatty acids]
:[https://lipidbank.jp/DLL.html long-chain alcohol]
:[https://lipidbank.jp/DLD.html long-chain aldehyde]
:[https://lipidbank.jp/XPR.html eicosanoids]
:[https://lipidbank.jp/OPO.html lipid peroxide]
:[https://lipidbank.jp/WWA.html wax]
:[https://lipidbank.jp/MMA.html mycolic acid]

| align="left" style="vertical-align:top" width=33%|
[[:Category:LBG|LBG: Glycerolipids グリセロ脂質]]
 [[Image:LBG.png|100px]] 

* [[:Category:LBGA|LBGA: Archaeal Lipid (Ether-type) 古細菌の脂質]]

;Links to the original LipidBank
:[https://lipidbank.jp/NAG.html acylglycerols]
:[https://lipidbank.jp/PGP.html glycerophospholipid]
:[https://lipidbank.jp/EEA.html ether-type lipid]
:[https://lipidbank.jp/GGG.html glycoglycerolipid]

| align="left" style="vertical-align:top" width=33%|
[[:Category:LBS|LBS: Sphingolipids スフィンゴ脂質]] (new)
 [[Image:LBS.png|110px]] 

* [[:Category:LBSB|LBSB: long-chain base and ceramide]]
* [[:Category:LBSC|LBSC: cerebroside]]
* [[:Category:LBSG|LBSG: acidic glycosphingolipid]]
* [[:Category:LBSP|LBSP: phospho-sphingolipid]]

|-
| style="vertical-align:top"| Sterol Lipids
 [[File:Cholestane.png]] 
;Links to the original LipidBank
:[https://lipidbank.jp/SST.html steroid]
:[https://lipidbank.jp/BBA.html bile acid]
:[https://lipidbank.jp/VVD.html vitamin D]

| style="vertical-align:top"| Prenol Lipids
 <BIG>(</BIG> [[File:Isoprene.png]]<BIG>)</BIG>n 
;Links to the original LipidBank
:[https://lipidbank.jp/IIP.html isoprenoid]
:[https://lipidbank.jp/VCA.html carotenoid]
:[https://lipidbank.jp/VVA.html vitamin A]
:[https://lipidbank.jp/VVK.html vitamin K]
:[https://lipidbank.jp/VCQ.html coenzyme Q]

| style="vertical-align:top"| Others

;Links to the original LipidBank
:[https://lipidbank.jp/CLS.html lipopolysaccharide]
:[https://lipidbank.jp/ALA.html lipoamino acid]
:[https://lipidbank.jp/TLP.html lipoprotein]
:[https://lipidbank.jp/VVE.html vitamin E]
:[https://lipidbank.jp/NAG.html acylglycerols]

|}
</center>

{{Twocolumn|
Biogenic substances insoluble to water are collectively called as '''lipid'''. Lipid is generally classified into the following three types.
* '''Simple lipid''' ... fatty acid esters of alchohol such as glycerol and sphingoid base.
* '''Complex lipid''' ... glycosylated or phosphorylated version of the simple lipid.
* '''Derived lipid''' ... alcohols and fatty acids derived by hydrolyzing the simple lipid. Also includes sterols and polyketides.
|
水に溶けない生体成分を一般に脂質と呼び、以下の3つに分けられます。
* '''単純脂質''' ... アルコールと脂肪酸のエステルで、スフィンゴ骨格とグリセロ骨格のものに大別されます。
* '''複合脂質''' ... 単純脂質にリン酸や糖がついたものです。
* '''誘導脂質''' ... 単純脂質を分解して得られるアルコール、脂肪酸。ステロールやポリケチドもここに含めます。
}}

Category:LB

2025-06-03T01:10:16Z

Editor:

{{Huge|LipidBank Database}}
{{LB/Header}}
{{Twocolumn|
LipidBank Database is an official data resource of [https://web.jcbl.jp/ JCBL] (Japanese Conference of Biochemistry of Lipids) under the CC-BY license.
Database contents are curated by [[JCBL:DBmeeting|a committee under JCBL]]. For citing this resource, please use the following information.
|
LipidBankデータベースは、CC-BYライセンスで公開する [https://web.jcbl.jp/ 日本脂質生化学会] の公式データベースです。内容はJCBLの[[JCBL:DBmeeting|構築委員会]]によって管理されています。
引用には以下の文献を利用してください。
}}
; References
* History: Yasugi E, Seyama Y "Lipid database "LipidBank" and international collaboration" Tanpakushitsu Kakusan Koso. 52(11), 1357-1362, 2007 (in Japanese; 日本語)
* Usage: Yasugi E, Watanabe K "LIPIDBANK for Web, the newly developed lipid database" Tanpakushitsu Kakusan Koso. 47(7), 837-841, 2002 (in Japanese; 日本語)
* Glycolipid: Watanabe K., Yasugi E. and Oshima M. "How to search the glycolipid data in LIPIDBANK for Web: the newly developed lipid database" Japan Trend Glycosci. and Glycotechnol. 12, 175-184, 2000
* LipidBank History & Committee page [[JCBL:DBmeeting]]

; Related projects
* [https://lipidbank.jp/ Original LipidBank classification]

<center>
{| class="wikitable"
|-
! colspan="3" | LipidBank Class Overview
|-
| align="left" style="vertical-align:top" width=33%|
[[:Category:LBF|LBF: Fatty acyls 脂肪酸アシル]]
 [[Image:LBF.png|100px]] 

;Links to the original LipidBank
:[https://lipidbank.jp/DFA.html fatty acids]
:[https://lipidbank.jp/DLL.html long-chain alcohol]
:[https://lipidbank.jp/DLD.html long-chain aldehyde]
:[https://lipidbank.jp/XPR.html eicosanoids]
:[https://lipidbank.jp/OPO.html lipid peroxide]
:[https://lipidbank.jp/WWA.html wax]
:[https://lipidbank.jp/MMA.html mycolic acid]

| align="left" style="vertical-align:top" width=33%|
[[:Category:LBG|LBG: Glycerolipids グリセロ脂質]]
 [[Image:LBG.png|100px]] 

* [[:Category:LBGA|LBGA: Archaeal Lipid (Ether-type) 古細菌の脂質]]

;Links to the original LipidBank
:[https://lipidbank.jp/NAG.html acylglycerols]
:[https://lipidbank.jp/PGP.html glycerophospholipid]
:[https://lipidbank.jp/EEA.html ether-type lipid]
:[https://lipidbank.jp/GGG.html glycoglycerolipid]

| align="left" style="vertical-align:top" width=33%|
[[:Category:LBS|LBS: Sphingolipids スフィンゴ脂質]] (new)
 [[Image:LBS.png|110px]] 

* [[:Category:LBSB|LBSB: long-chain base and ceramide]]
* [[:Category:LBSC|LBSC: cerebroside]]
* [[:Category:LBSG|LBSG: acidic glycosphingolipid]]
* [[:Category:LBSP|LBSP: phospho-sphingolipid]]

|-
| style="vertical-align:top"| Sterol Lipids
 [[File:Cholestane.png]] 
;Links to the original LipidBank
:[https://lipidbank.jp/SST.html steroid]
:[https://lipidbank.jp/BBA.html bile acid]
:[https://lipidbank.jp/VVD.html vitamin D]

| style="vertical-align:top"| Prenol Lipids
 <BIG>(</BIG> [[File:Isoprene.png]]<BIG>)</BIG>n 
;Links to the original LipidBank
:[https://lipidbank.jp/IIP.html isoprenoid]
:[https://lipidbank.jp/VCA.html carotenoid]
:[https://lipidbank.jp/VVA.html vitamin A]
:[https://lipidbank.jp/VVK.html vitamin K]
:[https://lipidbank.jp/VCQ.html coenzyme Q]

| style="vertical-align:top"| Others

;Links to the original LipidBank
:[https://lipidbank.jp/CLS.html lipopolysaccharide]
:[https://lipidbank.jp/ALA.html lipoamino acid]
:[https://lipidbank.jp/TLP.html lipoprotein]
:[https://lipidbank.jp/VVE.html vitamin E]
:[https://lipidbank.jp/NAG.html acylglycerols]

|}
</center>

{{Twocolumn|
Biogenic substances insoluble to water are collectively called as '''lipid'''. Lipid is generally classified into the following three types.
* '''Simple lipid''' ... fatty acid esters of alchohol such as glycerol and sphingoid base.
* '''Complex lipid''' ... glycosylated or phosphorylated version of the simple lipid.
* '''Derived lipid''' ... alcohols and fatty acids derived by hydrolyzing the simple lipid. Also includes sterols and polyketides.
|
水に溶けない生体成分を一般に脂質と呼び、以下の3つに分けられます。
* '''単純脂質''' ... アルコールと脂肪酸のエステルで、スフィンゴ骨格とグリセロ骨格のものに大別されます。
* '''複合脂質''' ... 単純脂質にリン酸や糖がついたものです。
* '''誘導脂質''' ... 単純脂質を分解して得られるアルコール、脂肪酸。ステロールやポリケチドもここに含めます。
}}

JCBL:DBmeeting

2025-05-28T01:46:22Z

Editor: /* Members of Executive Committee of Lipid Database (脂質データベース構築委員会メンバー） */

==About LipidBank==

{{Twocolumn|
"LipidBank" is an open, publicly free database of natural lipids including fatty acids, glycerolipids, sphingolipids, steroids, and various vitamins.

The database contains more than 6000 unique molecular structures (ChemDraw cdx format, MDL MOL format), their lipid names (common name, IUPAC), spectral information (mass, UV, IR, NMR and others), and most importantly, literature information.

The database lists natural lipids only, and all molecular information is manually curated and approved by experts in lipid research (see Informant in each record).

LipidBank is the official database of the Japanese Conference on the Biochemistry of Lipids (JCBL).

 '''Reference:''' 
Watanabe K., Yasugi E. and Oshima M. "How to search the glycolipid data in LIPIDBANK for Web: the newly developed lipid database in Japan" Trend Glycosci. and Glycotechnol. 12, 175-184, 2000. ([https://www.jstage.jst.go.jp/article/tigg1989/12/65/12_65_175/_article/-char/ja/ PDF])
|
LipidBankは、脂肪酸、グリセロ脂質、スフィンゴ脂質、ステロイド、各種ビタミンを含む天然脂質の公開データベースです。 

現在6000以上の天然物構造（ChemDraw cdx形式、MDL MOL形式）について、物質名（慣用名とIUPAC）、スペクトル情報（質量、UV, IR, NMRほか）に加えて、文献情報も掲載しています。 

このデータベースは天然物を対象としており、全データについて監修者がチェックしています。LipidBankは日本脂質生化学会の公式データベースです。 
 

文献： 
渡辺清博、八杉悦子、大島美恵子「糖脂質データを日本で新しく作成された生理活性脂質データベース[LIPIDBANK for Web]で検索してみよう」Trend Glycosci. and Glycotechnol. 12, 175-184, 2000.（[https://www.jstage.jst.go.jp/article/tigg1989/12/65/12_65_175/_article/-char/ja/ PDF]）
}}

==Bylaws==
<pre>
日本脂質生化学会脂質データベース構築委員会　規約

（名称）
第1条　本会を日本脂質生化学会脂質データベース構築委員会（以下、委員会という。）と称する。
（設置）
第2条　委員会は、日本脂質生化学会が設置する。
（目的）
第3条　委員会は、脂質データベース“LipidBank”の構築・維持・更新を目的とし、脂質データの集積・更新、データベースシステムの構築・維持、
ならびにこれらに関連する業務をおこなう。
（委員会）
第4条　委員会の委員は、脂質・バイオインフォマティクスに造詣の深い日本脂質生化学会会員で構成され、日本脂質生化学会会長が任命する。
　２　委員会には委員長を置くこととし、原則として日本脂質生化学会会長が兼務するが、委員の中から任命することができる。
　３　委員会に副委員長を置くことができ、日本脂質生化学会会長が任命する。
　４　委員会に顧問を置くことができ、日本脂質生化学会会長が任命する。
　５　顧問は委員会に出席し、意見を述べることができる。
（事務局）
第5条　委員会に、会務に関する事務をおこなうために事務局を置く。事務局長は委員長が指名する。
（雑則）
第6条　この規約に定めるもののほか、必要な事項は別に定める。

附則
本規約は、総会の承認を経て変更することができる。

（平成17年10月1日制定）
（平成29年6月15日改訂）
</pre>

==History (歴史)==
{{Twocolumn|
===LIPID INFORMATION SERVICE (LIPIDBANK) (1984? - 1997)===
The project was started as a database in Japanese around 1984 with Grant-in-Aid for scientific research publication (Akira Hayashi). This database was succeeded in 1989 under the
committee of lipid information (President: Yoshitaka Nagai), organized by the members of The Japanese Conference on the Biochemistry of Lipids (JCBL). The actual construction of the database was managed by the JCBL committee of database construction (President: Akira Hayashi, Vice-president: Nobuo Ueta, Secretary: Kiyohiro Watanabe).

The database included 16 lipid classes: fatty acid, long chain aldehyde, long chain alcohol, long chain base, bile acid, glyceride, phospholipid, glycolipid, lipoprotein, lipopolysaccharide, steroid, prostanoid, ether type lipid, mycolic acid and wax.

Each record contained lipid name, biological activity, source, references, structure and spectra. About 2,700 records were collected and saved on floppy discs.
|
===脂質情報データベース (1984? - 1997)===
LipidBankの淵源は、1984年頃に獲得された科学研究費補助金（研究成果刊行費、代表者：林陽）により構築が開始された日本語のデータベース「脂質情報データベース」である。1989年に、このデータベースは日本脂質生化学会（JCBL）により構成された脂質情報作成委員会（委員長：永井克孝）が立ち上げたプロジェクトに引き継がれ、構築が本格化した。実務は脂質情報データベース構築委員会（委員長：林陽、副委員長：植田伸夫、システム構築と入力：渡邊清博）が担った。 

このデータベースは、脂質を16種類に分類して集積された（脂肪酸、長鎖アルデヒド、長鎖アルコール、長鎖塩基、胆汁酸、グリセリド、リン脂質、糖脂質、リポタンパク質、リポ多糖、ステロイド、プロスタノイド、エーテル型脂質、ミコール酸、ワックスなど）。 

各脂質の名称、生理活性、分布、文献、化学構造、スペクトルデータなどの情報が記載された。約2,700件のデータが集積され、フロッピーディスクで配布された。
}}

{{Twocolumn|
===LIPIDBANK for Web (1996 - 1999)===
The initial three-year project started as a joint research between the International Medical Center of Japan (current National Center for Global Health and Medicine) ([http://www.ncgm.go.jp/ NCGM]) and the Japan Science and Technology Corporation ([http://www.jst.go.jp/ JST]).

A new executive committee was organized (President: Shoshichi Nojima, Vice-president: Mieko Oshima, Secretary: Kiyohiro Watanabe and Etsuko Yasugi).

The committee decided to collect the data on 27 lipid classes in English. Molecules in each class were collected independently under 27 team leaders and 122 data informants.

The database became publicly available from October 1999. The database server was placed at the University of Tokyo where the office of JCBL was located. The total number of molecules was about 5400.

|
===生理活性脂質データベース (1996 - 1999)===

3年間の本プロジェクトは、国立国際医療センター（現：国立国際医療研究センター）([http://www.ncgm.go.jp/ NCGM]) と科学技術振興機構 ([http://www.jst.go.jp/ JST]) との共同研究として発足した。

新たに生理活性脂質データベース構築検討会(委員長：野島庄七、副委員長：大島美恵子、データ入力：渡邊清博、八杉悦子）が結成された。

脂質を27種類に分類して、それぞれの脂質化合物データを英語で集積した。脂質分野ごとに、各脂質を専門とする27名のデータベース構築責任者をおき、122名のデータ提供者によりデータが収載された。

1999年秋にJCBLの事務局があった東京大学にサーバーを設置し、インターネット上に公開された。5,400件の脂質化合物データが収録された。
}}

{{Twocolumn|
===Updating LIPIDBANK for Web (1999 - 2005)===
After adding one lipid class (lipid peroxides), 28 lipid classes were reorganized into 17 lipid groups.

The DERIVED LIPIDS group now includes fatty acid, long chain alcohol, long chain aldehyde, and long chain base and ceramide. The FAT-SOLUBLE VITAMIN group includes carotenoid, coenzyme Q, vitamin A, vitamin D, vitamin E, and vitamin K. The GLYCOLIPID group includes glycosphingolipid, glycoglycerolipid and others. The PHOSPHOLIPID group includes glycerophospholipid, PAF, and sphingophospholipid.

In 2004, JCBL officially established an executive committee (President: Yousuke Seyama, Secretary: Etsuko Yasugi) for updating the database.

|
===生理活性脂質データベースの維持・更新(1999 - 2005)===
新たに過酸化脂質の項目を加えて、17種類の脂質グループに分類して、28種類の脂質化合物について、データ集積をおこなった。

誘導脂質には、脂肪酸、長鎖アルコール、長鎖アルデヒド、長鎖塩基とセラミドが含まれる。脂溶性ビタミンは、カロテノイド、コエンザイムQ、ビタミンA、D、E、Kから構成されている。糖脂質にはスフィンゴ糖脂質とグリセロ糖脂質が、リン脂質にはグリセロリン脂質、PAF、スフィンゴリン脂質が含まれる。

2004年には、脂質データベース構築委員会（委員長：脊山洋右、データ入力：八杉悦子）がJCBLから公認された。
}}

{{Twocolumn|
===Renovating LIPIDBANK for Web (2006-2007)===
LIPIDBANK for Web became the official database of JCBL, to which all rights were delegated from NCGM and JST. The name of database changed to "LipidBank".

The Hopanoid group was removed and the number of category is now 16. The database system and its contents were updated and reorganized by the JCBL committee members (President: Masahiro Nishijima).

|
===生理活性脂質データベースの刷新(2006 - 2007)===
生理活性脂質データベースは2006年にNCGMとJSTから譲渡され、JCBL公認のデータベースとなった。データベースの名称を"LipidBank"と改めた。 

脂質項目のうちホパノイドを削除し、16種類の脂質グループとした。脂質データベース構築委員会（委員長：西島正弘）が、データベースのシステムと内容の維持・更新を担当。

}}

{{Twocolumn|
=== Linking with the Wiki version (2017-2022)===
With financial support from the AMED program "Studies on Specific Activities and Functions of Lipid Molecules to Develop Innovative Medical Technologies" (PS: YOKOYAMA Shinji), wiki-based database was updated for glycosphingolipid and others.

Categories in the original LipidBank were translated into static HTML pages due to security issues.
|
=== LipidBank Wiki との連携 (2017-2022)===
AMED革新的先端研究開発支援事業「画期的医薬品等の創出をめざす脂質の生理活性と機能の解明」（総括：横山信治）より支援を受け、スフィンゴ糖脂質を中心に情報を整理、更新。

旧LipidBankの各カテゴリーはセキュリティ脆弱性のためにコンテンツをHTML固定ページに変換。
}}

===Contact Address===
{{Twocolumn|
If you have questions or suggestions, please contact with:

::Masanori Arita
:::arita@nig.ac.jp
::National Institute of Genetics
|
ご意見やご質問は、下記へお寄せください。
 
::有田正規
:::arita@nig.ac.jp
::国立遺伝学研究所
}}

==Members of Executive Committee of Lipid Database (脂質データベース構築委員会メンバー）==
2025年 5月 27日
<center>
{| class="wikitable"
|-
! colspan="3" style="text-align:center"| 委員長: 青木淳賢 (Junken Aoki)
|-
| colspan="3" style="text-align:center"| 副委員長: 有田　正規 (Masanori Arita), 横山　和明 (Kazuaki Yokoyama)
|-
! colspan="3" style="text-align:center"| 委員
|-
| 有田　誠 (Makoto Arita) || 石川寿樹 (Toshiki Ishikawa) ||
|-
| 糸乗　前 (Saki Itonori) || 今井　博之 (Hiroyuki Imai) || 笠間　健嗣 (Takeshi Kasama)
|-
| 北　芳博 (Yoshihiro Kita) || 小林　哲幸 (Tetsuyuki Kobayashi) || 酒井　祥太 (Shota Sakai)
|-
| 中村　和生 (Kazuo Nakamura) || 八杉　悦子 (Etsuko Yasugi) ||
|-
! colspan="3" style="text-align:center"| 顧問
|-
| 大島　美恵子（Mieko Oshima) || 脊山　洋右（Yousuke Seyama) || 和泉　孝志 (Takashi Izumi)
|-
| 清水　孝雄 (Takao Shimizu) || 西島　正弘（Masahiro Nishijima）||
|}
</center>

==Funding (資金）==
{|
|-
|colspan="2"| <big>'''1989 - 1997'''</big>
|-
|LIPID INFORMATION SERVICE was funded by a Grant-in-Aid for Scientific Research (Grant-in-Aid for Publication of Scientific Research Results) from the Japan Society for the Promotion of Science.
|LIPID INFORMATION SERVICEが日本学術振興会([http://www.jsps.go.jp/ JSPS])科学研究費に採択される。
|-
|colspan="2"| <big>'''1996 - 2002'''</big>
|-
|LIPIDBANK for Web was funded by the Database Development Program of the Japan Science and Technology Agency (JST).
|LIPIDBANK for Webが科学技術振興機構([http://www.jst.go.jp/ JST])に採択される。
|-
|colspan="2"| <big>'''2003 - 2006''', '''2009 - 2016'''</big>
|-
|LIPIDBANK for Web was funded by a Grant-in-Aid for Scientific Research (Grant-in-Aid for Publication of Scientific Research Results) from the Japan Society for the Promotion of Science.
|日本学術振興会([http://www.jsps.go.jp/ JSPS])科学研究費の研究成果公開促進費データベース事業による更新。
|-
|colspan="2"| <big>'''2017 - 2022'''</big>
|-
|LIPIDBANK was funded by AMED-CREST in "Studies on Specific Activities and Functions of Lipid Molecules to Develop Innovative Medical Technologies".
|AMED革新的先端研究開発支援事業「画期的医薬品等の創出をめざす脂質の生理活性と機能の解明」（総括：横山信治）による更新。
|}

==構築委員会の歴史==
{| class="wikitable"
|-
| 第1回 || 1997年1月8日 || 国立国際医療センター研究所 || 生理活性脂質データベース構築委員会
|-
| 第10回 || 2004年3月25日 ||学士会分館 || 脂質情報データベース推進委員会
|-
| 第20回 || 2007年3月8日 || 東京大学　医学部 || 脂質データベース構築委員会
|-
| 第30回 || 2015年5月29日 || 東京大学　薬学部 || 脂質データベース構築委員会
|-
| 第34回 || 2019年7月5日 || 北海道大学 || 脂質データベース構築委員会
|-
|colspan="4"| 2020-2022 年はCOVID-19のために中止。
|-
| 第37回 || 2025年5月27日 || オンライン || 脂質データベース構築委員会
|}

JCBL:DBmeeting

2025-05-27T07:02:52Z

Editor: /* Members of Executive Committee of Lipid Database (脂質データベース構築委員会メンバー） */

==About LipidBank==

{{Twocolumn|
"LipidBank" is an open, publicly free database of natural lipids including fatty acids, glycerolipids, sphingolipids, steroids, and various vitamins.

The database contains more than 6000 unique molecular structures (ChemDraw cdx format, MDL MOL format), their lipid names (common name, IUPAC), spectral information (mass, UV, IR, NMR and others), and most importantly, literature information.

The database lists natural lipids only, and all molecular information is manually curated and approved by experts in lipid research (see Informant in each record).

LipidBank is the official database of the Japanese Conference on the Biochemistry of Lipids (JCBL).

 '''Reference:''' 
Watanabe K., Yasugi E. and Oshima M. "How to search the glycolipid data in LIPIDBANK for Web: the newly developed lipid database in Japan" Trend Glycosci. and Glycotechnol. 12, 175-184, 2000. ([https://www.jstage.jst.go.jp/article/tigg1989/12/65/12_65_175/_article/-char/ja/ PDF])
|
LipidBankは、脂肪酸、グリセロ脂質、スフィンゴ脂質、ステロイド、各種ビタミンを含む天然脂質の公開データベースです。 

現在6000以上の天然物構造（ChemDraw cdx形式、MDL MOL形式）について、物質名（慣用名とIUPAC）、スペクトル情報（質量、UV, IR, NMRほか）に加えて、文献情報も掲載しています。 

このデータベースは天然物を対象としており、全データについて監修者がチェックしています。LipidBankは日本脂質生化学会の公式データベースです。 
 

文献： 
渡辺清博、八杉悦子、大島美恵子「糖脂質データを日本で新しく作成された生理活性脂質データベース[LIPIDBANK for Web]で検索してみよう」Trend Glycosci. and Glycotechnol. 12, 175-184, 2000.（[https://www.jstage.jst.go.jp/article/tigg1989/12/65/12_65_175/_article/-char/ja/ PDF]）
}}

==Bylaws==
<pre>
日本脂質生化学会脂質データベース構築委員会　規約

（名称）
第1条　本会を日本脂質生化学会脂質データベース構築委員会（以下、委員会という。）と称する。
（設置）
第2条　委員会は、日本脂質生化学会が設置する。
（目的）
第3条　委員会は、脂質データベース“LipidBank”の構築・維持・更新を目的とし、脂質データの集積・更新、データベースシステムの構築・維持、
ならびにこれらに関連する業務をおこなう。
（委員会）
第4条　委員会の委員は、脂質・バイオインフォマティクスに造詣の深い日本脂質生化学会会員で構成され、日本脂質生化学会会長が任命する。
　２　委員会には委員長を置くこととし、原則として日本脂質生化学会会長が兼務するが、委員の中から任命することができる。
　３　委員会に副委員長を置くことができ、日本脂質生化学会会長が任命する。
　４　委員会に顧問を置くことができ、日本脂質生化学会会長が任命する。
　５　顧問は委員会に出席し、意見を述べることができる。
（事務局）
第5条　委員会に、会務に関する事務をおこなうために事務局を置く。事務局長は委員長が指名する。
（雑則）
第6条　この規約に定めるもののほか、必要な事項は別に定める。

附則
本規約は、総会の承認を経て変更することができる。

（平成17年10月1日制定）
（平成29年6月15日改訂）
</pre>

==History (歴史)==
{{Twocolumn|
===LIPID INFORMATION SERVICE (LIPIDBANK) (1984? - 1997)===
The project was started as a database in Japanese around 1984 with Grant-in-Aid for scientific research publication (Akira Hayashi). This database was succeeded in 1989 under the
committee of lipid information (President: Yoshitaka Nagai), organized by the members of The Japanese Conference on the Biochemistry of Lipids (JCBL). The actual construction of the database was managed by the JCBL committee of database construction (President: Akira Hayashi, Vice-president: Nobuo Ueta, Secretary: Kiyohiro Watanabe).

The database included 16 lipid classes: fatty acid, long chain aldehyde, long chain alcohol, long chain base, bile acid, glyceride, phospholipid, glycolipid, lipoprotein, lipopolysaccharide, steroid, prostanoid, ether type lipid, mycolic acid and wax.

Each record contained lipid name, biological activity, source, references, structure and spectra. About 2,700 records were collected and saved on floppy discs.
|
===脂質情報データベース (1984? - 1997)===
LipidBankの淵源は、1984年頃に獲得された科学研究費補助金（研究成果刊行費、代表者：林陽）により構築が開始された日本語のデータベース「脂質情報データベース」である。1989年に、このデータベースは日本脂質生化学会（JCBL）により構成された脂質情報作成委員会（委員長：永井克孝）が立ち上げたプロジェクトに引き継がれ、構築が本格化した。実務は脂質情報データベース構築委員会（委員長：林陽、副委員長：植田伸夫、システム構築と入力：渡邊清博）が担った。 

このデータベースは、脂質を16種類に分類して集積された（脂肪酸、長鎖アルデヒド、長鎖アルコール、長鎖塩基、胆汁酸、グリセリド、リン脂質、糖脂質、リポタンパク質、リポ多糖、ステロイド、プロスタノイド、エーテル型脂質、ミコール酸、ワックスなど）。 

各脂質の名称、生理活性、分布、文献、化学構造、スペクトルデータなどの情報が記載された。約2,700件のデータが集積され、フロッピーディスクで配布された。
}}

{{Twocolumn|
===LIPIDBANK for Web (1996 - 1999)===
The initial three-year project started as a joint research between the International Medical Center of Japan (current National Center for Global Health and Medicine) ([http://www.ncgm.go.jp/ NCGM]) and the Japan Science and Technology Corporation ([http://www.jst.go.jp/ JST]).

A new executive committee was organized (President: Shoshichi Nojima, Vice-president: Mieko Oshima, Secretary: Kiyohiro Watanabe and Etsuko Yasugi).

The committee decided to collect the data on 27 lipid classes in English. Molecules in each class were collected independently under 27 team leaders and 122 data informants.

The database became publicly available from October 1999. The database server was placed at the University of Tokyo where the office of JCBL was located. The total number of molecules was about 5400.

|
===生理活性脂質データベース (1996 - 1999)===

3年間の本プロジェクトは、国立国際医療センター（現：国立国際医療研究センター）([http://www.ncgm.go.jp/ NCGM]) と科学技術振興機構 ([http://www.jst.go.jp/ JST]) との共同研究として発足した。

新たに生理活性脂質データベース構築検討会(委員長：野島庄七、副委員長：大島美恵子、データ入力：渡邊清博、八杉悦子）が結成された。

脂質を27種類に分類して、それぞれの脂質化合物データを英語で集積した。脂質分野ごとに、各脂質を専門とする27名のデータベース構築責任者をおき、122名のデータ提供者によりデータが収載された。

1999年秋にJCBLの事務局があった東京大学にサーバーを設置し、インターネット上に公開された。5,400件の脂質化合物データが収録された。
}}

{{Twocolumn|
===Updating LIPIDBANK for Web (1999 - 2005)===
After adding one lipid class (lipid peroxides), 28 lipid classes were reorganized into 17 lipid groups.

The DERIVED LIPIDS group now includes fatty acid, long chain alcohol, long chain aldehyde, and long chain base and ceramide. The FAT-SOLUBLE VITAMIN group includes carotenoid, coenzyme Q, vitamin A, vitamin D, vitamin E, and vitamin K. The GLYCOLIPID group includes glycosphingolipid, glycoglycerolipid and others. The PHOSPHOLIPID group includes glycerophospholipid, PAF, and sphingophospholipid.

In 2004, JCBL officially established an executive committee (President: Yousuke Seyama, Secretary: Etsuko Yasugi) for updating the database.

|
===生理活性脂質データベースの維持・更新(1999 - 2005)===
新たに過酸化脂質の項目を加えて、17種類の脂質グループに分類して、28種類の脂質化合物について、データ集積をおこなった。

誘導脂質には、脂肪酸、長鎖アルコール、長鎖アルデヒド、長鎖塩基とセラミドが含まれる。脂溶性ビタミンは、カロテノイド、コエンザイムQ、ビタミンA、D、E、Kから構成されている。糖脂質にはスフィンゴ糖脂質とグリセロ糖脂質が、リン脂質にはグリセロリン脂質、PAF、スフィンゴリン脂質が含まれる。

2004年には、脂質データベース構築委員会（委員長：脊山洋右、データ入力：八杉悦子）がJCBLから公認された。
}}

{{Twocolumn|
===Renovating LIPIDBANK for Web (2006-2007)===
LIPIDBANK for Web became the official database of JCBL, to which all rights were delegated from NCGM and JST. The name of database changed to "LipidBank".

The Hopanoid group was removed and the number of category is now 16. The database system and its contents were updated and reorganized by the JCBL committee members (President: Masahiro Nishijima).

|
===生理活性脂質データベースの刷新(2006 - 2007)===
生理活性脂質データベースは2006年にNCGMとJSTから譲渡され、JCBL公認のデータベースとなった。データベースの名称を"LipidBank"と改めた。 

脂質項目のうちホパノイドを削除し、16種類の脂質グループとした。脂質データベース構築委員会（委員長：西島正弘）が、データベースのシステムと内容の維持・更新を担当。

}}

{{Twocolumn|
=== Linking with the Wiki version (2017-2022)===
With financial support from the AMED program "Studies on Specific Activities and Functions of Lipid Molecules to Develop Innovative Medical Technologies" (PS: YOKOYAMA Shinji), wiki-based database was updated for glycosphingolipid and others.

Categories in the original LipidBank were translated into static HTML pages due to security issues.
|
=== LipidBank Wiki との連携 (2017-2022)===
AMED革新的先端研究開発支援事業「画期的医薬品等の創出をめざす脂質の生理活性と機能の解明」（総括：横山信治）より支援を受け、スフィンゴ糖脂質を中心に情報を整理、更新。

旧LipidBankの各カテゴリーはセキュリティ脆弱性のためにコンテンツをHTML固定ページに変換。
}}

===Contact Address===
{{Twocolumn|
If you have questions or suggestions, please contact with:

::Masanori Arita
:::arita@nig.ac.jp
::National Institute of Genetics
|
ご意見やご質問は、下記へお寄せください。
 
::有田正規
:::arita@nig.ac.jp
::国立遺伝学研究所
}}

==Members of Executive Committee of Lipid Database (脂質データベース構築委員会メンバー）==
2025年 5月 27日
<center>
{| class="wikitable"
|-
! colspan="3" style="text-align:center"| 委員長: 青木淳賢 (Junken Aoki)
|-
| colspan="3" style="text-align:center"| 副委員長: 有田　正規 (Masanori Arita), 横山　和明 (Kazuaki Yokoyama)
|-
! colspan="3" style="text-align:center"| 委員
|-
| 有田　誠 (Makoto Arita) || 石川寿樹 (Toshiki Ishikawa) || 和泉孝志 (Takashi Izumi)
|-
| 糸乗　前 (Saki Itonori) || 今井　博之 (Hiroyuki Imai) || 笠間　健嗣 (Takeshi Kasama)
|-
| 北　芳博 (Yoshihiro Kita) || 小林　哲幸 (Tetsuyuki Kobayashi) || 酒井　祥太 (Shota Sakai)
|-
| 中村　和生 (Kazuo Nakamura) || 八杉　悦子 (Etsuko Yasugi) ||
|-
! colspan="3" style="text-align:center"| 顧問
|-
| 大島　美恵子（Mieko Oshima) || 脊山　洋右（Yousuke Seyama) || 和泉　孝志 (Takashi Izumi)
|-
| 清水　孝雄 (Takao Shimizu) || 西島　正弘（Masahiro Nishijima）||
|}
</center>

==Funding (資金）==
{|
|-
|colspan="2"| <big>'''1989 - 1997'''</big>
|-
|LIPID INFORMATION SERVICE was funded by a Grant-in-Aid for Scientific Research (Grant-in-Aid for Publication of Scientific Research Results) from the Japan Society for the Promotion of Science.
|LIPID INFORMATION SERVICEが日本学術振興会([http://www.jsps.go.jp/ JSPS])科学研究費に採択される。
|-
|colspan="2"| <big>'''1996 - 2002'''</big>
|-
|LIPIDBANK for Web was funded by the Database Development Program of the Japan Science and Technology Agency (JST).
|LIPIDBANK for Webが科学技術振興機構([http://www.jst.go.jp/ JST])に採択される。
|-
|colspan="2"| <big>'''2003 - 2006''', '''2009 - 2016'''</big>
|-
|LIPIDBANK for Web was funded by a Grant-in-Aid for Scientific Research (Grant-in-Aid for Publication of Scientific Research Results) from the Japan Society for the Promotion of Science.
|日本学術振興会([http://www.jsps.go.jp/ JSPS])科学研究費の研究成果公開促進費データベース事業による更新。
|-
|colspan="2"| <big>'''2017 - 2022'''</big>
|-
|LIPIDBANK was funded by AMED-CREST in "Studies on Specific Activities and Functions of Lipid Molecules to Develop Innovative Medical Technologies".
|AMED革新的先端研究開発支援事業「画期的医薬品等の創出をめざす脂質の生理活性と機能の解明」（総括：横山信治）による更新。
|}

==構築委員会の歴史==
{| class="wikitable"
|-
| 第1回 || 1997年1月8日 || 国立国際医療センター研究所 || 生理活性脂質データベース構築委員会
|-
| 第10回 || 2004年3月25日 ||学士会分館 || 脂質情報データベース推進委員会
|-
| 第20回 || 2007年3月8日 || 東京大学　医学部 || 脂質データベース構築委員会
|-
| 第30回 || 2015年5月29日 || 東京大学　薬学部 || 脂質データベース構築委員会
|-
| 第34回 || 2019年7月5日 || 北海道大学 || 脂質データベース構築委員会
|-
|colspan="4"| 2020-2022 年はCOVID-19のために中止。
|-
| 第37回 || 2025年5月27日 || オンライン || 脂質データベース構築委員会
|}

JCBL:DBmeeting

2025-05-27T06:41:04Z

Editor: /* 構築委員会の歴史 */

==About LipidBank==

{{Twocolumn|
"LipidBank" is an open, publicly free database of natural lipids including fatty acids, glycerolipids, sphingolipids, steroids, and various vitamins.

The database contains more than 6000 unique molecular structures (ChemDraw cdx format, MDL MOL format), their lipid names (common name, IUPAC), spectral information (mass, UV, IR, NMR and others), and most importantly, literature information.

The database lists natural lipids only, and all molecular information is manually curated and approved by experts in lipid research (see Informant in each record).

LipidBank is the official database of the Japanese Conference on the Biochemistry of Lipids (JCBL).

 '''Reference:''' 
Watanabe K., Yasugi E. and Oshima M. "How to search the glycolipid data in LIPIDBANK for Web: the newly developed lipid database in Japan" Trend Glycosci. and Glycotechnol. 12, 175-184, 2000. ([https://www.jstage.jst.go.jp/article/tigg1989/12/65/12_65_175/_article/-char/ja/ PDF])
|
LipidBankは、脂肪酸、グリセロ脂質、スフィンゴ脂質、ステロイド、各種ビタミンを含む天然脂質の公開データベースです。 

現在6000以上の天然物構造（ChemDraw cdx形式、MDL MOL形式）について、物質名（慣用名とIUPAC）、スペクトル情報（質量、UV, IR, NMRほか）に加えて、文献情報も掲載しています。 

このデータベースは天然物を対象としており、全データについて監修者がチェックしています。LipidBankは日本脂質生化学会の公式データベースです。 
 

文献： 
渡辺清博、八杉悦子、大島美恵子「糖脂質データを日本で新しく作成された生理活性脂質データベース[LIPIDBANK for Web]で検索してみよう」Trend Glycosci. and Glycotechnol. 12, 175-184, 2000.（[https://www.jstage.jst.go.jp/article/tigg1989/12/65/12_65_175/_article/-char/ja/ PDF]）
}}

==Bylaws==
<pre>
日本脂質生化学会脂質データベース構築委員会　規約

（名称）
第1条　本会を日本脂質生化学会脂質データベース構築委員会（以下、委員会という。）と称する。
（設置）
第2条　委員会は、日本脂質生化学会が設置する。
（目的）
第3条　委員会は、脂質データベース“LipidBank”の構築・維持・更新を目的とし、脂質データの集積・更新、データベースシステムの構築・維持、
ならびにこれらに関連する業務をおこなう。
（委員会）
第4条　委員会の委員は、脂質・バイオインフォマティクスに造詣の深い日本脂質生化学会会員で構成され、日本脂質生化学会会長が任命する。
　２　委員会には委員長を置くこととし、原則として日本脂質生化学会会長が兼務するが、委員の中から任命することができる。
　３　委員会に副委員長を置くことができ、日本脂質生化学会会長が任命する。
　４　委員会に顧問を置くことができ、日本脂質生化学会会長が任命する。
　５　顧問は委員会に出席し、意見を述べることができる。
（事務局）
第5条　委員会に、会務に関する事務をおこなうために事務局を置く。事務局長は委員長が指名する。
（雑則）
第6条　この規約に定めるもののほか、必要な事項は別に定める。

附則
本規約は、総会の承認を経て変更することができる。

（平成17年10月1日制定）
（平成29年6月15日改訂）
</pre>

==History (歴史)==
{{Twocolumn|
===LIPID INFORMATION SERVICE (LIPIDBANK) (1984? - 1997)===
The project was started as a database in Japanese around 1984 with Grant-in-Aid for scientific research publication (Akira Hayashi). This database was succeeded in 1989 under the
committee of lipid information (President: Yoshitaka Nagai), organized by the members of The Japanese Conference on the Biochemistry of Lipids (JCBL). The actual construction of the database was managed by the JCBL committee of database construction (President: Akira Hayashi, Vice-president: Nobuo Ueta, Secretary: Kiyohiro Watanabe).

The database included 16 lipid classes: fatty acid, long chain aldehyde, long chain alcohol, long chain base, bile acid, glyceride, phospholipid, glycolipid, lipoprotein, lipopolysaccharide, steroid, prostanoid, ether type lipid, mycolic acid and wax.

Each record contained lipid name, biological activity, source, references, structure and spectra. About 2,700 records were collected and saved on floppy discs.
|
===脂質情報データベース (1984? - 1997)===
LipidBankの淵源は、1984年頃に獲得された科学研究費補助金（研究成果刊行費、代表者：林陽）により構築が開始された日本語のデータベース「脂質情報データベース」である。1989年に、このデータベースは日本脂質生化学会（JCBL）により構成された脂質情報作成委員会（委員長：永井克孝）が立ち上げたプロジェクトに引き継がれ、構築が本格化した。実務は脂質情報データベース構築委員会（委員長：林陽、副委員長：植田伸夫、システム構築と入力：渡邊清博）が担った。 

このデータベースは、脂質を16種類に分類して集積された（脂肪酸、長鎖アルデヒド、長鎖アルコール、長鎖塩基、胆汁酸、グリセリド、リン脂質、糖脂質、リポタンパク質、リポ多糖、ステロイド、プロスタノイド、エーテル型脂質、ミコール酸、ワックスなど）。 

各脂質の名称、生理活性、分布、文献、化学構造、スペクトルデータなどの情報が記載された。約2,700件のデータが集積され、フロッピーディスクで配布された。
}}

{{Twocolumn|
===LIPIDBANK for Web (1996 - 1999)===
The initial three-year project started as a joint research between the International Medical Center of Japan (current National Center for Global Health and Medicine) ([http://www.ncgm.go.jp/ NCGM]) and the Japan Science and Technology Corporation ([http://www.jst.go.jp/ JST]).

A new executive committee was organized (President: Shoshichi Nojima, Vice-president: Mieko Oshima, Secretary: Kiyohiro Watanabe and Etsuko Yasugi).

The committee decided to collect the data on 27 lipid classes in English. Molecules in each class were collected independently under 27 team leaders and 122 data informants.

The database became publicly available from October 1999. The database server was placed at the University of Tokyo where the office of JCBL was located. The total number of molecules was about 5400.

|
===生理活性脂質データベース (1996 - 1999)===

3年間の本プロジェクトは、国立国際医療センター（現：国立国際医療研究センター）([http://www.ncgm.go.jp/ NCGM]) と科学技術振興機構 ([http://www.jst.go.jp/ JST]) との共同研究として発足した。

新たに生理活性脂質データベース構築検討会(委員長：野島庄七、副委員長：大島美恵子、データ入力：渡邊清博、八杉悦子）が結成された。

脂質を27種類に分類して、それぞれの脂質化合物データを英語で集積した。脂質分野ごとに、各脂質を専門とする27名のデータベース構築責任者をおき、122名のデータ提供者によりデータが収載された。

1999年秋にJCBLの事務局があった東京大学にサーバーを設置し、インターネット上に公開された。5,400件の脂質化合物データが収録された。
}}

{{Twocolumn|
===Updating LIPIDBANK for Web (1999 - 2005)===
After adding one lipid class (lipid peroxides), 28 lipid classes were reorganized into 17 lipid groups.

The DERIVED LIPIDS group now includes fatty acid, long chain alcohol, long chain aldehyde, and long chain base and ceramide. The FAT-SOLUBLE VITAMIN group includes carotenoid, coenzyme Q, vitamin A, vitamin D, vitamin E, and vitamin K. The GLYCOLIPID group includes glycosphingolipid, glycoglycerolipid and others. The PHOSPHOLIPID group includes glycerophospholipid, PAF, and sphingophospholipid.

In 2004, JCBL officially established an executive committee (President: Yousuke Seyama, Secretary: Etsuko Yasugi) for updating the database.

|
===生理活性脂質データベースの維持・更新(1999 - 2005)===
新たに過酸化脂質の項目を加えて、17種類の脂質グループに分類して、28種類の脂質化合物について、データ集積をおこなった。

誘導脂質には、脂肪酸、長鎖アルコール、長鎖アルデヒド、長鎖塩基とセラミドが含まれる。脂溶性ビタミンは、カロテノイド、コエンザイムQ、ビタミンA、D、E、Kから構成されている。糖脂質にはスフィンゴ糖脂質とグリセロ糖脂質が、リン脂質にはグリセロリン脂質、PAF、スフィンゴリン脂質が含まれる。

2004年には、脂質データベース構築委員会（委員長：脊山洋右、データ入力：八杉悦子）がJCBLから公認された。
}}

{{Twocolumn|
===Renovating LIPIDBANK for Web (2006-2007)===
LIPIDBANK for Web became the official database of JCBL, to which all rights were delegated from NCGM and JST. The name of database changed to "LipidBank".

The Hopanoid group was removed and the number of category is now 16. The database system and its contents were updated and reorganized by the JCBL committee members (President: Masahiro Nishijima).

|
===生理活性脂質データベースの刷新(2006 - 2007)===
生理活性脂質データベースは2006年にNCGMとJSTから譲渡され、JCBL公認のデータベースとなった。データベースの名称を"LipidBank"と改めた。 

脂質項目のうちホパノイドを削除し、16種類の脂質グループとした。脂質データベース構築委員会（委員長：西島正弘）が、データベースのシステムと内容の維持・更新を担当。

}}

{{Twocolumn|
=== Linking with the Wiki version (2017-2022)===
With financial support from the AMED program "Studies on Specific Activities and Functions of Lipid Molecules to Develop Innovative Medical Technologies" (PS: YOKOYAMA Shinji), wiki-based database was updated for glycosphingolipid and others.

Categories in the original LipidBank were translated into static HTML pages due to security issues.
|
=== LipidBank Wiki との連携 (2017-2022)===
AMED革新的先端研究開発支援事業「画期的医薬品等の創出をめざす脂質の生理活性と機能の解明」（総括：横山信治）より支援を受け、スフィンゴ糖脂質を中心に情報を整理、更新。

旧LipidBankの各カテゴリーはセキュリティ脆弱性のためにコンテンツをHTML固定ページに変換。
}}

===Contact Address===
{{Twocolumn|
If you have questions or suggestions, please contact with:

::Masanori Arita
:::arita@nig.ac.jp
::National Institute of Genetics
|
ご意見やご質問は、下記へお寄せください。
 
::有田正規
:::arita@nig.ac.jp
::国立遺伝学研究所
}}

==Members of Executive Committee of Lipid Database (脂質データベース構築委員会メンバー）==
2025年 3月 4日
<center>
{| class="wikitable"
|-
! colspan="3" style="text-align:center"| 委員長: 青木淳賢 (Junken Aoki)
|-
| colspan="3" style="text-align:center"| 副委員長: 有田　正規 (Masanori Arita), 横山　和明 (Kazuaki Yokoyama)
|-
! colspan="3" style="text-align:center"| 委員
|-
| 有田　誠 (Makoto Arita) || 石川寿樹 (Toshiki Ishikawa) || 和泉孝志 (Takashi Izumi)
|-
| 糸乗　前 (Saki Itonori) || 今井　博之 (Hiroyuki Imai) || 笠間　健嗣 (Takeshi Kasama)
|-
| 北　芳博 (Yoshihiro Kita) || 小林　哲幸 (Tetsuyuki Kobayashi) || 酒井　祥太 (Shota Sakai)
|-
| 中村　和生 (Kazuo Nakamura) || 八杉　悦子 (Etsuko Yasugi) ||
|-
! colspan="3" style="text-align:center"| 顧問
|-
| 大島　美恵子（Mieko Oshima) || 脊山　洋右（Yousuke Seyama) || 和泉　孝志 (Takashi Izumi)
|-
| 清水　孝雄 (Takao Shimizu) || 西島　正弘（Masahiro Nishijima）||
|}
</center>

==Funding (資金）==
{|
|-
|colspan="2"| <big>'''1989 - 1997'''</big>
|-
|LIPID INFORMATION SERVICE was funded by a Grant-in-Aid for Scientific Research (Grant-in-Aid for Publication of Scientific Research Results) from the Japan Society for the Promotion of Science.
|LIPID INFORMATION SERVICEが日本学術振興会([http://www.jsps.go.jp/ JSPS])科学研究費に採択される。
|-
|colspan="2"| <big>'''1996 - 2002'''</big>
|-
|LIPIDBANK for Web was funded by the Database Development Program of the Japan Science and Technology Agency (JST).
|LIPIDBANK for Webが科学技術振興機構([http://www.jst.go.jp/ JST])に採択される。
|-
|colspan="2"| <big>'''2003 - 2006''', '''2009 - 2016'''</big>
|-
|LIPIDBANK for Web was funded by a Grant-in-Aid for Scientific Research (Grant-in-Aid for Publication of Scientific Research Results) from the Japan Society for the Promotion of Science.
|日本学術振興会([http://www.jsps.go.jp/ JSPS])科学研究費の研究成果公開促進費データベース事業による更新。
|-
|colspan="2"| <big>'''2017 - 2022'''</big>
|-
|LIPIDBANK was funded by AMED-CREST in "Studies on Specific Activities and Functions of Lipid Molecules to Develop Innovative Medical Technologies".
|AMED革新的先端研究開発支援事業「画期的医薬品等の創出をめざす脂質の生理活性と機能の解明」（総括：横山信治）による更新。
|}

==構築委員会の歴史==
{| class="wikitable"
|-
| 第1回 || 1997年1月8日 || 国立国際医療センター研究所 || 生理活性脂質データベース構築委員会
|-
| 第10回 || 2004年3月25日 ||学士会分館 || 脂質情報データベース推進委員会
|-
| 第20回 || 2007年3月8日 || 東京大学　医学部 || 脂質データベース構築委員会
|-
| 第30回 || 2015年5月29日 || 東京大学　薬学部 || 脂質データベース構築委員会
|-
| 第34回 || 2019年7月5日 || 北海道大学 || 脂質データベース構築委員会
|-
|colspan="4"| 2020-2022 年はCOVID-19のために中止。
|-
| 第37回 || 2025年5月27日 || オンライン || 脂質データベース構築委員会
|}

JCBL:DBmeeting

2025-05-27T06:38:16Z

Editor: /* Members of Executive Committee of Lipid Database (脂質データベース構築委員会メンバー） */

==About LipidBank==

{{Twocolumn|
"LipidBank" is an open, publicly free database of natural lipids including fatty acids, glycerolipids, sphingolipids, steroids, and various vitamins.

The database contains more than 6000 unique molecular structures (ChemDraw cdx format, MDL MOL format), their lipid names (common name, IUPAC), spectral information (mass, UV, IR, NMR and others), and most importantly, literature information.

The database lists natural lipids only, and all molecular information is manually curated and approved by experts in lipid research (see Informant in each record).

LipidBank is the official database of the Japanese Conference on the Biochemistry of Lipids (JCBL).

 '''Reference:''' 
Watanabe K., Yasugi E. and Oshima M. "How to search the glycolipid data in LIPIDBANK for Web: the newly developed lipid database in Japan" Trend Glycosci. and Glycotechnol. 12, 175-184, 2000. ([https://www.jstage.jst.go.jp/article/tigg1989/12/65/12_65_175/_article/-char/ja/ PDF])
|
LipidBankは、脂肪酸、グリセロ脂質、スフィンゴ脂質、ステロイド、各種ビタミンを含む天然脂質の公開データベースです。 

現在6000以上の天然物構造（ChemDraw cdx形式、MDL MOL形式）について、物質名（慣用名とIUPAC）、スペクトル情報（質量、UV, IR, NMRほか）に加えて、文献情報も掲載しています。 

このデータベースは天然物を対象としており、全データについて監修者がチェックしています。LipidBankは日本脂質生化学会の公式データベースです。 
 

文献： 
渡辺清博、八杉悦子、大島美恵子「糖脂質データを日本で新しく作成された生理活性脂質データベース[LIPIDBANK for Web]で検索してみよう」Trend Glycosci. and Glycotechnol. 12, 175-184, 2000.（[https://www.jstage.jst.go.jp/article/tigg1989/12/65/12_65_175/_article/-char/ja/ PDF]）
}}

==Bylaws==
<pre>
日本脂質生化学会脂質データベース構築委員会　規約

（名称）
第1条　本会を日本脂質生化学会脂質データベース構築委員会（以下、委員会という。）と称する。
（設置）
第2条　委員会は、日本脂質生化学会が設置する。
（目的）
第3条　委員会は、脂質データベース“LipidBank”の構築・維持・更新を目的とし、脂質データの集積・更新、データベースシステムの構築・維持、
ならびにこれらに関連する業務をおこなう。
（委員会）
第4条　委員会の委員は、脂質・バイオインフォマティクスに造詣の深い日本脂質生化学会会員で構成され、日本脂質生化学会会長が任命する。
　２　委員会には委員長を置くこととし、原則として日本脂質生化学会会長が兼務するが、委員の中から任命することができる。
　３　委員会に副委員長を置くことができ、日本脂質生化学会会長が任命する。
　４　委員会に顧問を置くことができ、日本脂質生化学会会長が任命する。
　５　顧問は委員会に出席し、意見を述べることができる。
（事務局）
第5条　委員会に、会務に関する事務をおこなうために事務局を置く。事務局長は委員長が指名する。
（雑則）
第6条　この規約に定めるもののほか、必要な事項は別に定める。

附則
本規約は、総会の承認を経て変更することができる。

（平成17年10月1日制定）
（平成29年6月15日改訂）
</pre>

==History (歴史)==
{{Twocolumn|
===LIPID INFORMATION SERVICE (LIPIDBANK) (1984? - 1997)===
The project was started as a database in Japanese around 1984 with Grant-in-Aid for scientific research publication (Akira Hayashi). This database was succeeded in 1989 under the
committee of lipid information (President: Yoshitaka Nagai), organized by the members of The Japanese Conference on the Biochemistry of Lipids (JCBL). The actual construction of the database was managed by the JCBL committee of database construction (President: Akira Hayashi, Vice-president: Nobuo Ueta, Secretary: Kiyohiro Watanabe).

The database included 16 lipid classes: fatty acid, long chain aldehyde, long chain alcohol, long chain base, bile acid, glyceride, phospholipid, glycolipid, lipoprotein, lipopolysaccharide, steroid, prostanoid, ether type lipid, mycolic acid and wax.

Each record contained lipid name, biological activity, source, references, structure and spectra. About 2,700 records were collected and saved on floppy discs.
|
===脂質情報データベース (1984? - 1997)===
LipidBankの淵源は、1984年頃に獲得された科学研究費補助金（研究成果刊行費、代表者：林陽）により構築が開始された日本語のデータベース「脂質情報データベース」である。1989年に、このデータベースは日本脂質生化学会（JCBL）により構成された脂質情報作成委員会（委員長：永井克孝）が立ち上げたプロジェクトに引き継がれ、構築が本格化した。実務は脂質情報データベース構築委員会（委員長：林陽、副委員長：植田伸夫、システム構築と入力：渡邊清博）が担った。 

このデータベースは、脂質を16種類に分類して集積された（脂肪酸、長鎖アルデヒド、長鎖アルコール、長鎖塩基、胆汁酸、グリセリド、リン脂質、糖脂質、リポタンパク質、リポ多糖、ステロイド、プロスタノイド、エーテル型脂質、ミコール酸、ワックスなど）。 

各脂質の名称、生理活性、分布、文献、化学構造、スペクトルデータなどの情報が記載された。約2,700件のデータが集積され、フロッピーディスクで配布された。
}}

{{Twocolumn|
===LIPIDBANK for Web (1996 - 1999)===
The initial three-year project started as a joint research between the International Medical Center of Japan (current National Center for Global Health and Medicine) ([http://www.ncgm.go.jp/ NCGM]) and the Japan Science and Technology Corporation ([http://www.jst.go.jp/ JST]).

A new executive committee was organized (President: Shoshichi Nojima, Vice-president: Mieko Oshima, Secretary: Kiyohiro Watanabe and Etsuko Yasugi).

The committee decided to collect the data on 27 lipid classes in English. Molecules in each class were collected independently under 27 team leaders and 122 data informants.

The database became publicly available from October 1999. The database server was placed at the University of Tokyo where the office of JCBL was located. The total number of molecules was about 5400.

|
===生理活性脂質データベース (1996 - 1999)===

3年間の本プロジェクトは、国立国際医療センター（現：国立国際医療研究センター）([http://www.ncgm.go.jp/ NCGM]) と科学技術振興機構 ([http://www.jst.go.jp/ JST]) との共同研究として発足した。

新たに生理活性脂質データベース構築検討会(委員長：野島庄七、副委員長：大島美恵子、データ入力：渡邊清博、八杉悦子）が結成された。

脂質を27種類に分類して、それぞれの脂質化合物データを英語で集積した。脂質分野ごとに、各脂質を専門とする27名のデータベース構築責任者をおき、122名のデータ提供者によりデータが収載された。

1999年秋にJCBLの事務局があった東京大学にサーバーを設置し、インターネット上に公開された。5,400件の脂質化合物データが収録された。
}}

{{Twocolumn|
===Updating LIPIDBANK for Web (1999 - 2005)===
After adding one lipid class (lipid peroxides), 28 lipid classes were reorganized into 17 lipid groups.

The DERIVED LIPIDS group now includes fatty acid, long chain alcohol, long chain aldehyde, and long chain base and ceramide. The FAT-SOLUBLE VITAMIN group includes carotenoid, coenzyme Q, vitamin A, vitamin D, vitamin E, and vitamin K. The GLYCOLIPID group includes glycosphingolipid, glycoglycerolipid and others. The PHOSPHOLIPID group includes glycerophospholipid, PAF, and sphingophospholipid.

In 2004, JCBL officially established an executive committee (President: Yousuke Seyama, Secretary: Etsuko Yasugi) for updating the database.

|
===生理活性脂質データベースの維持・更新(1999 - 2005)===
新たに過酸化脂質の項目を加えて、17種類の脂質グループに分類して、28種類の脂質化合物について、データ集積をおこなった。

誘導脂質には、脂肪酸、長鎖アルコール、長鎖アルデヒド、長鎖塩基とセラミドが含まれる。脂溶性ビタミンは、カロテノイド、コエンザイムQ、ビタミンA、D、E、Kから構成されている。糖脂質にはスフィンゴ糖脂質とグリセロ糖脂質が、リン脂質にはグリセロリン脂質、PAF、スフィンゴリン脂質が含まれる。

2004年には、脂質データベース構築委員会（委員長：脊山洋右、データ入力：八杉悦子）がJCBLから公認された。
}}

{{Twocolumn|
===Renovating LIPIDBANK for Web (2006-2007)===
LIPIDBANK for Web became the official database of JCBL, to which all rights were delegated from NCGM and JST. The name of database changed to "LipidBank".

The Hopanoid group was removed and the number of category is now 16. The database system and its contents were updated and reorganized by the JCBL committee members (President: Masahiro Nishijima).

|
===生理活性脂質データベースの刷新(2006 - 2007)===
生理活性脂質データベースは2006年にNCGMとJSTから譲渡され、JCBL公認のデータベースとなった。データベースの名称を"LipidBank"と改めた。 

脂質項目のうちホパノイドを削除し、16種類の脂質グループとした。脂質データベース構築委員会（委員長：西島正弘）が、データベースのシステムと内容の維持・更新を担当。

}}

{{Twocolumn|
=== Linking with the Wiki version (2017-2022)===
With financial support from the AMED program "Studies on Specific Activities and Functions of Lipid Molecules to Develop Innovative Medical Technologies" (PS: YOKOYAMA Shinji), wiki-based database was updated for glycosphingolipid and others.

Categories in the original LipidBank were translated into static HTML pages due to security issues.
|
=== LipidBank Wiki との連携 (2017-2022)===
AMED革新的先端研究開発支援事業「画期的医薬品等の創出をめざす脂質の生理活性と機能の解明」（総括：横山信治）より支援を受け、スフィンゴ糖脂質を中心に情報を整理、更新。

旧LipidBankの各カテゴリーはセキュリティ脆弱性のためにコンテンツをHTML固定ページに変換。
}}

===Contact Address===
{{Twocolumn|
If you have questions or suggestions, please contact with:

::Masanori Arita
:::arita@nig.ac.jp
::National Institute of Genetics
|
ご意見やご質問は、下記へお寄せください。
 
::有田正規
:::arita@nig.ac.jp
::国立遺伝学研究所
}}

==Members of Executive Committee of Lipid Database (脂質データベース構築委員会メンバー）==
2025年 3月 4日
<center>
{| class="wikitable"
|-
! colspan="3" style="text-align:center"| 委員長: 青木淳賢 (Junken Aoki)
|-
| colspan="3" style="text-align:center"| 副委員長: 有田　正規 (Masanori Arita), 横山　和明 (Kazuaki Yokoyama)
|-
! colspan="3" style="text-align:center"| 委員
|-
| 有田　誠 (Makoto Arita) || 石川寿樹 (Toshiki Ishikawa) || 和泉孝志 (Takashi Izumi)
|-
| 糸乗　前 (Saki Itonori) || 今井　博之 (Hiroyuki Imai) || 笠間　健嗣 (Takeshi Kasama)
|-
| 北　芳博 (Yoshihiro Kita) || 小林　哲幸 (Tetsuyuki Kobayashi) || 酒井　祥太 (Shota Sakai)
|-
| 中村　和生 (Kazuo Nakamura) || 八杉　悦子 (Etsuko Yasugi) ||
|-
! colspan="3" style="text-align:center"| 顧問
|-
| 大島　美恵子（Mieko Oshima) || 脊山　洋右（Yousuke Seyama) || 和泉　孝志 (Takashi Izumi)
|-
| 清水　孝雄 (Takao Shimizu) || 西島　正弘（Masahiro Nishijima）||
|}
</center>

==Funding (資金）==
{|
|-
|colspan="2"| <big>'''1989 - 1997'''</big>
|-
|LIPID INFORMATION SERVICE was funded by a Grant-in-Aid for Scientific Research (Grant-in-Aid for Publication of Scientific Research Results) from the Japan Society for the Promotion of Science.
|LIPID INFORMATION SERVICEが日本学術振興会([http://www.jsps.go.jp/ JSPS])科学研究費に採択される。
|-
|colspan="2"| <big>'''1996 - 2002'''</big>
|-
|LIPIDBANK for Web was funded by the Database Development Program of the Japan Science and Technology Agency (JST).
|LIPIDBANK for Webが科学技術振興機構([http://www.jst.go.jp/ JST])に採択される。
|-
|colspan="2"| <big>'''2003 - 2006''', '''2009 - 2016'''</big>
|-
|LIPIDBANK for Web was funded by a Grant-in-Aid for Scientific Research (Grant-in-Aid for Publication of Scientific Research Results) from the Japan Society for the Promotion of Science.
|日本学術振興会([http://www.jsps.go.jp/ JSPS])科学研究費の研究成果公開促進費データベース事業による更新。
|-
|colspan="2"| <big>'''2017 - 2022'''</big>
|-
|LIPIDBANK was funded by AMED-CREST in "Studies on Specific Activities and Functions of Lipid Molecules to Develop Innovative Medical Technologies".
|AMED革新的先端研究開発支援事業「画期的医薬品等の創出をめざす脂質の生理活性と機能の解明」（総括：横山信治）による更新。
|}

==構築委員会の歴史==
{| class="wikitable"
|-
| 第1回 || 1997年1月8日 || 国立国際医療センター研究所 || 生理活性脂質データベース構築委員会
|-
| 第10回 || 2004年3月25日 ||学士会分館 || 脂質情報データベース推進委員会
|-
| 第20回 || 2007年3月8日 || 東京大学　医学部 || 脂質データベース構築委員会
|-
| 第30回 || 2015年5月29日 || 東京大学　薬学部 || 脂質データベース構築委員会
|-
| 第34回 || 2019年7月5日 || 北海道大学 || 脂質データベース構築委員会
|-
|colspan="4"| 2020-2022 年はCOVID-19のために中止。JCBLホームページを2010-2021年まで本サーバで維持管理してきたが、2021年より新サイト (jcbl.jp) に移行。
|-
|
|}

Category:LBS

2025-03-07T06:38:45Z

Editor: /* {{Bilingual|概要|Class Overview}} */

{{Huge|{{Bilingual|スフィンゴ脂質|Sphingolipid}}}}
{{LB/Header}}
{{Hierarchy|{{PAGENAME}}}}
{| style="float:left"
| __TOC__
|}
=={{Bilingual|概要|Class Overview}}==

{{Twocolumn|
Three Sphingolipid categories (LBS) exist in this database.
|このデータベースではスフィンゴ脂質を以下に分けています。
}}

<center>
{| border="1" cellpadding="5" cellspacing="0"
|-
| style="vertical-align:top" width="33%"|
[[:Category:LBSB| '''Ceramide''']] {{LBS/Cer|OH}} セラミド 
*[[:Category:LBSB|Long-chain base and ceramide]]
| style="vertical-align:top" width="33%"|
[[:Category:LBS#スフィンゴ糖脂質 Glycosphingolipid|'''Glycosphingolipid''']] {{LBS/Cer|O-(sugar)}} スフィンゴ糖脂質 
*[[:Category:LBSC|Cerebroside (monohexosyl ceramides)]]
*[[:Category:LBSG|Acidic glycosphingolipid]]
| style="vertical-align:top" width="33%"|
[[:Category:LBSP| '''Phosphosphingolipid''']] {{LBS/Cer|O-(phosphate)}} スフィンゴリン脂質
*[[:Category:LBSP|Sphingomyelin, CPE, CAEP and GIPC]]
|}

</center>

<center>
{| class="wikitable"
|<big>
[[:Category:LBS/Search|{{Bilingual|スフィンゴ脂質検索画面にいく|Go to Sphingolipid search.}}]]
</big>
|}
</center>

==スフィンゴ脂質 Sphingolipid==

==={{Bilingual|表記法|Notation}}===
{| class="wikitable collapsible collapsed" style="width:80%"
!colspan="4" align="center" style="background:lightgray"| Symbol Abbreviations (e.g. Glc = glucose)
|-
!colspan="4" align="center" style="background:lightgray"| Backbones
{{#repeatnum:LBS/AbbrevRow|1|
Cer && ceramide && セラミド &&
Sph && sphingosine && スフィンゴシン &&
}}
|-
!colspan="4" align="center" style="background:lightgray"| Sugars
{{#repeatnum:LBS/AbbrevRow|1|
Glc && glucose && グルコース && C6H12O6 &&
Gal && galactose && ガラクトース && C6H12O6 &&
GlcNAc && ''N''-acetyl-glucosamine && ''N''-アセチルグルコサミン && C8H15NO6
GalNAc && ''N''-acetyl-galactosamine && ''N''-アセチルガラクトサミン && C8H15NO6
GlcN && glucosamine && グルコサミン && C6H13NO5
GalN && galactosamine && ガラクトサミン && C6H13NO5
GlcA && glucuronic acid && グルクロン酸 && C6H10O7
GalA && galacturonic acid && ガラクツロン酸 && C6H10O7 &&
Man && mannose && マンノース && C6H12O6 && 18950
Rha && rhamnose (= 6-deoxy-mannose) && ラムノース (6-デオキシマンノース) && C6H12O5 && 19233
Ins && inositol && イノシトール && C6H12O6 && 892
Fuc && fucose (= 6-deoxy-galactose) && フコース (6-デオキシガラクトース) && C6H12O5 && 17106
Ara && arabinose && アラビノース && C5H10O5 && 5460291
Xyl && xylose && キシロース && C5H10O5 && 135191
NeuNH && (deacetyl) neuraminic acid (pyruvate + mannosamine) && ノイラミン酸 (ピルビン酸＋マンノサミン) && C9H17N1O8 && 513472
NeuAc && ''N''-acetyl-neuraminic acid && ''N''-アセチルノイラミン酸 && C11H19NO9 && 439197
NeuGc && ''N''-glycolyl-neuraminic acid && ''N''-グリコリルノイラミン酸 && C11H19NO10 && 123802
Kdn && 2-keto-3-deoxy-D-glycero- D-galacto-nononic acid && デアミノノイラミン酸 && C9H16O9 && 13991616
}}
|-
!colspan="4" align="center" style="background:lightgray"| Modifiers
{{#repeatnum:LBS/AbbrevRow|1|
AEPn && aminoethylphosphonic acid, or (2-aminoethyl)hydroxyphosphoryl- && アミノエチルホスホン酸（C-P結合）
MAEPn && ''N''-methyl aminoethylphosphonic acid, or (''N''-methyl-2-aminoethyl) hydroxyphosphoryl- && AEPnの''N''-メチル体（C-P結合）
EtnP && phosphoethanolamine (PEA), or 2-aminoethanolphospho- && ホスホエタノールアミン
PC && Phosphocholine && ホスホコリン
Butenyl && Butenyl && ブテニル基
Me && Methyl && メチル基
Et && Ethyl && エチル基
}}
|}

===分類体系 ID-Code Design===
{{Twocolumn|
Major series of phosphosphingolipids are determined by molecules bound to their phosphates, and the series of glycosphingolipids are determined by oligosaccharides bound to their ceramides. The IUPAC series of glycosphingolipids (1977) were based on the order and bonding patterns of four sugars rooting at the long-chain base. Our series, however, are based on three sugars. Two original series, Echino and Schisto, are also added.
|スフィンゴリン脂質はリン酸に結合する分子や糖の種類、スフィンゴ糖脂質はセラミドに結合する糖鎖により系列を作成しています。1977年にIUPACが提唱したスフィンゴ糖脂質の系列は、長鎖塩基に結合する四糖の並びと結合を基準にしています。ここではより広い糖鎖の系列を検索できるよう、三糖を基準に分類しています。また新たにEchinoとSchistoの系列を加えています。
}}

{|
|
<table border=1>
<tr>
<td style="background-color:yellowgreen;" width=20px align="center"><big>L</big>
<td style="background-color:yellowgreen;" width=20px align="center"><big>B</big>
<td style="background-color:yellowgreen;" width=20px align="center"><big>S</big>
<td style="background-color:green;" width=20px align="center"><big>''G/P''</big>
<td style="background-color:Blue; color:white" width=20px align="center"><big>''s1''</big>
<td style="background-color:Blue; color:white" width=20px align="center"><big>''s2''</big>
<td style="background-color:tomato; color:white" width=20px align="center"><big>''n1''</big>
<td style="background-color:tomato; color:white" width=20px align="center"><big>''n2''</big>
<td style="background-color:firebrick; color:white" width=20px align="center"><big>''y''</big>
<td style="background-color:white;" width=20px align="center"><big>''c1''</big>
<td style="background-color:white;" width=20px align="center"><big>''c2''</big>
</tr>
</table>
|  
|
{| class="wikitable"
! '''G/P''' || '''G''' (glyco) || '''P''' (phospho)
|-
! '''s1, s2'''
|colspan="3"| structure code as explained below
|-
! '''n1, n2'''
|colspan="2"| number of sugars (2 digits)
|-
! '''y'''
|colspan="2"| number of sialic acids (1 digit)
|-
! '''c1, c2'''
|colspan="2"| serial numbers
|}
|}

===スフィンゴ糖脂質 Glycosphingolipid===

{| class="wikitable" style="text-align:right; background-color:white"
! First sugar || Code || Root sequence
! colspan=2 | Major Series
|-
! Cerebroside
| colspan="3" style="text-align:left" | '''For GalCer and GlcCer, visit [[:Category:LBSC|this page]].'''
|-
! starting with <big>Galactose</big>
| {{#volatile:ListMol/LBStitle|G1|LBSG1}} ({{#volatile:ClassMatrix|{{#countTitle:LBSG1}} items|LBSG1.....|7|8|9|9|Number_of_Sugars|Number_of_Sialic_acids}})
|style="text-align:right"| '''Gal'''-Cer
|
{| style="width:100%;"
|style="border:0;text-align:left"| {{#volatile:ListMol/LBS|Gala / Neogala|Mainchain.*Gala1-4?6?Galb1-Cer}}
|style="border:0;text-align:right"| {{#invoke:LBS|FormatSugar|Gala1-4/6Galb1-Cer}}
|-
|style="border:0;text-align:left"|{{#volatile:ListMol/LBS|Spirometo|Mainchain.*Galb1-4Glcb1-3Galb1-Cer}}
|style="border:0;text-align:right"| {{#invoke:LBS|FormatSugar|Galb1-4Glcb1-3Galb1-Cer}}
|}
|-
! rowspan="8" | starting with <big>Glucose</big>
|-
| {{#volatile:ListMol/LBStitle|G2|LBSG2}} ({{#volatile:ClassMatrix|{{#countTitle:LBSG2}} items|LBSG2.....|7|8|9|9|Number_of_Sugars|Number_of_Sialic_acids}})
|style="text-align:right"| '''GalNAcβ'''-Galβ-Glcβ-Cer
|
{| style="width:100%"
|-
|style="border:0;text-align:left"| {{#volatile:ListMol/LBS|Ganglio|Mainchain.*GalNAcb1-4Galb1-4Glcb1-Cer}}
|style="border:0;text-align:right"| {{#invoke:LBS|FormatSugar|GalNAcb1-4Galb1-4Glcb1-Cer}}
|-
|style="border:0;text-align:left"| {{#volatile:ListMol/LBS|Isoganglio|Mainchain.*GalNAcb1-3Galb1-4Glcb1-Cer}}<ref name="iso">In IUPAC, "iso" refers to a change from position 4 to position 3.</ref>
|style="border:0;text-align:right"| {{#invoke:LBS|FormatSugar|GalNAcb1-3Galb1-4Glcb1-Cer}}
|-
|style="border:0;text-align:left"| {{#volatile:ListMol/LBS|Lactoganglio|Structure.*GlcNAcb1-3$.*GalNAcb1-4$Galb1-4Glcb1-Cer}}
|style="border:0;text-align:right"| {{#invoke:LBS|FormatSugar|GlcNAcb1-3(GalNAcb1-4)Galb1-4Glcb1-Cer}}
|-
|style="border:0;text-align:left"| {{#volatile:ListMol/LBS|a-series|Structure.*$?NeuAca2-3$?Galb1-4Glcb1-Cer}}
|style="border:0;text-align:right"| {{#invoke:LBS|FormatSugar|GalNAcb1-4(NeuAca2-3)Galb1-4Glcb1-Cer}}
|-
|style="border:0;text-align:left"| {{#volatile:ListMol/LBS|b-series|Structure.*$?NeuAca2-8NeuAca2-3$?Galb1-4Glcb1-Cer}}
|style="border:0;text-align:right"| {{#invoke:LBS|FormatSugar|GalNAcb1-4(NeuAca2-8NeuAca2-3)Galb1-4Glcb1-Cer}}
|-
|style="border:0;text-align:left"| {{#volatile:ListMol/LBS|c-series|Structure.*$?NeuAca2-8NeuAca2-8NeuAca2-3$?Galb1-4Glcb1-Cer}}
|style="border:0;text-align:right"| {{#invoke:LBS|FormatSugar|GalNAcb1-4(NeuAca2-8NeuAca2-8NeuAca2-3)Galb1-4Glcb1-Cer}}
|-
|style="border:0;text-align:left"| {{#volatile:ListMol/LBS|α-series|Structure.*$?NeuAca2-6$?GalNAcb1-4Galb1-4Glcb1-Cer}}
|style="border:0;text-align:right"| {{#invoke:LBS|FormatSugar|...(NeuAca2-6)GalNAcb1-4Galb1-4Glcb1-Cer}}
|-
|style="border:0;text-align:left"| {{#volatile:ListMol/LBS|β-series|Structure.*$?NeuAca2-8NeuAca2-6$?GalNAcb1-4Galb1-4Glcb1-Cer}}
|style="border:0;text-align:right"| {{#invoke:LBS|FormatSugar|...(NeuAca2-8NeuAca2-6)GalNAcb1-4Galb1-4Glcb1-Cer}}
|}
|-
| {{#volatile:ListMol/LBStitle|G3|LBSG3}} ({{#volatile:ClassMatrix|{{#countTitle:LBSG3}} items|LBSG3.....|7|8|9|9|Number_of_Sugars|Number_of_Sialic_acids}})
|style="text-align:right"| '''GlcNAcβ'''-Galβ-Glcβ-Cer
|
{| style="width:100%"
|-
|style="border:0;text-align:left"| {{#volatile:ListMol/LBS|Lacto|Mainchain.*Galb1-3GlcNAcb1-3Galb1-4Glcb1-Cer}}
|style="border:0;text-align:right"| {{#invoke:LBS|FormatSugar|Galb1-3GlcNAcb1-3Galb1-4Glcb1-Cer}}
|-
|style="border:0;text-align:left"| {{#volatile:ListMol/LBS|Neolacto|Mainchain.*Gal.1-4GlcNAcb1-3Galb1-4Glcb1-Cer}}<ref name="neo">In IUPAC, "neo" refers to a change from position 3 to position 4.</ref>
|style="border:0;text-align:right"| {{#invoke:LBS|FormatSugar|Galb1-4GlcNAcb1-3Galb1-4Glcb1-Cer}}
|}
|-
| {{#volatile:ListMol/LBStitle|G4|LBSG4}} ({{#volatile:ClassMatrix|{{#countTitle:LBSG4}} items|LBSG4.....|7|8|9|9|Number_of_Sugars|Number_of_Sialic_acids}})
|style="text-align:right"| '''Galα'''-Galβ-Glcβ-Cer
|
{| style="width:100%"
|-
|style="border:0;text-align:left"| {{#volatile:ListMol/LBS|Globo|Mainchain.*Gala1-4Galb1-4Glcb1-Cer}}
|style="border:0;text-align:right"| {{#invoke:LBS|FormatSugar|Gala1-4Galb1-4Glcb1-Cer}}
|-
|style="border:0;text-align:left"| {{#volatile:ListMol/LBS|Isoglobo|Mainchain.*Gala1-3Galb1-4Glcb1-Cer}}<ref name="iso"/>
|style="border:0;text-align:right"| {{#invoke:LBS|FormatSugar|Gala1-3Galb1-4Glcb1-Cer}}
|}
|-
| {{#volatile:ListMol/LBStitle|G5|LBSG5}} ({{#volatile:ClassMatrix|{{#countTitle:LBSG5}} items|LBSG5.....|7|8|9|9|Number_of_Sugars|Number_of_Sialic_acids}})
|style="text-align:right"| Gal-Glc-Cer (Other than G2&sim;G4)
|
{| style="width:100%"
|style="border:0;text-align:left"| {{#volatile:ListMol/LBS|Muco|Mainchain.*Galb1-4Galb1-4Glcb1-Cer}}
|style="border:0;text-align:right"| {{#invoke:LBS|FormatSugar|Galb1-4Galb1-4Glcb1-Cer}}
|}
|-
| {{#volatile:ListMol/LBStitle|G6|LBSG6}} ({{#volatile:ClassMatrix|{{#countTitle:LBSG6}} items|LBSG6.....|7|8|9|9|Number_of_Sugars|Number_of_Sialic_acids}})
|style="text-align:right"| '''Man'''-Glcβ-Cer
|
{| style="width:100%"
|style="border:0;text-align:left"| {{#volatile:ListMol/LBS|Arthro|Mainchain.*GlcNAcb1-3Manb1-4Glcb1-Cer}}
|style="border:0;text-align:right"| {{#invoke:LBS|FormatSugar|GlcNAcb1-3Manb1-4Glcb1-Cer}}
|-
|style="border:0;text-align:left"| {{#volatile:ListMol/LBS|Mollu|Mainchain.*Mana1-3Manb1-4Glcb1-Cer}}
|style="border:0;text-align:right"| {{#invoke:LBS|FormatSugar|Mana1-3Manb1-4Glcb1-Cer}}
|}
|-
| {{#volatile:ListMol/LBStitle|G7|LBSG7}} ({{#volatile:ClassMatrix|{{#countTitle:LBSG7}} items|LBSG7.....|7|8|9|9|Number_of_Sugars|Number_of_Sialic_acids}})
|style="text-align:right"| '''NeuAc'''/'''NeuGc'''-Glcβ-Cer
|
{| style="width:100%"
|style="border:0;text-align:left"| {{#volatile:ListMol/LBS|Echino|Mainchain.*Neu(A~G)c.2-6Glcb1-Cer}}
|style="border:0;text-align:right"| '''NeuGc''' or {{#invoke:LBS|FormatSugar|NeuAca2-6Glcb1-Cer}}
|}
|-
| {{#volatile:ListMol/LBStitle|G8|LBSG8}} ({{#volatile:ClassMatrix|{{#countTitle:LBSG8}} items|LBSG8.....|7|8|9|9|Number_of_Sugars|Number_of_Sialic_acids}})
|style="text-align:right"| '''GalNAc'''-Glc-Cer
|
{| style="width:100%"
|style="border:0;text-align:left"| {{#volatile:ListMol/LBS|Schisto|Mainchain.*GalNAc.1-4Glc.1-Cer}}<ref>Makaaru CK, Damian RT, Smith DF, Cummings RD. "The human blood fluke Schistosoma mansoni synthesizes a novel type of glycosphingolipid" J Biol Chem 1992 267:2251-2257 PMID 1733932</ref>
|style="border:0;text-align:right"| {{#invoke:LBS|FormatSugar|GalNAcb1-4Glcb1-Cer}}
|}
|-
! starting with <big>Other Sugars</big>
| {{#volatile:ListMol/LBStitle|G(A&sim;R)|LBSG(A~B~C~D~E~F~G~H~J~K~M~N~O~P~Q~R)}}
|colspan="2"| Symbols follow the [[:Category:LBS#Sugar-Digit Table]].
|}
<references/>

===スフィンゴリン脂質 Phosphosphingolipid===
{| class="wikitable" style="text-align:right; background-color:white"
! First sugar || Code || Root sequence
!colspan="2"| Major Series
|-
! No Sugar Attached
| '''P1''' ([[:Category:LBSP|LBSP]])
| R-P-Cer
| Sphingomyelin and Ceramide phosphoetanolamine (Visit [[:Category:LBSP|this page]].)
|-
! rowspan="4" | starting with <big>Inositol</big>
| {{#volatile:ListMol/LBStitle|P2|LBSP2}} ({{#countTitle:LBSP2}} items)
| style="text-align:right"| '''GlcN'''α/β1−2/6Ins1-P-Cer
|
{|style="width:100%"
|style="border:0;text-align:left"| {{#volatile:ListMol/LBS|Protozoa & Fungi-specific|Mainchain.*GlcN.1-.Ins-P-Cer}}
| style="border:0;text-align:right"| {{#invoke:LBS|FormatSugar|GlcNa/b1-2/6Ins1-P-Cer}}
|}
|-
| {{#volatile:ListMol/LBStitle|P3|LBSP3}} ({{#countTitle:LBSP3}} items)
|style="text-align:right"| '''GlcA'''α/β1−2/6Ins1-P-Cer
|
{|style="width:100%"
|style="border:0;text-align:left"| {{#volatile:ListMol/LBS|Plant-specific|Mainchain.*GlcA.1-.Ins-P-Cer}}
|style="border:0;text-align:right"| {{#invoke:LBS|FormatSugar|GlcAa/b1-2/6Ins1-P-Cer}}
|}
|-
| {{#volatile:ListMol/LBStitle|P4|LBSP4}} ({{#countTitle:LBSP4}} items)
| style="text-align:right"| '''Man'''α/β1−2/6Ins1-P-Cer
|
{| style="width:100%"
| style="border:0;text-align:left"| {{#volatile:ListMol/LBS|Fungi-specific|Mainchain.*Man.1-.Ins-P-Cer}}
| style="border:0;text-align:right"| {{#invoke:LBS|FormatSugar|Mana/b1-2/6Ins1-P-Cer}}
|}
|-
| {{#volatile:ListMol/LBStitle|P5|LBSP5}} ({{#countTitle:LBSP5}} items)
| style="text-align:right"| Gal, Glc, and Others
| style="text-align:right"| {{#invoke:LBS|FormatSugar|X-Ins1-P-Cer}}
|}

===Sugar-Digit Table===

{{Bilingual|クリックすると一覧が出ます。記号の略称については|Click to see the full list. For abbreviations, see}} [[#Notation]].

{|
|-
| valign="top"|
{| class="wikitable"
|-
! Code || Structure
|-
! '''A'''
| Glc [[File:LBS-Monomer-Glc.png]]
|-
! '''B'''
| Gal [[File:LBS-Monomer-Gal.png]]
|-
! '''C'''
| GlcNAc [[File:LBS-Monomer-GlcNAc.png]]
|-
! '''D'''
| GalNAc [[File:LBS-Monomer-GalNAc.png]]
|-
! '''E'''
| GlcN [[File:LBS-Monomer-GlcN.png]]
|-
! '''F'''
| GalN [[File:LBS-Monomer-GalN.png]]
|-
! '''G'''
| GlcA [[File:LBS-Monomer-GlcA.png]]
|-
! '''H'''
| GalA [[File:LBS-Monomer-GalA.png]]
|-
! '''I'''
| not used
|}
|valign="top"|
{| class="wikitable"
|-
! Code || Structure
|-
! '''J'''
| {{#volatile:ListMol/LBS|Mannose|Structure.*Man}} [[File:LBS-Monomer-Man.png]]
|-
! '''K'''
| {{#volatile:ListMol/LBS|Rhamnose|Structure.*Rha}} [[File:LBS-Monomer-Rha.png]]
|-
! '''L'''
| {{#volatile:ListMol/LBS|Inositol|Structure.*Ins(Me)?-P-[^Cer]}}
|-
! '''M'''
| Fucose ({{#volatile:ListMol/LBS| 1|Structure[^F]+Fuc[^F]+$}}, {{#volatile:ListMol/LBS|2|Structure([^F]+Fuc){2}[^F]+$}}, {{#volatile:ListMol/LBS|>3|Structure([^F]+Fuc){3} }}) [[File:LBS-Monomer-Fuc.png]]
|-
! '''N'''
| {{#volatile:ListMol/LBS|Arabinose|Structure.*Ara}} [[File:LBS-Monomer-Ara.png]]
|-
! '''O'''
| {{#volatile:ListMol/LBS|Xylose|Structure.*Xyl}} [[File:LBS-Monomer-Xyl.png]]
|-
! '''P'''
| {{#volatile:ListMol/LBS|NeuAc / NeuNH|Structure.*(NeuAc~NeuNH)}} [[File:LBS-Monomer-NeuAc.png]]
|-
! '''Q'''
| {{#volatile:ListMol/LBS|NeuGc|Structure.*(NeuGc)}} [[File:LBS-Monomer-NeuGc.png]]
|-
! '''R'''
| {{#volatile:ListMol/LBS|Kdn|Structure.*(KDN)}} [[File:LBS-Monomer-KDN.png]]
|}
|valign="top"|
{| class="wikitable"
|-
! Code || Structure
|-
! '''S'''
| {{#volatile:ListMol/LBS|Phosphate (except GIPC)|Structure.*(Phospho)}} [[File:LBS-Monomer-P.png]]
|-
! '''T'''
| {{#volatile:ListMol/LBS|(M)AEPn|Structure.*(AEPn)}}, {{#volatile:ListMol/LBS|EtnP|Structure.*(EtnP)}}, {{#volatile:ListMol/LBS|PC|Structure.*(PC)}} [[File:LBS-Monomer-AEPn.png]]
|-
! '''U'''
| {{#volatile:ListMol/LBS|Sulfate|Structure.*Sulfo}} [[File:LBS-Monomer-S.png]]
|-
! '''V'''
| acyl/alkyl/alkenyl chain [[File:LBS-Monomer-Alkyl.png]]
|}

=={{Bilingual|生合成|Biosynthesis}}==
{{Twocolumn|
Sphingosine is synthesized from decarboxylating condensation of palmitoyl CoA with serine on the ER membrane. It is a 18-carbon amino alcohol (16 carbons from palmitic acid and 2 from serine) with one unsaturated bond (trans-form) at the C-4 position (2-amino-4-octadecene-1,3-diol). ([[:Category:LBS/Biosynthesis|more details]])
|
スフィンゴシンはパルミトイルCoAがアミノ酸セリンと脱炭酸縮合して生成します。炭素を18個含むアミノアルコール(16個がパルミチン酸、2個がセリン由来)でトランス型の不飽和結合をC-4に1つ含みます。（[[:Category:LBS/Biosynthesis|詳細はこちら]]）
}}

=={{Bilingual|スフィンゴ脂質の歴史|History of Sphingolipids}}==
{{Twocolumn|
Sphingolipids were first isolated from brain by J.L.W. Thudichum (1829-1901) as lipids of unknown function and structure.<ref>Thudichum J.L.W.?"A Treatise on the Chemical Constitution of the Balliere" Tindall and Cox, London,?1884</ref> The basic structure is a long-chain base (long-chain amino-alcohol) whose amino-group is acylated with a long-chain fatty acid. This hydrophobic structure is called ceramides.
Sphingolipid consists of phospho-sphingolipid and glyco-sphingolipid, whose ceramide structure is bonded with phosphate and (oligo)saccharides, respectively. Phosphosphingolipid includes sphingomyelin, and glycosphingolipid, cerebrosides and gangliosides. Both are abundant in neural tissues.<ref>Gault CR,?Obeid LM,?Hannun YA "An overview of sphingolipid synthesis to breakdown" Adv Exp Med Biol.?2010;688:1-23. PMID 20919643</ref>
|
スフィンゴ脂質は J.L.W. Thudichum (1829-1901) により機能や構造未知の脂質として脳から見いだされました。基本骨格は長鎖塩基 (長鎖アミノアルコール) のアミノ基が長鎖脂肪酸とアミド結合したもので、セラミドと呼ばれます。
スフィンゴ脂質はセラミドにリン酸が結合したスフィンゴリン脂質と糖が結合したスフィンゴ糖脂質に分けられます。スフィンゴリン脂質にはスフィンゴミエリンが、スフィンゴ糖脂質にはセレブロシドやガングリオシドなどが含まれ、いずれも神経系に多く存在します。
}}

<references/>

JCBL:DBmeeting

2025-03-05T04:28:12Z

Editor: /* Members of Executive Committee of Lipid Database (脂質データベース構築委員会メンバー） */

==About LipidBank==

{{Twocolumn|
"LipidBank" is an open, publicly free database of natural lipids including fatty acids, glycerolipids, sphingolipids, steroids, and various vitamins.

The database contains more than 6000 unique molecular structures (ChemDraw cdx format, MDL MOL format), their lipid names (common name, IUPAC), spectral information (mass, UV, IR, NMR and others), and most importantly, literature information.

The database lists natural lipids only, and all molecular information is manually curated and approved by experts in lipid research (see Informant in each record).

LipidBank is the official database of the Japanese Conference on the Biochemistry of Lipids (JCBL).

 '''Reference:''' 
Watanabe K., Yasugi E. and Oshima M. "How to search the glycolipid data in LIPIDBANK for Web: the newly developed lipid database in Japan" Trend Glycosci. and Glycotechnol. 12, 175-184, 2000. ([https://www.jstage.jst.go.jp/article/tigg1989/12/65/12_65_175/_article/-char/ja/ PDF])
|
LipidBankは、脂肪酸、グリセロ脂質、スフィンゴ脂質、ステロイド、各種ビタミンを含む天然脂質の公開データベースです。 

現在6000以上の天然物構造（ChemDraw cdx形式、MDL MOL形式）について、物質名（慣用名とIUPAC）、スペクトル情報（質量、UV, IR, NMRほか）に加えて、文献情報も掲載しています。 

このデータベースは天然物を対象としており、全データについて監修者がチェックしています。LipidBankは日本脂質生化学会の公式データベースです。 
 

文献： 
渡辺清博、八杉悦子、大島美恵子「糖脂質データを日本で新しく作成された生理活性脂質データベース[LIPIDBANK for Web]で検索してみよう」Trend Glycosci. and Glycotechnol. 12, 175-184, 2000.（[https://www.jstage.jst.go.jp/article/tigg1989/12/65/12_65_175/_article/-char/ja/ PDF]）
}}

==Bylaws==
<pre>
日本脂質生化学会脂質データベース構築委員会　規約

（名称）
第1条　本会を日本脂質生化学会脂質データベース構築委員会（以下、委員会という。）と称する。
（設置）
第2条　委員会は、日本脂質生化学会が設置する。
（目的）
第3条　委員会は、脂質データベース“LipidBank”の構築・維持・更新を目的とし、脂質データの集積・更新、データベースシステムの構築・維持、
ならびにこれらに関連する業務をおこなう。
（委員会）
第4条　委員会の委員は、脂質・バイオインフォマティクスに造詣の深い日本脂質生化学会会員で構成され、日本脂質生化学会会長が任命する。
　２　委員会には委員長を置くこととし、原則として日本脂質生化学会会長が兼務するが、委員の中から任命することができる。
　３　委員会に副委員長を置くことができ、日本脂質生化学会会長が任命する。
　４　委員会に顧問を置くことができ、日本脂質生化学会会長が任命する。
　５　顧問は委員会に出席し、意見を述べることができる。
（事務局）
第5条　委員会に、会務に関する事務をおこなうために事務局を置く。事務局長は委員長が指名する。
（雑則）
第6条　この規約に定めるもののほか、必要な事項は別に定める。

附則
本規約は、総会の承認を経て変更することができる。

（平成17年10月1日制定）
（平成29年6月15日改訂）
</pre>

==History (歴史)==
{{Twocolumn|
===LIPID INFORMATION SERVICE (LIPIDBANK) (1984? - 1997)===
The project was started as a database in Japanese around 1984 with Grant-in-Aid for scientific research publication (Akira Hayashi). This database was succeeded in 1989 under the
committee of lipid information (President: Yoshitaka Nagai), organized by the members of The Japanese Conference on the Biochemistry of Lipids (JCBL). The actual construction of the database was managed by the JCBL committee of database construction (President: Akira Hayashi, Vice-president: Nobuo Ueta, Secretary: Kiyohiro Watanabe).

The database included 16 lipid classes: fatty acid, long chain aldehyde, long chain alcohol, long chain base, bile acid, glyceride, phospholipid, glycolipid, lipoprotein, lipopolysaccharide, steroid, prostanoid, ether type lipid, mycolic acid and wax.

Each record contained lipid name, biological activity, source, references, structure and spectra. About 2,700 records were collected and saved on floppy discs.
|
===脂質情報データベース (1984? - 1997)===
LipidBankの淵源は、1984年頃に獲得された科学研究費補助金（研究成果刊行費、代表者：林陽）により構築が開始された日本語のデータベース「脂質情報データベース」である。1989年に、このデータベースは日本脂質生化学会（JCBL）により構成された脂質情報作成委員会（委員長：永井克孝）が立ち上げたプロジェクトに引き継がれ、構築が本格化した。実務は脂質情報データベース構築委員会（委員長：林陽、副委員長：植田伸夫、システム構築と入力：渡邊清博）が担った。 

このデータベースは、脂質を16種類に分類して集積された（脂肪酸、長鎖アルデヒド、長鎖アルコール、長鎖塩基、胆汁酸、グリセリド、リン脂質、糖脂質、リポタンパク質、リポ多糖、ステロイド、プロスタノイド、エーテル型脂質、ミコール酸、ワックスなど）。 

各脂質の名称、生理活性、分布、文献、化学構造、スペクトルデータなどの情報が記載された。約2,700件のデータが集積され、フロッピーディスクで配布された。
}}

{{Twocolumn|
===LIPIDBANK for Web (1996 - 1999)===
The initial three-year project started as a joint research between the International Medical Center of Japan (current National Center for Global Health and Medicine) ([http://www.ncgm.go.jp/ NCGM]) and the Japan Science and Technology Corporation ([http://www.jst.go.jp/ JST]).

A new executive committee was organized (President: Shoshichi Nojima, Vice-president: Mieko Oshima, Secretary: Kiyohiro Watanabe and Etsuko Yasugi).

The committee decided to collect the data on 27 lipid classes in English. Molecules in each class were collected independently under 27 team leaders and 122 data informants.

The database became publicly available from October 1999. The database server was placed at the University of Tokyo where the office of JCBL was located. The total number of molecules was about 5400.

|
===生理活性脂質データベース (1996 - 1999)===

3年間の本プロジェクトは、国立国際医療センター（現：国立国際医療研究センター）([http://www.ncgm.go.jp/ NCGM]) と科学技術振興機構 ([http://www.jst.go.jp/ JST]) との共同研究として発足した。

新たに生理活性脂質データベース構築検討会(委員長：野島庄七、副委員長：大島美恵子、データ入力：渡邊清博、八杉悦子）が結成された。

脂質を27種類に分類して、それぞれの脂質化合物データを英語で集積した。脂質分野ごとに、各脂質を専門とする27名のデータベース構築責任者をおき、122名のデータ提供者によりデータが収載された。

1999年秋にJCBLの事務局があった東京大学にサーバーを設置し、インターネット上に公開された。5,400件の脂質化合物データが収録された。
}}

{{Twocolumn|
===Updating LIPIDBANK for Web (1999 - 2005)===
After adding one lipid class (lipid peroxides), 28 lipid classes were reorganized into 17 lipid groups.

The DERIVED LIPIDS group now includes fatty acid, long chain alcohol, long chain aldehyde, and long chain base and ceramide. The FAT-SOLUBLE VITAMIN group includes carotenoid, coenzyme Q, vitamin A, vitamin D, vitamin E, and vitamin K. The GLYCOLIPID group includes glycosphingolipid, glycoglycerolipid and others. The PHOSPHOLIPID group includes glycerophospholipid, PAF, and sphingophospholipid.

In 2004, JCBL officially established an executive committee (President: Yousuke Seyama, Secretary: Etsuko Yasugi) for updating the database.

|
===生理活性脂質データベースの維持・更新(1999 - 2005)===
新たに過酸化脂質の項目を加えて、17種類の脂質グループに分類して、28種類の脂質化合物について、データ集積をおこなった。

誘導脂質には、脂肪酸、長鎖アルコール、長鎖アルデヒド、長鎖塩基とセラミドが含まれる。脂溶性ビタミンは、カロテノイド、コエンザイムQ、ビタミンA、D、E、Kから構成されている。糖脂質にはスフィンゴ糖脂質とグリセロ糖脂質が、リン脂質にはグリセロリン脂質、PAF、スフィンゴリン脂質が含まれる。

2004年には、脂質データベース構築委員会（委員長：脊山洋右、データ入力：八杉悦子）がJCBLから公認された。
}}

{{Twocolumn|
===Renovating LIPIDBANK for Web (2006-2007)===
LIPIDBANK for Web became the official database of JCBL, to which all rights were delegated from NCGM and JST. The name of database changed to "LipidBank".

The Hopanoid group was removed and the number of category is now 16. The database system and its contents were updated and reorganized by the JCBL committee members (President: Masahiro Nishijima).

|
===生理活性脂質データベースの刷新(2006 - 2007)===
生理活性脂質データベースは2006年にNCGMとJSTから譲渡され、JCBL公認のデータベースとなった。データベースの名称を"LipidBank"と改めた。 

脂質項目のうちホパノイドを削除し、16種類の脂質グループとした。脂質データベース構築委員会（委員長：西島正弘）が、データベースのシステムと内容の維持・更新を担当。

}}

{{Twocolumn|
=== Linking with the Wiki version (2017-2022)===
With financial support from the AMED program "Studies on Specific Activities and Functions of Lipid Molecules to Develop Innovative Medical Technologies" (PS: YOKOYAMA Shinji), wiki-based database was updated for glycosphingolipid and others.

Categories in the original LipidBank were translated into static HTML pages due to security issues.
|
=== LipidBank Wiki との連携 (2017-2022)===
AMED革新的先端研究開発支援事業「画期的医薬品等の創出をめざす脂質の生理活性と機能の解明」（総括：横山信治）より支援を受け、スフィンゴ糖脂質を中心に情報を整理、更新。

旧LipidBankの各カテゴリーはセキュリティ脆弱性のためにコンテンツをHTML固定ページに変換。
}}

===Contact Address===
{{Twocolumn|
If you have questions or suggestions, please contact with:

::Masanori Arita
:::arita@nig.ac.jp
::National Institute of Genetics
|
ご意見やご質問は、下記へお寄せください。
 
::有田正規
:::arita@nig.ac.jp
::国立遺伝学研究所
}}

==Members of Executive Committee of Lipid Database (脂質データベース構築委員会メンバー）==
2025年 3月 4日
<center>
{| class="wikitable"
|-
! colspan="3" style="text-align:center"| 委員長: 青木淳賢 (Junken Aoki)
|-
| colspan="3" style="text-align:center"| 副委員長: 有田　正規 (Masanori Arita), 横山　和明 (Kazuaki Yokoyama)
|-
! colspan="3" style="text-align:center"| 委員
|-
| 有田　誠 (Makoto Arita) || 石川寿樹 (Toshiki Ishikawa) || 和泉孝志 (Takashi Izumi)
|-
| 糸乗　前 (Saki Itonori) || 今井　博之 (Hiroyuki Imai) || 笠間　健嗣 (Takeshi Kasama)
|-
| 北　芳博 (Yoshihiro Kita) || 小林　哲幸 (Tetsuyuki Kobayashi) || 酒井　祥太 (Shota Sakai)
|-
| 中村　和生 (Kazuo Nakamura) || 八杉　悦子 (Etsuko Yasugi) ||
|-
! colspan="3" style="text-align:center"| 顧問
|-
| 大島　美恵子（Mieko Oshima) || 脊山　洋右（Yousuke Seyama) ||
|-
| 清水　孝雄 (Takao Shimizu) || 西島　正弘（Masahiro Nishijima）||
|}
</center>

==Funding (資金）==
{|
|-
|colspan="2"| <big>'''1989 - 1997'''</big>
|-
|LIPID INFORMATION SERVICE was funded by a Grant-in-Aid for Scientific Research (Grant-in-Aid for Publication of Scientific Research Results) from the Japan Society for the Promotion of Science.
|LIPID INFORMATION SERVICEが日本学術振興会([http://www.jsps.go.jp/ JSPS])科学研究費に採択される。
|-
|colspan="2"| <big>'''1996 - 2002'''</big>
|-
|LIPIDBANK for Web was funded by the Database Development Program of the Japan Science and Technology Agency (JST).
|LIPIDBANK for Webが科学技術振興機構([http://www.jst.go.jp/ JST])に採択される。
|-
|colspan="2"| <big>'''2003 - 2006''', '''2009 - 2016'''</big>
|-
|LIPIDBANK for Web was funded by a Grant-in-Aid for Scientific Research (Grant-in-Aid for Publication of Scientific Research Results) from the Japan Society for the Promotion of Science.
|日本学術振興会([http://www.jsps.go.jp/ JSPS])科学研究費の研究成果公開促進費データベース事業による更新。
|-
|colspan="2"| <big>'''2017 - 2022'''</big>
|-
|LIPIDBANK was funded by AMED-CREST in "Studies on Specific Activities and Functions of Lipid Molecules to Develop Innovative Medical Technologies".
|AMED革新的先端研究開発支援事業「画期的医薬品等の創出をめざす脂質の生理活性と機能の解明」（総括：横山信治）による更新。
|}

==構築委員会の歴史==
{| class="wikitable"
|-
| 第1回 || 1997年1月8日 || 国立国際医療センター研究所 || 生理活性脂質データベース構築委員会
|-
| 第10回 || 2004年3月25日 ||学士会分館 || 脂質情報データベース推進委員会
|-
| 第20回 || 2007年3月8日 || 東京大学　医学部 || 脂質データベース構築委員会
|-
| 第30回 || 2015年5月29日 || 東京大学　薬学部 || 脂質データベース構築委員会
|-
| 第34回 || 2019年7月5日 || 北海道大学 || 脂質データベース構築委員会
|-
|colspan="4"| 2020-2022 年はCOVID-19のために中止。JCBLホームページを2010-2021年まで本サーバで維持管理してきたが、2021年より新サイト (jcbl.jp) に移行。
|-
|
|}

JCBL:DBmeeting

2025-03-05T04:27:44Z

Editor: /* Members of Executive Committee of Lipid Database (脂質データベース構築委員会メンバー） */

==About LipidBank==

{{Twocolumn|
"LipidBank" is an open, publicly free database of natural lipids including fatty acids, glycerolipids, sphingolipids, steroids, and various vitamins.

The database contains more than 6000 unique molecular structures (ChemDraw cdx format, MDL MOL format), their lipid names (common name, IUPAC), spectral information (mass, UV, IR, NMR and others), and most importantly, literature information.

The database lists natural lipids only, and all molecular information is manually curated and approved by experts in lipid research (see Informant in each record).

LipidBank is the official database of the Japanese Conference on the Biochemistry of Lipids (JCBL).

 '''Reference:''' 
Watanabe K., Yasugi E. and Oshima M. "How to search the glycolipid data in LIPIDBANK for Web: the newly developed lipid database in Japan" Trend Glycosci. and Glycotechnol. 12, 175-184, 2000. ([https://www.jstage.jst.go.jp/article/tigg1989/12/65/12_65_175/_article/-char/ja/ PDF])
|
LipidBankは、脂肪酸、グリセロ脂質、スフィンゴ脂質、ステロイド、各種ビタミンを含む天然脂質の公開データベースです。 

現在6000以上の天然物構造（ChemDraw cdx形式、MDL MOL形式）について、物質名（慣用名とIUPAC）、スペクトル情報（質量、UV, IR, NMRほか）に加えて、文献情報も掲載しています。 

このデータベースは天然物を対象としており、全データについて監修者がチェックしています。LipidBankは日本脂質生化学会の公式データベースです。 
 

文献： 
渡辺清博、八杉悦子、大島美恵子「糖脂質データを日本で新しく作成された生理活性脂質データベース[LIPIDBANK for Web]で検索してみよう」Trend Glycosci. and Glycotechnol. 12, 175-184, 2000.（[https://www.jstage.jst.go.jp/article/tigg1989/12/65/12_65_175/_article/-char/ja/ PDF]）
}}

==Bylaws==
<pre>
日本脂質生化学会脂質データベース構築委員会　規約

（名称）
第1条　本会を日本脂質生化学会脂質データベース構築委員会（以下、委員会という。）と称する。
（設置）
第2条　委員会は、日本脂質生化学会が設置する。
（目的）
第3条　委員会は、脂質データベース“LipidBank”の構築・維持・更新を目的とし、脂質データの集積・更新、データベースシステムの構築・維持、
ならびにこれらに関連する業務をおこなう。
（委員会）
第4条　委員会の委員は、脂質・バイオインフォマティクスに造詣の深い日本脂質生化学会会員で構成され、日本脂質生化学会会長が任命する。
　２　委員会には委員長を置くこととし、原則として日本脂質生化学会会長が兼務するが、委員の中から任命することができる。
　３　委員会に副委員長を置くことができ、日本脂質生化学会会長が任命する。
　４　委員会に顧問を置くことができ、日本脂質生化学会会長が任命する。
　５　顧問は委員会に出席し、意見を述べることができる。
（事務局）
第5条　委員会に、会務に関する事務をおこなうために事務局を置く。事務局長は委員長が指名する。
（雑則）
第6条　この規約に定めるもののほか、必要な事項は別に定める。

附則
本規約は、総会の承認を経て変更することができる。

（平成17年10月1日制定）
（平成29年6月15日改訂）
</pre>

==History (歴史)==
{{Twocolumn|
===LIPID INFORMATION SERVICE (LIPIDBANK) (1984? - 1997)===
The project was started as a database in Japanese around 1984 with Grant-in-Aid for scientific research publication (Akira Hayashi). This database was succeeded in 1989 under the
committee of lipid information (President: Yoshitaka Nagai), organized by the members of The Japanese Conference on the Biochemistry of Lipids (JCBL). The actual construction of the database was managed by the JCBL committee of database construction (President: Akira Hayashi, Vice-president: Nobuo Ueta, Secretary: Kiyohiro Watanabe).

The database included 16 lipid classes: fatty acid, long chain aldehyde, long chain alcohol, long chain base, bile acid, glyceride, phospholipid, glycolipid, lipoprotein, lipopolysaccharide, steroid, prostanoid, ether type lipid, mycolic acid and wax.

Each record contained lipid name, biological activity, source, references, structure and spectra. About 2,700 records were collected and saved on floppy discs.
|
===脂質情報データベース (1984? - 1997)===
LipidBankの淵源は、1984年頃に獲得された科学研究費補助金（研究成果刊行費、代表者：林陽）により構築が開始された日本語のデータベース「脂質情報データベース」である。1989年に、このデータベースは日本脂質生化学会（JCBL）により構成された脂質情報作成委員会（委員長：永井克孝）が立ち上げたプロジェクトに引き継がれ、構築が本格化した。実務は脂質情報データベース構築委員会（委員長：林陽、副委員長：植田伸夫、システム構築と入力：渡邊清博）が担った。 

このデータベースは、脂質を16種類に分類して集積された（脂肪酸、長鎖アルデヒド、長鎖アルコール、長鎖塩基、胆汁酸、グリセリド、リン脂質、糖脂質、リポタンパク質、リポ多糖、ステロイド、プロスタノイド、エーテル型脂質、ミコール酸、ワックスなど）。 

各脂質の名称、生理活性、分布、文献、化学構造、スペクトルデータなどの情報が記載された。約2,700件のデータが集積され、フロッピーディスクで配布された。
}}

{{Twocolumn|
===LIPIDBANK for Web (1996 - 1999)===
The initial three-year project started as a joint research between the International Medical Center of Japan (current National Center for Global Health and Medicine) ([http://www.ncgm.go.jp/ NCGM]) and the Japan Science and Technology Corporation ([http://www.jst.go.jp/ JST]).

A new executive committee was organized (President: Shoshichi Nojima, Vice-president: Mieko Oshima, Secretary: Kiyohiro Watanabe and Etsuko Yasugi).

The committee decided to collect the data on 27 lipid classes in English. Molecules in each class were collected independently under 27 team leaders and 122 data informants.

The database became publicly available from October 1999. The database server was placed at the University of Tokyo where the office of JCBL was located. The total number of molecules was about 5400.

|
===生理活性脂質データベース (1996 - 1999)===

3年間の本プロジェクトは、国立国際医療センター（現：国立国際医療研究センター）([http://www.ncgm.go.jp/ NCGM]) と科学技術振興機構 ([http://www.jst.go.jp/ JST]) との共同研究として発足した。

新たに生理活性脂質データベース構築検討会(委員長：野島庄七、副委員長：大島美恵子、データ入力：渡邊清博、八杉悦子）が結成された。

脂質を27種類に分類して、それぞれの脂質化合物データを英語で集積した。脂質分野ごとに、各脂質を専門とする27名のデータベース構築責任者をおき、122名のデータ提供者によりデータが収載された。

1999年秋にJCBLの事務局があった東京大学にサーバーを設置し、インターネット上に公開された。5,400件の脂質化合物データが収録された。
}}

{{Twocolumn|
===Updating LIPIDBANK for Web (1999 - 2005)===
After adding one lipid class (lipid peroxides), 28 lipid classes were reorganized into 17 lipid groups.

The DERIVED LIPIDS group now includes fatty acid, long chain alcohol, long chain aldehyde, and long chain base and ceramide. The FAT-SOLUBLE VITAMIN group includes carotenoid, coenzyme Q, vitamin A, vitamin D, vitamin E, and vitamin K. The GLYCOLIPID group includes glycosphingolipid, glycoglycerolipid and others. The PHOSPHOLIPID group includes glycerophospholipid, PAF, and sphingophospholipid.

In 2004, JCBL officially established an executive committee (President: Yousuke Seyama, Secretary: Etsuko Yasugi) for updating the database.

|
===生理活性脂質データベースの維持・更新(1999 - 2005)===
新たに過酸化脂質の項目を加えて、17種類の脂質グループに分類して、28種類の脂質化合物について、データ集積をおこなった。

誘導脂質には、脂肪酸、長鎖アルコール、長鎖アルデヒド、長鎖塩基とセラミドが含まれる。脂溶性ビタミンは、カロテノイド、コエンザイムQ、ビタミンA、D、E、Kから構成されている。糖脂質にはスフィンゴ糖脂質とグリセロ糖脂質が、リン脂質にはグリセロリン脂質、PAF、スフィンゴリン脂質が含まれる。

2004年には、脂質データベース構築委員会（委員長：脊山洋右、データ入力：八杉悦子）がJCBLから公認された。
}}

{{Twocolumn|
===Renovating LIPIDBANK for Web (2006-2007)===
LIPIDBANK for Web became the official database of JCBL, to which all rights were delegated from NCGM and JST. The name of database changed to "LipidBank".

The Hopanoid group was removed and the number of category is now 16. The database system and its contents were updated and reorganized by the JCBL committee members (President: Masahiro Nishijima).

|
===生理活性脂質データベースの刷新(2006 - 2007)===
生理活性脂質データベースは2006年にNCGMとJSTから譲渡され、JCBL公認のデータベースとなった。データベースの名称を"LipidBank"と改めた。 

脂質項目のうちホパノイドを削除し、16種類の脂質グループとした。脂質データベース構築委員会（委員長：西島正弘）が、データベースのシステムと内容の維持・更新を担当。

}}

{{Twocolumn|
=== Linking with the Wiki version (2017-2022)===
With financial support from the AMED program "Studies on Specific Activities and Functions of Lipid Molecules to Develop Innovative Medical Technologies" (PS: YOKOYAMA Shinji), wiki-based database was updated for glycosphingolipid and others.

Categories in the original LipidBank were translated into static HTML pages due to security issues.
|
=== LipidBank Wiki との連携 (2017-2022)===
AMED革新的先端研究開発支援事業「画期的医薬品等の創出をめざす脂質の生理活性と機能の解明」（総括：横山信治）より支援を受け、スフィンゴ糖脂質を中心に情報を整理、更新。

旧LipidBankの各カテゴリーはセキュリティ脆弱性のためにコンテンツをHTML固定ページに変換。
}}

===Contact Address===
{{Twocolumn|
If you have questions or suggestions, please contact with:

::Masanori Arita
:::arita@nig.ac.jp
::National Institute of Genetics
|
ご意見やご質問は、下記へお寄せください。
 
::有田正規
:::arita@nig.ac.jp
::国立遺伝学研究所
}}

==Members of Executive Committee of Lipid Database (脂質データベース構築委員会メンバー）==
2025年 3月 4日
<center>
{| class="wikitable"
|-
! colspan="3" style="text-align:center"| 委員長: 青木淳賢 (Junken Aoki)
|-
| colspan="3" style="text-align:center"| 副委員長: 有田　正規 (Masanori Arita), 横山　和明 (Kazuaki Yokoyama)
|-
! colspan="3" style="text-align:center"| 委員
|-
| 有田　誠 (Makoto Arita) || 石川寿樹 (Toshiki Ishikawa) || 和泉孝志 (Takashi Izumi)
|-
| 糸乗　前 (Saki Itonori) || 今井　博之 (Hiroyuki Imai) || 笠間　健嗣 (Takeshi Kasama)
|-
| 北　芳博 (Yoshihiro Kita) || 小林　哲幸 (Tetsuyuki Kobayashi) || 酒井　祥太 (Shota Sakai)
|-
| 中村　和生 (Kazuo Nakamura) || 八杉　悦子 (Etsuko Yasugi) ||
|-
! colspan="3" style="text-align:center"| 顧問 (Advisors)
|-
| 大島　美恵子（Mieko Oshima) || 脊山　洋右（Yousuke Seyama) ||
|-
| 清水　孝雄 (Takao Shimizu) || 西島　正弘（Masahiro Nishijima）||
|}
</center>

==Funding (資金）==
{|
|-
|colspan="2"| <big>'''1989 - 1997'''</big>
|-
|LIPID INFORMATION SERVICE was funded by a Grant-in-Aid for Scientific Research (Grant-in-Aid for Publication of Scientific Research Results) from the Japan Society for the Promotion of Science.
|LIPID INFORMATION SERVICEが日本学術振興会([http://www.jsps.go.jp/ JSPS])科学研究費に採択される。
|-
|colspan="2"| <big>'''1996 - 2002'''</big>
|-
|LIPIDBANK for Web was funded by the Database Development Program of the Japan Science and Technology Agency (JST).
|LIPIDBANK for Webが科学技術振興機構([http://www.jst.go.jp/ JST])に採択される。
|-
|colspan="2"| <big>'''2003 - 2006''', '''2009 - 2016'''</big>
|-
|LIPIDBANK for Web was funded by a Grant-in-Aid for Scientific Research (Grant-in-Aid for Publication of Scientific Research Results) from the Japan Society for the Promotion of Science.
|日本学術振興会([http://www.jsps.go.jp/ JSPS])科学研究費の研究成果公開促進費データベース事業による更新。
|-
|colspan="2"| <big>'''2017 - 2022'''</big>
|-
|LIPIDBANK was funded by AMED-CREST in "Studies on Specific Activities and Functions of Lipid Molecules to Develop Innovative Medical Technologies".
|AMED革新的先端研究開発支援事業「画期的医薬品等の創出をめざす脂質の生理活性と機能の解明」（総括：横山信治）による更新。
|}

==構築委員会の歴史==
{| class="wikitable"
|-
| 第1回 || 1997年1月8日 || 国立国際医療センター研究所 || 生理活性脂質データベース構築委員会
|-
| 第10回 || 2004年3月25日 ||学士会分館 || 脂質情報データベース推進委員会
|-
| 第20回 || 2007年3月8日 || 東京大学　医学部 || 脂質データベース構築委員会
|-
| 第30回 || 2015年5月29日 || 東京大学　薬学部 || 脂質データベース構築委員会
|-
| 第34回 || 2019年7月5日 || 北海道大学 || 脂質データベース構築委員会
|-
|colspan="4"| 2020-2022 年はCOVID-19のために中止。JCBLホームページを2010-2021年まで本サーバで維持管理してきたが、2021年より新サイト (jcbl.jp) に移行。
|-
|
|}

Category:LBS

2024-05-28T06:42:07Z

Editor:

{{Huge|{{Bilingual|スフィンゴ脂質|Sphingolipid}}}}
{{LB/Header}}
{{Hierarchy|{{PAGENAME}}}}
{| style="float:left"
| __TOC__
|}
=={{Bilingual|概要|Class Overview}}==

{{Twocolumn|
Three Sphingolipid categories (LBS) exist in this database.
|このデータベースではスフィンゴ脂質を以下に分けています。
}}

<center>
{|
|-
| style="vertical-align:top" width="33%"|
[[:Category:LBSB| '''Ceramide''']] {{LBS/Cer|OH}} セラミド
| style="vertical-align:top" width="33%"|
[[:Category:LBS#スフィンゴ糖脂質 Glycosphingolipid|'''Glycosphingolipid''']] {{LBS/Cer|O-(sugar)}} スフィンゴ糖脂質
| style="vertical-align:top" width="33%"|
[[:Category:LBSP| '''Phosphosphingolipid''']] {{LBS/Cer|O-(phosphate)}} スフィンゴリン脂質
|-
|
*[[:Category:LBSB|Long-chain base and ceramide]]
|
*[[:Category:LBSC|Cerebroside (monohexosyl ceramides)]]
*[[:Category:LBSG|Acidic glycosphingolipid]]
|
*[[:Category:LBSP|Sphingomyelin, CPE, CAEP and GIPC]]
|}
</center>

<center>
{| class="wikitable"
|<big>
[[:Category:LBS/Search|{{Bilingual|スフィンゴ脂質検索画面にいく|Go to Sphingolipid search.}}]]
</big>
|}
</center>

==スフィンゴ脂質 Sphingolipid==

==={{Bilingual|表記法|Notation}}===
{| class="wikitable collapsible collapsed" style="width:80%"
!colspan="4" align="center" style="background:lightgray"| Symbol Abbreviations (e.g. Glc = glucose)
|-
!colspan="4" align="center" style="background:lightgray"| Backbones
{{#repeatnum:LBS/AbbrevRow|1|
Cer && ceramide && セラミド &&
Sph && sphingosine && スフィンゴシン &&
}}
|-
!colspan="4" align="center" style="background:lightgray"| Sugars
{{#repeatnum:LBS/AbbrevRow|1|
Glc && glucose && グルコース && C6H12O6 &&
Gal && galactose && ガラクトース && C6H12O6 &&
GlcNAc && ''N''-acetyl-glucosamine && ''N''-アセチルグルコサミン && C8H15NO6
GalNAc && ''N''-acetyl-galactosamine && ''N''-アセチルガラクトサミン && C8H15NO6
GlcN && glucosamine && グルコサミン && C6H13NO5
GalN && galactosamine && ガラクトサミン && C6H13NO5
GlcA && glucuronic acid && グルクロン酸 && C6H10O7
GalA && galacturonic acid && ガラクツロン酸 && C6H10O7 &&
Man && mannose && マンノース && C6H12O6 && 18950
Rha && rhamnose (= 6-deoxy-mannose) && ラムノース (6-デオキシマンノース) && C6H12O5 && 19233
Ins && inositol && イノシトール && C6H12O6 && 892
Fuc && fucose (= 6-deoxy-galactose) && フコース (6-デオキシガラクトース) && C6H12O5 && 17106
Ara && arabinose && アラビノース && C5H10O5 && 5460291
Xyl && xylose && キシロース && C5H10O5 && 135191
NeuNH && (deacetyl) neuraminic acid (pyruvate + mannosamine) && ノイラミン酸 (ピルビン酸＋マンノサミン) && C9H17N1O8 && 513472
NeuAc && ''N''-acetyl-neuraminic acid && ''N''-アセチルノイラミン酸 && C11H19NO9 && 439197
NeuGc && ''N''-glycolyl-neuraminic acid && ''N''-グリコリルノイラミン酸 && C11H19NO10 && 123802
Kdn && 2-keto-3-deoxy-D-glycero- D-galacto-nononic acid && デアミノノイラミン酸 && C9H16O9 && 13991616
}}
|-
!colspan="4" align="center" style="background:lightgray"| Modifiers
{{#repeatnum:LBS/AbbrevRow|1|
AEPn && aminoethylphosphonic acid, or (2-aminoethyl)hydroxyphosphoryl- && アミノエチルホスホン酸（C-P結合）
MAEPn && ''N''-methyl aminoethylphosphonic acid, or (''N''-methyl-2-aminoethyl) hydroxyphosphoryl- && AEPnの''N''-メチル体（C-P結合）
EtnP && phosphoethanolamine (PEA), or 2-aminoethanolphospho- && ホスホエタノールアミン
PC && Phosphocholine && ホスホコリン
Butenyl && Butenyl && ブテニル基
Me && Methyl && メチル基
Et && Ethyl && エチル基
}}
|}

===分類体系 ID-Code Design===
{{Twocolumn|
Major series of phosphosphingolipids are determined by molecules bound to their phosphates, and the series of glycosphingolipids are determined by oligosaccharides bound to their ceramides. The IUPAC series of glycosphingolipids (1977) were based on the order and bonding patterns of four sugars rooting at the long-chain base. Our series, however, are based on three sugars. Two original series, Echino and Schisto, are also added.
|スフィンゴリン脂質はリン酸に結合する分子や糖の種類、スフィンゴ糖脂質はセラミドに結合する糖鎖により系列を作成しています。1977年にIUPACが提唱したスフィンゴ糖脂質の系列は、長鎖塩基に結合する四糖の並びと結合を基準にしています。ここではより広い糖鎖の系列を検索できるよう、三糖を基準に分類しています。また新たにEchinoとSchistoの系列を加えています。
}}

{|
|
<table border=1>
<tr>
<td style="background-color:yellowgreen;" width=20px align="center"><big>L</big>
<td style="background-color:yellowgreen;" width=20px align="center"><big>B</big>
<td style="background-color:yellowgreen;" width=20px align="center"><big>S</big>
<td style="background-color:green;" width=20px align="center"><big>''G/P''</big>
<td style="background-color:Blue; color:white" width=20px align="center"><big>''s1''</big>
<td style="background-color:Blue; color:white" width=20px align="center"><big>''s2''</big>
<td style="background-color:tomato; color:white" width=20px align="center"><big>''n1''</big>
<td style="background-color:tomato; color:white" width=20px align="center"><big>''n2''</big>
<td style="background-color:firebrick; color:white" width=20px align="center"><big>''y''</big>
<td style="background-color:white;" width=20px align="center"><big>''c1''</big>
<td style="background-color:white;" width=20px align="center"><big>''c2''</big>
</tr>
</table>
|  
|
{| class="wikitable"
! '''G/P''' || '''G''' (glyco) || '''P''' (phospho)
|-
! '''s1, s2'''
|colspan="3"| structure code as explained below
|-
! '''n1, n2'''
|colspan="2"| number of sugars (2 digits)
|-
! '''y'''
|colspan="2"| number of sialic acids (1 digit)
|-
! '''c1, c2'''
|colspan="2"| serial numbers
|}
|}

===スフィンゴ糖脂質 Glycosphingolipid===

{| class="wikitable" style="text-align:right; background-color:white"
! First sugar || Code || Root sequence
! colspan=2 | Major Series
|-
! Cerebroside
| colspan="3" style="text-align:left" | '''For GalCer and GlcCer, visit [[:Category:LBSC|this page]].'''
|-
! starting with <big>Galactose</big>
| {{#volatile:ListMol/LBStitle|G1|LBSG1}} ({{#volatile:ClassMatrix|{{#countTitle:LBSG1}} items|LBSG1.....|7|8|9|9|Number_of_Sugars|Number_of_Sialic_acids}})
|style="text-align:right"| '''Gal'''-Cer
|
{| style="width:100%;"
|style="border:0;text-align:left"| {{#volatile:ListMol/LBS|Gala / Neogala|Mainchain.*Gala1-4?6?Galb1-Cer}}
|style="border:0;text-align:right"| {{#invoke:LBS|FormatSugar|Gala1-4/6Galb1-Cer}}
|-
|style="border:0;text-align:left"|{{#volatile:ListMol/LBS|Spirometo|Mainchain.*Galb1-4Glcb1-3Galb1-Cer}}
|style="border:0;text-align:right"| {{#invoke:LBS|FormatSugar|Galb1-4Glcb1-3Galb1-Cer}}
|}
|-
! rowspan="8" | starting with <big>Glucose</big>
|-
| {{#volatile:ListMol/LBStitle|G2|LBSG2}} ({{#volatile:ClassMatrix|{{#countTitle:LBSG2}} items|LBSG2.....|7|8|9|9|Number_of_Sugars|Number_of_Sialic_acids}})
|style="text-align:right"| '''GalNAcβ'''-Galβ-Glcβ-Cer
|
{| style="width:100%"
|-
|style="border:0;text-align:left"| {{#volatile:ListMol/LBS|Ganglio|Mainchain.*GalNAcb1-4Galb1-4Glcb1-Cer}}
|style="border:0;text-align:right"| {{#invoke:LBS|FormatSugar|GalNAcb1-4Galb1-4Glcb1-Cer}}
|-
|style="border:0;text-align:left"| {{#volatile:ListMol/LBS|Isoganglio|Mainchain.*GalNAcb1-3Galb1-4Glcb1-Cer}}<ref name="iso">In IUPAC, "iso" refers to a change from position 4 to position 3.</ref>
|style="border:0;text-align:right"| {{#invoke:LBS|FormatSugar|GalNAcb1-3Galb1-4Glcb1-Cer}}
|-
|style="border:0;text-align:left"| {{#volatile:ListMol/LBS|Lactoganglio|Structure.*GlcNAcb1-3$.*GalNAcb1-4$Galb1-4Glcb1-Cer}}
|style="border:0;text-align:right"| {{#invoke:LBS|FormatSugar|GlcNAcb1-3(GalNAcb1-4)Galb1-4Glcb1-Cer}}
|-
|style="border:0;text-align:left"| {{#volatile:ListMol/LBS|a-series|Structure.*$?NeuAca2-3$?Galb1-4Glcb1-Cer}}
|style="border:0;text-align:right"| {{#invoke:LBS|FormatSugar|GalNAcb1-4(NeuAca2-3)Galb1-4Glcb1-Cer}}
|-
|style="border:0;text-align:left"| {{#volatile:ListMol/LBS|b-series|Structure.*$?NeuAca2-8NeuAca2-3$?Galb1-4Glcb1-Cer}}
|style="border:0;text-align:right"| {{#invoke:LBS|FormatSugar|GalNAcb1-4(NeuAca2-8NeuAca2-3)Galb1-4Glcb1-Cer}}
|-
|style="border:0;text-align:left"| {{#volatile:ListMol/LBS|c-series|Structure.*$?NeuAca2-8NeuAca2-8NeuAca2-3$?Galb1-4Glcb1-Cer}}
|style="border:0;text-align:right"| {{#invoke:LBS|FormatSugar|GalNAcb1-4(NeuAca2-8NeuAca2-8NeuAca2-3)Galb1-4Glcb1-Cer}}
|-
|style="border:0;text-align:left"| {{#volatile:ListMol/LBS|α-series|Structure.*$?NeuAca2-6$?GalNAcb1-4Galb1-4Glcb1-Cer}}
|style="border:0;text-align:right"| {{#invoke:LBS|FormatSugar|...(NeuAca2-6)GalNAcb1-4Galb1-4Glcb1-Cer}}
|-
|style="border:0;text-align:left"| {{#volatile:ListMol/LBS|β-series|Structure.*$?NeuAca2-8NeuAca2-6$?GalNAcb1-4Galb1-4Glcb1-Cer}}
|style="border:0;text-align:right"| {{#invoke:LBS|FormatSugar|...(NeuAca2-8NeuAca2-6)GalNAcb1-4Galb1-4Glcb1-Cer}}
|}
|-
| {{#volatile:ListMol/LBStitle|G3|LBSG3}} ({{#volatile:ClassMatrix|{{#countTitle:LBSG3}} items|LBSG3.....|7|8|9|9|Number_of_Sugars|Number_of_Sialic_acids}})
|style="text-align:right"| '''GlcNAcβ'''-Galβ-Glcβ-Cer
|
{| style="width:100%"
|-
|style="border:0;text-align:left"| {{#volatile:ListMol/LBS|Lacto|Mainchain.*Galb1-3GlcNAcb1-3Galb1-4Glcb1-Cer}}
|style="border:0;text-align:right"| {{#invoke:LBS|FormatSugar|Galb1-3GlcNAcb1-3Galb1-4Glcb1-Cer}}
|-
|style="border:0;text-align:left"| {{#volatile:ListMol/LBS|Neolacto|Mainchain.*Gal.1-4GlcNAcb1-3Galb1-4Glcb1-Cer}}<ref name="neo">In IUPAC, "neo" refers to a change from position 3 to position 4.</ref>
|style="border:0;text-align:right"| {{#invoke:LBS|FormatSugar|Galb1-4GlcNAcb1-3Galb1-4Glcb1-Cer}}
|}
|-
| {{#volatile:ListMol/LBStitle|G4|LBSG4}} ({{#volatile:ClassMatrix|{{#countTitle:LBSG4}} items|LBSG4.....|7|8|9|9|Number_of_Sugars|Number_of_Sialic_acids}})
|style="text-align:right"| '''Galα'''-Galβ-Glcβ-Cer
|
{| style="width:100%"
|-
|style="border:0;text-align:left"| {{#volatile:ListMol/LBS|Globo|Mainchain.*Gala1-4Galb1-4Glcb1-Cer}}
|style="border:0;text-align:right"| {{#invoke:LBS|FormatSugar|Gala1-4Galb1-4Glcb1-Cer}}
|-
|style="border:0;text-align:left"| {{#volatile:ListMol/LBS|Isoglobo|Mainchain.*Gala1-3Galb1-4Glcb1-Cer}}<ref name="iso"/>
|style="border:0;text-align:right"| {{#invoke:LBS|FormatSugar|Gala1-3Galb1-4Glcb1-Cer}}
|}
|-
| {{#volatile:ListMol/LBStitle|G5|LBSG5}} ({{#volatile:ClassMatrix|{{#countTitle:LBSG5}} items|LBSG5.....|7|8|9|9|Number_of_Sugars|Number_of_Sialic_acids}})
|style="text-align:right"| Gal-Glc-Cer (Other than G2&sim;G4)
|
{| style="width:100%"
|style="border:0;text-align:left"| {{#volatile:ListMol/LBS|Muco|Mainchain.*Galb1-4Galb1-4Glcb1-Cer}}
|style="border:0;text-align:right"| {{#invoke:LBS|FormatSugar|Galb1-4Galb1-4Glcb1-Cer}}
|}
|-
| {{#volatile:ListMol/LBStitle|G6|LBSG6}} ({{#volatile:ClassMatrix|{{#countTitle:LBSG6}} items|LBSG6.....|7|8|9|9|Number_of_Sugars|Number_of_Sialic_acids}})
|style="text-align:right"| '''Man'''-Glcβ-Cer
|
{| style="width:100%"
|style="border:0;text-align:left"| {{#volatile:ListMol/LBS|Arthro|Mainchain.*GlcNAcb1-3Manb1-4Glcb1-Cer}}
|style="border:0;text-align:right"| {{#invoke:LBS|FormatSugar|GlcNAcb1-3Manb1-4Glcb1-Cer}}
|-
|style="border:0;text-align:left"| {{#volatile:ListMol/LBS|Mollu|Mainchain.*Mana1-3Manb1-4Glcb1-Cer}}
|style="border:0;text-align:right"| {{#invoke:LBS|FormatSugar|Mana1-3Manb1-4Glcb1-Cer}}
|}
|-
| {{#volatile:ListMol/LBStitle|G7|LBSG7}} ({{#volatile:ClassMatrix|{{#countTitle:LBSG7}} items|LBSG7.....|7|8|9|9|Number_of_Sugars|Number_of_Sialic_acids}})
|style="text-align:right"| '''NeuAc'''/'''NeuGc'''-Glcβ-Cer
|
{| style="width:100%"
|style="border:0;text-align:left"| {{#volatile:ListMol/LBS|Echino|Mainchain.*Neu(A~G)c.2-6Glcb1-Cer}}
|style="border:0;text-align:right"| '''NeuGc''' or {{#invoke:LBS|FormatSugar|NeuAca2-6Glcb1-Cer}}
|}
|-
| {{#volatile:ListMol/LBStitle|G8|LBSG8}} ({{#volatile:ClassMatrix|{{#countTitle:LBSG8}} items|LBSG8.....|7|8|9|9|Number_of_Sugars|Number_of_Sialic_acids}})
|style="text-align:right"| '''GalNAc'''-Glc-Cer
|
{| style="width:100%"
|style="border:0;text-align:left"| {{#volatile:ListMol/LBS|Schisto|Mainchain.*GalNAc.1-4Glc.1-Cer}}<ref>Makaaru CK, Damian RT, Smith DF, Cummings RD. "The human blood fluke Schistosoma mansoni synthesizes a novel type of glycosphingolipid" J Biol Chem 1992 267:2251-2257 PMID 1733932</ref>
|style="border:0;text-align:right"| {{#invoke:LBS|FormatSugar|GalNAcb1-4Glcb1-Cer}}
|}
|-
! starting with <big>Other Sugars</big>
| {{#volatile:ListMol/LBStitle|G(A&sim;R)|LBSG(A~B~C~D~E~F~G~H~J~K~M~N~O~P~Q~R)}}
|colspan="2"| Symbols follow the [[:Category:LBS#Sugar-Digit Table]].
|}
<references/>

===スフィンゴリン脂質 Phosphosphingolipid===
{| class="wikitable" style="text-align:right; background-color:white"
! First sugar || Code || Root sequence
!colspan="2"| Major Series
|-
! No Sugar Attached
| '''P1''' ([[:Category:LBSP|LBSP]])
| R-P-Cer
| Sphingomyelin and Ceramide phosphoetanolamine (Visit [[:Category:LBSP|this page]].)
|-
! rowspan="4" | starting with <big>Inositol</big>
| {{#volatile:ListMol/LBStitle|P2|LBSP2}} ({{#countTitle:LBSP2}} items)
| style="text-align:right"| '''GlcN'''α/β1−2/6Ins1-P-Cer
|
{|style="width:100%"
|style="border:0;text-align:left"| {{#volatile:ListMol/LBS|Protozoa & Fungi-specific|Mainchain.*GlcN.1-.Ins-P-Cer}}
| style="border:0;text-align:right"| {{#invoke:LBS|FormatSugar|GlcNa/b1-2/6Ins1-P-Cer}}
|}
|-
| {{#volatile:ListMol/LBStitle|P3|LBSP3}} ({{#countTitle:LBSP3}} items)
|style="text-align:right"| '''GlcA'''α/β1−2/6Ins1-P-Cer
|
{|style="width:100%"
|style="border:0;text-align:left"| {{#volatile:ListMol/LBS|Plant-specific|Mainchain.*GlcA.1-.Ins-P-Cer}}
|style="border:0;text-align:right"| {{#invoke:LBS|FormatSugar|GlcAa/b1-2/6Ins1-P-Cer}}
|}
|-
| {{#volatile:ListMol/LBStitle|P4|LBSP4}} ({{#countTitle:LBSP4}} items)
| style="text-align:right"| '''Man'''α/β1−2/6Ins1-P-Cer
|
{| style="width:100%"
| style="border:0;text-align:left"| {{#volatile:ListMol/LBS|Fungi-specific|Mainchain.*Man.1-.Ins-P-Cer}}
| style="border:0;text-align:right"| {{#invoke:LBS|FormatSugar|Mana/b1-2/6Ins1-P-Cer}}
|}
|-
| {{#volatile:ListMol/LBStitle|P5|LBSP5}} ({{#countTitle:LBSP5}} items)
| style="text-align:right"| Gal, Glc, and Others
| style="text-align:right"| {{#invoke:LBS|FormatSugar|X-Ins1-P-Cer}}
|}

===Sugar-Digit Table===

{{Bilingual|クリックすると一覧が出ます。記号の略称については|Click to see the full list. For abbreviations, see}} [[#Notation]].

{|
|-
| valign="top"|
{| class="wikitable"
|-
! Code || Structure
|-
! '''A'''
| Glc [[File:LBS-Monomer-Glc.png]]
|-
! '''B'''
| Gal [[File:LBS-Monomer-Gal.png]]
|-
! '''C'''
| GlcNAc [[File:LBS-Monomer-GlcNAc.png]]
|-
! '''D'''
| GalNAc [[File:LBS-Monomer-GalNAc.png]]
|-
! '''E'''
| GlcN [[File:LBS-Monomer-GlcN.png]]
|-
! '''F'''
| GalN [[File:LBS-Monomer-GalN.png]]
|-
! '''G'''
| GlcA [[File:LBS-Monomer-GlcA.png]]
|-
! '''H'''
| GalA [[File:LBS-Monomer-GalA.png]]
|-
! '''I'''
| not used
|}
|valign="top"|
{| class="wikitable"
|-
! Code || Structure
|-
! '''J'''
| {{#volatile:ListMol/LBS|Mannose|Structure.*Man}} [[File:LBS-Monomer-Man.png]]
|-
! '''K'''
| {{#volatile:ListMol/LBS|Rhamnose|Structure.*Rha}} [[File:LBS-Monomer-Rha.png]]
|-
! '''L'''
| {{#volatile:ListMol/LBS|Inositol|Structure.*Ins(Me)?-P-[^Cer]}}
|-
! '''M'''
| Fucose ({{#volatile:ListMol/LBS| 1|Structure[^F]+Fuc[^F]+$}}, {{#volatile:ListMol/LBS|2|Structure([^F]+Fuc){2}[^F]+$}}, {{#volatile:ListMol/LBS|>3|Structure([^F]+Fuc){3} }}) [[File:LBS-Monomer-Fuc.png]]
|-
! '''N'''
| {{#volatile:ListMol/LBS|Arabinose|Structure.*Ara}} [[File:LBS-Monomer-Ara.png]]
|-
! '''O'''
| {{#volatile:ListMol/LBS|Xylose|Structure.*Xyl}} [[File:LBS-Monomer-Xyl.png]]
|-
! '''P'''
| {{#volatile:ListMol/LBS|NeuAc / NeuNH|Structure.*(NeuAc~NeuNH)}} [[File:LBS-Monomer-NeuAc.png]]
|-
! '''Q'''
| {{#volatile:ListMol/LBS|NeuGc|Structure.*(NeuGc)}} [[File:LBS-Monomer-NeuGc.png]]
|-
! '''R'''
| {{#volatile:ListMol/LBS|Kdn|Structure.*(KDN)}} [[File:LBS-Monomer-KDN.png]]
|}
|valign="top"|
{| class="wikitable"
|-
! Code || Structure
|-
! '''S'''
| {{#volatile:ListMol/LBS|Phosphate (except GIPC)|Structure.*(Phospho)}} [[File:LBS-Monomer-P.png]]
|-
! '''T'''
| {{#volatile:ListMol/LBS|(M)AEPn|Structure.*(AEPn)}}, {{#volatile:ListMol/LBS|EtnP|Structure.*(EtnP)}}, {{#volatile:ListMol/LBS|PC|Structure.*(PC)}} [[File:LBS-Monomer-AEPn.png]]
|-
! '''U'''
| {{#volatile:ListMol/LBS|Sulfate|Structure.*Sulfo}} [[File:LBS-Monomer-S.png]]
|-
! '''V'''
| acyl/alkyl/alkenyl chain [[File:LBS-Monomer-Alkyl.png]]
|}

=={{Bilingual|生合成|Biosynthesis}}==
{{Twocolumn|
Sphingosine is synthesized from decarboxylating condensation of palmitoyl CoA with serine on the ER membrane. It is a 18-carbon amino alcohol (16 carbons from palmitic acid and 2 from serine) with one unsaturated bond (trans-form) at the C-4 position (2-amino-4-octadecene-1,3-diol). ([[:Category:LBS/Biosynthesis|more details]])
|
スフィンゴシンはパルミトイルCoAがアミノ酸セリンと脱炭酸縮合して生成します。炭素を18個含むアミノアルコール(16個がパルミチン酸、2個がセリン由来)でトランス型の不飽和結合をC-4に1つ含みます。（[[:Category:LBS/Biosynthesis|詳細はこちら]]）
}}

=={{Bilingual|スフィンゴ脂質の歴史|History of Sphingolipids}}==
{{Twocolumn|
Sphingolipids were first isolated from brain by J.L.W. Thudichum (1829-1901) as lipids of unknown function and structure.<ref>Thudichum J.L.W.?"A Treatise on the Chemical Constitution of the Balliere" Tindall and Cox, London,?1884</ref> The basic structure is a long-chain base (long-chain amino-alcohol) whose amino-group is acylated with a long-chain fatty acid. This hydrophobic structure is called ceramides.
Sphingolipid consists of phospho-sphingolipid and glyco-sphingolipid, whose ceramide structure is bonded with phosphate and (oligo)saccharides, respectively. Phosphosphingolipid includes sphingomyelin, and glycosphingolipid, cerebrosides and gangliosides. Both are abundant in neural tissues.<ref>Gault CR,?Obeid LM,?Hannun YA "An overview of sphingolipid synthesis to breakdown" Adv Exp Med Biol.?2010;688:1-23. PMID 20919643</ref>
|
スフィンゴ脂質は J.L.W. Thudichum (1829-1901) により機能や構造未知の脂質として脳から見いだされました。基本骨格は長鎖塩基 (長鎖アミノアルコール) のアミノ基が長鎖脂肪酸とアミド結合したもので、セラミドと呼ばれます。
スフィンゴ脂質はセラミドにリン酸が結合したスフィンゴリン脂質と糖が結合したスフィンゴ糖脂質に分けられます。スフィンゴリン脂質にはスフィンゴミエリンが、スフィンゴ糖脂質にはセレブロシドやガングリオシドなどが含まれ、いずれも神経系に多く存在します。
}}

<references/>

Category:LBSG

2023-12-02T12:31:05Z

Editor: /* Svennerholm Notation スヴェンネルホルム表記 */

Acidic Glycosphingolipid
{{LB/Header}}
{{Hierarchy|{{PAGENAME}}}}

==Ganglioside ガングリオシド==

{{Twocolumn|
Ganglioside is a glycosphingolipid with one or more sialic acid. It was named by Klenk E. in 1942 as the major sphingolipid in ganglion, a nerve cell cluster.<ref>Sweeley CC, Siddiqui B. "Chemistry of Mammalian Glycolipids" Chapter 6 in ''The Glycoconjugates Volume I: Mammalian Glycoproteins and Glycolipids'' (Ed. Horowitz MI, Pigman W) 1977 Elsevier Inc. ISBN 978-0-12-356101-5</ref>
In vertebrate, close to 190 gangliosides have been identified.<ref>Yu RK, Tsai YT, Ariga T, Yanagisawa M. (2011) Structures, biosynthesis, and functions of gangliosides--an overview" J Oleo Sci. 60(10):537-44. PMID 21937853</ref>
They reside on lipid rafts of cell membranes, and involve in many cellular functions.
Major structures with sialic acids include ganglio, lacto, and neolacto series.
|
酸性糖であるシアル酸を含む糖脂質をガングリオシドと呼びます。神経細胞の集まりである神経核 (ganglion) に多いことから Klenk E.により1942年に命名されました。
脊椎動物では現在およそ190種のガングリオシドが見出されています。ガングリオシドは細胞膜の脂質ラフトに存在し、多くの生理機能に関わっています。シアル酸の結合する主要系列はガングリオ、ラクト、ネオラクト等です。
}}

<references/>

===Svennerholm Notation スヴェンネルホルム表記===

{{Twocolumn|
The often-used notation for ganglioside was proposed by the Swedish scientist, Lars Svennerholm. Each alpha-numeric digit stands for the number of sialic acids or sugars.
|
ガングリオシドの略称には、スウェーデンの科学者 Lars Svennerholm が導入した記法がよく使われます。各桁の数字やアルファベットはシアル酸の数や糖の数を意味します。
}}

{| class="wikitable" style="text-align:center; width:300px;"
! Abbreviation
| GM || GD || GT || GQ || GP
|-
! Number of Sialic Acid
| 1 || 2 || 3 || 4 || 5
|}

{| class="wikitable" style="text-align:center; width:350px;"
! Suffix Number
| 1 || 2 || 3 || 4
|-
! Core
| Gg4Cer || Gg3Cer || LacCer || GalCer
|}
{| class="wikitable" style="text-align:center;width:350px;"
! Suffix Alphabet (only for Gg4Cer core)
| a || b || c
|-
| Number of Sialic Acid Attached to IIGal
| 1 || 2 || 3
|}

;Examples
: GQ1b ... 4 sialic acids (GQ), 4 sugars (GQ1), 2 sialic acids attached to the 2nd galactose (GQ1b)
: GM2 ... 1 sialic acids (GM), 3 sugars (GM2).

{{:Category:LBS/Biosynthesis/Ganglioside}}

==Sulfatide スルファチド==

{{Twocolumn|

More than ten compounds of sulfoglycolipids (glycosphingolipid sulfate, sulfatide, SM4) are identified by differences in sulfonated sugar chains. Among them 3-O-Sulfated galactosylceramide(GalCer) is called galactosylsulfatide, and is present in myelin sheath like GalCer. <ref>Ishizuka, I. “Chemistry and functional distribution of sulfoglycolipids” Prog. Lipid Res.1997; 36:245-319 PMID 9640458 </ref>
The existence of glucosylsufatide, 3-O-sulfated glucosylceramide was reported in rat kidney.<ref>Iida N, Toida T, Kushi Y, Handa S, Fredman P, Svennerholm L, Ishizuka I. A sulfated glucosylceramide from rat kidney. J Biol Chem. 1989 5;264:5974-80.PMID 2925645 </ref>

Sulfatides are present in various organs, such as nervous system, kidney, respiratory organ and digestive tract. The physiological functions of sulfatides are related to myelinogenesis, diabetes, immune system, thrombosis, bacterial and virus infection. <ref> Takahashi T, Suzuki T. “Role of sulfatide in normal and pathological cells and tissues” J Lipid Res. 2012; 53: 1437–1450, PMID 22619219 Takahashi T, Suzuki T. “Role of sulfatide in influenza A virus replication” Biol Pharm Bull. 2015; 38:809-16.PMID 26027821 </ref>

Lysosomal storage disease, metachromatic leukodystrophy, is a congenital metabolic disorder, and is caused by deficiency of lysosomal enzyme arylsulfatase A or its activator.<ref>Mirzaian M, Kramer G, Poorthuis BJ. “Quantification of sulfatides and lysosulfatides in tissues and body fluids by liquid chromatography-tandem mass spectrometry”J Lipid Res. 2015; 56:936-43. PMID 25632048 </ref>
|
硫酸化糖脂質には硫酸化される糖鎖の違いにより十数種類が同定されています。その中でもガラクトシルセラミド(GalCer)のガラクトース3位の水酸基に硫酸基を導入したものをガラクトシルスルファチドと呼び、GalCerと同様にミエリンに多く存在します。ラット腎臓にはグルコシルセラミドに硫酸基が結合したグルコシルスルファチドも報告があります。

スルファチドは神経系、腎臓、呼吸器、消化器などさまざまな組織に存在する糖脂質で、ミエリン形成に関わるほか、糖尿病、免疫系、血栓形成、細菌感染、ウィルス感染など生理作用は多岐にわたります。

リソソーム病である異染性白質ジストロフィー(metachromatic leukodystrophy)という先天性代謝異常症は、スルファチド分解酵素(ASA)あるいは活性化因子の欠損か低下により起こります。
}}

===Metabolic pathway<ref>Honke K. Biosynthesis and biological function of sulfoglycolipids. Proc Jpn Acad Ser B Phys Biol Sci. 2013 89:129-38. PMID 23574804</ref>===

;Biosynthesis
;Cerebroside sulfotransferase (CST) + 3’-phosphoadenosine-5’-phosphosulfate(PAPS)
:Galactosylceramide → galactosylsulfatide

;Degradation
;Arylsulfatase A (ASA) + Saposin B (activator)
:Galctoslsulfatide → Galactosylceramide

<references/>

==Acidic Modifiers 酸性基==

===Sialic acid シアル酸===
{{Twocolumn|
Sialic acid is a collective noun and comprises a family of derivatives of neuraminic acid (5-amino- 3,5-dideoxy- D-glycero- D-galacto- nonulosonic acid)<ref>Schauer R "Sialic Acids - Chemistry, Metabolism and Function" Springer-Verlag, 1982.ISBN 978-3-7091-8680-0 </ref>.
Nowadays, there are over 30 derivatives of neuraminic acid, including the followings.
* N-acetyl neuraminic acid (NeuAc)
* N-glycolyl neuraminic acid (NeuGc)
* deamino neuraminic acid (Kdn: 3-deoxy-D-glycero-D-galacto-nonulosonic acid)

NeuGc is different from NecAc only by a single oxygen. After NeuAc is bound to cytidine monophosphate (CMP), CMP-NeuAc is converted by N-acetylneuraminic acid hydroxylase (CMAH) to CMP-NeuGc. This gene is generally conserved among mammals but human, sauropsids (birds and reptiles), and monotreme lack this gene <ref>Irie A, Koyama S, Kozutsumi Y, et al. "The molecular basis for the absence of N-glycolylneuraminic acid in humans" J Biol Chem 273:15866–15871, 1998 PMID 9624188</ref><ref>Schauer R, Srinivasan GV, Coddeville B, et al. "Low incidence of N-glycolylneuraminic acid in birds and reptiles and its absence in the platypus" Carbohydr Res 344:1494–1500, 2009 PMID 19541293</ref> (therefore no NeuGc). Kdn is prominent in some fish but not in mammals.
|
シアル酸は、ノイラミン酸（5-アミノ-3,5-ジデオキシ-D-グリセロ-D-ガラクト-ノヌロン酸）に由来する物質の総称です。
現在、ノイラミン酸には以下を含む30 種以上の誘導体が知られています。
* N-アセチルノイラミン酸 (NeuAc)
* N-グリコリルノイラミン酸 (NeuGc)
* デアミノノイラミン酸 (Kdn)

NeuGcはNeuAcは酸素原子一つしか違いません。シチジンモノホスホ-Neu5Acを基質として、シチジンN-アセチルノイラミン酸ヒドロキシラーゼ（CMAH)によりCMP-NeuGcが生成されます。この遺伝子は哺乳類に保存されていますが、ヒト、鳥類、爬虫類、単孔類は欠損しています（つまりNeuGcを持たない）。Kdnは魚類に知られていますが哺乳類には殆どありません。
}}

<center>
<table cellspacing="15">
<tr>
<td> N-acetyl neuraminic acid (Neu5Ac) </td>
<td> N-glycolyl neuraminic acid (Neu5Gc) </td>
<td> deamino neuraminic acid (Kdn)</td>
</tr>
<tr>
<td style="position: relative">[[File:NeuAc.png]] <div style="position:absolute; top:25px; left:10px">[[File:circle10.png|20px]]</div> </td>
<td style="position: relative">[[File:NeuGc.png]] <div style="position:absolute; top:30px; left:0px">[[File:circle10.png|20px]]</div> </td>
<td style="position: relative">[[File:Kdn.png]] <div style="position:absolute; top:22px; left:35px">[[File:circle10.png|20px]]</div> </td>
</tr>
</table>
</center>

{{Twocolumn|
Derivatives include the followings for the above three types.<ref>Angata T, Varki A "Chemical diversity in the sialic acids and related alpha-keto acids: an evolutionary perspective" Chem Rev 102(2):439-469, 2002 PMID 11841250</ref>
Such modifications are tissue- and organelle-specific.<ref>Butor C, Diaz S, Varki A "High level O-acetylation of sialic acids on N-linked oligosaccharides of rat liver membranes. Differential subcellular distribution of 7- and 9-O-acetyl groups and of enzymes involved in their regulation" J Biol Chem 268(14):10197-10206, 1993 PMID 8486687</ref>
* 8-O-methylation, 9-O-methylation
* 4-O-sulfation, 8-O-sulfation
* O-acetylation on the hydroxyl groups at C4, C7, and C9
|
誘導体には、上記の 3 構造全てにおいて以下が挙げられます。修飾は臓器や細胞小器官特異的におこなわれます。
* 8-O-メチル化、9-O-メチル化
* 4-O-硫酸化、8-O-硫酸化
* C4, C7 または C9 における O-アセチル化
}}

====History====
{{Twocolumn|
* Gunnar Blix found a novel acidic aminosugars from salivary gland mucin in 1936 and later named it sialic acid (1938)<ref> Lundblad A "Gunnar Blix and his discovery of sialic acids. Fascinating molecules in glycobiology" Ups J Med Sci. 2015; 120:104–112 PMID 25921326</ref>. (Dried salivary mucin contains 2% sialic acid.)
* Ernst Klenk identified "Substanz X" from the brain (neuro) of Tay-Sach's disease patient (1935) and later identified a polyhydroxyamino carboxylic acid, and called it neuraminic acid (1941).
* Both substances are found identical, and the correct structure was postulated by Alfred Gottshalk in 1955 <ref>Gottschalk A. "Structural Relationship between Sialic Acid, Neuraminic Acid and 2-Carboxy-Pyrrole" Nature 1955; 176, 881 - 882 doi:10.1038/176881a0 </ref>
* In the same period, Tamio Yamakawa and Sakaru Suzuki identified a novel ganglioside from horse erythrocyte stroma and named it hematoside (1951), now called GM3<ref>Kanfer JN and Hakomori S "Sphingolipid biochemistry (Handbook of Lipid Research 3)" Chapter 1, Springer Science & Business Media, 2012 ISBN 978-1475703986</ref>.
|
* Gunnar Blixが1936年に唾液(sialo)のムチンから新規の酸性アミノ糖を見つけ、後にこれをシアル酸と名づけました(1938)。
* Ernst Klenkはテイサックス病患者の脳から「物質X」を見つけ (1935)、後に加水分解によって水酸化アミノカルボン酸であるノイラミン酸を抽出しました(1941)。
* 両者は同一物質であることがわかり、Alfred Gottshalkが1955年に正しい構造を提出しました。
* Klenkとほぼ同時代に山川民夫と鈴木旺は馬の赤血球からヘキソースアミンを含まないガングリオシドを抽出し、1951年ヘマトシドと名付けました（現在のGM3）。
}}

<references/>

===ウロン酸===

under construction

===リン酸===

under construction

Category:LBSG

2023-12-01T06:13:19Z

Editor: /* Acidic Modifiers 酸性基 */

Acidic Glycosphingolipid
{{LB/Header}}
{{Hierarchy|{{PAGENAME}}}}

==Ganglioside ガングリオシド==

{{Twocolumn|
Ganglioside is a glycosphingolipid with one or more sialic acid. It was named by Klenk E. in 1942 as the major sphingolipid in ganglion, a nerve cell cluster.<ref>Sweeley CC, Siddiqui B. "Chemistry of Mammalian Glycolipids" Chapter 6 in ''The Glycoconjugates Volume I: Mammalian Glycoproteins and Glycolipids'' (Ed. Horowitz MI, Pigman W) 1977 Elsevier Inc. ISBN 978-0-12-356101-5</ref>
In vertebrate, close to 190 gangliosides have been identified.<ref>Yu RK, Tsai YT, Ariga T, Yanagisawa M. (2011) Structures, biosynthesis, and functions of gangliosides--an overview" J Oleo Sci. 60(10):537-44. PMID 21937853</ref>
They reside on lipid rafts of cell membranes, and involve in many cellular functions.
Major structures with sialic acids include ganglio, lacto, and neolacto series.
|
酸性糖であるシアル酸を含む糖脂質をガングリオシドと呼びます。神経細胞の集まりである神経核 (ganglion) に多いことから Klenk E.により1942年に命名されました。
脊椎動物では現在およそ190種のガングリオシドが見出されています。ガングリオシドは細胞膜の脂質ラフトに存在し、多くの生理機能に関わっています。シアル酸の結合する主要系列はガングリオ、ラクト、ネオラクト等です。
}}

<references/>

===Svennerholm Notation スヴェンネルホルム表記===

{{Twocolumn|
The notation was proposed by the Swedish scientist, Lars Svennerholm. Each alpha-numeric digit stands for the number of sialic acids or sugars.
|
スウェーデンの科学者 Lars Svennerholm が導入した記法です。各桁の数字やアルファベットはシアル酸の数や糖の数を意味します。
}}

{| class="wikitable" style="text-align:center; width:300px;"
! Abbreviation
| GM || GD || GT || GQ || GP
|-
! Number of Sialic Acid
| 1 || 2 || 3 || 4 || 5
|}

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! Suffix Number
| 1 || 2 || 3 || 4
|-
! Core
| Gg4Cer || Gg3Cer || LacCer || GalCer
|}
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! Suffix Alphabet (only for Gg4Cer core)
| a || b || c
|-
| Number of Sialic Acid Attached to IIGal
| 1 || 2 || 3
|}

;Examples
: GQ1b ... 4 sialic acids (GQ), 4 sugars (GQ1), 2 sialic acids attached to the 2nd galactose (GQ1b)
: GM2 ... 1 sialic acids (GM), 3 sugars (GM2).

{{:Category:LBS/Biosynthesis/Ganglioside}}

==Sulfatide スルファチド==

{{Twocolumn|

More than ten compounds of sulfoglycolipids (glycosphingolipid sulfate, sulfatide, SM4) are identified by differences in sulfonated sugar chains. Among them 3-O-Sulfated galactosylceramide(GalCer) is called galactosylsulfatide, and is present in myelin sheath like GalCer. <ref>Ishizuka, I. “Chemistry and functional distribution of sulfoglycolipids” Prog. Lipid Res.1997; 36:245-319 PMID 9640458 </ref>
The existence of glucosylsufatide, 3-O-sulfated glucosylceramide was reported in rat kidney.<ref>Iida N, Toida T, Kushi Y, Handa S, Fredman P, Svennerholm L, Ishizuka I. A sulfated glucosylceramide from rat kidney. J Biol Chem. 1989 5;264:5974-80.PMID 2925645 </ref>

Sulfatides are present in various organs, such as nervous system, kidney, respiratory organ and digestive tract. The physiological functions of sulfatides are related to myelinogenesis, diabetes, immune system, thrombosis, bacterial and virus infection. <ref> Takahashi T, Suzuki T. “Role of sulfatide in normal and pathological cells and tissues” J Lipid Res. 2012; 53: 1437–1450, PMID 22619219 Takahashi T, Suzuki T. “Role of sulfatide in influenza A virus replication” Biol Pharm Bull. 2015; 38:809-16.PMID 26027821 </ref>

Lysosomal storage disease, metachromatic leukodystrophy, is a congenital metabolic disorder, and is caused by deficiency of lysosomal enzyme arylsulfatase A or its activator.<ref>Mirzaian M, Kramer G, Poorthuis BJ. “Quantification of sulfatides and lysosulfatides in tissues and body fluids by liquid chromatography-tandem mass spectrometry”J Lipid Res. 2015; 56:936-43. PMID 25632048 </ref>
|
硫酸化糖脂質には硫酸化される糖鎖の違いにより十数種類が同定されています。その中でもガラクトシルセラミド(GalCer)のガラクトース3位の水酸基に硫酸基を導入したものをガラクトシルスルファチドと呼び、GalCerと同様にミエリンに多く存在します。ラット腎臓にはグルコシルセラミドに硫酸基が結合したグルコシルスルファチドも報告があります。

スルファチドは神経系、腎臓、呼吸器、消化器などさまざまな組織に存在する糖脂質で、ミエリン形成に関わるほか、糖尿病、免疫系、血栓形成、細菌感染、ウィルス感染など生理作用は多岐にわたります。

リソソーム病である異染性白質ジストロフィー(metachromatic leukodystrophy)という先天性代謝異常症は、スルファチド分解酵素(ASA)あるいは活性化因子の欠損か低下により起こります。
}}

===Metabolic pathway<ref>Honke K. Biosynthesis and biological function of sulfoglycolipids. Proc Jpn Acad Ser B Phys Biol Sci. 2013 89:129-38. PMID 23574804</ref>===

;Biosynthesis
;Cerebroside sulfotransferase (CST) + 3’-phosphoadenosine-5’-phosphosulfate(PAPS)
:Galactosylceramide → galactosylsulfatide

;Degradation
;Arylsulfatase A (ASA) + Saposin B (activator)
:Galctoslsulfatide → Galactosylceramide

<references/>

==Acidic Modifiers 酸性基==

===Sialic acid シアル酸===
{{Twocolumn|
Sialic acid is a collective noun and comprises a family of derivatives of neuraminic acid (5-amino- 3,5-dideoxy- D-glycero- D-galacto- nonulosonic acid)<ref>Schauer R "Sialic Acids - Chemistry, Metabolism and Function" Springer-Verlag, 1982.ISBN 978-3-7091-8680-0 </ref>.
Nowadays, there are over 30 derivatives of neuraminic acid, including the followings.
* N-acetyl neuraminic acid (NeuAc)
* N-glycolyl neuraminic acid (NeuGc)
* deamino neuraminic acid (Kdn: 3-deoxy-D-glycero-D-galacto-nonulosonic acid)

NeuGc is different from NecAc only by a single oxygen. After NeuAc is bound to cytidine monophosphate (CMP), CMP-NeuAc is converted by N-acetylneuraminic acid hydroxylase (CMAH) to CMP-NeuGc. This gene is generally conserved among mammals but human, sauropsids (birds and reptiles), and monotreme lack this gene <ref>Irie A, Koyama S, Kozutsumi Y, et al. "The molecular basis for the absence of N-glycolylneuraminic acid in humans" J Biol Chem 273:15866–15871, 1998 PMID 9624188</ref><ref>Schauer R, Srinivasan GV, Coddeville B, et al. "Low incidence of N-glycolylneuraminic acid in birds and reptiles and its absence in the platypus" Carbohydr Res 344:1494–1500, 2009 PMID 19541293</ref> (therefore no NeuGc). Kdn is prominent in some fish but not in mammals.
|
シアル酸は、ノイラミン酸（5-アミノ-3,5-ジデオキシ-D-グリセロ-D-ガラクト-ノヌロン酸）に由来する物質の総称です。
現在、ノイラミン酸には以下を含む30 種以上の誘導体が知られています。
* N-アセチルノイラミン酸 (NeuAc)
* N-グリコリルノイラミン酸 (NeuGc)
* デアミノノイラミン酸 (Kdn)

NeuGcはNeuAcは酸素原子一つしか違いません。シチジンモノホスホ-Neu5Acを基質として、シチジンN-アセチルノイラミン酸ヒドロキシラーゼ（CMAH)によりCMP-NeuGcが生成されます。この遺伝子は哺乳類に保存されていますが、ヒト、鳥類、爬虫類、単孔類は欠損しています（つまりNeuGcを持たない）。Kdnは魚類に知られていますが哺乳類には殆どありません。
}}

<center>
<table cellspacing="15">
<tr>
<td> N-acetyl neuraminic acid (Neu5Ac) </td>
<td> N-glycolyl neuraminic acid (Neu5Gc) </td>
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</center>

{{Twocolumn|
Derivatives include the followings for the above three types.<ref>Angata T, Varki A "Chemical diversity in the sialic acids and related alpha-keto acids: an evolutionary perspective" Chem Rev 102(2):439-469, 2002 PMID 11841250</ref>
Such modifications are tissue- and organelle-specific.<ref>Butor C, Diaz S, Varki A "High level O-acetylation of sialic acids on N-linked oligosaccharides of rat liver membranes. Differential subcellular distribution of 7- and 9-O-acetyl groups and of enzymes involved in their regulation" J Biol Chem 268(14):10197-10206, 1993 PMID 8486687</ref>
* 8-O-methylation, 9-O-methylation
* 4-O-sulfation, 8-O-sulfation
* O-acetylation on the hydroxyl groups at C4, C7, and C9
|
誘導体には、上記の 3 構造全てにおいて以下が挙げられます。修飾は臓器や細胞小器官特異的におこなわれます。
* 8-O-メチル化、9-O-メチル化
* 4-O-硫酸化、8-O-硫酸化
* C4, C7 または C9 における O-アセチル化
}}

====History====
{{Twocolumn|
* Gunnar Blix found a novel acidic aminosugars from salivary gland mucin in 1936 and later named it sialic acid (1938)<ref> Lundblad A "Gunnar Blix and his discovery of sialic acids. Fascinating molecules in glycobiology" Ups J Med Sci. 2015; 120:104–112 PMID 25921326</ref>. (Dried salivary mucin contains 2% sialic acid.)
* Ernst Klenk identified "Substanz X" from the brain (neuro) of Tay-Sach's disease patient (1935) and later identified a polyhydroxyamino carboxylic acid, and called it neuraminic acid (1941).
* Both substances are found identical, and the correct structure was postulated by Alfred Gottshalk in 1955 <ref>Gottschalk A. "Structural Relationship between Sialic Acid, Neuraminic Acid and 2-Carboxy-Pyrrole" Nature 1955; 176, 881 - 882 doi:10.1038/176881a0 </ref>
* In the same period, Tamio Yamakawa and Sakaru Suzuki identified a novel ganglioside from horse erythrocyte stroma and named it hematoside (1951), now called GM3<ref>Kanfer JN and Hakomori S "Sphingolipid biochemistry (Handbook of Lipid Research 3)" Chapter 1, Springer Science & Business Media, 2012 ISBN 978-1475703986</ref>.
|
* Gunnar Blixが1936年に唾液(sialo)のムチンから新規の酸性アミノ糖を見つけ、後にこれをシアル酸と名づけました(1938)。
* Ernst Klenkはテイサックス病患者の脳から「物質X」を見つけ (1935)、後に加水分解によって水酸化アミノカルボン酸であるノイラミン酸を抽出しました(1941)。
* 両者は同一物質であることがわかり、Alfred Gottshalkが1955年に正しい構造を提出しました。
* Klenkとほぼ同時代に山川民夫と鈴木旺は馬の赤血球からヘキソースアミンを含まないガングリオシドを抽出し、1951年ヘマトシドと名付けました（現在のGM3）。
}}

<references/>

===ウロン酸===

under construction

===リン酸===

under construction

JCBL:DBmeeting

2023-12-01T05:03:43Z

Editor: /* History (歴史) */

==About LipidBank==

{{Twocolumn|
"LipidBank" is an open, publicly free database of natural lipids including fatty acids, glycerolipids, sphingolipids, steroids, and various vitamins.

The database contains more than 6000 unique molecular structures (ChemDraw cdx format, MDL MOL format), their lipid names (common name, IUPAC), spectral information (mass, UV, IR, NMR and others), and most importantly, literature information.

The database lists natural lipids only, and all molecular information is manually curated and approved by experts in lipid research (see Informant in each record).

LipidBank is the official database of the Japanese Conference on the Biochemistry of Lipids (JCBL).

 '''Reference:''' 
Watanabe K., Yasugi E. and Oshima M. "How to search the glycolipid data in LIPIDBANK for Web: the newly developed lipid database in Japan" Trend Glycosci. and Glycotechnol. 12, 175-184, 2000. ([https://www.jstage.jst.go.jp/article/tigg1989/12/65/12_65_175/_article/-char/ja/ PDF])
|
LipidBankは、脂肪酸、グリセロ脂質、スフィンゴ脂質、ステロイド、各種ビタミンを含む天然脂質の公開データベースです。 

現在6000以上の天然物構造（ChemDraw cdx形式、MDL MOL形式）について、物質名（慣用名とIUPAC）、スペクトル情報（質量、UV, IR, NMRほか）に加えて、文献情報も掲載しています。 

このデータベースは天然物を対象としており、全データについて監修者がチェックしています。LipidBankは日本脂質生化学会の公式データベースです。 
 

文献： 
渡辺清博、八杉悦子、大島美恵子「糖脂質データを日本で新しく作成された生理活性脂質データベース[LIPIDBANK for Web]で検索してみよう」Trend Glycosci. and Glycotechnol. 12, 175-184, 2000.（[https://www.jstage.jst.go.jp/article/tigg1989/12/65/12_65_175/_article/-char/ja/ PDF]）
}}

==Bylaws==
<pre>
日本脂質生化学会脂質データベース構築委員会　規約

（名称）
第1条　本会を日本脂質生化学会脂質データベース構築委員会（以下、委員会という。）と称する。
（設置）
第2条　委員会は、日本脂質生化学会が設置する。
（目的）
第3条　委員会は、脂質データベース“LipidBank”の構築・維持・更新を目的とし、脂質データの集積・更新、データベースシステムの構築・維持、
ならびにこれらに関連する業務をおこなう。
（委員会）
第4条　委員会の委員は、脂質・バイオインフォマティクスに造詣の深い日本脂質生化学会会員で構成され、日本脂質生化学会会長が任命する。
　２　委員会には委員長を置くこととし、原則として日本脂質生化学会会長が兼務するが、委員の中から任命することができる。
　３　委員会に副委員長を置くことができ、日本脂質生化学会会長が任命する。
　４　委員会に顧問を置くことができ、日本脂質生化学会会長が任命する。
　５　顧問は委員会に出席し、意見を述べることができる。
（事務局）
第5条　委員会に、会務に関する事務をおこなうために事務局を置く。事務局長は委員長が指名する。
（雑則）
第6条　この規約に定めるもののほか、必要な事項は別に定める。

附則
本規約は、総会の承認を経て変更することができる。

（平成17年10月1日制定）
（平成29年6月15日改訂）
</pre>

==History (歴史)==
{{Twocolumn|
===LIPID INFORMATION SERVICE (LIPIDBANK) (1984? - 1997)===
The project was started as a database in Japanese around 1984 with Grant-in-Aid for scientific research publication (Akira Hayashi). This database was succeeded in 1989 under the
committee of lipid information (President: Yoshitaka Nagai), organized by the members of The Japanese Conference on the Biochemistry of Lipids (JCBL). The actual construction of the database was managed by the JCBL committee of database construction (President: Akira Hayashi, Vice-president: Nobuo Ueta, Secretary: Kiyohiro Watanabe).

The database included 16 lipid classes: fatty acid, long chain aldehyde, long chain alcohol, long chain base, bile acid, glyceride, phospholipid, glycolipid, lipoprotein, lipopolysaccharide, steroid, prostanoid, ether type lipid, mycolic acid and wax.

Each record contained lipid name, biological activity, source, references, structure and spectra. About 2,700 records were collected and saved on floppy discs.
|
===脂質情報データベース (1984? - 1997)===
LipidBankの淵源は、1984年頃に獲得された科学研究費補助金（研究成果刊行費、代表者：林陽）により構築が開始された日本語のデータベース「脂質情報データベース」である。1989年に、このデータベースは日本脂質生化学会（JCBL）により構成された脂質情報作成委員会（委員長：永井克孝）が立ち上げたプロジェクトに引き継がれ、構築が本格化した。実務は脂質情報データベース構築委員会（委員長：林陽、副委員長：植田伸夫、システム構築と入力：渡邊清博）が担った。 

このデータベースは、脂質を16種類に分類して集積された（脂肪酸、長鎖アルデヒド、長鎖アルコール、長鎖塩基、胆汁酸、グリセリド、リン脂質、糖脂質、リポタンパク質、リポ多糖、ステロイド、プロスタノイド、エーテル型脂質、ミコール酸、ワックスなど）。 

各脂質の名称、生理活性、分布、文献、化学構造、スペクトルデータなどの情報が記載された。約2,700件のデータが集積され、フロッピーディスクで配布された。
}}

{{Twocolumn|
===LIPIDBANK for Web (1996 - 1999)===
The initial three-year project started as a joint research between the International Medical Center of Japan (current National Center for Global Health and Medicine) ([http://www.ncgm.go.jp/ NCGM]) and the Japan Science and Technology Corporation ([http://www.jst.go.jp/ JST]).

A new executive committee was organized (President: Shoshichi Nojima, Vice-president: Mieko Oshima, Secretary: Kiyohiro Watanabe and Etsuko Yasugi).

The committee decided to collect the data on 27 lipid classes in English. Molecules in each class were collected independently under 27 team leaders and 122 data informants.

The database became publicly available from October 1999. The database server was placed at the University of Tokyo where the office of JCBL was located. The total number of molecules was about 5400.

|
===生理活性脂質データベース (1996 - 1999)===

3年間の本プロジェクトは、国立国際医療センター（現：国立国際医療研究センター）([http://www.ncgm.go.jp/ NCGM]) と科学技術振興機構 ([http://www.jst.go.jp/ JST]) との共同研究として発足した。

新たに生理活性脂質データベース構築検討会(委員長：野島庄七、副委員長：大島美恵子、データ入力：渡邊清博、八杉悦子）が結成された。

脂質を27種類に分類して、それぞれの脂質化合物データを英語で集積した。脂質分野ごとに、各脂質を専門とする27名のデータベース構築責任者をおき、122名のデータ提供者によりデータが収載された。

1999年秋にJCBLの事務局があった東京大学にサーバーを設置し、インターネット上に公開された。5,400件の脂質化合物データが収録された。
}}

{{Twocolumn|
===Updating LIPIDBANK for Web (1999 - 2005)===
After adding one lipid class (lipid peroxides), 28 lipid classes were reorganized into 17 lipid groups.

The DERIVED LIPIDS group now includes fatty acid, long chain alcohol, long chain aldehyde, and long chain base and ceramide. The FAT-SOLUBLE VITAMIN group includes carotenoid, coenzyme Q, vitamin A, vitamin D, vitamin E, and vitamin K. The GLYCOLIPID group includes glycosphingolipid, glycoglycerolipid and others. The PHOSPHOLIPID group includes glycerophospholipid, PAF, and sphingophospholipid.

In 2004, JCBL officially established an executive committee (President: Yousuke Seyama, Secretary: Etsuko Yasugi) for updating the database.

|
===生理活性脂質データベースの維持・更新(1999 - 2005)===
新たに過酸化脂質の項目を加えて、17種類の脂質グループに分類して、28種類の脂質化合物について、データ集積をおこなった。

誘導脂質には、脂肪酸、長鎖アルコール、長鎖アルデヒド、長鎖塩基とセラミドが含まれる。脂溶性ビタミンは、カロテノイド、コエンザイムQ、ビタミンA、D、E、Kから構成されている。糖脂質にはスフィンゴ糖脂質とグリセロ糖脂質が、リン脂質にはグリセロリン脂質、PAF、スフィンゴリン脂質が含まれる。

2004年には、脂質データベース構築委員会（委員長：脊山洋右、データ入力：八杉悦子）がJCBLから公認された。
}}

{{Twocolumn|
===Renovating LIPIDBANK for Web (2006-2007)===
LIPIDBANK for Web became the official database of JCBL, to which all rights were delegated from NCGM and JST. The name of database changed to "LipidBank".

The Hopanoid group was removed and the number of category is now 16. The database system and its contents were updated and reorganized by the JCBL committee members (President: Masahiro Nishijima).

|
===生理活性脂質データベースの刷新(2006 - 2007)===
生理活性脂質データベースは2006年にNCGMとJSTから譲渡され、JCBL公認のデータベースとなった。データベースの名称を"LipidBank"と改めた。 

脂質項目のうちホパノイドを削除し、16種類の脂質グループとした。脂質データベース構築委員会（委員長：西島正弘）が、データベースのシステムと内容の維持・更新を担当。

}}

{{Twocolumn|
=== Linking with the Wiki version (2017-2022)===
With financial support from the AMED program "Studies on Specific Activities and Functions of Lipid Molecules to Develop Innovative Medical Technologies" (PS: YOKOYAMA Shinji), wiki-based database was updated for glycosphingolipid and others.

Categories in the original LipidBank were translated into static HTML pages due to security issues.
|
=== LipidBank Wiki との連携 (2017-2022)===
AMED革新的先端研究開発支援事業「画期的医薬品等の創出をめざす脂質の生理活性と機能の解明」（総括：横山信治）より支援を受け、スフィンゴ糖脂質を中心に情報を整理、更新。

旧LipidBankの各カテゴリーはセキュリティ脆弱性のためにコンテンツをHTML固定ページに変換。
}}

===Contact Address===
{{Twocolumn|
If you have questions or suggestions, please contact with:

::Masanori Arita
:::arita@nig.ac.jp
::National Institute of Genetics
|
ご意見やご質問は、下記へお寄せください。
 
::有田正規
:::arita@nig.ac.jp
::国立遺伝学研究所
}}

==Members of Executive Committee of Lipid Database (脂質データベース構築委員会メンバー）==
2019年 2月 27日
<center>
{| class="wikitable"
|-
! colspan="3" style="text-align:center"| 委員長: 和泉　孝志 (Takashi Izumi)
|-
! colspan="3" style="text-align:center"| 委員
|-
| 青木淳賢 (Junken Aoki) || 有田　誠 (Makoto Arita) || 有田　正規 (Masanori Arita)
|-
| 糸乗　前 (Saki Itonori) || 今井　博之 (Hiroyuki Imai) || 笠間　健嗣 (Takeshi Kasama)
|-
| 北　芳博 (Yoshihiro Kita) || 小林　哲幸 (Tetsuyuki Kobayashi) || 酒井　祥太 (Shota Sakai)
|-
| 清水　孝雄 (Takao Shimizu) || 中村　和生 (Kazuo Nakamura) || 八杉　悦子 (Etsuko Yasugi)
|-
| 横山　和明 (Kazuaki Yokoyama) || ||
|-
! colspan="3" style="text-align:center"| Advisors
|-
| 大島　美恵子（Mieko Oshima) || 脊山　洋右（Yousuke Seyama) || 西島　正弘（Masahiro Nishijima）
|}
</center>

==Funding (資金）==
{|
|-
|colspan="2"| <big>'''1989 - 1997'''</big>
|-
|LIPID INFORMATION SERVICE was funded by a Grant-in-Aid for Scientific Research (Grant-in-Aid for Publication of Scientific Research Results) from the Japan Society for the Promotion of Science.
|LIPID INFORMATION SERVICEが日本学術振興会([http://www.jsps.go.jp/ JSPS])科学研究費に採択される。
|-
|colspan="2"| <big>'''1996 - 2002'''</big>
|-
|LIPIDBANK for Web was funded by the Database Development Program of the Japan Science and Technology Agency (JST).
|LIPIDBANK for Webが科学技術振興機構([http://www.jst.go.jp/ JST])に採択される。
|-
|colspan="2"| <big>'''2003 - 2006''', '''2009 - 2016'''</big>
|-
|LIPIDBANK for Web was funded by a Grant-in-Aid for Scientific Research (Grant-in-Aid for Publication of Scientific Research Results) from the Japan Society for the Promotion of Science.
|日本学術振興会([http://www.jsps.go.jp/ JSPS])科学研究費の研究成果公開促進費データベース事業による更新。
|-
|colspan="2"| <big>'''2017 - 2022'''</big>
|-
|LIPIDBANK was funded by AMED-CREST in "Studies on Specific Activities and Functions of Lipid Molecules to Develop Innovative Medical Technologies".
|AMED革新的先端研究開発支援事業「画期的医薬品等の創出をめざす脂質の生理活性と機能の解明」（総括：横山信治）による更新。
|}

==構築委員会の歴史==
{| class="wikitable"
|-
| 第1回 || 1997年1月8日 || 国立国際医療センター研究所 || 生理活性脂質データベース構築委員会
|-
| 第10回 || 2004年3月25日 ||学士会分館 || 脂質情報データベース推進委員会
|-
| 第20回 || 2007年3月8日 || 東京大学　医学部 || 脂質データベース構築委員会
|-
| 第30回 || 2015年5月29日 || 東京大学　薬学部 || 脂質データベース構築委員会
|-
| 第34回 || 2019年7月5日 || 北海道大学 || 脂質データベース構築委員会
|-
|colspan="4"| 2020-2022 年はCOVID-19のために中止。JCBLホームページを2010-2021年まで本サーバで維持管理してきたが、2021年より新サイト (jcbl.jp) に移行。
|-
|
|}

Category:LBG

2023-11-30T01:05:16Z

Editor: /* Glycerophospholipid */

{{Huge|{{Bilingual|グリセロ脂質|Glycerolipid}} }}
{{LB/Header}}
{{Hierarchy|{{PAGENAME}}}}
{| style="float:right"
|__TOC__
|}
==Class Overview==

{{Twocolumn|
Complex lipid is the major structural component of biological membranes (lipid bilayer), and is broadly classified into glycerolipid containing glycerol and sphingolipid containing sphingoid. The glycerolipid category (LBG) includes glycoglycerolipid and　phosphoglycerolipid.
|
リン酸や糖などを含む脂質は複合脂質と呼ばれ、細胞膜の脂質二重層の主要な構成要素です。複合脂質は、一般的にグリセロールを含む脂質 (グリセロ脂質) とスフィンゴイドを含む脂質 (スフィンゴ脂質) に大別されます。グリセロ脂質 (LBG) には、グリセロ糖脂質 (glycoglycerolipid) とグリセロリン脂質 (glycerophospholipid) が含まれます。
}}

={{Bilingual|略称の記載法|Common Nomenclature}}=
{{Twocolumn|
[https://lipidmaps.org LipidMaps Consortium] in the US defines the standard way of structure description (nomenclature). Please follow this standard especially when exact structure is not determined due to experimental procedures.
|
米国の[https://lipidmaps.org LipidMaps コンソーシアム]では、構造の標準的な表記法を定めています（命名系）。とりわけ分析法により構造に曖昧な部分が残る場合は、以下の表記法を踏襲してください。
}}
Reference: "Update on LIPID MAPS classification, nomenclature, and shorthand notation for MS-derived lipid structures" [https://www.jlr.org/article/S0022-2275(20)60017-7/fulltext J Lipid Res 61(12), 1539-1555, 2020]

==GlyceroLipid==

{{Twocolumn|
Glycerolipid is referred to as mono-, di-, and triglycerides depending on the number of acyl chains (fatty acids). When sugars are attached, the modification comes before the backbone name; SQ, MG, and DG indicate Sulfoquinovose, single hexose, and double hexoses, respectively.Hexose is commonly galactose, and MG and DG may refer to mono- and digalactose.
|
配位するアシル基（脂肪酸）の数により、モノ・ジ・トリアシルグリセロール（それぞれ MG, DG, TG）と呼ばれます。グリセロール骨格に糖鎖が付く場合は MG や DG の前に SQ (Sulfoquinovosyl)、MG (Monoglycosyl)、DG （Diglycosyl) をつけます。MGやDGの略称はガラクトースの意味で使われる場合もあります。
}}

{| class="wikitable" cellpadding="4"
|-
! || || Monoglycosyl (単糖） || Diglycosyl （二糖） || Sulfoquinovosyl （スルホキノボース）
|-
| MG : || Monoacylglycerol (モノアシルグリセロール) || MGMG || DGMG || SQMG
|-
| DG : || Diacylglycerol (ジアシルグリセロール) || MGDG || DGDG || SQDG
|-
| TG : || Triacylglycerol (トリアシルグリセロール)
|colspan="3" align="center"| n.a. (該当なし)
|}

==Glycerophospholipid==
{{Twocolmn|

|
グリセロリン脂質は生体膜の主要成分であり、グリセロールに２つの脂肪酸とリン酸を含む極性基が結合しています。

}}
{| class="wikitable"
|-
| Phosphatidic acid ホスファチジン酸 || PA, Ptd
|-
| Phosphatidylcholine ホスファチジルコリン || PC, PtdCho
|-
| Phosphatidylethanolamine ホスファチジルエタノールアミン || PE, PtdEtn
|-
| Phosphatidylserine ホスファチジルセリン || PS, PtdSer
|-
| Phosphatidylinositol ホスファチジルイノシトール || PI, PtdIns
|-
| Phosphatidylinositol-mannoside ホスファチジルイノシトールマンノシド || PIM
|-
| Phosphatidylglycerol ホスファチジルグリセロール || PG, PtdGro
|-
| Phosphatidylglycerolphosphate ホスファチジルグリセロールリン酸 || PGP
|-
| Cardiolipin カルジオリピン || CL, Ptd2Gro
|-
| Bis[monoacylglycero]phosphates ビス（モノアシルグリセロ）リン酸 || BMP
|}

Category:LBSB

2023-11-29T06:25:01Z

Editor:

{{LB/Header}}
{{Hierarchy|{{PAGENAME}}}}

{{Twocolumn|
Long-chain base (LCB or sphingoid base) is a 2-aminoalkane (or alkene) 1,3-diol. In cells, it constitutes sphingolipids and little exists as a free form.
When LCB is linked with a long-chain fatty acid via an amide bond, it is called a ceramide (Cer).<ref>Yamaji T, Hanada K "Sphingolipid metabolism and interorganellar localization of sphingolipid enzymes and lipid transfer proteins" Traffic 2015 16:101-122. PMID 25382749</ref>
|
長鎖塩基 LCB（またはスフィンゴイド塩基）は 2-アミノアルカン（またはアルケン） 1,3-ジオールを指し、生体内ではスフィンゴ脂質の構成成分です。遊離のLCBは微量しか存在しません。長鎖塩基に長鎖脂肪酸がアミド結合したものを、セラミドと呼びます。
}}
<references/>

* [[PathwayMap:CeramideBiosynthesis]]
* [https://lipidbank.jp/DLB.html Link to the original LipidBank]

==Notation 表記法 ==
{|
|style="background:lightgray" width="200px"| Sph d18:1 
|Sph is an abbreviation of LCB. ''d'' or ''t'' stands for double or triple hydroxy groups, respectively. (We count the terminal alcohol.) 18 is the carbon chain length. 1 after the colon is the number of unsaturated bonds (double bonds).
|width="30%"|
長鎖塩基 LCB は Sph と表します。 ''d'', ''t'' はそれぞれ 2, 3 個の水酸基（アルコールの水酸基含む）を意味し、18は炭素鎖長です。コロンの次にくる1は不飽和結合（二重結合）の数を表します。
|}

{|
|style="background:lightgray" width="200px"| Cer  d18:1Δ8E/20:0 
| Cer is an abbreviations of ceramide. The first part indicates the sphingoid base and the second, after the slash, fatty acid. In this website we do not use superscripts or subscripts for readability. Also we do not italicize E (or trans) and Z (or cis) for the same reason.
|width="30%"| セラミドは　Cer　と表します。左側が長鎖塩基、スラッシュを挟んで右側は脂肪酸を表しています。このサイトでは上付き／下付きは使用せず（見づらいため）、 E (トランス）, Z (シス）もイタリックにしていません。
|}

{| style="border-spacing: 20px;"
|-
! '''Common Name'''
| sphingosine (= (4E)-sphingenine) スフィンゴシン
| sphinganine (= dihydrosphingosine) スフィンガニン
| phytosphingosine (= 4-hydroxydihydrosphingosine) フィトスフィンゴシン
| 6-hydroxysphingosine 6-ヒドロキシスフィンゴシン
|-
! '''Abbreviation'''
| d18:1 or So
| d18:0 or Sa (DHSo)
| t18:0 or Phyto
| t18:1 or 6-t18:1
|-
! '''Structure 構造'''
| {{LBS/Sph|OH}}
| {{LBS/DHSph|OH}}
| {{LBS/PhytoSph|OH}}
| {{LBS/6HSph|OH}}
|-
! '''Source 分布'''
| Major in mammals
| Major in mammals
| Major in fungi and plant
| Found in skin
|}

==Long-chain base 長鎖塩基==

{{Twocolumn|
The structural variation of LCB depends on biological species.<ref>Merrill AH "Sphingolipid and Glycosphingolipid Metabolic Pathways in the Era of Sphingolipidomics" Chem. Rev. 2011 111:6387–6422. PMID 21942574</ref>
|生物種によってLCBの構造は大きく異なります。
}}

{| class="wikitable"
! Classification || Long-chain base
|-
| Mammalia || sphingosine (= (4E)-d18:1) (4E)-d20:1 (nerve tissue), t18:0 (intestine)
|-
| Arthropoda || short-chain sphingosine (d14:1, d16:1) <ref>Guan XL, Cestra G, Shui G, Kuhrs A, Schittenhelm RB, Hafen E, van der Goot FG, Robinett CC, Gatti M, Gonzalez-Gaitan M, Wenk MR "Biochemical membrane lipidomics during Drosophila development" Dev Cell 2013 24:98-111. PMID 23260625</ref>
|-
| Plantae || (8E/Z)-d18:1, (8E/Z)-t18:1, (4E,8E/Z)-d18:2
|-
| Fungi || 9-methyl (4E,8E)-d18:2, t18:0
|}

===Bioactivity===
{{Twocolumn|
* Free LCB induces apoptosis.<ref>Hung WC, Chang HC, Chuang LY "Activation of caspase-3-like proteases in apoptosis induced by sphingosine and other long-chain bases in Hep3B hepatoma cells" Biochem J. 1999 338:161-166. PMID 9931312</ref>
* Sphingosine 1-phosphate is a lipid mediator of cell proliferation and motility control.<ref>Takabe K, Spiegel S."Export of sphingosine-1-phosphate and cancer progression"J Lipid Res. 2014 55:1839-46. PMID 24474820</ref>
|
* 遊離のLCBはアポトーシスを惹起します。
* スフィンゴシン 1リン酸 (Sph-1-P) は脂質メディエータとして細胞増殖や運動制御に働きます。
}}

<references/>

==Ceramide セラミド==

{{Twocolumn|
The conjugated fatty acids are often length 16 to 26. In normal tissues, little ceramide exists as an intermediate of phospho- and glycosphingolipid, whereas in the skin (corneocyte), ceramides and fatty-acid conjugated acyl-ceramides dominates and exhibit the barrier function.
| セラミドに結合する脂肪酸の炭素鎖長は16から26が多く、通常組織ではスフィンゴリン脂質やスフィンゴ糖脂質の中間体として少量存在します。皮膚の角質層にはセラミドに更に脂肪酸が結合したアシルセラミドがあり、皮膚のバリア機能を担います。
}}

===Composition===
{| class="wikitable"
|-
!rowspan="2"| Species
!colspan="3"| Glycosylceramide
!colspan="3"| Glycosyl inositol phosphoceramide (GIPC)
|-
! Fatty acid
! Long chain base
! References
! Fatty acid
! Long chain base
! References
|-
!Plants
| 16:0 - 26:0 16:1 - 26:1 16:0 VLCFA
| d18:2Δ4E8E/Z d18:2Δ4E8E/Z d18:1Δ8E/Z t18:1Δ8E/Z
| <ref name=Mark>Markham JE, Lynch DV, Napier JA, Dunn TM, Cahoon EB. "Plant sphingolipids: function follows form" Curr Opin Plant Biol. 2013 16: 350-7. PMID 23499054</ref><ref name="War">Warnecke D, Heinz E."Recently discovered functions of glucosylceramides in plants and fungi" Cell Mol Life Sci. 2003 60:919-41.PMID 12827281</ref> <ref name="Mark"/><ref name="War"/> <ref name="Mark"/> <ref name="Mark"/><ref name="War"/>
| VLCFA 14:0 - 26:0 20:1 - 26:1
| t18:1Δ8E/Z t18:1Δ8E/Z, t18:0 t18:1Δ8E/Z, t18:0
| <ref name="Mark"/> <ref name="Bure">Buré C, Cacas JL, Mongrand S, Schmitter JM. "Characterization of glycosyl inositol phosphoryl ceramides from plants and fungi by mass spectrometry" Anal Bioanal Chem. 2013 406:995-1010 PMID 23887274</ref> <ref name="Mark"/><ref name="Bure"/>
|-
!Fungi
| 16:0 - 18:0 16:1 - 18:1
| 9-methyl d18:2Δ4E,8E 9-methyl d18:2Δ4E,8E
| <ref name="Nim">Nimrichter L, Rodrigues ML. "Fungal glucosylceramides: from structural components to biologically active targets of new antimicrobials" Front Microbiol. 2011 2:212.PMID 22025918</ref><ref name="War"/> <ref name="Nim"/><ref name="War"/>
| 24:0 - 26:0 24:1 - 26:1 16:0 - 26:0
| t18:0 t18:0 t18:0, t20:0
| <ref name="Nim"/> <ref name="War"/> <ref name="War"/><ref name="Bure"/>
|}

===Bioactivity===

{{Twocolumn|
* Atopic dermatitis (and dry skin) is associated with a decrease and compositional change of ceramides.<ref>Macheleidt O, Kaiser HW, Sandhoff K "Deficiency of epidermal protein-bound omega-hydroxyceramides in atopic dermatitis" J Invest Dermatol. 2002 119:166-173. PMID 12164940</ref>
* Ceramides involve in cell proliferation and autophagy, and ceramide 1-phosphate functions as a lipid mediator.<ref>Young MM, Kester M, Wang HG "Sphingolipids: regulators of crosstalk between apoptosis and autophagy" J Lipid Res.2013 54:5-19. PMID 23152582</ref>
|
* アトピー性皮膚炎や乾燥肌ではセラミド量が減少し、組成も変化しています。
* 通常細胞内ではLCBと同様に細胞増殖やオートファジーに関与し、セラミド末端にリン酸が結合した Cer-1-P も脂質メディエータとして働きます。
}}

<references/>

===Metabolism===

[[:Category:LBS/Biosynthesis|Metabolism, Glycosphingolipid in Plant and Fungi]]

Category:LBSB

2023-11-29T06:24:42Z

Editor:

{{LB/Header}}
{{Hierarchy|{{PAGENAME}}}}

{{Twocolumn|
Long-chain base (LCB or sphingoid base) is a 2-aminoalkane (or alkene) 1,3-diol. In cells, it constitutes sphingolipids and little exists as a free form.
When LCB is linked with a long-chain fatty acid via an amide bond, it is called a ceramide (Cer).<ref>Yamaji T, Hanada K "Sphingolipid metabolism and interorganellar localization of sphingolipid enzymes and lipid transfer proteins" Traffic 2015 16:101-122. PMID 25382749</ref>
|
長鎖塩基 LCB（またはスフィンゴイド塩基）は 2-アミノアルカン（またはアルケン） 1,3-ジオールを指し、生体内ではスフィンゴ脂質の構成成分です。遊離のLCBは微量しか存在しません。長鎖塩基に長鎖脂肪酸がアミド結合したものを、セラミドと呼びます。
}}
<references/>

* Pathway map for biosynthesis [[PathwayMap:CeramideBiosynthesis]]
* [https://lipidbank.jp/DLB.html Link to the original LipidBank]

==Notation 表記法 ==
{|
|style="background:lightgray" width="200px"| Sph d18:1 
|Sph is an abbreviation of LCB. ''d'' or ''t'' stands for double or triple hydroxy groups, respectively. (We count the terminal alcohol.) 18 is the carbon chain length. 1 after the colon is the number of unsaturated bonds (double bonds).
|width="30%"|
長鎖塩基 LCB は Sph と表します。 ''d'', ''t'' はそれぞれ 2, 3 個の水酸基（アルコールの水酸基含む）を意味し、18は炭素鎖長です。コロンの次にくる1は不飽和結合（二重結合）の数を表します。
|}

{|
|style="background:lightgray" width="200px"| Cer  d18:1Δ8E/20:0 
| Cer is an abbreviations of ceramide. The first part indicates the sphingoid base and the second, after the slash, fatty acid. In this website we do not use superscripts or subscripts for readability. Also we do not italicize E (or trans) and Z (or cis) for the same reason.
|width="30%"| セラミドは　Cer　と表します。左側が長鎖塩基、スラッシュを挟んで右側は脂肪酸を表しています。このサイトでは上付き／下付きは使用せず（見づらいため）、 E (トランス）, Z (シス）もイタリックにしていません。
|}

{| style="border-spacing: 20px;"
|-
! '''Common Name'''
| sphingosine (= (4E)-sphingenine) スフィンゴシン
| sphinganine (= dihydrosphingosine) スフィンガニン
| phytosphingosine (= 4-hydroxydihydrosphingosine) フィトスフィンゴシン
| 6-hydroxysphingosine 6-ヒドロキシスフィンゴシン
|-
! '''Abbreviation'''
| d18:1 or So
| d18:0 or Sa (DHSo)
| t18:0 or Phyto
| t18:1 or 6-t18:1
|-
! '''Structure 構造'''
| {{LBS/Sph|OH}}
| {{LBS/DHSph|OH}}
| {{LBS/PhytoSph|OH}}
| {{LBS/6HSph|OH}}
|-
! '''Source 分布'''
| Major in mammals
| Major in mammals
| Major in fungi and plant
| Found in skin
|}

==Long-chain base 長鎖塩基==

{{Twocolumn|
The structural variation of LCB depends on biological species.<ref>Merrill AH "Sphingolipid and Glycosphingolipid Metabolic Pathways in the Era of Sphingolipidomics" Chem. Rev. 2011 111:6387–6422. PMID 21942574</ref>
|生物種によってLCBの構造は大きく異なります。
}}

{| class="wikitable"
! Classification || Long-chain base
|-
| Mammalia || sphingosine (= (4E)-d18:1) (4E)-d20:1 (nerve tissue), t18:0 (intestine)
|-
| Arthropoda || short-chain sphingosine (d14:1, d16:1) <ref>Guan XL, Cestra G, Shui G, Kuhrs A, Schittenhelm RB, Hafen E, van der Goot FG, Robinett CC, Gatti M, Gonzalez-Gaitan M, Wenk MR "Biochemical membrane lipidomics during Drosophila development" Dev Cell 2013 24:98-111. PMID 23260625</ref>
|-
| Plantae || (8E/Z)-d18:1, (8E/Z)-t18:1, (4E,8E/Z)-d18:2
|-
| Fungi || 9-methyl (4E,8E)-d18:2, t18:0
|}

===Bioactivity===
{{Twocolumn|
* Free LCB induces apoptosis.<ref>Hung WC, Chang HC, Chuang LY "Activation of caspase-3-like proteases in apoptosis induced by sphingosine and other long-chain bases in Hep3B hepatoma cells" Biochem J. 1999 338:161-166. PMID 9931312</ref>
* Sphingosine 1-phosphate is a lipid mediator of cell proliferation and motility control.<ref>Takabe K, Spiegel S."Export of sphingosine-1-phosphate and cancer progression"J Lipid Res. 2014 55:1839-46. PMID 24474820</ref>
|
* 遊離のLCBはアポトーシスを惹起します。
* スフィンゴシン 1リン酸 (Sph-1-P) は脂質メディエータとして細胞増殖や運動制御に働きます。
}}

<references/>

==Ceramide セラミド==

{{Twocolumn|
The conjugated fatty acids are often length 16 to 26. In normal tissues, little ceramide exists as an intermediate of phospho- and glycosphingolipid, whereas in the skin (corneocyte), ceramides and fatty-acid conjugated acyl-ceramides dominates and exhibit the barrier function.
| セラミドに結合する脂肪酸の炭素鎖長は16から26が多く、通常組織ではスフィンゴリン脂質やスフィンゴ糖脂質の中間体として少量存在します。皮膚の角質層にはセラミドに更に脂肪酸が結合したアシルセラミドがあり、皮膚のバリア機能を担います。
}}

===Composition===
{| class="wikitable"
|-
!rowspan="2"| Species
!colspan="3"| Glycosylceramide
!colspan="3"| Glycosyl inositol phosphoceramide (GIPC)
|-
! Fatty acid
! Long chain base
! References
! Fatty acid
! Long chain base
! References
|-
!Plants
| 16:0 - 26:0 16:1 - 26:1 16:0 VLCFA
| d18:2Δ4E8E/Z d18:2Δ4E8E/Z d18:1Δ8E/Z t18:1Δ8E/Z
| <ref name=Mark>Markham JE, Lynch DV, Napier JA, Dunn TM, Cahoon EB. "Plant sphingolipids: function follows form" Curr Opin Plant Biol. 2013 16: 350-7. PMID 23499054</ref><ref name="War">Warnecke D, Heinz E."Recently discovered functions of glucosylceramides in plants and fungi" Cell Mol Life Sci. 2003 60:919-41.PMID 12827281</ref> <ref name="Mark"/><ref name="War"/> <ref name="Mark"/> <ref name="Mark"/><ref name="War"/>
| VLCFA 14:0 - 26:0 20:1 - 26:1
| t18:1Δ8E/Z t18:1Δ8E/Z, t18:0 t18:1Δ8E/Z, t18:0
| <ref name="Mark"/> <ref name="Bure">Buré C, Cacas JL, Mongrand S, Schmitter JM. "Characterization of glycosyl inositol phosphoryl ceramides from plants and fungi by mass spectrometry" Anal Bioanal Chem. 2013 406:995-1010 PMID 23887274</ref> <ref name="Mark"/><ref name="Bure"/>
|-
!Fungi
| 16:0 - 18:0 16:1 - 18:1
| 9-methyl d18:2Δ4E,8E 9-methyl d18:2Δ4E,8E
| <ref name="Nim">Nimrichter L, Rodrigues ML. "Fungal glucosylceramides: from structural components to biologically active targets of new antimicrobials" Front Microbiol. 2011 2:212.PMID 22025918</ref><ref name="War"/> <ref name="Nim"/><ref name="War"/>
| 24:0 - 26:0 24:1 - 26:1 16:0 - 26:0
| t18:0 t18:0 t18:0, t20:0
| <ref name="Nim"/> <ref name="War"/> <ref name="War"/><ref name="Bure"/>
|}

===Bioactivity===

{{Twocolumn|
* Atopic dermatitis (and dry skin) is associated with a decrease and compositional change of ceramides.<ref>Macheleidt O, Kaiser HW, Sandhoff K "Deficiency of epidermal protein-bound omega-hydroxyceramides in atopic dermatitis" J Invest Dermatol. 2002 119:166-173. PMID 12164940</ref>
* Ceramides involve in cell proliferation and autophagy, and ceramide 1-phosphate functions as a lipid mediator.<ref>Young MM, Kester M, Wang HG "Sphingolipids: regulators of crosstalk between apoptosis and autophagy" J Lipid Res.2013 54:5-19. PMID 23152582</ref>
|
* アトピー性皮膚炎や乾燥肌ではセラミド量が減少し、組成も変化しています。
* 通常細胞内ではLCBと同様に細胞増殖やオートファジーに関与し、セラミド末端にリン酸が結合した Cer-1-P も脂質メディエータとして働きます。
}}

<references/>

===Metabolism===

[[:Category:LBS/Biosynthesis|Metabolism, Glycosphingolipid in Plant and Fungi]]

Category:LB

2023-11-29T06:04:18Z

Editor:

{{Huge|LipidBank Database}}
{{LB/Header}}
{{Twocolumn|
LipidBank Database is an official data resource of [https://web.jcbl.jp/ JCBL] (Japanese Conference of Biochemistry of Lipids).
Database contents are curated by [[JCBL:DBmeeting|a committee under JCBL]]. For citing this resource, please use the following information.
|
LipidBankデータベースは [https://web.jcbl.jp/ 日本脂質生化学会] の公式データベースです。内容はJCBLの[[JCBL:DBmeeting|構築委員会]]によって管理されています。
引用される場合は以下の文献を利用してください。
}}
; References
* History: Yasugi E, Seyama Y "Lipid database "LipidBank" and international collaboration" Tanpakushitsu Kakusan Koso. 52(11), 1357-1362, 2007 (in Japanese; 日本語)
* Usage: Yasugi E, Watanabe K "LIPIDBANK for Web, the newly developed lipid database" Tanpakushitsu Kakusan Koso. 47(7), 837-841, 2002 (in Japanese; 日本語)
* Glycolipid: Watanabe K., Yasugi E. and Oshima M. "How to search the glycolipid data in LIPIDBANK for Web: the newly developed lipid database" Japan Trend Glycosci. and Glycotechnol. 12, 175-184, 2000
* LipidBank History & Committee page [[JCBL:DBmeeting]]

; Related projects
* [https://lipidbank.jp/ Original LipidBank classification]
* [[Lipoquality:Database|LipoQuality Database]]

<center>
{| class="wikitable"
|-
! colspan="3" | LipidBank Class Overview
|-
| align="left" style="vertical-align:top" width=33%|
[[:Category:LBF|LBF: Fatty acyls 脂肪酸アシル]]
 [[Image:LBF.png|100px]] 

;Links to the original LipidBank
:[https://lipidbank.jp/DFA.html fatty acids]
:[https://lipidbank.jp/DLL.html long-chain alcohol]
:[https://lipidbank.jp/DLD.html long-chain aldehyde]
:[https://lipidbank.jp/XPR.html eicosanoids]
:[https://lipidbank.jp/OPO.html lipid peroxide]
:[https://lipidbank.jp/WWA.html wax]
:[https://lipidbank.jp/MMA.html mycolic acid]

| align="left" style="vertical-align:top" width=33%|
[[:Category:LBG|LBG: Glycerolipids グリセロ脂質]]
 [[Image:LBG.png|100px]] 

;Links to the original LipidBank
:[https://lipidbank.jp/NAG.html acylglycerols]
:[https://lipidbank.jp/PGP.html glycerophospholipid]
:[https://lipidbank.jp/EEA.html ether-type lipid]
:[https://lipidbank.jp/GGG.html glycoglycerolipid]
* [[:Category:LBGA|LBGA: Archaeal Lipid (Ether-type) 古細菌の脂質]]

| align="left" style="vertical-align:top" width=33%|
[[:Category:LBS|LBS: Sphingolipids スフィンゴ脂質]] (new)
 [[Image:LBS.png|110px]] 

* [[:Category:LBSB|LBSB: long-chain base and ceramide]]
* [[:Category:LBSC|LBSC: cerebroside]]
* [[:Category:LBSG|LBSG: acidic glycosphingolipid]]
* [[:Category:LBSP|LBSP: phospho-sphingolipid]]

|-
| style="vertical-align:top"| Sterol Lipids
 [[File:Cholestane.png]] 
;Links to the original LipidBank
:[https://lipidbank.jp/SST.html steroid]
:[https://lipidbank.jp/BBA.html bile acid]
:[https://lipidbank.jp/VVD.html vitamin D]

| style="vertical-align:top"| Prenol Lipids
 <BIG>(</BIG> [[File:Isoprene.png]]<BIG>)</BIG>n 
;Links to the original LipidBank
:[https://lipidbank.jp/IIP.html isoprenoid]
:[https://lipidbank.jp/VCA.html carotenoid]
:[https://lipidbank.jp/VVA.html vitamin A]
:[https://lipidbank.jp/VVK.html vitamin K]
:[https://lipidbank.jp/VCQ.html coenzyme Q]

| style="vertical-align:top"| Others

;Links to the original LipidBank
:[https://lipidbank.jp/CLS.html lipopolysaccharide]
:[https://lipidbank.jp/ALA.html lipoamino acid]
:[https://lipidbank.jp/TLP.html lipoprotein]
:[https://lipidbank.jp/VVE.html vitamin E]
:[https://lipidbank.jp/NAG.html acylglycerols]

|}
</center>

{{Twocolumn|
Biogenic substances insoluble to water are collectively called as '''lipid'''. Lipid is generally classified into the following three types.
* '''Simple lipid''' ... fatty acid esters of alchohol such as glycerol and sphingoid base.
* '''Complex lipid''' ... glycosylated or phosphorylated version of the simple lipid.
* '''Derived lipid''' ... alcohols and fatty acids derived by hydrolyzing the simple lipid. Also includes sterols and polyketides.
|
水に溶けない生体成分を一般に脂質と呼び、以下の3つに分けられます。
* '''単純脂質''' ... アルコールと脂肪酸のエステルで、スフィンゴ骨格とグリセロ骨格のものに大別されます。
* '''複合脂質''' ... 単純脂質にリン酸や糖がついたものです。
* '''誘導脂質''' ... 単純脂質を分解して得られるアルコール、脂肪酸。ステロールやポリケチドもここに含めます。
}}

Category:LB

2023-11-29T05:33:42Z

Editor:

{{Huge|LipidBank Database}}
{{LB/Header}}
{{Twocolumn|
LipidBank Database is an official data resource of [https://web.jcbl.jp/ JCBL] (Japanese Conference of Biochemistry of Lipids).
Database contents are curated by [[JCBL:DBmeeting|a committee under JCBL]]. For citing this resource, please use the following information.
|
LipidBankデータベースは [https://web.jcbl.jp/ 日本脂質生化学会] の公式データベースです。内容はJCBLの[[JCBL:DBmeeting|構築委員会]]によって管理されています。
引用される場合は以下の文献を利用してください。
}}
; References
* History: Yasugi E, Seyama Y "Lipid database "LipidBank" and international collaboration" Tanpakushitsu Kakusan Koso. 52(11), 1357-1362, 2007 (in Japanese; 日本語)
* Usage: Yasugi E, Watanabe K "LIPIDBANK for Web, the newly developed lipid database" Tanpakushitsu Kakusan Koso. 47(7), 837-841, 2002 (in Japanese; 日本語)
* Glycolipid: Watanabe K., Yasugi E. and Oshima M. "How to search the glycolipid data in LIPIDBANK for Web: the newly developed lipid database" Japan Trend Glycosci. and Glycotechnol. 12, 175-184, 2000
* LipidBank History & Committee page [[JCBL:DBmeeting]]

; Related projects
* [https://lipidbank.jp/ Original LipidBank Database]
* [[Lipoquality:Database|LipoQuality Database]]

<center>
{| class="wikitable"
|-
! colspan="3" | LipidBank Class Overview
|-
| align="left" style="vertical-align:top" width=33%|
[[:Category:LBF|LBF: Fatty acyls 脂肪酸アシル]]
 [[Image:LBF.png|100px]] 

;Links to the original LipidBank
:[https://lipidbank.jp/DFA.html fatty acids]
:[https://lipidbank.jp/DLL.html long-chain alcohol]
:[https://lipidbank.jp/DLD.html long-chain aldehyde]
:[https://lipidbank.jp/XPR.html eicosanoids]
:[https://lipidbank.jp/OPO.html lipid peroxide]
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[[:Category:LBG|LBG: Glycerolipids グリセロ脂質]]
 [[Image:LBG.png|100px]] 

;Links to the original LipidBank
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:[https://lipidbank.jp/PGP.html glycerophospholipid]
:[https://lipidbank.jp/EEA.html ether-type lipid]
:[https://lipidbank.jp/GGG.html glycoglycerolipid]
* [[:Category:LBGA|LBGA: Archaeal Lipid (Ether-type) 古細菌の脂質]]

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[[:Category:LBS|LBS: Sphingolipids スフィンゴ脂質]] (new)
 [[Image:LBS.png|110px]] 

* [[:Category:LBSB|LBSB: long-chain base and ceramide]]
* [[:Category:LBSC|LBSC: cerebroside]]
* [[:Category:LBSG|LBSG: acidic glycosphingolipid]]
* [[:Category:LBSP|LBSP: phospho-sphingolipid]]

|-
| style="vertical-align:top"| Sterol Lipids
 [[File:Cholestane.png]] 
;Links to the original LipidBank
:[https://lipidbank.jp/SST.html steroid]
:[https://lipidbank.jp/BBA.html bile acid]
:[https://lipidbank.jp/VVD.html vitamin D]

| style="vertical-align:top"| Prenol Lipids
 <BIG>(</BIG> [[File:Isoprene.png]]<BIG>)</BIG>n 
;Links to the original LipidBank
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:[https://lipidbank.jp/VCA.html carotenoid]
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| style="vertical-align:top"| Others

;Links to the original LipidBank
:[https://lipidbank.jp/CLS.html lipopolysaccharide]
:[https://lipidbank.jp/ALA.html lipoamino acid]
:[https://lipidbank.jp/TLP.html lipoprotein]
:[https://lipidbank.jp/VVE.html vitamin E]
:[https://lipidbank.jp/NAG.html acylglycerols]

|}
</center>

{{Twocolumn|
Biogenic substances insoluble to water are collectively called as '''lipid'''. Lipid is generally classified into the following three types.
* '''Simple lipid''' ... fatty acid esters of alchohol such as glycerol and sphingoid base.
* '''Complex lipid''' ... glycosylated or phosphorylated version of the simple lipid.
* '''Derived lipid''' ... alcohols and fatty acids derived by hydrolyzing the simple lipid. Also includes sterols and polyketides.
|
水に溶けない生体成分を一般に脂質と呼び、以下の3つに分けられます。
* '''単純脂質''' ... アルコールと脂肪酸のエステルで、スフィンゴ骨格とグリセロ骨格のものに大別されます。
* '''複合脂質''' ... 単純脂質にリン酸や糖がついたものです。
* '''誘導脂質''' ... 単純脂質を分解して得られるアルコール、脂肪酸。ステロールやポリケチドもここに含めます。
}}

PathwayMap:GLtest

2023-11-29T05:29:15Z

Editor: Editor moved page PathwayMap:GLtest to PathwayMap:GlycerolipidBiosynthesis

#REDIRECT [[PathwayMap:GlycerolipidBiosynthesis]]

PathwayMap:GlycerolipidBiosynthesis

2023-11-29T05:29:15Z

Editor: Editor moved page PathwayMap:GLtest to PathwayMap:GlycerolipidBiosynthesis

<div id="source" style="display:none">
<nowiki>
[title] <2.5,2.5>
#Glycerolipid Metabolome
de novo pathway of glycerophospholipid

//titles
[OMM_name] <88.5,42.5>css(font-size:40px;background:rgb(200,200,150;border:5px solid black;color:)
Mitochondrial outer membrane

[IMM_name] <88.5,35>css(font-size:40px;background:rgb(200,200,150;border:5px solid black;color:)
Mitochondrial inner membrane

[ER] <6,113.5>css(font-size:40px;background:rgb(200,200,150;border:5px solid black;z-index:2)
Endoplasmic reticulum

//=========================================Organelles======================================================
//Mitochondria outer membrane
[OMM] <38.5,2.5,2100,700>css(background:rgb(255,200,50;z-index:1;border:30px solid rgb(155,100,10)

//Mitochondria inner membrane
[IMM] <57.5,17.5,1500,350>css(background:rgb(255,200,50;z-index:2;border:30px solid rgb(155,100,10)

//Endoplasmic reticulum
[ER1] <1,1,400,2050>css(background:rgb(200,255,10;border-right:50px solid rgb(200,200,0;box-shadow:none;z-index:1)

//Golgi
[Golgi] <39,51.5,700,1000>css(background:rgb(50,140,140;border:30px solid rgb(100,200,200;box-shadow:none;z-index:1)

//=========================================Metabolites=====================================================
//glycerol-3-phosphate
[G3P3] <29.5,1.5>
!GL{OH |OH|O-PO_s3s_}
?[link](http://lipidbank.jp/cgi-bin/main.cgi?id=PGP "G3P")
d=(l_w5)=>u[LPA]
d=(l_w5)=>u[LPAmt]

//lysophosphatidic acid
[LPA] <22.5,13>
!GL{O-CO-R1|OH|O-PO_s3s_}
LPA
d=(l_w5)=>u[PAER]

//lysophosphatidic acid
[LPAmt] <36.5,13>
!GL{O-CO-R1|OH|O-PO_s3s_}
LPA
d=(l_w5)=>u[PA2]

//phosphatidic acid, mitochondrial
[PAER] <23,32>
!GL{O-CO-R1|O-CO-R2|O-PO_s3s_}
?[link](http://jcbl.jp/wiki/Volatile:ListMol?my_1=LBGPA"PA")
d=(l_w5)=>u[DAG2]
d=(l_w5)=>u[CDP-DAGer]

//phosphatidic acid, mitochondrial
[PAmt] <54,15>
!GL{O-CO-R1|O-CO-R2|O-PO_s3s_}
?[link](http://jcbl.jp/wiki/Volatile:ListMol?my_1=LBGPA"PA")
r=(l_w5)=>l[CDP-DAG]

//cytidine diphosphate-diacylglycerol
[CDP-DAG] <73,15>
!GL{O-CO-R1 | O-CO-R2 | O-PO2-CMP</t>}
CDP-DAG
r=(l_w5)=>l[PGP]

//cytidine diphosphate-diacylglycerol
[CDP-DAGer] <22,60>
!GL{O-CO-R1 | O-CO-R2 | O-PO2-CMP</t>}
CDP-DAG
r=(l_w5)=>u[PI]
d=(l_w5)=>u[PI2]
//cytidine triphosphate
[CTP] <64,14.5>
CTP
d=(l_w2)=>d[PPi]

//pyrophosphate
[PPi] <68.5,13>
pyrophosphate

//phosphatidylglycerol-phosphate
[PGP] <96,14>
!PG{O-CO-R1 | O-CO-R2 | O-PO2-O| HO|O3P-O}
PGP
r=(l_w4)=>l[PG]

//glycerol-3-phosphate
[G3P] <82.5,9>
!GL{OH |OH|O-PO_s3s_}
?[link](http://lipidbank.jp/cgi-bin/main.cgi?id=PGP "G3P")
d=(l_w2)=>d[CMP]

[CMP] <90.5,13>
CMP

[PG] <118,13.5>
!PG{O-CO-R1 | O-CO-R2 | PO2-O| HO|HO }
?[link](http://jcbl.jp/wiki/Volatile:ListMol?my_1=LBGPG"PG")

r=(l_w4)=>[CL]
[H2O] <109,14>
H2O
d=(l_w2)=>d[Pi]

[Pi] <113,14>
Pi

[CDP-DAGbox] <128,13.5>
CDP-DAG
d=(l_w2)=>d[CMP2]

[CMP2] <134.5,13.5>
CMP

//cardiolipin
[CL] <138,12>
!CL{O-CO-R1|O-CO-R2|O-PO-O|HO|O-PO-O|O-CO-R3| O-CO-R4}
CL
u=(l_w5)=>d[CL2]

[CL2] <142,3>
CL

[PA2] <37,23.5>
!GL{O-CO-R1|O-CO-R2|O-PO_s3s_}
PA
=(l_w5)=>[PAmt]

//diacylglycerol
[DAG] <54,28>
!GL{O-CO-R1|O-CO-R1| OH}
DAG
u=(l_w5)=>d[PAmt]

[unknown] <53,38>
?
u==>d[DAG]

//diacylglycerol
[DAG2] <22,48.5>
!GL{O-CO-R1|O-CO-R1| OH}
DAG
r=(l_w5)=>[PC]

//phosphatidylinositol
[PI] <33.5,76>
!GL{O-CO-R1 | O-CO-R2 | O-PO2-Inositol}
?[link](http://jcbl.jp/wiki/Volatile:ListMol?my_1=LBGPI"PI")

//phosphatidylinositol
[PI2] <21.5,76>
!GL{O-CO-R1 | O-CO-R2 | O-PO2-Inositol}
?[link](http://jcbl.jp/wiki/Volatile:ListMol?my_1=LBGPI"PI")

//phosphatidylcholine
[PC] <53.5,48.5>
!GL{O-CO-R1|O-CO-R2|O-PO2-Choline}
?[link](http://jcbl.jp/wiki/Volatile:ListMol?my_1=LBGPC"PC")

//phosphatidylethanolamine
[PE] <24,92.5>
!GL{O-CO-R1|O-CO-R2| O-PO2-Ethanolamine}
PE

//===================================Gene====================================================
[Tam41] <66,17>css(background:rgb(255,200,50;border:5px solid rgb(255,100,50;z-index:5)
Tam41

<pop>
Enzyme: CDP-diacylglycerol synthase 
This reaction is not catalyzed by Cds1 in mitochondria.
?[link](http://www.cell.com/cell-metabolism/pdf/S1550-4131(13)00142-3.pdf"Tamura et al. 2013. Cell Metab. 17(5):709-718.")
</pop>

//phosphatidylglycerolphosphate (PGP) synthase
[aa] (gene) <87,16.5>css(background:rgb(255,200,50;border:5px solid rgb(255,100,50;z-index:5)
PGS1

//phosphatidylglycerophosphatase
[PTPMT1] <109.5,17.5>css(background:rgb(255,200,50;border:5px solid rgb(255,100,50;z-index:5)
PTPMT1

//cardiolipin synthase
[CRLS1] <130.5,17>css(background:rgb(255,200,50;border:5px solid rgb(255,100,50;z-index:5)
CRLS1

[PRELITRIAP1] <45.5,21>css(background:rgb(255,200,50;border:5px solid rgb(255,100,50;z-index:5)
Transferred by
PRELI1 + TRIAP1

<pop>
In yeast Ups1 shuffles PA between the OMM and IMM and the PA-loaded Ups1 needs the interaction with Mdm35 for stabilisation.
?[link](http://science.sciencemag.org/cgi/pmidlookup?view=long&pmid=23042293"Connerth et al. 2012. Science. 338(6108):815-818.")
In human, the orthologous gene of Ups1 is PRELI1 and TRIAP1 is the gene which has the function of Mdm35.
?[link](https://linkinghub.elsevier.com/retrieve/pii/S1550-4131(13)00297-0"Potting et al. 2013. Cell Metab. 18(2):287-295.")
</pop>

//nucleoside diphosphate kinase Nm23-H4
[NME4] <139.5,7>css(background:rgb(255,200,50;border:5px solid rgb(255,100,50;z-index:5)
Transffered by
Nm23-H4
<pop>
The nucleoside diphosphate kinase Nm23-H4 (encoded by the NME4 gene) localizes in the mitochondrial inter-membrane space
and seems to have a dual function either in the transfer of phosphate groups or in the transfer of CL from the IMM to the OMM.
?[link](https://www.ncbi.nlm.nih.gov/pmc/articles/pmid/23150663/"Schlattner et al. 2013. J Biol Chem. 288(1):111-121.")
</pop>

//acylglycerol kinase
[AGK] <56.5,24>css(background:rgb(255,200,50;border:5px solid rgb(255,100,50;z-index:5)
AGK
<pop>
There is a term "Multi-substrate lipid kinase (MuLK)" (Waggoner et al., 2004).
This enzyme phosphorylates diacylglycerol, ceramide, and 1-acylglycerol but not sphingosine.
?[link](http://www.jbc.org/content/279/37/38228.long"Waggoner et al. 2004. J Biol Chem. 279(37):38228-38235.")

AGK deficiency results in Sengers syndrome with dysfunction of the mitochondrial energy metabolism.

?[link](https://www.ncbi.nlm.nih.gov/pmc/articles/PMC3523805/"Calvo et al. 2012. Sci Transl Med. 4(118):118ra10.")
?[link](https://www.ncbi.nlm.nih.gov/pmc/articles/PMC3276657/"Mayr et al. 2012. Am J Hum Genet. 90(2):314-320.")

</pop>

[GPATer] <24.5,9>css(background:rgb(255,200,50;border:5px solid rgb(255,100,50;z-index:5)
GPAT3,4

[GPATmit] <35.5,9>css(background:rgb(255,200,50;border:5px solid rgb(255,100,50;z-index:5)
GPAT1,2

[AGPAT] <36.5,20>css(background:rgb(255,200,50;border:5px solid rgb(255,100,50;z-index:5)
AGPAT1,4

[AGPAT2] <22,24>css(background:rgb(255,200,50;border:5px solid rgb(255,100,50;z-index:5)
AGPAT1,2,3,5

//Phosphatidate phosphatase
[LPIN] <23,42.5>css(background:rgb(255,200,50;border:5px solid rgb(255,100,50;z-index:5)
LPIN
?[link](http://www.genome.jp/dbget-bin/www_bget?ec:3.1.3.4"KEGG")
<pop>
Phosphatidate phosphatase
</pop>

//CDP-diacylglycerol--inositol 3-phosphatidyltransferase
[CDIPT] <36.5,69>css(background:rgb(255,200,50;border:5px solid rgb(255,100,50;z-index:5)
CDIPT
?[link](http://www.genome.jp/dbget-bin/www_bget?ec:2.7.8.11"KEGG")

//CDP-diacylglycerol--inositol 3-phosphatidyltransferase
[CDIPT2] <24,69>css(background:rgb(255,200,50;border:5px solid rgb(255,100,50;z-index:5)
CDIPT
?[link](http://www.genome.jp/dbget-bin/www_bget?ec:2.7.8.11"KEGG")

//Cholinephosphotransferase
[CHPT1] <44,48.5>css(background:rgb(255,200,50;border:5px solid rgb(255,100,50;z-index:5)
CHPT
?[link](http://www.genome.jp/dbget-bin/www_bget?ec:2.7.8.2"KEGG")
?[link](http://www.uniprot.org/uniprot/Q8WUD6"UniProt")

<pop>
Subcellular localization
?[link](https://www.ncbi.nlm.nih.gov/pmc/articles/PMC124149/"Henneberry et al.( 2002) Mol Biol Cell. 13(9):3148-3161")
</pop>

</nowiki>
</div>
<div id="mainTxt" style="height:800px;"> </div>

PathwayMap:CeramideBiosynthesis

2023-11-29T03:59:09Z

Editor: Created page with "<div id="source" style="display:none"> <nowiki> [title] <2.5,2.5> #Ceramide Biosynthesis //titles [ER] <6.83,66.82>css(font-size:20px;background:rgb(200,200,150;border:5px solid black;z-index:2) Endoplasmic reticulum [Cytosol] <70,1>css(font-size:20px;background:rgb(200,200,150;border:5px solid black;z-index:2) Cytosol [PlasmaMembraneName] <91.51,4.97>css(font-size:20px;background:rgb(200,200,150;border:5px solid black;z-index:2) Plasma Membrane [LysosomeName] <82.14..."

<div id="source" style="display:none">
<nowiki>
[title] <2.5,2.5>
#Ceramide Biosynthesis

//titles
[ER] <6.83,66.82>css(font-size:20px;background:rgb(200,200,150;border:5px solid black;z-index:2)
Endoplasmic reticulum

[Cytosol] <70,1>css(font-size:20px;background:rgb(200,200,150;border:5px solid black;z-index:2)
Cytosol

[PlasmaMembraneName] <91.51,4.97>css(font-size:20px;background:rgb(200,200,150;border:5px solid black;z-index:2)
Plasma Membrane

[LysosomeName] <82.14,16.54>css(font-size:20px;background:rgb(200,200,150;border:5px solid black;z-index:2)
Lysosome

[cisGLD] <24.68,41.48>css(font-size:20px;background:rgb(200,200,150;border:5px solid black;z-index:2)
cis/medial Golgi

[transGLD] <44.10,41.48>css(font-size:20px;background:rgb(200,200,150;border:5px solid black;z-index:2)
trans Golgi

[TGNName] <71.40,41.48>css(font-size:20px;background:rgb(200,200,150;border:5px solid black;z-index:2)
trans Golgi network

//========================================Organelle boxes========================

[ER1] <3.89,0.66,166.03,1024.31>css(background:rgb(200,255,10;border-right:50px solid rgb(200,200,0;box-shadow:none;z-index:1)
[ER2] <11.03,52.92,1280.14,340.00>css(background:rgb(200,255,10;border-top:50px solid rgb(200,200,0;box-shadow:none;z-index:1)
[ER3] <3.84,53.16,165.38,333.00>css(background:rgb(200,255,10;box-shadow:none;z-index:1)

[PlasmaMembrane] <94.81,1.10,51.19,1154.37>css(background:rgb(100,100,100;box-shadow:none;z-index:1;)

//Golgi
[Golgi] <24.81,20.95,162.20,324.15>css(background:rgb(50,140,140;border:30px solid rgb(100,200,200;box-shadow:none;z-index:1)

//Golgi
[Golgi_trans] <35.84,20.95,404.71,324.15>css(background:rgb(50,140,140;border:30px solid rgb(100,200,200;box-shadow:none;z-index:1)

//Trans Golgi network
[TGN] <63.40,20.95,404.71,324.15>css(background:rgb(50,140,140;border:30px solid rgb(100,200,200;box-shadow:none;z-index:1)

//Lysosome
[Lysosome] (mark) <77.73,0.56,170.61,255.93>css(background:rgb(130,140,140;border:30px solid rgb(130,180,180;box-shadow:none;z-index:1)

//=========================================Metabolites=====================================================
//Palmitoyl-CoA
[PalCoA] <12.68,1.66>
PalCoA
d=(l_w3)=>u[3KDS]

//3-ketodihydrosphingosine
[3KDS] <12.68,7.17>
3-KDS
d=(l_w3)=>u[DHS]

//dihydrosphingosine
[DHS] <13.23,12.68>
DHS
d=(l_w3)=>u[DHC]

//dihydroceramide
[DHC] <13.23,17.64>
DHC
d=(l_w3)=>u[Cer]

//Ceramide
[C1P] <66.71,15.44>
!SP{O-PO3}
C1P
r=(l_w)=>[PlasmaMembrane]

//Ceramide
[Cer] <12.13,23.15>
!SP{O}
Cer
r=(l_w3)=>u[GlcCer]
r=(l_w3)=l[CERT]

//Ceramide
[Cer2] <38.33,25.73>
Cer
u=(l_w3)=>u[SM]

//Ceramide
[Cer3] <56.18,18.90>
Cer

//Ceramide
[Cer4] <63.95,18.19>
Cer
d=(l_w3)=>d[C1P]

//Ceramide
[Cer5] <13.79,45.76>
Cer

//Ceramide
[Cer6] <52.92,51.82>
Cer

//Ceramide
[Cer7] <97.02,19.30>
Cer
u=(l_w3)=>d[SM4]

//Ceramide
[Cer8] <80.48,4.97>
Cer

//Ceramide
[Cer9] <79.94,11.03>
Cer

//Sphingosine
[Sph] <13.23,32.53>
Sph
u=(l_w3)=>d[Cer]

//Glucosylceramide
[GlcCer] <19.30,29.77>
!SP{O-Glc}
GlcCer
d=(l_w3)=>[GlcCer2]
d=(l_w3)=l[FAPP2]
d=(l_w3)=>u[Cer5]

//Glucosylceramide
[GlcCer2] <28.12,35.84>
GlcCer
r=(l_w3)=>l[GlcCer3]

//Glucosylceramide
[GlcCer3] <38.33,35.18>
GlcCer
d=(l_w3)=>l[LacCer]

//Glucosylceramide
[GlcCer4] <66.71,38.04>
GlcCer
l=(l_w3)=>L[LacCer2]

//Glucosylceramide
[GlcCer5] <83.79,11.03>
GlcCer
d=(l_w3)=>d[Cer9]

//Lactosylceramide
[LacCer] <46.5,36>
!SP{O-Glc-Gal}
LacCer
r=(l_w3)=>r[GM3]

//Lactosylceramide
[LacCer2] <67,32.5>
!SP{O-Glc-Gal}
LacCer
l=(l_w3)=>L[GB3]
d=(l_w3)=>d[GA2]

//Globotriaosylceramide
[GB3] <66.5,27.5>
!SP{O-Glc-Gal-Gal}
Gb3
r=(l_w)=>[PlasmaMembrane]

//Globoside
[GA2] <76.07,34.73>
!SP{O-Glc-Gal-GalNAc}
GA2
r=(l_w)=>[PlasmaMembrane]

//asialoGM１
[GM3] <45.15,30.45>
!SP{O-Glc-Gal| SA}
GM3

//asialoGM 3
[GM2] <71.5,22.5>
!SP{O-Glc-Gal-GalNAc| SA|}
GM2
r=(l_w)=>[PlasmaMembrane]

//GM1
[SM] <43.05,25.20>
!SP{O-Choline}
SM
r=(l_w3)=>d[Cer3]

//Sphingomyelin
[SM2] <64.50,51.82>
SM
l=(l_w3)=>r[Cer6]

//Sphingomyelin
[SM3] <100.33,26.46>
SM
u=(l_w3)=>d[Cer7]

//Sphingomyelin
[SM4] <96.47,12.13>
SM

//Sphingomyelin
[SM5] <84.35,4.97>
SM
u=(l_w3)=>u[Cer8]
//===============================================gene========================================
//serine palmitoyl transferase
[SPT] <13.23,3.86>css(background:rgb(255,200,50;border:5px solid rgb(255,100,50;z-index:5)
SPT

//3-ketodihydrosphingosine reductase
[KDSR] <12.68,9.38>css(background:rgb(255,200,50;border:5px solid rgb(255,100,50;z-index:5)
KDSR

//ceramide synthase
[CerS] <12.68,14.33>css(background:rgb(255,200,50;border:5px solid rgb(255,100,50;z-index:5)
CerS

//ceramide synthase
[CerS2] <12.68,29.22>css(background:rgb(255,200,50;border:5px solid rgb(255,100,50;z-index:5)
CerS

//dihydroceramide Δ4-desaturase
[DES] <12.68,19.84>css(background:rgb(255,200,50;border:5px solid rgb(255,100,50;z-index:5)
DES

//UDP-glucose:ceramide glucosyltransferase
[UGCG] <21.50,26.46>css(background:rgb(255,200,50;border:5px solid rgb(255,100,50;z-index:5)
UGCG

//Unknown Gene
[Ugen] <24.81,35.84>css(background:rgb(255,200,50;border:5px solid rgb(255,100,50;z-index:5)
?

//Unknown Gene
[Ugen2] <63.95,39.69>css(background:rgb(255,200,50;border:5px solid rgb(255,100,50;z-index:5)
?

//Unknown Gene
[Ugen3] <38.33,19.95>css(background:rgb(255,200,50;border:5px solid rgb(255,100,50;z-index:5)
?

//β-1,4-galactosyltransferase5 and 6
[B4GalT5] <39.38,37.80>css(background:rgb(255,200,50;border:5px solid rgb(255,100,50;z-index:5)
B4GalT5

//β-1,4-galactosyltransferase5 and 6
[B4GalT5-2] <62.84,36.38>css(background:rgb(255,200,50;border:5px solid rgb(255,100,50;z-index:5)
B4GalT5

//ST3β-galactoside α-2,3-sialyltransferase 5
[ST3GalT5] <56.23,34.18>css(background:rgb(255,200,50;border:5px solid rgb(255,100,50;z-index:5)
ST3GalT5

//Sphingomyelin synthase 1
[SMS1] <42.00,22.05>css(background:rgb(255,200,50;border:5px solid rgb(255,100,50;z-index:5)
SMS1

//Sphingomyelin synthase 2
[SMS2] <95.37,15.44>css(background:rgb(255,200,50;border:5px solid rgb(255,100,50;z-index:5)
SMS2

//neutral SMase 2
[NSMase2] <53.55,21.53>css(background:rgb(255,200,50;border:5px solid rgb(255,100,50;z-index:5)
NSMase 2

//neutral SMase 2
[NSMase1] <57.33,51.27>css(background:rgb(255,200,50;border:5px solid rgb(255,100,50;z-index:5)
NSMase 1

//four-phosphate adaptor protein 2
[FAPP2] <24.81,45.76>css(background:rgb(255,200,50;border:5px solid rgb(255,100,50;z-index:5)
transferred by FAPP2
r=(l_w3)=>d[GlcCer4]

//α-1,4-galactosyltransferase
[A4GalT] <62.30,31.97>css(background:rgb(255,200,50;border:5px solid rgb(255,100,50;z-index:5)
A4GalT

//β-1,4-N-acetylgalactosaminyltransferase 1 (GM2/GD2 synthase)
[B4GalNT1] <72.5,39>css(background:rgb(255,200,50;border:5px solid rgb(255,100,50;z-index:5)
B4GalNT1

//ceramide transfer protein
[CERT] <33.08,15.23>css(background:rgb(255,200,50;border:5px solid rgb(255,100,50;z-index:5)
transferred by CERT
d=(l_w3)=>u[Cer2]
r=(l_w3)=>l[Cer4]

//ceramidekinase
[CERK] <66.71,20.40>css(background:rgb(255,200,50;border:5px solid rgb(255,100,50;z-index:5)
CERK

//β-glucosidases 1
[GBA1] <81.59,13.23>css(background:rgb(255,200,50;border:5px solid rgb(255,100,50;z-index:5)
GBA1

//β-glucosidases 2
[GBA2] <12.68,42.45>css(background:rgb(255,200,50;border:5px solid rgb(255,100,50;z-index:5)
GBA2

//acidic SMase
[ASMase] <98.12,23.15>css(background:rgb(255,200,50;border:5px solid rgb(255,100,50;z-index:5)
ASMase

//acidic SMase
[ASMase2] <81.59,1.66>css(background:rgb(255,200,50;border:5px solid rgb(255,100,50;z-index:5)
ASMase

</nowiki>
</div>
<div id="mainTxt" style="height:800px;"> </div>

Category:LBG

2023-11-29T03:06:28Z

Editor: /* Glycerophospholipid */

{{Huge|{{Bilingual|グリセロ脂質|Glycerolipid}} }}
{{LB/Header}}
{{Hierarchy|{{PAGENAME}}}}
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|__TOC__
|}
==Class Overview==

{{Twocolumn|
Complex lipid is the major structural component of biological membranes (lipid bilayer), and is broadly classified into glycerolipid containing glycerol and sphingolipid containing sphingoid. The glycerolipid category (LBG) includes glycoglycerolipid and　phosphoglycerolipid.
|
リン酸や糖などを含む脂質は複合脂質と呼ばれ、細胞膜の脂質二重層の主要な構成要素です。複合脂質は、一般的にグリセロールを含む脂質 (グリセロ脂質) とスフィンゴイドを含む脂質 (スフィンゴ脂質) に大別されます。グリセロ脂質 (LBG) には、グリセロ糖脂質 (glycoglycerolipid) とグリセロリン脂質 (glycerophospholipid) が含まれます。
}}

={{Bilingual|略称の記載法|Common Nomenclature}}=
{{Twocolumn|
[https://lipidmaps.org LipidMaps Consortium] in the US defines the standard way of structure description (nomenclature). Please follow this standard especially when exact structure is not determined due to experimental procedures.
|
米国の[https://lipidmaps.org LipidMaps コンソーシアム]では、構造の標準的な表記法を定めています（命名系）。とりわけ分析法により構造に曖昧な部分が残る場合は、以下の表記法を踏襲してください。
}}
Reference: "Update on LIPID MAPS classification, nomenclature, and shorthand notation for MS-derived lipid structures" [https://www.jlr.org/article/S0022-2275(20)60017-7/fulltext J Lipid Res 61(12), 1539-1555, 2020]

==GlyceroLipid==

{{Twocolumn|
Glycerolipid is referred to as mono-, di-, and triglycerides depending on the number of acyl chains (fatty acids). When sugars are attached, the modification comes before the backbone name; SQ, MG, and DG indicate Sulfoquinovose, single hexose, and double hexoses, respectively.Hexose is commonly galactose, and MG and DG may refer to mono- and digalactose.
|
配位するアシル基（脂肪酸）の数により、モノ・ジ・トリアシルグリセロール（それぞれ MG, DG, TG）と呼ばれます。グリセロール骨格に糖鎖が付く場合は MG や DG の前に SQ (Sulfoquinovosyl)、MG (Monoglycosyl)、DG （Diglycosyl) をつけます。MGやDGの略称はガラクトースの意味で使われる場合もあります。
}}

{| class="wikitable" cellpadding="4"
|-
! || || Monoglycosyl (単糖） || Diglycosyl （二糖） || Sulfoquinovosyl （スルホキノボース）
|-
| MG : || Monoacylglycerol (モノアシルグリセロール) || MGMG || DGMG || SQMG
|-
| DG : || Diacylglycerol (ジアシルグリセロール) || MGDG || DGDG || SQDG
|-
| TG : || Triacylglycerol (トリアシルグリセロール)
|colspan="3" align="center"| n.a. (該当なし)
|}

==Glycerophospholipid==

{| class="wikitable"
|-
| Phosphatidic acid ホスファチジン酸 || PA, Ptd
|-
| Phosphatidylcholine ホスファチジルコリン || PC, PtdCho
|-
| Phosphatidylethanolamine ホスファチジルエタノールアミン || PE, PtdEtn
|-
| Phosphatidylglycerol ホスファチジルグリセロール || PG, PtdGro
|-
| Phosphatidylinositol ホスファチジルイノシトール || PI, PtdIns
|-
| Phosphatidylserine ホスファチジルセリン || PS, PtdSer
|-
| Cardiolipin カルジオリピン || CL, Ptd2Gro
|-
| Bis[monoacylglycero]phosphates ビス（モノアシルグリセロ）リン酸 || BMP
|-
| Phosphatidylglycerolphosphate ホスファチジルグリセロールリン酸 || PGP
|-
| Phosphatidylinositol-mannoside ホスファチジルイノシトールマンノシド || PIM
|}

Category:LBG

2023-11-29T03:05:07Z

Editor: /* Glycerophospholipid */

{{Huge|{{Bilingual|グリセロ脂質|Glycerolipid}} }}
{{LB/Header}}
{{Hierarchy|{{PAGENAME}}}}
{| style="float:right"
|__TOC__
|}
==Class Overview==

{{Twocolumn|
Complex lipid is the major structural component of biological membranes (lipid bilayer), and is broadly classified into glycerolipid containing glycerol and sphingolipid containing sphingoid. The glycerolipid category (LBG) includes glycoglycerolipid and　phosphoglycerolipid.
|
リン酸や糖などを含む脂質は複合脂質と呼ばれ、細胞膜の脂質二重層の主要な構成要素です。複合脂質は、一般的にグリセロールを含む脂質 (グリセロ脂質) とスフィンゴイドを含む脂質 (スフィンゴ脂質) に大別されます。グリセロ脂質 (LBG) には、グリセロ糖脂質 (glycoglycerolipid) とグリセロリン脂質 (glycerophospholipid) が含まれます。
}}

={{Bilingual|略称の記載法|Common Nomenclature}}=
{{Twocolumn|
[https://lipidmaps.org LipidMaps Consortium] in the US defines the standard way of structure description (nomenclature). Please follow this standard especially when exact structure is not determined due to experimental procedures.
|
米国の[https://lipidmaps.org LipidMaps コンソーシアム]では、構造の標準的な表記法を定めています（命名系）。とりわけ分析法により構造に曖昧な部分が残る場合は、以下の表記法を踏襲してください。
}}
Reference: "Update on LIPID MAPS classification, nomenclature, and shorthand notation for MS-derived lipid structures" [https://www.jlr.org/article/S0022-2275(20)60017-7/fulltext J Lipid Res 61(12), 1539-1555, 2020]

==GlyceroLipid==

{{Twocolumn|
Glycerolipid is referred to as mono-, di-, and triglycerides depending on the number of acyl chains (fatty acids). When sugars are attached, the modification comes before the backbone name; SQ, MG, and DG indicate Sulfoquinovose, single hexose, and double hexoses, respectively.Hexose is commonly galactose, and MG and DG may refer to mono- and digalactose.
|
配位するアシル基（脂肪酸）の数により、モノ・ジ・トリアシルグリセロール（それぞれ MG, DG, TG）と呼ばれます。グリセロール骨格に糖鎖が付く場合は MG や DG の前に SQ (Sulfoquinovosyl)、MG (Monoglycosyl)、DG （Diglycosyl) をつけます。MGやDGの略称はガラクトースの意味で使われる場合もあります。
}}

{| class="wikitable" cellpadding="4"
|-
! || || Monoglycosyl (単糖） || Diglycosyl （二糖） || Sulfoquinovosyl （スルホキノボース）
|-
| MG : || Monoacylglycerol (モノアシルグリセロール) || MGMG || DGMG || SQMG
|-
| DG : || Diacylglycerol (ジアシルグリセロール) || MGDG || DGDG || SQDG
|-
| TG : || Triacylglycerol (トリアシルグリセロール)
|colspan="3" align="center"| n.a. (該当なし)
|}

==Glycerophospholipid==

{| cellpadding="4"
|-
| Phosphatidic acid ホスファチジン酸 || PA, Ptd
|-
| Phosphatidylcholine ホスファチジルコリン || PC, PtdCho
|-
| Phosphatidylethanolamine ホスファチジルエタノールアミン || PE, PtdEtn
|-
| Phosphatidylglycerol ホスファチジルグリセロール || PG, PtdGro
|-
| Phosphatidylinositol ホスファチジルイノシトール || PI, PtdIns
|-
| Phosphatidylserine ホスファチジルセリン || PS, PtdSer
|-
| Cardiolipin カルジオリピン || CL, Ptd2Gro
|-
| Bis[monoacylglycero]phosphates ビス（モノアシルグリセロ）リン酸 || BMP
|-
| Phosphatidylglycerolphosphate ホスファチジルグリセロールリン酸 || PGP
|-
| Phosphatidylinositol-mannoside ホスファチジルイノシトールマンノシド || PIM
|}

JCBL:DBmeeting

2023-11-29T02:54:06Z

Editor: /* 構築委員会の歴史 */

==About LipidBank==

{{Twocolumn|
"LipidBank" is an open, publicly free database of natural lipids including fatty acids, glycerolipids, sphingolipids, steroids, and various vitamins.

The database contains more than 6000 unique molecular structures (ChemDraw cdx format, MDL MOL format), their lipid names (common name, IUPAC), spectral information (mass, UV, IR, NMR and others), and most importantly, literature information.

The database lists natural lipids only, and all molecular information is manually curated and approved by experts in lipid research (see Informant in each record).

LipidBank is the official database of the Japanese Conference on the Biochemistry of Lipids (JCBL).

 '''Reference:''' 
Watanabe K., Yasugi E. and Oshima M. "How to search the glycolipid data in LIPIDBANK for Web: the newly developed lipid database in Japan" Trend Glycosci. and Glycotechnol. 12, 175-184, 2000. ([https://www.jstage.jst.go.jp/article/tigg1989/12/65/12_65_175/_article/-char/ja/ PDF])
|
LipidBankは、脂肪酸、グリセロ脂質、スフィンゴ脂質、ステロイド、各種ビタミンを含む天然脂質の公開データベースです。 

現在6000以上の天然物構造（ChemDraw cdx形式、MDL MOL形式）について、物質名（慣用名とIUPAC）、スペクトル情報（質量、UV, IR, NMRほか）に加えて、文献情報も掲載しています。 

このデータベースは天然物を対象としており、全データについて監修者がチェックしています。LipidBankは日本脂質生化学会の公式データベースです。 
 

文献： 
渡辺清博、八杉悦子、大島美恵子「糖脂質データを日本で新しく作成された生理活性脂質データベース[LIPIDBANK for Web]で検索してみよう」Trend Glycosci. and Glycotechnol. 12, 175-184, 2000.（[https://www.jstage.jst.go.jp/article/tigg1989/12/65/12_65_175/_article/-char/ja/ PDF]）
}}

==Bylaws==
<pre>
日本脂質生化学会脂質データベース構築委員会　規約

（名称）
第1条　本会を日本脂質生化学会脂質データベース構築委員会（以下、委員会という。）と称する。
（設置）
第2条　委員会は、日本脂質生化学会が設置する。
（目的）
第3条　委員会は、脂質データベース“LipidBank”の構築・維持・更新を目的とし、脂質データの集積・更新、データベースシステムの構築・維持、
ならびにこれらに関連する業務をおこなう。
（委員会）
第4条　委員会の委員は、脂質・バイオインフォマティクスに造詣の深い日本脂質生化学会会員で構成され、日本脂質生化学会会長が任命する。
　２　委員会には委員長を置くこととし、原則として日本脂質生化学会会長が兼務するが、委員の中から任命することができる。
　３　委員会に副委員長を置くことができ、日本脂質生化学会会長が任命する。
　４　委員会に顧問を置くことができ、日本脂質生化学会会長が任命する。
　５　顧問は委員会に出席し、意見を述べることができる。
（事務局）
第5条　委員会に、会務に関する事務をおこなうために事務局を置く。事務局長は委員長が指名する。
（雑則）
第6条　この規約に定めるもののほか、必要な事項は別に定める。

附則
本規約は、総会の承認を経て変更することができる。

（平成17年10月1日制定）
（平成29年6月15日改訂）
</pre>

==History (歴史)==
{{Twocolumn|
===LIPID INFORMATION SERVICE (LIPIDBANK) (1984? - 1997)===
The project was started as a database in Japanese around 1984 with Grant-in-Aid for scientific research publication (Akira Hayashi). This database was succeeded in 1989 under the
committee of lipid information (President: Yoshitaka Nagai), organized by the members of The Japanese Conference on the Biochemistry of Lipids (JCBL). The actual construction of the database was managed by the JCBL committee of database construction (President: Akira Hayashi, Vice-president: Nobuo Ueta, Secretary: Kiyohiro Watanabe).

The database included 16 lipid classes: fatty acid, long chain aldehyde, long chain alcohol, long chain base, bile acid, glyceride, phospholipid, glycolipid, lipoprotein, lipopolysaccharide, steroid, prostanoid, ether type lipid, mycolic acid and wax.

Each record contained lipid name, biological activity, source, references, structure and spectra. About 2,700 records were collected and saved on floppy discs.
|
===脂質情報データベース (1984? - 1997)===
LipidBankの淵源は、1984年頃に獲得された科学研究費補助金（研究成果刊行費、代表者：林陽）により構築が開始された日本語のデータベース「脂質情報データベース」である。1989年に、このデータベースは日本脂質生化学会（JCBL）により構成された脂質情報作成委員会（委員長：永井克孝）が立ち上げたプロジェクトに引き継がれ、構築が本格化した。実務は脂質情報データベース構築委員会（委員長：林陽、副委員長：植田伸夫、システム構築と入力：渡邊清博）が担った。 

このデータベースは、脂質を16種類に分類して集積された（脂肪酸、長鎖アルデヒド、長鎖アルコール、長鎖塩基、胆汁酸、グリセリド、リン脂質、糖脂質、リポタンパク質、リポ多糖、ステロイド、プロスタノイド、エーテル型脂質、ミコール酸、ワックスなど）。 

各脂質の名称、生理活性、分布、文献、化学構造、スペクトルデータなどの情報が記載された。約2,700件のデータが集積され、フロッピーディスクで配布された。
}}

{{Twocolumn|
===LIPIDBANK for Web (1996 - 1999)===
The initial three-year project started as a joint research between the International Medical Center of Japan (current National Center for Global Health and Medicine) ([http://www.ncgm.go.jp/ NCGM]) and the Japan Science and Technology Corporation ([http://www.jst.go.jp/ JST]).

A new executive committee was organized (President: Shoshichi Nojima, Vice-president: Mieko Oshima, Secretary: Kiyohiro Watanabe and Etsuko Yasugi).

The committee decided to collect the data on 27 lipid classes in English. Molecules in each class were collected independently under 27 team leaders and 122 data informants.

The database became publicly available from October 1999. The database server was placed at the University of Tokyo where the office of JCBL was located. The total number of molecules was about 5400.

|
===生理活性脂質データベース (1996 - 1999)===

3年間の本プロジェクトは、国立国際医療センター（現：国立国際医療研究センター）([http://www.ncgm.go.jp/ NCGM]) と科学技術振興機構 ([http://www.jst.go.jp/ JST]) との共同研究として発足した。

新たに生理活性脂質データベース構築検討会(委員長：野島庄七、副委員長：大島美恵子、データ入力：渡邊清博、八杉悦子）が結成された。

脂質を27種類に分類して、それぞれの脂質化合物データを英語で集積した。脂質分野ごとに、各脂質を専門とする27名のデータベース構築責任者をおき、122名のデータ提供者によりデータが収載された。

1999年秋にJCBLの事務局があった東京大学にサーバーを設置し、インターネット上に公開された。5,400件の脂質化合物データが収録された。
}}

{{Twocolumn|
===Updating LIPIDBANK for Web (1999 - 2005)===
After adding one lipid class (lipid peroxides), 28 lipid classes were reorganized into 17 lipid groups.

The DERIVED LIPIDS group now includes fatty acid, long chain alcohol, long chain aldehyde, and long chain base and ceramide. The FAT-SOLUBLE VITAMIN group includes carotenoid, coenzyme Q, vitamin A, vitamin D, vitamin E, and vitamin K. The GLYCOLIPID group includes glycosphingolipid, glycoglycerolipid and others. The PHOSPHOLIPID group includes glycerophospholipid, PAF, and sphingophospholipid.

In 2004, JCBL officially established an executive committee (President: Yousuke Seyama, Secretary: Etsuko Yasugi) for updating the database.

|
===生理活性脂質データベースの維持・更新(1999 - 2005)===
新たに過酸化脂質の項目を加えて、17種類の脂質グループに分類して、28種類の脂質化合物について、データ集積をおこなった。

誘導脂質には、脂肪酸、長鎖アルコール、長鎖アルデヒド、長鎖塩基とセラミドが含まれる。脂溶性ビタミンは、カロテノイド、コエンザイムQ、ビタミンA、D、E、Kから構成されている。糖脂質にはスフィンゴ糖脂質とグリセロ糖脂質が、リン脂質にはグリセロリン脂質、PAF、スフィンゴリン脂質が含まれる。

2004年には、脂質データベース構築委員会（委員長：脊山洋右、データ入力：八杉悦子）がJCBLから公認された。
}}

{{Twocolumn|
===Renovating LIPIDBANK for Web (2006-2007)===
LIPIDBANK for Web became the official database of JCBL, to which all rights were delegated from NCGM and JST. The name of database changed to "LipidBank".

The Hopanoid group was removed and the number of category is now 16. The database system and its contents were updated and reorganized by the JCBL committee members (President: Masahiro Nishijima).

|
===生理活性脂質データベースの刷新(2006 - 2007)===
生理活性脂質データベースは2006年にNCGMとJSTから譲渡され、JCBL公認のデータベースとなった。データベースの名称を"LipidBank"と改めた。 

脂質項目のうちホパノイドを削除し、16種類の脂質グループとした。脂質データベース構築委員会（委員長：西島正弘）が、データベースのシステムと内容の維持・更新を担当。

}}

{{Twocolumn|
=== Linking with the Wiki version (2017-2022)===
With financial support from the AMED program "Studies on Specific Activities and Functions of Lipid Molecules to Develop Innovative Medical Technologies" (PS: YOKOYAMA Shinji), wiki-based database was updated for glycosphingolipid and others.

Categories in the original LipidBank were translated into static HTML pages due to security issues.
|
=== LipidBank Wiki との連携 (2017-2022)===
AMED革新的先端研究開発支援事業「画期的医薬品等の創出をめざす脂質の生理活性と機能の解明」（総括：横山信治）よりwiki版データベース構築の支援を受け、スフィンゴ糖脂質を中心に情報を整理、更新。

旧LipidBankの各カテゴリーはセキュリティ脆弱性のためにコンテンツをHTML固定ページに変換。
}}

===Contact Address===
{{Twocolumn|
If you have questions or suggestions, please contact with:

::Masanori Arita
:::arita@nig.ac.jp
::National Institute of Genetics
|
ご意見やご質問は、下記へお寄せください。
 
::有田正規
:::arita@nig.ac.jp
::国立遺伝学研究所
}}

==Members of Executive Committee of Lipid Database (脂質データベース構築委員会メンバー）==
2019年 2月 27日
<center>
{| class="wikitable"
|-
! colspan="3" style="text-align:center"| 委員長: 和泉　孝志 (Takashi Izumi)
|-
! colspan="3" style="text-align:center"| 委員
|-
| 青木淳賢 (Junken Aoki) || 有田　誠 (Makoto Arita) || 有田　正規 (Masanori Arita)
|-
| 糸乗　前 (Saki Itonori) || 今井　博之 (Hiroyuki Imai) || 笠間　健嗣 (Takeshi Kasama)
|-
| 北　芳博 (Yoshihiro Kita) || 小林　哲幸 (Tetsuyuki Kobayashi) || 酒井　祥太 (Shota Sakai)
|-
| 清水　孝雄 (Takao Shimizu) || 中村　和生 (Kazuo Nakamura) || 八杉　悦子 (Etsuko Yasugi)
|-
| 横山　和明 (Kazuaki Yokoyama) || ||
|-
! colspan="3" style="text-align:center"| Advisors
|-
| 大島　美恵子（Mieko Oshima) || 脊山　洋右（Yousuke Seyama) || 西島　正弘（Masahiro Nishijima）
|}
</center>

==Funding (資金）==
{|
|-
|colspan="2"| <big>'''1989 - 1997'''</big>
|-
|LIPID INFORMATION SERVICE was funded by a Grant-in-Aid for Scientific Research (Grant-in-Aid for Publication of Scientific Research Results) from the Japan Society for the Promotion of Science.
|LIPID INFORMATION SERVICEが日本学術振興会([http://www.jsps.go.jp/ JSPS])科学研究費に採択される。
|-
|colspan="2"| <big>'''1996 - 2002'''</big>
|-
|LIPIDBANK for Web was funded by the Database Development Program of the Japan Science and Technology Agency (JST).
|LIPIDBANK for Webが科学技術振興機構([http://www.jst.go.jp/ JST])に採択される。
|-
|colspan="2"| <big>'''2003 - 2006''', '''2009 - 2016'''</big>
|-
|LIPIDBANK for Web was funded by a Grant-in-Aid for Scientific Research (Grant-in-Aid for Publication of Scientific Research Results) from the Japan Society for the Promotion of Science.
|日本学術振興会([http://www.jsps.go.jp/ JSPS])科学研究費の研究成果公開促進費データベース事業による更新。
|-
|colspan="2"| <big>'''2017 - 2022'''</big>
|-
|LIPIDBANK was funded by AMED-CREST in "Studies on Specific Activities and Functions of Lipid Molecules to Develop Innovative Medical Technologies".
|AMED革新的先端研究開発支援事業「画期的医薬品等の創出をめざす脂質の生理活性と機能の解明」（総括：横山信治）による更新。
|}

==構築委員会の歴史==
{| class="wikitable"
|-
| 第1回 || 1997年1月8日 || 国立国際医療センター研究所 || 生理活性脂質データベース構築委員会
|-
| 第10回 || 2004年3月25日 ||学士会分館 || 脂質情報データベース推進委員会
|-
| 第20回 || 2007年3月8日 || 東京大学　医学部 || 脂質データベース構築委員会
|-
| 第30回 || 2015年5月29日 || 東京大学　薬学部 || 脂質データベース構築委員会
|-
| 第34回 || 2019年7月5日 || 北海道大学 || 脂質データベース構築委員会
|-
|colspan="4"| 2020-2022 年はCOVID-19のために中止。JCBLホームページを2010-2021年まで本サーバで維持管理してきたが、2021年より新サイト (jcbl.jp) に移行。
|-
|
|}

JCBL:DBmeeting

2023-11-29T02:53:18Z

Editor:

==About LipidBank==

{{Twocolumn|
"LipidBank" is an open, publicly free database of natural lipids including fatty acids, glycerolipids, sphingolipids, steroids, and various vitamins.

The database contains more than 6000 unique molecular structures (ChemDraw cdx format, MDL MOL format), their lipid names (common name, IUPAC), spectral information (mass, UV, IR, NMR and others), and most importantly, literature information.

The database lists natural lipids only, and all molecular information is manually curated and approved by experts in lipid research (see Informant in each record).

LipidBank is the official database of the Japanese Conference on the Biochemistry of Lipids (JCBL).

 '''Reference:''' 
Watanabe K., Yasugi E. and Oshima M. "How to search the glycolipid data in LIPIDBANK for Web: the newly developed lipid database in Japan" Trend Glycosci. and Glycotechnol. 12, 175-184, 2000. ([https://www.jstage.jst.go.jp/article/tigg1989/12/65/12_65_175/_article/-char/ja/ PDF])
|
LipidBankは、脂肪酸、グリセロ脂質、スフィンゴ脂質、ステロイド、各種ビタミンを含む天然脂質の公開データベースです。 

現在6000以上の天然物構造（ChemDraw cdx形式、MDL MOL形式）について、物質名（慣用名とIUPAC）、スペクトル情報（質量、UV, IR, NMRほか）に加えて、文献情報も掲載しています。 

このデータベースは天然物を対象としており、全データについて監修者がチェックしています。LipidBankは日本脂質生化学会の公式データベースです。 
 

文献： 
渡辺清博、八杉悦子、大島美恵子「糖脂質データを日本で新しく作成された生理活性脂質データベース[LIPIDBANK for Web]で検索してみよう」Trend Glycosci. and Glycotechnol. 12, 175-184, 2000.（[https://www.jstage.jst.go.jp/article/tigg1989/12/65/12_65_175/_article/-char/ja/ PDF]）
}}

==Bylaws==
<pre>
日本脂質生化学会脂質データベース構築委員会　規約

（名称）
第1条　本会を日本脂質生化学会脂質データベース構築委員会（以下、委員会という。）と称する。
（設置）
第2条　委員会は、日本脂質生化学会が設置する。
（目的）
第3条　委員会は、脂質データベース“LipidBank”の構築・維持・更新を目的とし、脂質データの集積・更新、データベースシステムの構築・維持、
ならびにこれらに関連する業務をおこなう。
（委員会）
第4条　委員会の委員は、脂質・バイオインフォマティクスに造詣の深い日本脂質生化学会会員で構成され、日本脂質生化学会会長が任命する。
　２　委員会には委員長を置くこととし、原則として日本脂質生化学会会長が兼務するが、委員の中から任命することができる。
　３　委員会に副委員長を置くことができ、日本脂質生化学会会長が任命する。
　４　委員会に顧問を置くことができ、日本脂質生化学会会長が任命する。
　５　顧問は委員会に出席し、意見を述べることができる。
（事務局）
第5条　委員会に、会務に関する事務をおこなうために事務局を置く。事務局長は委員長が指名する。
（雑則）
第6条　この規約に定めるもののほか、必要な事項は別に定める。

附則
本規約は、総会の承認を経て変更することができる。

（平成17年10月1日制定）
（平成29年6月15日改訂）
</pre>

==History (歴史)==
{{Twocolumn|
===LIPID INFORMATION SERVICE (LIPIDBANK) (1984? - 1997)===
The project was started as a database in Japanese around 1984 with Grant-in-Aid for scientific research publication (Akira Hayashi). This database was succeeded in 1989 under the
committee of lipid information (President: Yoshitaka Nagai), organized by the members of The Japanese Conference on the Biochemistry of Lipids (JCBL). The actual construction of the database was managed by the JCBL committee of database construction (President: Akira Hayashi, Vice-president: Nobuo Ueta, Secretary: Kiyohiro Watanabe).

The database included 16 lipid classes: fatty acid, long chain aldehyde, long chain alcohol, long chain base, bile acid, glyceride, phospholipid, glycolipid, lipoprotein, lipopolysaccharide, steroid, prostanoid, ether type lipid, mycolic acid and wax.

Each record contained lipid name, biological activity, source, references, structure and spectra. About 2,700 records were collected and saved on floppy discs.
|
===脂質情報データベース (1984? - 1997)===
LipidBankの淵源は、1984年頃に獲得された科学研究費補助金（研究成果刊行費、代表者：林陽）により構築が開始された日本語のデータベース「脂質情報データベース」である。1989年に、このデータベースは日本脂質生化学会（JCBL）により構成された脂質情報作成委員会（委員長：永井克孝）が立ち上げたプロジェクトに引き継がれ、構築が本格化した。実務は脂質情報データベース構築委員会（委員長：林陽、副委員長：植田伸夫、システム構築と入力：渡邊清博）が担った。 

このデータベースは、脂質を16種類に分類して集積された（脂肪酸、長鎖アルデヒド、長鎖アルコール、長鎖塩基、胆汁酸、グリセリド、リン脂質、糖脂質、リポタンパク質、リポ多糖、ステロイド、プロスタノイド、エーテル型脂質、ミコール酸、ワックスなど）。 

各脂質の名称、生理活性、分布、文献、化学構造、スペクトルデータなどの情報が記載された。約2,700件のデータが集積され、フロッピーディスクで配布された。
}}

{{Twocolumn|
===LIPIDBANK for Web (1996 - 1999)===
The initial three-year project started as a joint research between the International Medical Center of Japan (current National Center for Global Health and Medicine) ([http://www.ncgm.go.jp/ NCGM]) and the Japan Science and Technology Corporation ([http://www.jst.go.jp/ JST]).

A new executive committee was organized (President: Shoshichi Nojima, Vice-president: Mieko Oshima, Secretary: Kiyohiro Watanabe and Etsuko Yasugi).

The committee decided to collect the data on 27 lipid classes in English. Molecules in each class were collected independently under 27 team leaders and 122 data informants.

The database became publicly available from October 1999. The database server was placed at the University of Tokyo where the office of JCBL was located. The total number of molecules was about 5400.

|
===生理活性脂質データベース (1996 - 1999)===

3年間の本プロジェクトは、国立国際医療センター（現：国立国際医療研究センター）([http://www.ncgm.go.jp/ NCGM]) と科学技術振興機構 ([http://www.jst.go.jp/ JST]) との共同研究として発足した。

新たに生理活性脂質データベース構築検討会(委員長：野島庄七、副委員長：大島美恵子、データ入力：渡邊清博、八杉悦子）が結成された。

脂質を27種類に分類して、それぞれの脂質化合物データを英語で集積した。脂質分野ごとに、各脂質を専門とする27名のデータベース構築責任者をおき、122名のデータ提供者によりデータが収載された。

1999年秋にJCBLの事務局があった東京大学にサーバーを設置し、インターネット上に公開された。5,400件の脂質化合物データが収録された。
}}

{{Twocolumn|
===Updating LIPIDBANK for Web (1999 - 2005)===
After adding one lipid class (lipid peroxides), 28 lipid classes were reorganized into 17 lipid groups.

The DERIVED LIPIDS group now includes fatty acid, long chain alcohol, long chain aldehyde, and long chain base and ceramide. The FAT-SOLUBLE VITAMIN group includes carotenoid, coenzyme Q, vitamin A, vitamin D, vitamin E, and vitamin K. The GLYCOLIPID group includes glycosphingolipid, glycoglycerolipid and others. The PHOSPHOLIPID group includes glycerophospholipid, PAF, and sphingophospholipid.

In 2004, JCBL officially established an executive committee (President: Yousuke Seyama, Secretary: Etsuko Yasugi) for updating the database.

|
===生理活性脂質データベースの維持・更新(1999 - 2005)===
新たに過酸化脂質の項目を加えて、17種類の脂質グループに分類して、28種類の脂質化合物について、データ集積をおこなった。

誘導脂質には、脂肪酸、長鎖アルコール、長鎖アルデヒド、長鎖塩基とセラミドが含まれる。脂溶性ビタミンは、カロテノイド、コエンザイムQ、ビタミンA、D、E、Kから構成されている。糖脂質にはスフィンゴ糖脂質とグリセロ糖脂質が、リン脂質にはグリセロリン脂質、PAF、スフィンゴリン脂質が含まれる。

2004年には、脂質データベース構築委員会（委員長：脊山洋右、データ入力：八杉悦子）がJCBLから公認された。
}}

{{Twocolumn|
===Renovating LIPIDBANK for Web (2006-2007)===
LIPIDBANK for Web became the official database of JCBL, to which all rights were delegated from NCGM and JST. The name of database changed to "LipidBank".

The Hopanoid group was removed and the number of category is now 16. The database system and its contents were updated and reorganized by the JCBL committee members (President: Masahiro Nishijima).

|
===生理活性脂質データベースの刷新(2006 - 2007)===
生理活性脂質データベースは2006年にNCGMとJSTから譲渡され、JCBL公認のデータベースとなった。データベースの名称を"LipidBank"と改めた。 

脂質項目のうちホパノイドを削除し、16種類の脂質グループとした。脂質データベース構築委員会（委員長：西島正弘）が、データベースのシステムと内容の維持・更新を担当。

}}

{{Twocolumn|
=== Linking with the Wiki version (2017-2022)===
With financial support from the AMED program "Studies on Specific Activities and Functions of Lipid Molecules to Develop Innovative Medical Technologies" (PS: YOKOYAMA Shinji), wiki-based database was updated for glycosphingolipid and others.

Categories in the original LipidBank were translated into static HTML pages due to security issues.
|
=== LipidBank Wiki との連携 (2017-2022)===
AMED革新的先端研究開発支援事業「画期的医薬品等の創出をめざす脂質の生理活性と機能の解明」（総括：横山信治）よりwiki版データベース構築の支援を受け、スフィンゴ糖脂質を中心に情報を整理、更新。

旧LipidBankの各カテゴリーはセキュリティ脆弱性のためにコンテンツをHTML固定ページに変換。
}}

===Contact Address===
{{Twocolumn|
If you have questions or suggestions, please contact with:

::Masanori Arita
:::arita@nig.ac.jp
::National Institute of Genetics
|
ご意見やご質問は、下記へお寄せください。
 
::有田正規
:::arita@nig.ac.jp
::国立遺伝学研究所
}}

==Members of Executive Committee of Lipid Database (脂質データベース構築委員会メンバー）==
2019年 2月 27日
<center>
{| class="wikitable"
|-
! colspan="3" style="text-align:center"| 委員長: 和泉　孝志 (Takashi Izumi)
|-
! colspan="3" style="text-align:center"| 委員
|-
| 青木淳賢 (Junken Aoki) || 有田　誠 (Makoto Arita) || 有田　正規 (Masanori Arita)
|-
| 糸乗　前 (Saki Itonori) || 今井　博之 (Hiroyuki Imai) || 笠間　健嗣 (Takeshi Kasama)
|-
| 北　芳博 (Yoshihiro Kita) || 小林　哲幸 (Tetsuyuki Kobayashi) || 酒井　祥太 (Shota Sakai)
|-
| 清水　孝雄 (Takao Shimizu) || 中村　和生 (Kazuo Nakamura) || 八杉　悦子 (Etsuko Yasugi)
|-
| 横山　和明 (Kazuaki Yokoyama) || ||
|-
! colspan="3" style="text-align:center"| Advisors
|-
| 大島　美恵子（Mieko Oshima) || 脊山　洋右（Yousuke Seyama) || 西島　正弘（Masahiro Nishijima）
|}
</center>

==Funding (資金）==
{|
|-
|colspan="2"| <big>'''1989 - 1997'''</big>
|-
|LIPID INFORMATION SERVICE was funded by a Grant-in-Aid for Scientific Research (Grant-in-Aid for Publication of Scientific Research Results) from the Japan Society for the Promotion of Science.
|LIPID INFORMATION SERVICEが日本学術振興会([http://www.jsps.go.jp/ JSPS])科学研究費に採択される。
|-
|colspan="2"| <big>'''1996 - 2002'''</big>
|-
|LIPIDBANK for Web was funded by the Database Development Program of the Japan Science and Technology Agency (JST).
|LIPIDBANK for Webが科学技術振興機構([http://www.jst.go.jp/ JST])に採択される。
|-
|colspan="2"| <big>'''2003 - 2006''', '''2009 - 2016'''</big>
|-
|LIPIDBANK for Web was funded by a Grant-in-Aid for Scientific Research (Grant-in-Aid for Publication of Scientific Research Results) from the Japan Society for the Promotion of Science.
|日本学術振興会([http://www.jsps.go.jp/ JSPS])科学研究費の研究成果公開促進費データベース事業による更新。
|-
|colspan="2"| <big>'''2017 - 2022'''</big>
|-
|LIPIDBANK was funded by AMED-CREST in "Studies on Specific Activities and Functions of Lipid Molecules to Develop Innovative Medical Technologies".
|AMED革新的先端研究開発支援事業「画期的医薬品等の創出をめざす脂質の生理活性と機能の解明」（総括：横山信治）による更新。
|}

==構築委員会の歴史==
{| class="wikitable"
|-
| 第1回 || 1997年1月8日 || 国立国際医療センター研究所 || 生理活性脂質データベース構築委員会
|-
| 第10回 || 2004年3月25日 ||学士会分館 || 脂質情報データベース推進委員会
|-
| 第20回 || 2007年3月8日 || 東京大学　医学部 || 脂質データベース構築委員会
|-
| 第30回 || 2015年5月29日 || 東京大学　薬学部 || 脂質データベース構築委員会
|-
| 第34回 || 2019年7月5日 || 北海道大学 || 脂質データベース構築委員会
|-
| 2020-2022 年はCOVID-19のために中止。JCBLホームページを2010-2021年まで本サーバで維持管理してきたが、2021年より新サイト (jcbl.jp) に移行。
|-
|
|}

Category:LB

2023-11-29T01:49:49Z

Editor:

{{Huge|LipidBank Database}}
{{LB/Header}}
{{Twocolumn|
LipidBank Database is an official data resource of [https://web.jcbl.jp/ JCBL] (Japanese Conference of Biochemistry of Lipids).
Database contents are curated by [[JCBL:DBmeeting|a committee under JCBL]]. For citing this resource, please use the following information.
|
LipidBankデータベースは [https://web.jcbl.jp/ 日本脂質生化学会] の公式データベースです。内容はJCBLの[[JCBL:DBmeeting|構築委員会]]によって管理されています。
引用される場合は以下の文献を利用してください。
}}
; References
* Yasugi E, Watanabe K "LIPIDBANK for Web, the newly developed lipid database" Tanpakushitsu Kakusan Koso. 47(7), 837-841, 2002 (in Japanese; 日本語)
* Watanabe K., Yasugi E. and Oshima M. "How to search the glycolipid data in LIPIDBANK for Web: the newly developed lipid database" Japan Trend Glycosci. and Glycotechnol. 12, 175-184, 2000
* [[JCBL:DBmeeting|LipidBank History & Committee page]]

; Related projects
* [https://lipidbank.jp/ Original LipidBank Database]
* [[Lipoquality:Database|LipoQuality Database]]

<center>
{| class="wikitable"
|-
! colspan="3" | LipidBank Class Overview
|-
| align="left" style="vertical-align:top" width=33%|
[[:Category:LBF|LBF: Fatty acyls 脂肪酸アシル]]
 [[Image:LBF.png|100px]] 

;Links to the original LipidBank
:[https://lipidbank.jp/DFA.html fatty acids]
:[https://lipidbank.jp/DLL.html long-chain alcohol]
:[https://lipidbank.jp/DLD.html long-chain aldehyde]
:[https://lipidbank.jp/XPR.html eicosanoids]
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:[https://lipidbank.jp/WWA.html wax]
:[https://lipidbank.jp/MMA.html mycolic acid]

| align="left" style="vertical-align:top" width=33%|
[[:Category:LBG|LBG: Glycerolipids グリセロ脂質]]
 [[Image:LBG.png|100px]] 

;Links to the original LipidBank
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:[https://lipidbank.jp/PGP.html glycerophospholipid]
:[https://lipidbank.jp/EEA.html ether-type lipid]
:[https://lipidbank.jp/GGG.html glycoglycerolipid]
* [[:Category:LBGA|LBGA: Archaeal Lipid (Ether-type) 古細菌の脂質]]

| align="left" style="vertical-align:top" width=33%|
[[:Category:LBS|LBS: Sphingolipids スフィンゴ脂質]] (new)
 [[Image:LBS.png|110px]] 

* [[:Category:LBSB|LBSB: long-chain base and ceramide]]
* [[:Category:LBSC|LBSC: cerebroside]]
* [[:Category:LBSG|LBSG: acidic glycosphingolipid]]
* [[:Category:LBSP|LBSP: phospho-sphingolipid]]

|-
| style="vertical-align:top"| Sterol Lipids
 [[File:Cholestane.png]] 
;Links to the original LipidBank
:[https://lipidbank.jp/SST.html steroid]
:[https://lipidbank.jp/BBA.html bile acid]
:[https://lipidbank.jp/VVD.html vitamin D]

| style="vertical-align:top"| Prenol Lipids
 <BIG>(</BIG> [[File:Isoprene.png]]<BIG>)</BIG>n 
;Links to the original LipidBank
:[https://lipidbank.jp/IIP.html isoprenoid]
:[https://lipidbank.jp/VCA.html carotenoid]
:[https://lipidbank.jp/VVA.html vitamin A]
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| style="vertical-align:top"| Others

;Links to the original LipidBank
:[https://lipidbank.jp/CLS.html lipopolysaccharide]
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:[https://lipidbank.jp/TLP.html lipoprotein]
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|}
</center>

{{Twocolumn|
Biogenic substances insoluble to water are collectively called as '''lipid'''. Lipid is generally classified into the following three types.
* '''Simple lipid''' ... fatty acid esters of alchohol such as glycerol and sphingoid base.
* '''Complex lipid''' ... glycosylated or phosphorylated version of the simple lipid.
* '''Derived lipid''' ... alcohols and fatty acids derived by hydrolyzing the simple lipid. Also includes sterols and polyketides.
|
水に溶けない生体成分を一般に脂質と呼び、以下の3つに分けられます。
* '''単純脂質''' ... アルコールと脂肪酸のエステルで、スフィンゴ骨格とグリセロ骨格のものに大別されます。
* '''複合脂質''' ... 単純脂質にリン酸や糖がついたものです。
* '''誘導脂質''' ... 単純脂質を分解して得られるアルコール、脂肪酸。ステロールやポリケチドもここに含めます。
}}

Category:LB

2023-11-29T00:28:10Z

Editor:

{{Huge|LipidBank Database}}
{{LB/Header}}

{{Twocolumn|
LipidBank Database is an official data resource of [https://web.jcbl.jp/ JCBL] (Japanese Conference of Biochemistry of Lipids).
Database contents are curated by a committee under JCBL. For citing this resource, please use the following articles.
|
LipidBankデータベースは [https://web.jcbl.jp/ 日本脂質生化学会] の公式データベースです。内容はJCBLの構築委員会によって管理されています。
引用される場合は以下の文献を明記してください。
}}
; LipidBank References
* Yasugi E, Watanabe K "LIPIDBANK for Web, the newly developed lipid database" Tanpakushitsu Kakusan Koso. 47(7), 837-841, 2002
* Watanabe K., Yasugi E. and Oshima M. "How to search the glycolipid data in LIPIDBANK for Web: the newly developed lipid database" Japan Trend Glycosci. and Glycotechnol. 12, 175-184, 2000

; Related projects
* [https://lipidbank.jp/ Original LipidBank Database]
* [[Lipoquality:Database|LipoQuality Database]]

<center>
{| class="wikitable"
|-
! colspan="3" | LipidBank Class Overview
|-
| align="left" style="vertical-align:top" width=33%|
[[:Category:LBF|LBF: Fatty acyls 脂肪酸アシル]]
 [[Image:LBF.png|100px]] 

;Links to the original LipidBank
:[https://lipidbank.jp/DFA.html fatty acids]
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[[:Category:LBG|LBG: Glycerolipids グリセロ脂質]]
 [[Image:LBG.png|100px]] 

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|-
| style="vertical-align:top"| Sterol Lipids
 [[File:Cholestane.png]] 
;Links to the original LipidBank
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| style="vertical-align:top"| Prenol Lipids
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;Links to the original LipidBank
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;Links to the original LipidBank
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|}
</center>

{{Twocolumn|
Biogenic substances insoluble to water are collectively called as '''lipid'''. Lipid is generally classified into the following three types.
* '''Simple lipid''' ... fatty acid esters of alchohol such as glycerol and sphingoid base.
* '''Complex lipid''' ... glycosylated or phosphorylated version of the simple lipid.
* '''Derived lipid''' ... alcohols and fatty acids derived by hydrolyzing the simple lipid. Also includes sterols and polyketides.
|
水に溶けない生体成分を一般に脂質と呼び、以下の3つに分けられます。
* '''単純脂質''' ... アルコールと脂肪酸のエステルで、スフィンゴ骨格とグリセロ骨格のものに大別されます。
* '''複合脂質''' ... 単純脂質にリン酸や糖がついたものです。
* '''誘導脂質''' ... 単純脂質を分解して得られるアルコール、脂肪酸。ステロールやポリケチドもここに含めます。
}}

Category:LB

2023-11-29T00:16:21Z

Editor:

{{Huge|LipidBank Database}}
{{LB/Header}}

; Related projects
* [https://lipidbank.jp/ Original LipidBank Database]
* [[Lipoquality:Database|LipoQuality Database]]

<center>
{| class="wikitable"
|-
! colspan="3" | LipidBank Class Overview
|-
| align="left" style="vertical-align:top" width=33%|
[[:Category:LBF|LBF: Fatty acyls 脂肪酸アシル]]
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;Links to the original LipidBank
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;Links to the original LipidBank
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| style="vertical-align:top"| Others

;Links to the original LipidBank
:[https://lipidbank.jp/CLS.html lipopolysaccharide]
:[https://lipidbank.jp/ALA.html lipoamino acid]
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|}
</center>

{{Twocolumn|
Biogenic substances insoluble to water are collectively called as '''lipid'''. Lipid is generally classified into the following three types.
* '''Simple lipid''' ... fatty acid esters of alchohol such as glycerol and sphingoid base.
* '''Complex lipid''' ... glycosylated or phosphorylated version of the simple lipid.
* '''Derived lipid''' ... alcohols and fatty acids derived by hydrolyzing the simple lipid. Also includes sterols and polyketides.
|
水に溶けない生体成分を一般に脂質と呼び、以下の3つに分けられます。
* '''単純脂質''' ... アルコールと脂肪酸のエステルで、スフィンゴ骨格とグリセロ骨格のものに大別されます。
* '''複合脂質''' ... 単純脂質にリン酸や糖がついたものです。
* '''誘導脂質''' ... 単純脂質を分解して得られるアルコール、脂肪酸。ステロールやポリケチドもここに含めます。
}}

Lipoquality:Database

2023-11-29T00:14:21Z

Editor:

; Homo sapiens : NIST plasma (SRM 1950)
; <nowiki>Mus musculus (background: C57BL/6J; diet: CE2, chows of PUFA-dietary controled studies)</nowiki> : Adrenal gland, Atrium, Brain, Brown adipose tissue, Cerebellum, Cortex, Epididymis, Eye, Feces, Heart, Kidney, Large intestine, Liver, Lung, Macrophage, Medulla, Pancreas, Plasma, Seminal, Skeletal muscle, Skin, Small intestine, Spleen, Stomach, Testis, Thymus, Tongue, Ventricle, White adipose tissue
; Human cultured cell : HEK293, HeLa, Jurkat, LNCaP, PC3, TPC-1
; Mouse cultured cell : 3T3-L1, C2C12
; Plant : Arabidopsis thaliana, Oryza sativa, Solanum melongena
; Algae : Auxenochlorella protothecoides, Chlamydomonas reinhardtii, Chlorella sorokiniana, Chlorella variabilis, Dunaliella salina, Euglena gracilis, Nannochloropsis oculata, Pavlova lutheri, Pleurochrysis carterae
; Measurement : See [http://metabolonote.kazusa.or.jp/Main_Page Metabolonote] (see [http://metabolonote.kazusa.or.jp/SE196:/ SE196], [http://metabolonote.kazusa.or.jp/SE197:/ SE197]) database.

<h1>Data download</h1>

[http://jcbl.jp//lipodata/download/AllData_20200206.zip AllData_20200206.zip] Feb 6, 2020 (22M)

<h1>{{Bilingual|脂質記載法|Notation}}</h1>

The style follows the proposal for lipidomics nomenclature
(Liebisch G et al. J Lipid Res 2013. PMID 23549332). Please visit [http://prime.psc.riken.jp/Metabolomics_Software/MS-DIAL/index5.html the MS-DIAL page] for more details.

{|
|valign="top"|
; Phosphoglycerolipid symbols
{| class="wikitable"
! Name
! Notation
|-
| Phosphatidic acid
| PA
|-
| R2-lyso-PA
| LPA
|-
| Phosphatidyl-choline
| PC
|-
| R2-lyso-PC
| LPC
|-
| R1-ether-PC
| EtherPC
|-
| Phosphatidyl-ethanolamine
| PE
|-
| R2-lyso-PE
| LPE
|-
| R1-ether-PE
| EtherPE
|-
| Phosphatidyl-inositol
| PI
|-
| R2-lyso-PI
| LPI
|-
| Phosphatidyl-serine
| PS
|-
| R2-lyso-PS
| LPS
|-
| Phosphatidyl-glycerol
| PG
|-
| R2-lyso-PG
| LPG
|-
| Bis(monoacylglycero)phosphate
| BMP
|-
| 1-Monoacylglycerol-phospho-2,3-diacylglycerol
| HBMP
|-
| Cardiolipin
| CL
|}
|valign="top"|
;Glycerolipid, Plant lipid, and other symbols
{| class="wikitable"
! Name
! Notation
|-
| Triacylglycerol
| TG
|-
| Diacylglycerol
| DG
|-
| Monoacylglycerol
| MG
|-
| Monogalactosyl-diacylglycerol
| MGDG
|-
| Digalactosyl-diacylglycerol
| DGDG
|-
| Sulfoquinovosyl-diacylglycerol
| SQDG
|-
| Diacylglyceryl-trimethylhomoserine
| DGTS
|-
| Glucuronosyl-diacylglycerol
| DGGA
|-
| Fatty acid
| FA
|-
| Fatty acid ester of hydroxyl fatty acid
| FAHFA
|-
| Acylcarnitine
| CAR
|-
| Sphingomyelin
| SM
|}
|}

; Ceramide symbols<ref>Masukawa Y et al. "Characterization of overall ceramide species in human stratum corneums" J Lipid Res 49:1466-1476, 2008</ref>
{| class="wikitable"
!
! ''non-hydroxy FA'' [N]
! ''α-hydroxy FA'' [A]
! ''β-hydroxy FA'' [B]
! ''esterified ω-hydroxy FA'' [EO]
|-
! ''dihydrosphingosine'' [DS]
| Cer-NDS
| Cer-ADS
| Cer-BDS
| Cer-EODS
|-
! ''sphingosine'' [S]
| Cer-NS
| Cer-AS
| Cer-BS
| Cer-EOS
|-
! ''phytosphingosine'' [P]
| Cer-NP
| Cer-AP
| Cer-BP
| Cer-EOP
|-
! ''6-hydroxy sphingosine'' [H]
| Cer-NH
| Cer-AH
| Cer-BH
| Cer-EOH
|}

<references/>

Lipoquality:Database

2023-11-29T00:13:08Z

Editor:

<h1>Lipidomics data resource</h1>

; Homo sapiens : NIST plasma (SRM 1950)
; <nowiki>Mus musculus (background: C57BL/6J; diet: CE2, chows of PUFA-dietary controled studies)</nowiki> : Adrenal gland, Atrium, Brain, Brown adipose tissue, Cerebellum, Cortex, Epididymis, Eye, Feces, Heart, Kidney, Large intestine, Liver, Lung, Macrophage, Medulla, Pancreas, Plasma, Seminal, Skeletal muscle, Skin, Small intestine, Spleen, Stomach, Testis, Thymus, Tongue, Ventricle, White adipose tissue
; Human cultured cell : HEK293, HeLa, Jurkat, LNCaP, PC3, TPC-1
; Mouse cultured cell : 3T3-L1, C2C12
; Plant : Arabidopsis thaliana, Oryza sativa, Solanum melongena
; Algae : Auxenochlorella protothecoides, Chlamydomonas reinhardtii, Chlorella sorokiniana, Chlorella variabilis, Dunaliella salina, Euglena gracilis, Nannochloropsis oculata, Pavlova lutheri, Pleurochrysis carterae
; Measurement : See [http://metabolonote.kazusa.or.jp/Main_Page Metabolonote] (see [http://metabolonote.kazusa.or.jp/SE196:/ SE196], [http://metabolonote.kazusa.or.jp/SE197:/ SE197]) database.

<h1>Data download</h1>

[http://jcbl.jp//lipodata/download/AllData_20200206.zip AllData_20200206.zip] Feb 6, 2020 (22M)

<h1>{{Bilingual|脂質記載法|Notation}}</h1>

The style follows the proposal for lipidomics nomenclature
(Liebisch G et al. J Lipid Res 2013. PMID 23549332). Please visit [http://prime.psc.riken.jp/Metabolomics_Software/MS-DIAL/index5.html the MS-DIAL page] for more details.

{|
|valign="top"|
; Phosphoglycerolipid symbols
{| class="wikitable"
! Name
! Notation
|-
| Phosphatidic acid
| PA
|-
| R2-lyso-PA
| LPA
|-
| Phosphatidyl-choline
| PC
|-
| R2-lyso-PC
| LPC
|-
| R1-ether-PC
| EtherPC
|-
| Phosphatidyl-ethanolamine
| PE
|-
| R2-lyso-PE
| LPE
|-
| R1-ether-PE
| EtherPE
|-
| Phosphatidyl-inositol
| PI
|-
| R2-lyso-PI
| LPI
|-
| Phosphatidyl-serine
| PS
|-
| R2-lyso-PS
| LPS
|-
| Phosphatidyl-glycerol
| PG
|-
| R2-lyso-PG
| LPG
|-
| Bis(monoacylglycero)phosphate
| BMP
|-
| 1-Monoacylglycerol-phospho-2,3-diacylglycerol
| HBMP
|-
| Cardiolipin
| CL
|}
|valign="top"|
;Glycerolipid, Plant lipid, and other symbols
{| class="wikitable"
! Name
! Notation
|-
| Triacylglycerol
| TG
|-
| Diacylglycerol
| DG
|-
| Monoacylglycerol
| MG
|-
| Monogalactosyl-diacylglycerol
| MGDG
|-
| Digalactosyl-diacylglycerol
| DGDG
|-
| Sulfoquinovosyl-diacylglycerol
| SQDG
|-
| Diacylglyceryl-trimethylhomoserine
| DGTS
|-
| Glucuronosyl-diacylglycerol
| DGGA
|-
| Fatty acid
| FA
|-
| Fatty acid ester of hydroxyl fatty acid
| FAHFA
|-
| Acylcarnitine
| CAR
|-
| Sphingomyelin
| SM
|}
|}

; Ceramide symbols<ref>Masukawa Y et al. "Characterization of overall ceramide species in human stratum corneums" J Lipid Res 49:1466-1476, 2008</ref>
{| class="wikitable"
!
! ''non-hydroxy FA'' [N]
! ''α-hydroxy FA'' [A]
! ''β-hydroxy FA'' [B]
! ''esterified ω-hydroxy FA'' [EO]
|-
! ''dihydrosphingosine'' [DS]
| Cer-NDS
| Cer-ADS
| Cer-BDS
| Cer-EODS
|-
! ''sphingosine'' [S]
| Cer-NS
| Cer-AS
| Cer-BS
| Cer-EOS
|-
! ''phytosphingosine'' [P]
| Cer-NP
| Cer-AP
| Cer-BP
| Cer-EOP
|-
! ''6-hydroxy sphingosine'' [H]
| Cer-NH
| Cer-AH
| Cer-BH
| Cer-EOH
|}

<references/>

Category:LBG

2023-11-27T23:39:48Z

Editor: /* Glycerophospholipid */

{{Huge|{{Bilingual|グリセロ脂質|Glycerolipid}} }}
{{LB/Header}}
{{Hierarchy|{{PAGENAME}}}}
{| style="float:right"
|__TOC__
|}
==Class Overview==

{{Twocolumn|
Complex lipid is the major structural component of biological membranes (lipid bilayer), and is broadly classified into glycerolipid containing glycerol and sphingolipid containing sphingoid. The glycerolipid category (LBG) includes glycoglycerolipid and　phosphoglycerolipid.
|
リン酸や糖などを含む脂質は複合脂質と呼ばれ、細胞膜の脂質二重層の主要な構成要素です。複合脂質は、一般的にグリセロールを含む脂質 (グリセロ脂質) とスフィンゴイドを含む脂質 (スフィンゴ脂質) に大別されます。グリセロ脂質 (LBG) には、グリセロ糖脂質 (glycoglycerolipid) とグリセロリン脂質 (glycerophospholipid) が含まれます。
}}

={{Bilingual|略称の記載法|Common Nomenclature}}=
{{Twocolumn|
[https://lipidmaps.org LipidMaps Consortium] in the US defines the standard way of structure description (nomenclature). Please follow this standard especially when exact structure is not determined due to experimental procedures.
|
米国の[https://lipidmaps.org LipidMaps コンソーシアム]では、構造の標準的な表記法を定めています（命名系）。とりわけ分析法により構造に曖昧な部分が残る場合は、以下の表記法を踏襲してください。
}}
Reference: "Update on LIPID MAPS classification, nomenclature, and shorthand notation for MS-derived lipid structures" [https://www.jlr.org/article/S0022-2275(20)60017-7/fulltext J Lipid Res 61(12), 1539-1555, 2020]

==GlyceroLipid==

{{Twocolumn|
Glycerolipid is referred to as mono-, di-, and triglycerides depending on the number of acyl chains (fatty acids). When sugars are attached, the modification comes before the backbone name; SQ, MG, and DG indicate Sulfoquinovose, single hexose, and double hexoses, respectively.Hexose is commonly galactose, and MG and DG may refer to mono- and digalactose.
|
配位するアシル基（脂肪酸）の数により、モノ・ジ・トリアシルグリセロール（それぞれ MG, DG, TG）と呼ばれます。グリセロール骨格に糖鎖が付く場合は MG や DG の前に SQ (Sulfoquinovosyl)、MG (Monoglycosyl)、DG （Diglycosyl) をつけます。MGやDGの略称はガラクトースの意味で使われる場合もあります。
}}

{| class="wikitable" cellpadding="4"
|-
! || || Monoglycosyl (単糖） || Diglycosyl （二糖） || Sulfoquinovosyl （スルホキノボース）
|-
| MG : || Monoacylglycerol (モノアシルグリセロール) || MGMG || DGMG || SQMG
|-
| DG : || Diacylglycerol (ジアシルグリセロール) || MGDG || DGDG || SQDG
|-
| TG : || Triacylglycerol (トリアシルグリセロール)
|colspan="3" align="center"| n.a. (該当なし)
|}

==Glycerophospholipid==

{| cellpadding="4"
|-
| PA, Ptd: || Phosphatidic acid || ホスファチジン酸
|-
| PC, PtdCho: || Phosphatidylcholine || ホスファチジルコリン
|-
| PE, PtdEtn: || Phosphatidylethanolamine || ホスファチジルエタノールアミン
|-
| PG, PtdGro: || Phosphatidylglycerol || ホスファチジルグリセロール
|-
| PI, PtdIns: || Phosphatidylinositol || ホスファチジルイノシトール
|-
| PS, PtdSer: || Phosphatidylserine || ホスファチジルセリン
|-
| CL, Ptd2Gro: || Cardiolipin || カルジオリピン
|}

Category:LBG

2023-11-27T23:39:16Z

Editor: /* GlyceroLipid */

{{Huge|{{Bilingual|グリセロ脂質|Glycerolipid}} }}
{{LB/Header}}
{{Hierarchy|{{PAGENAME}}}}
{| style="float:right"
|__TOC__
|}
==Class Overview==

{{Twocolumn|
Complex lipid is the major structural component of biological membranes (lipid bilayer), and is broadly classified into glycerolipid containing glycerol and sphingolipid containing sphingoid. The glycerolipid category (LBG) includes glycoglycerolipid and　phosphoglycerolipid.
|
リン酸や糖などを含む脂質は複合脂質と呼ばれ、細胞膜の脂質二重層の主要な構成要素です。複合脂質は、一般的にグリセロールを含む脂質 (グリセロ脂質) とスフィンゴイドを含む脂質 (スフィンゴ脂質) に大別されます。グリセロ脂質 (LBG) には、グリセロ糖脂質 (glycoglycerolipid) とグリセロリン脂質 (glycerophospholipid) が含まれます。
}}

={{Bilingual|略称の記載法|Common Nomenclature}}=
{{Twocolumn|
[https://lipidmaps.org LipidMaps Consortium] in the US defines the standard way of structure description (nomenclature). Please follow this standard especially when exact structure is not determined due to experimental procedures.
|
米国の[https://lipidmaps.org LipidMaps コンソーシアム]では、構造の標準的な表記法を定めています（命名系）。とりわけ分析法により構造に曖昧な部分が残る場合は、以下の表記法を踏襲してください。
}}
Reference: "Update on LIPID MAPS classification, nomenclature, and shorthand notation for MS-derived lipid structures" [https://www.jlr.org/article/S0022-2275(20)60017-7/fulltext J Lipid Res 61(12), 1539-1555, 2020]

==GlyceroLipid==

{{Twocolumn|
Glycerolipid is referred to as mono-, di-, and triglycerides depending on the number of acyl chains (fatty acids). When sugars are attached, the modification comes before the backbone name; SQ, MG, and DG indicate Sulfoquinovose, single hexose, and double hexoses, respectively.Hexose is commonly galactose, and MG and DG may refer to mono- and digalactose.
|
配位するアシル基（脂肪酸）の数により、モノ・ジ・トリアシルグリセロール（それぞれ MG, DG, TG）と呼ばれます。グリセロール骨格に糖鎖が付く場合は MG や DG の前に SQ (Sulfoquinovosyl)、MG (Monoglycosyl)、DG （Diglycosyl) をつけます。MGやDGの略称はガラクトースの意味で使われる場合もあります。
}}

{| class="wikitable" cellpadding="4"
|-
! || || Monoglycosyl (単糖） || Diglycosyl （二糖） || Sulfoquinovosyl （スルホキノボース）
|-
| MG : || Monoacylglycerol (モノアシルグリセロール) || MGMG || DGMG || SQMG
|-
| DG : || Diacylglycerol (ジアシルグリセロール) || MGDG || DGDG || SQDG
|-
| TG : || Triacylglycerol (トリアシルグリセロール)
|colspan="3" align="center"| n.a. (該当なし)
|}

==Glycerophospholipid==

{| cellpadding="4"
|-
| PA, Ptd: || Phosphatidic acid || ホスファチジン酸
|-
| PC, PtdCho: || Phosphatidylcholine || ホスファチジルコリン
|-
| PE, PtdEtn: || Phosphatidylethanolamine || ホスファチジルエタノールアミン
|-
| PG, PtdGro: || Phosphatidylglycerol || ホスファチジルグリセロール
|-
| PI, PtdIns: || Phosphatidylinositol || ホスファチジルイノシトール
|-
| PS, PtdSer: || Phosphatidylserine || ホスファチジルセリン
|-
| CL, Ptd2Gro: || Cardiolipin || カルジオリピン

}}

Category:LBG

2023-11-27T23:36:13Z

Editor:

{{Huge|{{Bilingual|グリセロ脂質|Glycerolipid}} }}
{{LB/Header}}
{{Hierarchy|{{PAGENAME}}}}
{| style="float:right"
|__TOC__
|}
==Class Overview==

{{Twocolumn|
Complex lipid is the major structural component of biological membranes (lipid bilayer), and is broadly classified into glycerolipid containing glycerol and sphingolipid containing sphingoid. The glycerolipid category (LBG) includes glycoglycerolipid and　phosphoglycerolipid.
|
リン酸や糖などを含む脂質は複合脂質と呼ばれ、細胞膜の脂質二重層の主要な構成要素です。複合脂質は、一般的にグリセロールを含む脂質 (グリセロ脂質) とスフィンゴイドを含む脂質 (スフィンゴ脂質) に大別されます。グリセロ脂質 (LBG) には、グリセロ糖脂質 (glycoglycerolipid) とグリセロリン脂質 (glycerophospholipid) が含まれます。
}}

={{Bilingual|略称の記載法|Common Nomenclature}}=
{{Twocolumn|
[https://lipidmaps.org LipidMaps Consortium] in the US defines the standard way of structure description (nomenclature). Please follow this standard especially when exact structure is not determined due to experimental procedures.
|
米国の[https://lipidmaps.org LipidMaps コンソーシアム]では、構造の標準的な表記法を定めています（命名系）。とりわけ分析法により構造に曖昧な部分が残る場合は、以下の表記法を踏襲してください。
}}
Reference: "Update on LIPID MAPS classification, nomenclature, and shorthand notation for MS-derived lipid structures" [https://www.jlr.org/article/S0022-2275(20)60017-7/fulltext J Lipid Res 61(12), 1539-1555, 2020]

==GlyceroLipid==

{{Twocolumn|
Glycerolipid is referred to as mono-, di-, and triglycerides depending on the number of acyl chains (fatty acids). When sugars are attached, the modification comes before the backbone name; SQ, MG, and DG indicate Sulfoquinovose, single hexose, and double hexoses, respectively.Hexose is commonly galactose, and MG and DG may refer to mono- and digalactose.
|
配位するアシル基（脂肪酸）の数により、モノ・ジ・トリアシルグリセロール（それぞれ MG, DG, TG）と呼ばれます。グリセロール骨格に糖鎖が付く場合は MG や DG の前に SQ (Sulfoquinovosyl)、MG (Monoglycosyl)、DG （Diglycosyl) をつけます。MGやDGの略称はガラクトースの意味で使われる場合もあります。
}}

{| class="wikitable" cellpadding="4"
|-
! || || Monoglycosyl (単糖） || Diglycosyl （二糖） || Sulfoquinovosyl （スルホキノボース）
|-
| MG : || Monoacylglycerol (モノアシルグリセロール) || MGMG || DGMG || SQMG
|-
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|-
| TG : || Triacylglycerol (トリアシルグリセロール) || || ||
|}

==Glycerophospholipid==

{| cellpadding="4"
|-
| PA, Ptd: || Phosphatidic acid || ホスファチジン酸
|-
| PC, PtdCho: || Phosphatidylcholine || ホスファチジルコリン
|-
| PE, PtdEtn: || Phosphatidylethanolamine || ホスファチジルエタノールアミン
|-
| PG, PtdGro: || Phosphatidylglycerol || ホスファチジルグリセロール
|-
| PI, PtdIns: || Phosphatidylinositol || ホスファチジルイノシトール
|-
| PS, PtdSer: || Phosphatidylserine || ホスファチジルセリン
|-
| CL, Ptd2Gro: || Cardiolipin || カルジオリピン

}}

Category:LB

2023-11-27T06:29:42Z

Editor:

{{Huge|LipidBank}}
{{LB/Header}}
==Class Overview==

{{Twocolumn|
Biogenic substances insoluble to water are collectively called as '''lipid'''. Lipid is generally classified into the following three types.
* '''Simple lipid''' ... fatty acid esters of alchohol such as glycerol and sphingoid base.
* '''Complex lipid''' ... glycosylated or phosphorylated version of the simple lipid.
* '''Derived lipid''' ... alcohols and fatty acids derived by hydrolyzing the simple lipid. Also includes sterols and polyketides.
|
水に溶けない生体成分を一般に脂質と呼び、以下の3つに分けられます。
* '''単純脂質''' ... アルコールと脂肪酸のエステルで、スフィンゴ骨格とグリセロ骨格のものに大別されます。
* '''複合脂質''' ... 単純脂質にリン酸や糖がついたものです。
* '''誘導脂質''' ... 単純脂質を分解して得られるアルコール、脂肪酸。ステロールやポリケチドもここに含めます。
}}

<center>
{| class="wikitable"
|-
! colspan="3" | Lipid Overview
|-
| align="left" style="vertical-align:top" width=33%|
[[:Category:LBF|LBF: Fatty acyls 脂肪酸アシル]]
 [[Image:LBF.png|100px]] 

;Links to the original LipidBank
:[https://lipidbank.jp/DFA.html fatty acids]
:[https://lipidbank.jp/DLL.html long-chain alcohol]
:[https://lipidbank.jp/DLD.html long-chain aldehyde]
:[https://lipidbank.jp/XPR.html eicosanoids]
:[https://lipidbank.jp/OPO.html lipid peroxide]
:[https://lipidbank.jp/WWA.html wax]
:[https://lipidbank.jp/MMA.html mycolic acid]

| align="left" style="vertical-align:top" width=33%|
[[:Category:LBG|LBG: Glycerolipids グリセロ脂質]]
 [[Image:LBG.png|100px]] 

;Links to the original LipidBank
:[https://lipidbank.jp/NAG.html acylglycerols]
:[https://lipidbank.jp/PGP.html glycerophospholipid]
:[https://lipidbank.jp/EEA.html ether-type lipid]
:[https://lipidbank.jp/GGG.html glycoglycerolipid]
* [[:Category:LBGA|LBGA: Archaeal Lipid (Ether-type) 古細菌の脂質]]

| align="left" style="vertical-align:top" width=33%|
[[:Category:LBS|LBS: Sphingolipids スフィンゴ脂質]] (new)
 [[Image:LBS.png|110px]] 

* [[:Category:LBSB|LBSB: long-chain base and ceramide]]
* [[:Category:LBSC|LBSC: cerebroside]]
* [[:Category:LBSG|LBSG: acidic glycosphingolipid]]
* [[:Category:LBSP|LBSP: phospho-sphingolipid]]

|-
| style="vertical-align:top"| Sterol Lipids
 [[File:Cholestane.png]] 
;Links to the original LipidBank
:[https://lipidbank.jp/SST.html steroid]
:[https://lipidbank.jp/BBA.html bile acid]
:[https://lipidbank.jp/VVD.html vitamin D]

| style="vertical-align:top"| Prenol Lipids
 <BIG>(</BIG> [[File:Isoprene.png]]<BIG>)</BIG>n 
;Links to the original LipidBank
:[https://lipidbank.jp/IIP.html isoprenoid]
:[https://lipidbank.jp/VCA.html carotenoid]
:[https://lipidbank.jp/VVA.html vitamin A]
:[https://lipidbank.jp/VVK.html vitamin K]
:[https://lipidbank.jp/VCQ.html coenzyme Q]

| style="vertical-align:top"| Others

;Links to the original LipidBank
:[https://lipidbank.jp/CLS.html lipopolysaccharide]
:[https://lipidbank.jp/ALA.html lipoamino acid]
:[https://lipidbank.jp/TLP.html lipoprotein]
:[https://lipidbank.jp/VVE.html vitamin E]
:[https://lipidbank.jp/NAG.html acylglycerols]

|}
</center>

; Related projects
* [[Lipoquality:Database|LipoQuality Database]]

File:Cholestane.png

2023-11-27T06:28:37Z

Editor:

File:Isoprene.png

2023-11-27T06:25:13Z

Editor:

Category:LBSB

2023-11-27T05:51:03Z

Editor:

{{LB/Header}}
{{Hierarchy|{{PAGENAME}}}}

{{Twocolumn|
Long-chain base (LCB or sphingoid base) is a 2-aminoalkane (or alkene) 1,3-diol. In cells, it constitutes sphingolipids and little exists as a free form.
When LCB is linked with a long-chain fatty acid via an amide bond, it is called a ceramide (Cer).<ref>Yamaji T, Hanada K "Sphingolipid metabolism and interorganellar localization of sphingolipid enzymes and lipid transfer proteins" Traffic 2015 16:101-122. PMID 25382749</ref>
|
長鎖塩基 LCB（またはスフィンゴイド塩基）は 2-アミノアルカン（またはアルケン） 1,3-ジオールを指し、生体内ではスフィンゴ脂質の構成成分です。遊離のLCBは微量しか存在しません。長鎖塩基に長鎖脂肪酸がアミド結合したものを、セラミドと呼びます。
}}
<references/>

[https://lipidbank.jp/DLB.html Link to the original LipidBank]

==Notation 表記法 ==
{|
|style="background:lightgray" width="200px"| Sph d18:1 
|Sph is an abbreviation of LCB. ''d'' or ''t'' stands for double or triple hydroxy groups, respectively. (We count the terminal alcohol.) 18 is the carbon chain length. 1 after the colon is the number of unsaturated bonds (double bonds).
|width="30%"|
長鎖塩基 LCB は Sph と表します。 ''d'', ''t'' はそれぞれ 2, 3 個の水酸基（アルコールの水酸基含む）を意味し、18は炭素鎖長です。コロンの次にくる1は不飽和結合（二重結合）の数を表します。
|}

{|
|style="background:lightgray" width="200px"| Cer  d18:1Δ8E/20:0 
| Cer is an abbreviations of ceramide. The first part indicates the sphingoid base and the second, after the slash, fatty acid. In this website we do not use superscripts or subscripts for readability. Also we do not italicize E (or trans) and Z (or cis) for the same reason.
|width="30%"| セラミドは　Cer　と表します。左側が長鎖塩基、スラッシュを挟んで右側は脂肪酸を表しています。このサイトでは上付き／下付きは使用せず（見づらいため）、 E (トランス）, Z (シス）もイタリックにしていません。
|}

{| style="border-spacing: 20px;"
|-
! '''Common Name'''
| sphingosine (= (4E)-sphingenine) スフィンゴシン
| sphinganine (= dihydrosphingosine) スフィンガニン
| phytosphingosine (= 4-hydroxydihydrosphingosine) フィトスフィンゴシン
| 6-hydroxysphingosine 6-ヒドロキシスフィンゴシン
|-
! '''Abbreviation'''
| d18:1 or So
| d18:0 or Sa (DHSo)
| t18:0 or Phyto
| t18:1 or 6-t18:1
|-
! '''Structure 構造'''
| {{LBS/Sph|OH}}
| {{LBS/DHSph|OH}}
| {{LBS/PhytoSph|OH}}
| {{LBS/6HSph|OH}}
|-
! '''Source 分布'''
| Major in mammals
| Major in mammals
| Major in fungi and plant
| Found in skin
|}

==Long-chain base 長鎖塩基==

{{Twocolumn|
The structural variation of LCB depends on biological species.<ref>Merrill AH "Sphingolipid and Glycosphingolipid Metabolic Pathways in the Era of Sphingolipidomics" Chem. Rev. 2011 111:6387–6422. PMID 21942574</ref>
|生物種によってLCBの構造は大きく異なります。
}}

{| class="wikitable"
! Classification || Long-chain base
|-
| Mammalia || sphingosine (= (4E)-d18:1) (4E)-d20:1 (nerve tissue), t18:0 (intestine)
|-
| Arthropoda || short-chain sphingosine (d14:1, d16:1) <ref>Guan XL, Cestra G, Shui G, Kuhrs A, Schittenhelm RB, Hafen E, van der Goot FG, Robinett CC, Gatti M, Gonzalez-Gaitan M, Wenk MR "Biochemical membrane lipidomics during Drosophila development" Dev Cell 2013 24:98-111. PMID 23260625</ref>
|-
| Plantae || (8E/Z)-d18:1, (8E/Z)-t18:1, (4E,8E/Z)-d18:2
|-
| Fungi || 9-methyl (4E,8E)-d18:2, t18:0
|}

===Bioactivity===
{{Twocolumn|
* Free LCB induces apoptosis.<ref>Hung WC, Chang HC, Chuang LY "Activation of caspase-3-like proteases in apoptosis induced by sphingosine and other long-chain bases in Hep3B hepatoma cells" Biochem J. 1999 338:161-166. PMID 9931312</ref>
* Sphingosine 1-phosphate is a lipid mediator of cell proliferation and motility control.<ref>Takabe K, Spiegel S."Export of sphingosine-1-phosphate and cancer progression"J Lipid Res. 2014 55:1839-46. PMID 24474820</ref>
|
* 遊離のLCBはアポトーシスを惹起します。
* スフィンゴシン 1リン酸 (Sph-1-P) は脂質メディエータとして細胞増殖や運動制御に働きます。
}}

<references/>

==Ceramide セラミド==

{{Twocolumn|
The conjugated fatty acids are often length 16 to 26. In normal tissues, little ceramide exists as an intermediate of phospho- and glycosphingolipid, whereas in the skin (corneocyte), ceramides and fatty-acid conjugated acyl-ceramides dominates and exhibit the barrier function.
| セラミドに結合する脂肪酸の炭素鎖長は16から26が多く、通常組織ではスフィンゴリン脂質やスフィンゴ糖脂質の中間体として少量存在します。皮膚の角質層にはセラミドに更に脂肪酸が結合したアシルセラミドがあり、皮膚のバリア機能を担います。
}}

===Composition===
{| class="wikitable"
|-
!rowspan="2"| Species
!colspan="3"| Glycosylceramide
!colspan="3"| Glycosyl inositol phosphoceramide (GIPC)
|-
! Fatty acid
! Long chain base
! References
! Fatty acid
! Long chain base
! References
|-
!Plants
| 16:0 - 26:0 16:1 - 26:1 16:0 VLCFA
| d18:2Δ4E8E/Z d18:2Δ4E8E/Z d18:1Δ8E/Z t18:1Δ8E/Z
| <ref name=Mark>Markham JE, Lynch DV, Napier JA, Dunn TM, Cahoon EB. "Plant sphingolipids: function follows form" Curr Opin Plant Biol. 2013 16: 350-7. PMID 23499054</ref><ref name="War">Warnecke D, Heinz E."Recently discovered functions of glucosylceramides in plants and fungi" Cell Mol Life Sci. 2003 60:919-41.PMID 12827281</ref> <ref name="Mark"/><ref name="War"/> <ref name="Mark"/> <ref name="Mark"/><ref name="War"/>
| VLCFA 14:0 - 26:0 20:1 - 26:1
| t18:1Δ8E/Z t18:1Δ8E/Z, t18:0 t18:1Δ8E/Z, t18:0
| <ref name="Mark"/> <ref name="Bure">Buré C, Cacas JL, Mongrand S, Schmitter JM. "Characterization of glycosyl inositol phosphoryl ceramides from plants and fungi by mass spectrometry" Anal Bioanal Chem. 2013 406:995-1010 PMID 23887274</ref> <ref name="Mark"/><ref name="Bure"/>
|-
!Fungi
| 16:0 - 18:0 16:1 - 18:1
| 9-methyl d18:2Δ4E,8E 9-methyl d18:2Δ4E,8E
| <ref name="Nim">Nimrichter L, Rodrigues ML. "Fungal glucosylceramides: from structural components to biologically active targets of new antimicrobials" Front Microbiol. 2011 2:212.PMID 22025918</ref><ref name="War"/> <ref name="Nim"/><ref name="War"/>
| 24:0 - 26:0 24:1 - 26:1 16:0 - 26:0
| t18:0 t18:0 t18:0, t20:0
| <ref name="Nim"/> <ref name="War"/> <ref name="War"/><ref name="Bure"/>
|}

===Bioactivity===

{{Twocolumn|
* Atopic dermatitis (and dry skin) is associated with a decrease and compositional change of ceramides.<ref>Macheleidt O, Kaiser HW, Sandhoff K "Deficiency of epidermal protein-bound omega-hydroxyceramides in atopic dermatitis" J Invest Dermatol. 2002 119:166-173. PMID 12164940</ref>
* Ceramides involve in cell proliferation and autophagy, and ceramide 1-phosphate functions as a lipid mediator.<ref>Young MM, Kester M, Wang HG "Sphingolipids: regulators of crosstalk between apoptosis and autophagy" J Lipid Res.2013 54:5-19. PMID 23152582</ref>
|
* アトピー性皮膚炎や乾燥肌ではセラミド量が減少し、組成も変化しています。
* 通常細胞内ではLCBと同様に細胞増殖やオートファジーに関与し、セラミド末端にリン酸が結合した Cer-1-P も脂質メディエータとして働きます。
}}

<references/>

===Metabolism===

[[:Category:LBS/Biosynthesis|Metabolism, Glycosphingolipid in Plant and Fungi]]

Category:LBS

2023-05-26T01:15:53Z

Editor: /* {{Bilingual|生合成|Biosynthesis}} */

{{Huge|{{Bilingual|スフィンゴ脂質|Sphingolipid}}}}
{{LB/Header}}
{{Hierarchy|{{PAGENAME}}}}
{| style="float:left"
| __TOC__
|}
=={{Bilingual|概要|Class Overview}}==

{{Twocolumn|
Three Sphingolipid categories (LBS) exist in this database.
|このデータベースではスフィンゴ脂質を以下に分けています。
}}

<center>
{|
|-
| style="vertical-align:top" width="33%"|
[[:Category:LBSB| '''Ceramide''']] {{LBS/Cer|OH}} セラミド
| style="vertical-align:top" width="33%"|
'''Glycosphingolipid''' {{LBS/Cer|O-(sugar)}} スフィンゴ糖脂質
| style="vertical-align:top" width="33%"|
[[:Category:LBSP| '''Phosphosphingolipid''']] {{LBS/Cer|O-(phosphate)}} スフィンゴリン脂質
|-
|
*[[:Category:LBSB|Long-chain base and ceramide]]
|
*[[:Category:LBSC|Cerebroside (monohexosyl ceramides)]]
*[[:Category:LBSG|Acidic glycosphingolipid]]
|
*[[:Category:LBSP|Sphingomyelin, CPE, CAEP and GIPC]]
|}
</center>

<center>
{| class="wikitable"
|<big>
[[:Category:LBS/Search|{{Bilingual|スフィンゴ脂質検索画面にいく|Go to Sphingolipid search.}}]]
</big>
|}
</center>

=={{Bilingual|スフィンゴ脂質|Sphingolipid}}==

==={{Bilingual|表記法|Notation}}===
{| class="wikitable collapsible collapsed" style="width:80%"
!colspan="4" align="center" style="background:lightgray"| Symbol Abbreviations (e.g. Glc = glucose)
|-
!colspan="4" align="center" style="background:lightgray"| Backbones
{{#repeatnum:LBS/AbbrevRow|1|
Cer && ceramide && セラミド &&
Sph && sphingosine && スフィンゴシン &&
}}
|-
!colspan="4" align="center" style="background:lightgray"| Sugars
{{#repeatnum:LBS/AbbrevRow|1|
Glc && glucose && グルコース && C6H12O6 &&
Gal && galactose && ガラクトース && C6H12O6 &&
GlcNAc && ''N''-acetyl-glucosamine && ''N''-アセチルグルコサミン && C8H15NO6
GalNAc && ''N''-acetyl-galactosamine && ''N''-アセチルガラクトサミン && C8H15NO6
GlcN && glucosamine && グルコサミン && C6H13NO5
GalN && galactosamine && ガラクトサミン && C6H13NO5
GlcA && glucuronic acid && グルクロン酸 && C6H10O7
GalA && galacturonic acid && ガラクツロン酸 && C6H10O7 &&
Man && mannose && マンノース && C6H12O6 && 18950
Rha && rhamnose (= 6-deoxy-mannose) && ラムノース (6-デオキシマンノース) && C6H12O5 && 19233
Ins && inositol && イノシトール && C6H12O6 && 892
Fuc && fucose (= 6-deoxy-galactose) && フコース (6-デオキシガラクトース) && C6H12O5 && 17106
Ara && arabinose && アラビノース && C5H10O5 && 5460291
Xyl && xylose && キシロース && C5H10O5 && 135191
NeuNH && (deacetyl) neuraminic acid (pyruvate + mannosamine) && ノイラミン酸 (ピルビン酸＋マンノサミン) && C9H17N1O8 && 513472
NeuAc && ''N''-acetyl-neuraminic acid && ''N''-アセチルノイラミン酸 && C11H19NO9 && 439197
NeuGc && ''N''-glycolyl-neuraminic acid && ''N''-グリコリルノイラミン酸 && C11H19NO10 && 123802
Kdn && 2-keto-3-deoxy-D-glycero- D-galacto-nononic acid && デアミノノイラミン酸 && C9H16O9 && 13991616
}}
|-
!colspan="4" align="center" style="background:lightgray"| Modifiers
{{#repeatnum:LBS/AbbrevRow|1|
AEPn && aminoethylphosphonic acid, or (2-aminoethyl)hydroxyphosphoryl- && アミノエチルホスホン酸（C-P結合）
MAEPn && ''N''-methyl aminoethylphosphonic acid, or (''N''-methyl-2-aminoethyl) hydroxyphosphoryl- && AEPnの''N''-メチル体（C-P結合）
EtnP && phosphoethanolamine (PEA), or 2-aminoethanolphospho- && ホスホエタノールアミン
PC && Phosphocholine && ホスホコリン
Butenyl && Butenyl && ブテニル基
Me && Methyl && メチル基
Et && Ethyl && エチル基
}}
|}

==={{Bilingual|分類体系|Page/ID-Code Design}}===
{{Twocolumn|
Major series of phosphosphingolipids are determined by molecules bound to their phosphates, and the series of glycosphingolipids are determined by oligosaccharides bound to their ceramides. The IUPAC series of glycosphingolipids (1977) were based on the order and bonding patterns of four sugars rooting at the long-chain base. Our series, however, are based on three sugars. Two original series, Echino and Schisto, are also added.
|スフィンゴリン脂質はリン酸に結合する分子や糖の種類、スフィンゴ糖脂質はセラミドに結合する糖鎖により系列を作成しています。1977年にIUPACが提唱したスフィンゴ糖脂質の系列は、長鎖塩基に結合する四糖の並びと結合を基準にしています。ここではより広い糖鎖の系列を検索できるよう、三糖を基準に分類しています。また新たにEchinoとSchistoの系列を加えています。
}}

{|
|
<table border=1>
<tr>
<td style="background-color:yellowgreen;" width=20px align="center"><big>L</big>
<td style="background-color:yellowgreen;" width=20px align="center"><big>B</big>
<td style="background-color:yellowgreen;" width=20px align="center"><big>S</big>
<td style="background-color:green;" width=20px align="center"><big>''G/P''</big>
<td style="background-color:Blue; color:white" width=20px align="center"><big>''s1''</big>
<td style="background-color:Blue; color:white" width=20px align="center"><big>''s2''</big>
<td style="background-color:tomato; color:white" width=20px align="center"><big>''n1''</big>
<td style="background-color:tomato; color:white" width=20px align="center"><big>''n2''</big>
<td style="background-color:firebrick; color:white" width=20px align="center"><big>''y''</big>
<td style="background-color:white;" width=20px align="center"><big>''c1''</big>
<td style="background-color:white;" width=20px align="center"><big>''c2''</big>
</tr>
</table>
|  
|
{| class="wikitable"
! '''G/P''' || '''G''' (glyco) || '''P''' (phospho)
|-
! '''s1, s2'''
|colspan="3"| structure code as explained below
|-
! '''n1, n2'''
|colspan="2"| number of sugars (2 digits)
|-
! '''y'''
|colspan="2"| number of sialic acids (1 digit)
|-
! '''c1, c2'''
|colspan="2"| serial numbers
|}
|}

==={{Bilingual|スフィンゴ糖脂質１文字目|First (s1) Digit for Glycosphingolipid}}===

{| class="wikitable" style="text-align:right; background-color:white"
! First sugar || Code || Root sequence
! colspan=2 | Major Series
|-
! Cerebroside
| colspan="3" style="text-align:left" | '''For GalCer and GlcCer, visit [[:Category:LBSC|this page]].'''
|-
! starting with <big>Galactose</big>
| {{#volatile:ListMol/LBStitle|G1|LBSG1}} ({{#volatile:ClassMatrix|{{#countTitle:LBSG1}} items|LBSG1.....|7|8|9|9|Number_of_Sugars|Number_of_Sialic_acids}})
|style="text-align:right"| '''Gal'''-Cer
|
{| style="width:100%;"
|style="border:0;text-align:left"| {{#volatile:ListMol/LBS|Gala / Neogala|Mainchain.*Gala1-4?6?Galb1-Cer}}
|style="border:0;text-align:right"| {{#invoke:LBS|FormatSugar|Gala1-4/6Galb1-Cer}}
|-
|style="border:0;text-align:left"|{{#volatile:ListMol/LBS|Spirometo|Mainchain.*Galb1-4Glcb1-3Galb1-Cer}}
|style="border:0;text-align:right"| {{#invoke:LBS|FormatSugar|Galb1-4Glcb1-3Galb1-Cer}}
|}
|-
! rowspan="8" | starting with <big>Glucose</big>
|-
| {{#volatile:ListMol/LBStitle|G2|LBSG2}} ({{#volatile:ClassMatrix|{{#countTitle:LBSG2}} items|LBSG2.....|7|8|9|9|Number_of_Sugars|Number_of_Sialic_acids}})
|style="text-align:right"| '''GalNAcβ'''-Galβ-Glcβ-Cer
|
{| style="width:100%"
|-
|style="border:0;text-align:left"| {{#volatile:ListMol/LBS|Ganglio|Mainchain.*GalNAcb1-4Galb1-4Glcb1-Cer}}
|style="border:0;text-align:right"| {{#invoke:LBS|FormatSugar|GalNAcb1-4Galb1-4Glcb1-Cer}}
|-
|style="border:0;text-align:left"| {{#volatile:ListMol/LBS|Isoganglio|Mainchain.*GalNAcb1-3Galb1-4Glcb1-Cer}}<ref name="iso">In IUPAC, "iso" refers to a change from position 4 to position 3.</ref>
|style="border:0;text-align:right"| {{#invoke:LBS|FormatSugar|GalNAcb1-3Galb1-4Glcb1-Cer}}
|-
|style="border:0;text-align:left"| {{#volatile:ListMol/LBS|Lactoganglio|Structure.*GlcNAcb1-3$.*GalNAcb1-4$Galb1-4Glcb1-Cer}}
|style="border:0;text-align:right"| {{#invoke:LBS|FormatSugar|GlcNAcb1-3(GalNAcb1-4)Galb1-4Glcb1-Cer}}
|-
|style="border:0;text-align:left"| {{#volatile:ListMol/LBS|a-series|Structure.*$?NeuAca2-3$?Galb1-4Glcb1-Cer}}
|style="border:0;text-align:right"| {{#invoke:LBS|FormatSugar|GalNAcb1-4(NeuAca2-3)Galb1-4Glcb1-Cer}}
|-
|style="border:0;text-align:left"| {{#volatile:ListMol/LBS|b-series|Structure.*$?NeuAca2-8NeuAca2-3$?Galb1-4Glcb1-Cer}}
|style="border:0;text-align:right"| {{#invoke:LBS|FormatSugar|GalNAcb1-4(NeuAca2-8NeuAca2-3)Galb1-4Glcb1-Cer}}
|-
|style="border:0;text-align:left"| {{#volatile:ListMol/LBS|c-series|Structure.*$?NeuAca2-8NeuAca2-8NeuAca2-3$?Galb1-4Glcb1-Cer}}
|style="border:0;text-align:right"| {{#invoke:LBS|FormatSugar|GalNAcb1-4(NeuAca2-8NeuAca2-8NeuAca2-3)Galb1-4Glcb1-Cer}}
|-
|style="border:0;text-align:left"| {{#volatile:ListMol/LBS|α-series|Structure.*$?NeuAca2-6$?GalNAcb1-4Galb1-4Glcb1-Cer}}
|style="border:0;text-align:right"| {{#invoke:LBS|FormatSugar|...(NeuAca2-6)GalNAcb1-4Galb1-4Glcb1-Cer}}
|-
|style="border:0;text-align:left"| {{#volatile:ListMol/LBS|β-series|Structure.*$?NeuAca2-8NeuAca2-6$?GalNAcb1-4Galb1-4Glcb1-Cer}}
|style="border:0;text-align:right"| {{#invoke:LBS|FormatSugar|...(NeuAca2-8NeuAca2-6)GalNAcb1-4Galb1-4Glcb1-Cer}}
|}
|-
| {{#volatile:ListMol/LBStitle|G3|LBSG3}} ({{#volatile:ClassMatrix|{{#countTitle:LBSG3}} items|LBSG3.....|7|8|9|9|Number_of_Sugars|Number_of_Sialic_acids}})
|style="text-align:right"| '''GlcNAcβ'''-Galβ-Glcβ-Cer
|
{| style="width:100%"
|-
|style="border:0;text-align:left"| {{#volatile:ListMol/LBS|Lacto|Mainchain.*Galb1-3GlcNAcb1-3Galb1-4Glcb1-Cer}}
|style="border:0;text-align:right"| {{#invoke:LBS|FormatSugar|Galb1-3GlcNAcb1-3Galb1-4Glcb1-Cer}}
|-
|style="border:0;text-align:left"| {{#volatile:ListMol/LBS|Neolacto|Mainchain.*Gal.1-4GlcNAcb1-3Galb1-4Glcb1-Cer}}<ref name="neo">In IUPAC, "neo" refers to a change from position 3 to position 4.</ref>
|style="border:0;text-align:right"| {{#invoke:LBS|FormatSugar|Galb1-4GlcNAcb1-3Galb1-4Glcb1-Cer}}
|}
|-
| {{#volatile:ListMol/LBStitle|G4|LBSG4}} ({{#volatile:ClassMatrix|{{#countTitle:LBSG4}} items|LBSG4.....|7|8|9|9|Number_of_Sugars|Number_of_Sialic_acids}})
|style="text-align:right"| '''Galα'''-Galβ-Glcβ-Cer
|
{| style="width:100%"
|-
|style="border:0;text-align:left"| {{#volatile:ListMol/LBS|Globo|Mainchain.*Gala1-4Galb1-4Glcb1-Cer}}
|style="border:0;text-align:right"| {{#invoke:LBS|FormatSugar|Gala1-4Galb1-4Glcb1-Cer}}
|-
|style="border:0;text-align:left"| {{#volatile:ListMol/LBS|Isoglobo|Mainchain.*Gala1-3Galb1-4Glcb1-Cer}}<ref name="iso"/>
|style="border:0;text-align:right"| {{#invoke:LBS|FormatSugar|Gala1-3Galb1-4Glcb1-Cer}}
|}
|-
| {{#volatile:ListMol/LBStitle|G5|LBSG5}} ({{#volatile:ClassMatrix|{{#countTitle:LBSG5}} items|LBSG5.....|7|8|9|9|Number_of_Sugars|Number_of_Sialic_acids}})
|style="text-align:right"| Gal-Glc-Cer (Other than G2&sim;G4)
|
{| style="width:100%"
|style="border:0;text-align:left"| {{#volatile:ListMol/LBS|Muco|Mainchain.*Galb1-4Galb1-4Glcb1-Cer}}
|style="border:0;text-align:right"| {{#invoke:LBS|FormatSugar|Galb1-4Galb1-4Glcb1-Cer}}
|}
|-
| {{#volatile:ListMol/LBStitle|G6|LBSG6}} ({{#volatile:ClassMatrix|{{#countTitle:LBSG6}} items|LBSG6.....|7|8|9|9|Number_of_Sugars|Number_of_Sialic_acids}})
|style="text-align:right"| '''Man'''-Glcβ-Cer
|
{| style="width:100%"
|style="border:0;text-align:left"| {{#volatile:ListMol/LBS|Arthro|Mainchain.*GlcNAcb1-3Manb1-4Glcb1-Cer}}
|style="border:0;text-align:right"| {{#invoke:LBS|FormatSugar|GlcNAcb1-3Manb1-4Glcb1-Cer}}
|-
|style="border:0;text-align:left"| {{#volatile:ListMol/LBS|Mollu|Mainchain.*Mana1-3Manb1-4Glcb1-Cer}}
|style="border:0;text-align:right"| {{#invoke:LBS|FormatSugar|Mana1-3Manb1-4Glcb1-Cer}}
|}
|-
| {{#volatile:ListMol/LBStitle|G7|LBSG7}} ({{#volatile:ClassMatrix|{{#countTitle:LBSG7}} items|LBSG7.....|7|8|9|9|Number_of_Sugars|Number_of_Sialic_acids}})
|style="text-align:right"| '''NeuAc'''/'''NeuGc'''-Glcβ-Cer
|
{| style="width:100%"
|style="border:0;text-align:left"| {{#volatile:ListMol/LBS|Echino|Mainchain.*Neu(A~G)c.2-6Glcb1-Cer}}
|style="border:0;text-align:right"| '''NeuGc''' or {{#invoke:LBS|FormatSugar|NeuAca2-6Glcb1-Cer}}
|}
|-
| {{#volatile:ListMol/LBStitle|G8|LBSG8}} ({{#volatile:ClassMatrix|{{#countTitle:LBSG8}} items|LBSG8.....|7|8|9|9|Number_of_Sugars|Number_of_Sialic_acids}})
|style="text-align:right"| '''GalNAc'''-Glc-Cer
|
{| style="width:100%"
|style="border:0;text-align:left"| {{#volatile:ListMol/LBS|Schisto|Mainchain.*GalNAc.1-4Glc.1-Cer}}<ref>Makaaru CK, Damian RT, Smith DF, Cummings RD. "The human blood fluke Schistosoma mansoni synthesizes a novel type of glycosphingolipid" J Biol Chem 1992 267:2251-2257 PMID 1733932</ref>
|style="border:0;text-align:right"| {{#invoke:LBS|FormatSugar|GalNAcb1-4Glcb1-Cer}}
|}
|-
! starting with <big>Other Sugars</big>
| {{#volatile:ListMol/LBStitle|G(A&sim;R)|LBSG(A~B~C~D~E~F~G~H~J~K~M~N~O~P~Q~R)}}
|colspan="2"| Symbols follow the Sugar-digit table.
|}
<references/>

==={{Bilingual|スフィンゴリン脂質１文字目|First (s1) Digit for Phosphosphingolipid}}===
{| class="wikitable" style="text-align:right; background-color:white"
! First sugar || Code || Root sequence
!colspan="2"| Major Series
|-
! No Sugar Attached
| '''P1''' ([[:Category:LBSP|LBSP]])
| R-P-Cer
| Sphingomyelin and Ceramide phosphoetanolamine (Visit [[:Category:LBSP|this page]].)
|-
! rowspan="4" | starting with <big>Inositol</big>
| {{#volatile:ListMol/LBStitle|P2|LBSP2}} ({{#countTitle:LBSP2}} items)
| style="text-align:right"| '''GlcN'''α/β1−2/6Ins1-P-Cer
|
{|style="width:100%"
|style="border:0;text-align:left"| {{#volatile:ListMol/LBS|Protozoa & Fungi-specific|Mainchain.*GlcN.1-.Ins-P-Cer}}
| style="border:0;text-align:right"| {{#invoke:LBS|FormatSugar|GlcNa/b1-2/6Ins1-P-Cer}}
|}
|-
| {{#volatile:ListMol/LBStitle|P3|LBSP3}} ({{#countTitle:LBSP3}} items)
|style="text-align:right"| '''GlcA'''α/β1−2/6Ins1-P-Cer
|
{|style="width:100%"
|style="border:0;text-align:left"| {{#volatile:ListMol/LBS|Plant-specific|Mainchain.*GlcA.1-.Ins-P-Cer}}
|style="border:0;text-align:right"| {{#invoke:LBS|FormatSugar|GlcAa/b1-2/6Ins1-P-Cer}}
|}
|-
| {{#volatile:ListMol/LBStitle|P4|LBSP4}} ({{#countTitle:LBSP4}} items)
| style="text-align:right"| '''Man'''α/β1−2/6Ins1-P-Cer
|
{| style="width:100%"
| style="border:0;text-align:left"| {{#volatile:ListMol/LBS|Fungi-specific|Mainchain.*Man.1-.Ins-P-Cer}}
| style="border:0;text-align:right"| {{#invoke:LBS|FormatSugar|Mana/b1-2/6Ins1-P-Cer}}
|}
|-
| {{#volatile:ListMol/LBStitle|P5|LBSP5}} ({{#countTitle:LBSP5}} items)
| style="text-align:right"| Gal, Glc, and Others
| style="text-align:right"| {{#invoke:LBS|FormatSugar|X-Ins1-P-Cer}}
|}

==={{Bilingual|コード２文字目|Second (s2) Digit}}===

{{Bilingual|クリックすると一覧が出ます。記号の略称については|Click to see the full list. For abbreviations, see}} [[#Notation]].

{|
|-
| valign="top"|
{| class="wikitable"
|-
! Code || Structure
|-
! '''A'''
| Glc [[File:LBS-Monomer-Glc.png]]
|-
! '''B'''
| Gal [[File:LBS-Monomer-Gal.png]]
|-
! '''C'''
| GlcNAc [[File:LBS-Monomer-GlcNAc.png]]
|-
! '''D'''
| GalNAc [[File:LBS-Monomer-GalNAc.png]]
|-
! '''E'''
| GlcN [[File:LBS-Monomer-GlcN.png]]
|-
! '''F'''
| GalN [[File:LBS-Monomer-GalN.png]]
|-
! '''G'''
| GlcA [[File:LBS-Monomer-GlcA.png]]
|-
! '''H'''
| GalA [[File:LBS-Monomer-GalA.png]]
|-
! '''I'''
| not used
|}
|valign="top"|
{| class="wikitable"
|-
! Code || Structure
|-
! '''J'''
| {{#volatile:ListMol/LBS|Mannose|Structure.*Man}} [[File:LBS-Monomer-Man.png]]
|-
! '''K'''
| {{#volatile:ListMol/LBS|Rhamnose|Structure.*Rha}} [[File:LBS-Monomer-Rha.png]]
|-
! '''L'''
| {{#volatile:ListMol/LBS|Inositol|Structure.*Ins(Me)?-P-[^Cer]}}
|-
! '''M'''
| Fucose ({{#volatile:ListMol/LBS| 1|Structure[^F]+Fuc[^F]+$}}, {{#volatile:ListMol/LBS|2|Structure([^F]+Fuc){2}[^F]+$}}, {{#volatile:ListMol/LBS|>3|Structure([^F]+Fuc){3} }}) [[File:LBS-Monomer-Fuc.png]]
|-
! '''N'''
| {{#volatile:ListMol/LBS|Arabinose|Structure.*Ara}} [[File:LBS-Monomer-Ara.png]]
|-
! '''O'''
| {{#volatile:ListMol/LBS|Xylose|Structure.*Xyl}} [[File:LBS-Monomer-Xyl.png]]
|-
! '''P'''
| {{#volatile:ListMol/LBS|NeuAc / NeuNH|Structure.*(NeuAc~NeuNH)}} [[File:LBS-Monomer-NeuAc.png]]
|-
! '''Q'''
| {{#volatile:ListMol/LBS|NeuGc|Structure.*(NeuGc)}} [[File:LBS-Monomer-NeuGc.png]]
|-
! '''R'''
| {{#volatile:ListMol/LBS|Kdn|Structure.*(KDN)}} [[File:LBS-Monomer-KDN.png]]
|}
|valign="top"|
{| class="wikitable"
|-
! Code || Structure
|-
! '''S'''
| {{#volatile:ListMol/LBS|Phosphate (except GIPC)|Structure.*(Phospho)}} [[File:LBS-Monomer-P.png]]
|-
! '''T'''
| {{#volatile:ListMol/LBS|(M)AEPn|Structure.*(AEPn)}}, {{#volatile:ListMol/LBS|EtnP|Structure.*(EtnP)}}, {{#volatile:ListMol/LBS|PC|Structure.*(PC)}} [[File:LBS-Monomer-AEPn.png]]
|-
! '''U'''
| {{#volatile:ListMol/LBS|Sulfate|Structure.*Sulfo}} [[File:LBS-Monomer-S.png]]
|-
! '''V'''
| acyl/alkyl/alkenyl chain [[File:LBS-Monomer-Alkyl.png]]
|}

=={{Bilingual|生合成|Biosynthesis}}==
{{Twocolumn|
Sphingosine is synthesized from decarboxylating condensation of palmitoyl CoA with serine on the ER membrane. It is a 18-carbon amino alcohol (16 carbons from palmitic acid and 2 from serine) with one unsaturated bond (trans-form) at the C-4 position (2-amino-4-octadecene-1,3-diol). ([[:Category:LBS/Biosynthesis|more details]])
|
スフィンゴシンはパルミトイルCoAがアミノ酸セリンと脱炭酸縮合して生成します。炭素を18個含むアミノアルコール(16個がパルミチン酸、2個がセリン由来)でトランス型の不飽和結合をC-4に1つ含みます。（[[:Category:LBS/Biosynthesis|詳細はこちら]]）
}}

=={{Bilingual|スフィンゴ脂質の歴史|History of Sphingolipids}}==
{{Twocolumn|
Sphingolipids were first isolated from brain by J.L.W. Thudichum (1829-1901) as lipids of unknown function and structure.<ref>Thudichum J.L.W.?"A Treatise on the Chemical Constitution of the Balliere" Tindall and Cox, London,?1884</ref> The basic structure is a long-chain base (long-chain amino-alcohol) whose amino-group is acylated with a long-chain fatty acid. This hydrophobic structure is called ceramides.
Sphingolipid consists of phospho-sphingolipid and glyco-sphingolipid, whose ceramide structure is bonded with phosphate and (oligo)saccharides, respectively. Phosphosphingolipid includes sphingomyelin, and glycosphingolipid, cerebrosides and gangliosides. Both are abundant in neural tissues.<ref>Gault CR,?Obeid LM,?Hannun YA "An overview of sphingolipid synthesis to breakdown" Adv Exp Med Biol.?2010;688:1-23. PMID 20919643</ref>
|
スフィンゴ脂質は J.L.W. Thudichum (1829-1901) により機能や構造未知の脂質として脳から見いだされました。基本骨格は長鎖塩基 (長鎖アミノアルコール) のアミノ基が長鎖脂肪酸とアミド結合したもので、セラミドと呼ばれます。
スフィンゴ脂質はセラミドにリン酸が結合したスフィンゴリン脂質と糖が結合したスフィンゴ糖脂質に分けられます。スフィンゴリン脂質にはスフィンゴミエリンが、スフィンゴ糖脂質にはセレブロシドやガングリオシドなどが含まれ、いずれも神経系に多く存在します。
}}

<references/>

Category:LBS

2023-05-26T01:15:29Z

Editor:

{{Huge|{{Bilingual|スフィンゴ脂質|Sphingolipid}}}}
{{LB/Header}}
{{Hierarchy|{{PAGENAME}}}}
{| style="float:left"
| __TOC__
|}
=={{Bilingual|概要|Class Overview}}==

{{Twocolumn|
Three Sphingolipid categories (LBS) exist in this database.
|このデータベースではスフィンゴ脂質を以下に分けています。
}}

<center>
{|
|-
| style="vertical-align:top" width="33%"|
[[:Category:LBSB| '''Ceramide''']] {{LBS/Cer|OH}} セラミド
| style="vertical-align:top" width="33%"|
'''Glycosphingolipid''' {{LBS/Cer|O-(sugar)}} スフィンゴ糖脂質
| style="vertical-align:top" width="33%"|
[[:Category:LBSP| '''Phosphosphingolipid''']] {{LBS/Cer|O-(phosphate)}} スフィンゴリン脂質
|-
|
*[[:Category:LBSB|Long-chain base and ceramide]]
|
*[[:Category:LBSC|Cerebroside (monohexosyl ceramides)]]
*[[:Category:LBSG|Acidic glycosphingolipid]]
|
*[[:Category:LBSP|Sphingomyelin, CPE, CAEP and GIPC]]
|}
</center>

<center>
{| class="wikitable"
|<big>
[[:Category:LBS/Search|{{Bilingual|スフィンゴ脂質検索画面にいく|Go to Sphingolipid search.}}]]
</big>
|}
</center>

=={{Bilingual|スフィンゴ脂質|Sphingolipid}}==

==={{Bilingual|表記法|Notation}}===
{| class="wikitable collapsible collapsed" style="width:80%"
!colspan="4" align="center" style="background:lightgray"| Symbol Abbreviations (e.g. Glc = glucose)
|-
!colspan="4" align="center" style="background:lightgray"| Backbones
{{#repeatnum:LBS/AbbrevRow|1|
Cer && ceramide && セラミド &&
Sph && sphingosine && スフィンゴシン &&
}}
|-
!colspan="4" align="center" style="background:lightgray"| Sugars
{{#repeatnum:LBS/AbbrevRow|1|
Glc && glucose && グルコース && C6H12O6 &&
Gal && galactose && ガラクトース && C6H12O6 &&
GlcNAc && ''N''-acetyl-glucosamine && ''N''-アセチルグルコサミン && C8H15NO6
GalNAc && ''N''-acetyl-galactosamine && ''N''-アセチルガラクトサミン && C8H15NO6
GlcN && glucosamine && グルコサミン && C6H13NO5
GalN && galactosamine && ガラクトサミン && C6H13NO5
GlcA && glucuronic acid && グルクロン酸 && C6H10O7
GalA && galacturonic acid && ガラクツロン酸 && C6H10O7 &&
Man && mannose && マンノース && C6H12O6 && 18950
Rha && rhamnose (= 6-deoxy-mannose) && ラムノース (6-デオキシマンノース) && C6H12O5 && 19233
Ins && inositol && イノシトール && C6H12O6 && 892
Fuc && fucose (= 6-deoxy-galactose) && フコース (6-デオキシガラクトース) && C6H12O5 && 17106
Ara && arabinose && アラビノース && C5H10O5 && 5460291
Xyl && xylose && キシロース && C5H10O5 && 135191
NeuNH && (deacetyl) neuraminic acid (pyruvate + mannosamine) && ノイラミン酸 (ピルビン酸＋マンノサミン) && C9H17N1O8 && 513472
NeuAc && ''N''-acetyl-neuraminic acid && ''N''-アセチルノイラミン酸 && C11H19NO9 && 439197
NeuGc && ''N''-glycolyl-neuraminic acid && ''N''-グリコリルノイラミン酸 && C11H19NO10 && 123802
Kdn && 2-keto-3-deoxy-D-glycero- D-galacto-nononic acid && デアミノノイラミン酸 && C9H16O9 && 13991616
}}
|-
!colspan="4" align="center" style="background:lightgray"| Modifiers
{{#repeatnum:LBS/AbbrevRow|1|
AEPn && aminoethylphosphonic acid, or (2-aminoethyl)hydroxyphosphoryl- && アミノエチルホスホン酸（C-P結合）
MAEPn && ''N''-methyl aminoethylphosphonic acid, or (''N''-methyl-2-aminoethyl) hydroxyphosphoryl- && AEPnの''N''-メチル体（C-P結合）
EtnP && phosphoethanolamine (PEA), or 2-aminoethanolphospho- && ホスホエタノールアミン
PC && Phosphocholine && ホスホコリン
Butenyl && Butenyl && ブテニル基
Me && Methyl && メチル基
Et && Ethyl && エチル基
}}
|}

==={{Bilingual|分類体系|Page/ID-Code Design}}===
{{Twocolumn|
Major series of phosphosphingolipids are determined by molecules bound to their phosphates, and the series of glycosphingolipids are determined by oligosaccharides bound to their ceramides. The IUPAC series of glycosphingolipids (1977) were based on the order and bonding patterns of four sugars rooting at the long-chain base. Our series, however, are based on three sugars. Two original series, Echino and Schisto, are also added.
|スフィンゴリン脂質はリン酸に結合する分子や糖の種類、スフィンゴ糖脂質はセラミドに結合する糖鎖により系列を作成しています。1977年にIUPACが提唱したスフィンゴ糖脂質の系列は、長鎖塩基に結合する四糖の並びと結合を基準にしています。ここではより広い糖鎖の系列を検索できるよう、三糖を基準に分類しています。また新たにEchinoとSchistoの系列を加えています。
}}

{|
|
<table border=1>
<tr>
<td style="background-color:yellowgreen;" width=20px align="center"><big>L</big>
<td style="background-color:yellowgreen;" width=20px align="center"><big>B</big>
<td style="background-color:yellowgreen;" width=20px align="center"><big>S</big>
<td style="background-color:green;" width=20px align="center"><big>''G/P''</big>
<td style="background-color:Blue; color:white" width=20px align="center"><big>''s1''</big>
<td style="background-color:Blue; color:white" width=20px align="center"><big>''s2''</big>
<td style="background-color:tomato; color:white" width=20px align="center"><big>''n1''</big>
<td style="background-color:tomato; color:white" width=20px align="center"><big>''n2''</big>
<td style="background-color:firebrick; color:white" width=20px align="center"><big>''y''</big>
<td style="background-color:white;" width=20px align="center"><big>''c1''</big>
<td style="background-color:white;" width=20px align="center"><big>''c2''</big>
</tr>
</table>
|  
|
{| class="wikitable"
! '''G/P''' || '''G''' (glyco) || '''P''' (phospho)
|-
! '''s1, s2'''
|colspan="3"| structure code as explained below
|-
! '''n1, n2'''
|colspan="2"| number of sugars (2 digits)
|-
! '''y'''
|colspan="2"| number of sialic acids (1 digit)
|-
! '''c1, c2'''
|colspan="2"| serial numbers
|}
|}

==={{Bilingual|スフィンゴ糖脂質１文字目|First (s1) Digit for Glycosphingolipid}}===

{| class="wikitable" style="text-align:right; background-color:white"
! First sugar || Code || Root sequence
! colspan=2 | Major Series
|-
! Cerebroside
| colspan="3" style="text-align:left" | '''For GalCer and GlcCer, visit [[:Category:LBSC|this page]].'''
|-
! starting with <big>Galactose</big>
| {{#volatile:ListMol/LBStitle|G1|LBSG1}} ({{#volatile:ClassMatrix|{{#countTitle:LBSG1}} items|LBSG1.....|7|8|9|9|Number_of_Sugars|Number_of_Sialic_acids}})
|style="text-align:right"| '''Gal'''-Cer
|
{| style="width:100%;"
|style="border:0;text-align:left"| {{#volatile:ListMol/LBS|Gala / Neogala|Mainchain.*Gala1-4?6?Galb1-Cer}}
|style="border:0;text-align:right"| {{#invoke:LBS|FormatSugar|Gala1-4/6Galb1-Cer}}
|-
|style="border:0;text-align:left"|{{#volatile:ListMol/LBS|Spirometo|Mainchain.*Galb1-4Glcb1-3Galb1-Cer}}
|style="border:0;text-align:right"| {{#invoke:LBS|FormatSugar|Galb1-4Glcb1-3Galb1-Cer}}
|}
|-
! rowspan="8" | starting with <big>Glucose</big>
|-
| {{#volatile:ListMol/LBStitle|G2|LBSG2}} ({{#volatile:ClassMatrix|{{#countTitle:LBSG2}} items|LBSG2.....|7|8|9|9|Number_of_Sugars|Number_of_Sialic_acids}})
|style="text-align:right"| '''GalNAcβ'''-Galβ-Glcβ-Cer
|
{| style="width:100%"
|-
|style="border:0;text-align:left"| {{#volatile:ListMol/LBS|Ganglio|Mainchain.*GalNAcb1-4Galb1-4Glcb1-Cer}}
|style="border:0;text-align:right"| {{#invoke:LBS|FormatSugar|GalNAcb1-4Galb1-4Glcb1-Cer}}
|-
|style="border:0;text-align:left"| {{#volatile:ListMol/LBS|Isoganglio|Mainchain.*GalNAcb1-3Galb1-4Glcb1-Cer}}<ref name="iso">In IUPAC, "iso" refers to a change from position 4 to position 3.</ref>
|style="border:0;text-align:right"| {{#invoke:LBS|FormatSugar|GalNAcb1-3Galb1-4Glcb1-Cer}}
|-
|style="border:0;text-align:left"| {{#volatile:ListMol/LBS|Lactoganglio|Structure.*GlcNAcb1-3$.*GalNAcb1-4$Galb1-4Glcb1-Cer}}
|style="border:0;text-align:right"| {{#invoke:LBS|FormatSugar|GlcNAcb1-3(GalNAcb1-4)Galb1-4Glcb1-Cer}}
|-
|style="border:0;text-align:left"| {{#volatile:ListMol/LBS|a-series|Structure.*$?NeuAca2-3$?Galb1-4Glcb1-Cer}}
|style="border:0;text-align:right"| {{#invoke:LBS|FormatSugar|GalNAcb1-4(NeuAca2-3)Galb1-4Glcb1-Cer}}
|-
|style="border:0;text-align:left"| {{#volatile:ListMol/LBS|b-series|Structure.*$?NeuAca2-8NeuAca2-3$?Galb1-4Glcb1-Cer}}
|style="border:0;text-align:right"| {{#invoke:LBS|FormatSugar|GalNAcb1-4(NeuAca2-8NeuAca2-3)Galb1-4Glcb1-Cer}}
|-
|style="border:0;text-align:left"| {{#volatile:ListMol/LBS|c-series|Structure.*$?NeuAca2-8NeuAca2-8NeuAca2-3$?Galb1-4Glcb1-Cer}}
|style="border:0;text-align:right"| {{#invoke:LBS|FormatSugar|GalNAcb1-4(NeuAca2-8NeuAca2-8NeuAca2-3)Galb1-4Glcb1-Cer}}
|-
|style="border:0;text-align:left"| {{#volatile:ListMol/LBS|α-series|Structure.*$?NeuAca2-6$?GalNAcb1-4Galb1-4Glcb1-Cer}}
|style="border:0;text-align:right"| {{#invoke:LBS|FormatSugar|...(NeuAca2-6)GalNAcb1-4Galb1-4Glcb1-Cer}}
|-
|style="border:0;text-align:left"| {{#volatile:ListMol/LBS|β-series|Structure.*$?NeuAca2-8NeuAca2-6$?GalNAcb1-4Galb1-4Glcb1-Cer}}
|style="border:0;text-align:right"| {{#invoke:LBS|FormatSugar|...(NeuAca2-8NeuAca2-6)GalNAcb1-4Galb1-4Glcb1-Cer}}
|}
|-
| {{#volatile:ListMol/LBStitle|G3|LBSG3}} ({{#volatile:ClassMatrix|{{#countTitle:LBSG3}} items|LBSG3.....|7|8|9|9|Number_of_Sugars|Number_of_Sialic_acids}})
|style="text-align:right"| '''GlcNAcβ'''-Galβ-Glcβ-Cer
|
{| style="width:100%"
|-
|style="border:0;text-align:left"| {{#volatile:ListMol/LBS|Lacto|Mainchain.*Galb1-3GlcNAcb1-3Galb1-4Glcb1-Cer}}
|style="border:0;text-align:right"| {{#invoke:LBS|FormatSugar|Galb1-3GlcNAcb1-3Galb1-4Glcb1-Cer}}
|-
|style="border:0;text-align:left"| {{#volatile:ListMol/LBS|Neolacto|Mainchain.*Gal.1-4GlcNAcb1-3Galb1-4Glcb1-Cer}}<ref name="neo">In IUPAC, "neo" refers to a change from position 3 to position 4.</ref>
|style="border:0;text-align:right"| {{#invoke:LBS|FormatSugar|Galb1-4GlcNAcb1-3Galb1-4Glcb1-Cer}}
|}
|-
| {{#volatile:ListMol/LBStitle|G4|LBSG4}} ({{#volatile:ClassMatrix|{{#countTitle:LBSG4}} items|LBSG4.....|7|8|9|9|Number_of_Sugars|Number_of_Sialic_acids}})
|style="text-align:right"| '''Galα'''-Galβ-Glcβ-Cer
|
{| style="width:100%"
|-
|style="border:0;text-align:left"| {{#volatile:ListMol/LBS|Globo|Mainchain.*Gala1-4Galb1-4Glcb1-Cer}}
|style="border:0;text-align:right"| {{#invoke:LBS|FormatSugar|Gala1-4Galb1-4Glcb1-Cer}}
|-
|style="border:0;text-align:left"| {{#volatile:ListMol/LBS|Isoglobo|Mainchain.*Gala1-3Galb1-4Glcb1-Cer}}<ref name="iso"/>
|style="border:0;text-align:right"| {{#invoke:LBS|FormatSugar|Gala1-3Galb1-4Glcb1-Cer}}
|}
|-
| {{#volatile:ListMol/LBStitle|G5|LBSG5}} ({{#volatile:ClassMatrix|{{#countTitle:LBSG5}} items|LBSG5.....|7|8|9|9|Number_of_Sugars|Number_of_Sialic_acids}})
|style="text-align:right"| Gal-Glc-Cer (Other than G2&sim;G4)
|
{| style="width:100%"
|style="border:0;text-align:left"| {{#volatile:ListMol/LBS|Muco|Mainchain.*Galb1-4Galb1-4Glcb1-Cer}}
|style="border:0;text-align:right"| {{#invoke:LBS|FormatSugar|Galb1-4Galb1-4Glcb1-Cer}}
|}
|-
| {{#volatile:ListMol/LBStitle|G6|LBSG6}} ({{#volatile:ClassMatrix|{{#countTitle:LBSG6}} items|LBSG6.....|7|8|9|9|Number_of_Sugars|Number_of_Sialic_acids}})
|style="text-align:right"| '''Man'''-Glcβ-Cer
|
{| style="width:100%"
|style="border:0;text-align:left"| {{#volatile:ListMol/LBS|Arthro|Mainchain.*GlcNAcb1-3Manb1-4Glcb1-Cer}}
|style="border:0;text-align:right"| {{#invoke:LBS|FormatSugar|GlcNAcb1-3Manb1-4Glcb1-Cer}}
|-
|style="border:0;text-align:left"| {{#volatile:ListMol/LBS|Mollu|Mainchain.*Mana1-3Manb1-4Glcb1-Cer}}
|style="border:0;text-align:right"| {{#invoke:LBS|FormatSugar|Mana1-3Manb1-4Glcb1-Cer}}
|}
|-
| {{#volatile:ListMol/LBStitle|G7|LBSG7}} ({{#volatile:ClassMatrix|{{#countTitle:LBSG7}} items|LBSG7.....|7|8|9|9|Number_of_Sugars|Number_of_Sialic_acids}})
|style="text-align:right"| '''NeuAc'''/'''NeuGc'''-Glcβ-Cer
|
{| style="width:100%"
|style="border:0;text-align:left"| {{#volatile:ListMol/LBS|Echino|Mainchain.*Neu(A~G)c.2-6Glcb1-Cer}}
|style="border:0;text-align:right"| '''NeuGc''' or {{#invoke:LBS|FormatSugar|NeuAca2-6Glcb1-Cer}}
|}
|-
| {{#volatile:ListMol/LBStitle|G8|LBSG8}} ({{#volatile:ClassMatrix|{{#countTitle:LBSG8}} items|LBSG8.....|7|8|9|9|Number_of_Sugars|Number_of_Sialic_acids}})
|style="text-align:right"| '''GalNAc'''-Glc-Cer
|
{| style="width:100%"
|style="border:0;text-align:left"| {{#volatile:ListMol/LBS|Schisto|Mainchain.*GalNAc.1-4Glc.1-Cer}}<ref>Makaaru CK, Damian RT, Smith DF, Cummings RD. "The human blood fluke Schistosoma mansoni synthesizes a novel type of glycosphingolipid" J Biol Chem 1992 267:2251-2257 PMID 1733932</ref>
|style="border:0;text-align:right"| {{#invoke:LBS|FormatSugar|GalNAcb1-4Glcb1-Cer}}
|}
|-
! starting with <big>Other Sugars</big>
| {{#volatile:ListMol/LBStitle|G(A&sim;R)|LBSG(A~B~C~D~E~F~G~H~J~K~M~N~O~P~Q~R)}}
|colspan="2"| Symbols follow the Sugar-digit table.
|}
<references/>

==={{Bilingual|スフィンゴリン脂質１文字目|First (s1) Digit for Phosphosphingolipid}}===
{| class="wikitable" style="text-align:right; background-color:white"
! First sugar || Code || Root sequence
!colspan="2"| Major Series
|-
! No Sugar Attached
| '''P1''' ([[:Category:LBSP|LBSP]])
| R-P-Cer
| Sphingomyelin and Ceramide phosphoetanolamine (Visit [[:Category:LBSP|this page]].)
|-
! rowspan="4" | starting with <big>Inositol</big>
| {{#volatile:ListMol/LBStitle|P2|LBSP2}} ({{#countTitle:LBSP2}} items)
| style="text-align:right"| '''GlcN'''α/β1−2/6Ins1-P-Cer
|
{|style="width:100%"
|style="border:0;text-align:left"| {{#volatile:ListMol/LBS|Protozoa & Fungi-specific|Mainchain.*GlcN.1-.Ins-P-Cer}}
| style="border:0;text-align:right"| {{#invoke:LBS|FormatSugar|GlcNa/b1-2/6Ins1-P-Cer}}
|}
|-
| {{#volatile:ListMol/LBStitle|P3|LBSP3}} ({{#countTitle:LBSP3}} items)
|style="text-align:right"| '''GlcA'''α/β1−2/6Ins1-P-Cer
|
{|style="width:100%"
|style="border:0;text-align:left"| {{#volatile:ListMol/LBS|Plant-specific|Mainchain.*GlcA.1-.Ins-P-Cer}}
|style="border:0;text-align:right"| {{#invoke:LBS|FormatSugar|GlcAa/b1-2/6Ins1-P-Cer}}
|}
|-
| {{#volatile:ListMol/LBStitle|P4|LBSP4}} ({{#countTitle:LBSP4}} items)
| style="text-align:right"| '''Man'''α/β1−2/6Ins1-P-Cer
|
{| style="width:100%"
| style="border:0;text-align:left"| {{#volatile:ListMol/LBS|Fungi-specific|Mainchain.*Man.1-.Ins-P-Cer}}
| style="border:0;text-align:right"| {{#invoke:LBS|FormatSugar|Mana/b1-2/6Ins1-P-Cer}}
|}
|-
| {{#volatile:ListMol/LBStitle|P5|LBSP5}} ({{#countTitle:LBSP5}} items)
| style="text-align:right"| Gal, Glc, and Others
| style="text-align:right"| {{#invoke:LBS|FormatSugar|X-Ins1-P-Cer}}
|}

==={{Bilingual|コード２文字目|Second (s2) Digit}}===

{{Bilingual|クリックすると一覧が出ます。記号の略称については|Click to see the full list. For abbreviations, see}} [[#Notation]].

{|
|-
| valign="top"|
{| class="wikitable"
|-
! Code || Structure
|-
! '''A'''
| Glc [[File:LBS-Monomer-Glc.png]]
|-
! '''B'''
| Gal [[File:LBS-Monomer-Gal.png]]
|-
! '''C'''
| GlcNAc [[File:LBS-Monomer-GlcNAc.png]]
|-
! '''D'''
| GalNAc [[File:LBS-Monomer-GalNAc.png]]
|-
! '''E'''
| GlcN [[File:LBS-Monomer-GlcN.png]]
|-
! '''F'''
| GalN [[File:LBS-Monomer-GalN.png]]
|-
! '''G'''
| GlcA [[File:LBS-Monomer-GlcA.png]]
|-
! '''H'''
| GalA [[File:LBS-Monomer-GalA.png]]
|-
! '''I'''
| not used
|}
|valign="top"|
{| class="wikitable"
|-
! Code || Structure
|-
! '''J'''
| {{#volatile:ListMol/LBS|Mannose|Structure.*Man}} [[File:LBS-Monomer-Man.png]]
|-
! '''K'''
| {{#volatile:ListMol/LBS|Rhamnose|Structure.*Rha}} [[File:LBS-Monomer-Rha.png]]
|-
! '''L'''
| {{#volatile:ListMol/LBS|Inositol|Structure.*Ins(Me)?-P-[^Cer]}}
|-
! '''M'''
| Fucose ({{#volatile:ListMol/LBS| 1|Structure[^F]+Fuc[^F]+$}}, {{#volatile:ListMol/LBS|2|Structure([^F]+Fuc){2}[^F]+$}}, {{#volatile:ListMol/LBS|>3|Structure([^F]+Fuc){3} }}) [[File:LBS-Monomer-Fuc.png]]
|-
! '''N'''
| {{#volatile:ListMol/LBS|Arabinose|Structure.*Ara}} [[File:LBS-Monomer-Ara.png]]
|-
! '''O'''
| {{#volatile:ListMol/LBS|Xylose|Structure.*Xyl}} [[File:LBS-Monomer-Xyl.png]]
|-
! '''P'''
| {{#volatile:ListMol/LBS|NeuAc / NeuNH|Structure.*(NeuAc~NeuNH)}} [[File:LBS-Monomer-NeuAc.png]]
|-
! '''Q'''
| {{#volatile:ListMol/LBS|NeuGc|Structure.*(NeuGc)}} [[File:LBS-Monomer-NeuGc.png]]
|-
! '''R'''
| {{#volatile:ListMol/LBS|Kdn|Structure.*(KDN)}} [[File:LBS-Monomer-KDN.png]]
|}
|valign="top"|
{| class="wikitable"
|-
! Code || Structure
|-
! '''S'''
| {{#volatile:ListMol/LBS|Phosphate (except GIPC)|Structure.*(Phospho)}} [[File:LBS-Monomer-P.png]]
|-
! '''T'''
| {{#volatile:ListMol/LBS|(M)AEPn|Structure.*(AEPn)}}, {{#volatile:ListMol/LBS|EtnP|Structure.*(EtnP)}}, {{#volatile:ListMol/LBS|PC|Structure.*(PC)}} [[File:LBS-Monomer-AEPn.png]]
|-
! '''U'''
| {{#volatile:ListMol/LBS|Sulfate|Structure.*Sulfo}} [[File:LBS-Monomer-S.png]]
|-
! '''V'''
| acyl/alkyl/alkenyl chain [[File:LBS-Monomer-Alkyl.png]]
|}

=={{Bilingual|生合成|Biosynthesis}}==
{{Twocolumn|
Sphingosine is synthesized from decarboxylating condensation of palmitoyl CoA with serine on the ER membrane. It is a 18-carbon amino alcohol (16 carbons from palmitic acid and 2 from serine) with one unsaturated bond (trans-form) at the C-4 position (2-amino-4-octadecene-1,3-diol). ([[:Category:LBS/Biosynthesis|more details]])
|
スフィンゴシンはパルミトイルCoAがアミノ酸セリンと脱炭酸縮合して生成します。炭素を18個含むアミノアルコール(16個がパルミチン酸、2個がセリン由来)でトランス型の不飽和結合をC-4に1つ含みます。（[[:Category:LBS/Biosynthesis|詳細はこちら]]）
}}

==={{Bilingual|スフィンゴ脂質の歴史|History of Sphingolipids}}===
{{Twocolumn|
Sphingolipids were first isolated from brain by J.L.W. Thudichum (1829-1901) as lipids of unknown function and structure.<ref>Thudichum J.L.W.?"A Treatise on the Chemical Constitution of the Balliere" Tindall and Cox, London,?1884</ref> The basic structure is a long-chain base (long-chain amino-alcohol) whose amino-group is acylated with a long-chain fatty acid. This hydrophobic structure is called ceramides.
Sphingolipid consists of phospho-sphingolipid and glyco-sphingolipid, whose ceramide structure is bonded with phosphate and (oligo)saccharides, respectively. Phosphosphingolipid includes sphingomyelin, and glycosphingolipid, cerebrosides and gangliosides. Both are abundant in neural tissues.<ref>Gault CR,?Obeid LM,?Hannun YA "An overview of sphingolipid synthesis to breakdown" Adv Exp Med Biol.?2010;688:1-23. PMID 20919643</ref>
|
スフィンゴ脂質は J.L.W. Thudichum (1829-1901) により機能や構造未知の脂質として脳から見いだされました。基本骨格は長鎖塩基 (長鎖アミノアルコール) のアミノ基が長鎖脂肪酸とアミド結合したもので、セラミドと呼ばれます。
スフィンゴ脂質はセラミドにリン酸が結合したスフィンゴリン脂質と糖が結合したスフィンゴ糖脂質に分けられます。スフィンゴリン脂質にはスフィンゴミエリンが、スフィンゴ糖脂質にはセレブロシドやガングリオシドなどが含まれ、いずれも神経系に多く存在します。
}}

<references/>

Category:LBSC

2023-05-18T05:12:50Z

Editor: /* Galactosylceramide (GalCer) */

Cerebroside
{{LB/Header}}
{{Hierarchy|{{PAGENAME}}}}
{|
|{{LBS/Cer|O-Glucose}} GlcCer
|{{LBS/Cer|O-Galactose}} GalCer
|-
|colspan=2|
{{Twocolumn|
Monoglycosylceramides (or cerebrosides) are glycosphingolipids where a single sugar is attached to the ceramide structure. Especially, glucopyranose-attached Glucosylceramide (GlcCer) and galactopyranose-attached Galactosylceramide (GalCer) are widely observed in all kingdoms.
GlcCer and GalCer are not registered in LipidBank. Instead, we summarize their distribution with bibliographic references with species information.

|
モノグリコシルセラミド (またはセレブロシド) はセラミドに糖が1個エステル結合したスフィンゴ糖脂質です。特にグルコース（ピラノース型）がβ結合したグルコシルセラミド (GlcCer) とガラクトース（ピラノース型）がβ結合したガラクトシルセラミド (GalCer) は生物界に広く分布します。データベース中には掲載せず、ここに解説と生物種ごとの報告例を掲載します。
}}
|}

==Glucosylceramide (GlcCer)==

{{Twocolumn|
GlcCer is widely observed not only in Animal, Plant or Fungi kingdoms, but also in Protozoa Kingdom<ref>Tan RX, Chen JH. "The cerebrosides" Nat Prod Rep. 2003;20:509-34.PMID 14620845, Yu R.K. Yanagisawa M. Ariga T. Glycosphingolipid Structures,in Comprehensive Glycoscience Vol.1,pp. 73-122,doi 10.1016/B978-044451967-2/00003-9, Itonori S, Sugita M. Glycophylogenetic Aspects of Lower Animals. in Comprehensive Glycoscience Vol.3, pp. 253-84, doi 10.1016/B978-044451967-2/00050-7 (J.P. Kamerling, ed.) Elsevier, Oxford (UK). (2007)</ref>. Ceramide structures (hydrocarbon chain length, the number and position of double bonds, existence of hydroxy and other modification groups) may vary, and become complex especially in Plant and Fungi Kingdoms, and Protostomia <ref>Sphingoid base chain may terminate with an isopropyl group in spongia, annelida, echinodermata, and bacteria. Terminal isobutyl or sec-pentyl group has been found only in echinodermata. Methylated or cyclopropane-containing sphingoid base is found in spongia, echinodermata, protochordata, and fungi.</ref>.
In Animal Kingdom, GlcCer is the basic structure for different derivative series such as Globo, Lacto, and Ganglio Series. In Protostomia, GlcCer is the major ceramide in its nerve tissue, e.g. shrimp brain <ref>Okamura N, Stoskopf M, Hendricks F, Kishimoto Y. "Phylogenetic dichotomy of nerve glycosphingolipids" Proc Natl Acad Sci, 1985 82:6779-6782 PMID 3863128 </ref>, and its amide-linked fatty acids do not contain hydroxy groups. GlcCer in plants contains many α-hydroxy fatty acids. In some cold-resistant plants ω9-unsaturated fatty acids are detected. In Mammalia (of Deuterostomia), GlcCer is major in the spleen, blood, and skin.

Gaucher's disease is an inborn metabolic disorder in which GlcCer accumulates in the liver and spleen because of the deficiency of the enzyme glucocerebrosidase to dissociate glucose from the ceramide structure <ref> Brady RO, Kanfer JN, Shapiro D. "Metabolism of glucocerebrosides. II. Evidence of an enzymatic deficiency in Gaucher's desease" Biochem Biophys Res Commun. 1965;18:221-5 PMID 14282020 </ref>.
|
'''GlcCer'''は系統発生的にみると動物の各組織に広く分布するだけでなく、植物界や菌界、原生生物界にも含まれます。セラミド構造（炭化水素の鎖長、二重結合の数と位置、水酸基の有無、修飾基の有無など）の組み合わせは多岐にわたり、特に植物界や菌界、旧口動物のセラミドは複雑です。動物界において、GlcCerはさまざまな糖鎖を持つ糖脂質の基本構造になり、グロボ系列、ラクト系列、ガングリオ系列などが生成されます。旧口（前口）動物の神経系にはGlcCerが多く含まれ（例えばエビ）、セラミド骨格の脂肪酸に水酸基を含みません。対して、植物は α-水酸化の脂肪酸が多く、耐冷性植物の一部からは ω9-不飽和の脂肪酸も見いだされます。後口動物の哺乳綱において、GlcCerは、脾臓、血液、皮膚などに多く含まれます。

先天性代謝異常症であるゴーシェ (Gaucher) 病は、GlcCerを分解するグルコセレブロシダーゼが欠損し、肝臓や脾臓にGlcCerが蓄積して発症します。
}}

==Galactosylceramide (GalCer)==
{{Twocolumn|
GalCer has been observed in Eubacterial Domain, but not in Protozoa, Plant, or Fungi (except Ascomycota). It is widely observed in Animal Kingdom, but not in Ecdysozoa (cuticle-shedding animals) of Protostomia. Its ceramide structure differs widely as in GlcCer but not so complex as GlcCer in Plant and Fungi. GalCer is the basic structure for sulfatide (3-O-sulfogalactosylceramide or SM4) and Gala Series often found in Annelida (segmented worm). In Mammalia (of Deuterostomia), GalCer is major in the nerve tissue, especially myelin sheath, whose amido-linked fatty acids are hydroxylated at the C-2 position for more than 50%.

Krabbe disease (globoid cell leukodystrophy) is an inborn metabolic disorder in which a small amount of psychosine (galactosylsphingosine, i.e., the lyso form of GalCer) induces demyelination because of the deficiency of the enzyme galactosylceramidase <ref>Suzuki K. "Globoid cell leukodystrophy (Krabbe's disease): update" J Child Neurol. 2003;18:595-603.PMID 14572137, Suzuki K. "Evolving concept of the pathogenesis of globoid cell leukodystrophy (Krabbe disease)" Proc Jpn Acad Ser B Phys Biol Sci 2003; 79:1-8</ref>. α-GalCer, found from Porifera (marine sponge), in which galactose is α-bonded to ceramide (not the usual β-bond), uniquely binds to human or mouse NKT cells and is considered a potent anti-tumor agent.<ref>Kitamura H, Iwakabe K, Yahata T, Nishimura S, Ohta A, Ohmi Y, Sato M, Takeda K, Okumura K, Van Kaer L, Kawano T, Taniguchi M, Nishimura T. "The natural killer T (NKT) cell ligand alpha-galactosylceramide demonstrates its immunopotentiating effect by inducing interleukin (IL)-12 production by dendritic cells and IL-12 receptor expression on NKT cells" J Exp Med. 1999; 5;189(7):1121-8. PMID 10190903 </ref> Recently, α-linked GlcCer and GalCer were reported in NKT cells in trace amount<ref>Kain L et al. "The Identification of the Endogenous Ligands of Natural Killer T Cells Reveals the Presence of Mammalian α-Linked Glycosylceramides" Immunity 41(4), 543-554, 2014 PMID 25367571</ref>.

'''GalCer'''は真正細菌に存在しますが、原生生物界、植物界、菌界（子嚢菌を除く）では報告がありません。動物界に広く分布しますが旧口動物である脱皮動物には確認されていません。セラミド構造は、GlcCerと同様に多様ですが、植物や菌類のGlcCerほど複雑ではありません。GalCerはスルファチド (3-O-硫酸化ガラクトシルセラミドまたはSM4) や環形動物門に多く含まれるガラ系列の基本構造です。
後口動物である哺乳綱では神経系、特にミエリン鞘にGalCerが多く含まれ、その脂肪酸の50%以上は、C2位が水酸化されています。

クラッベ病（グロボイド細胞ロイコジストロフィー; GLD）はガラクトシルセラミダーゼの欠損により微量のサイコシン（ガラクトシルスフィンゴシン、つまり GalCer のリゾ体）が蓄積して脱髄（ミエリンの破壊）を起こす遺伝性疾患です。また、海綿動物門に発見されたα-GalCerは、ガラクトースがセラミドに（通常のβでなく）α結合しており、ヒトやマウスのナチュラルキラーT (NKT) 細胞に特異的に結合し抗腫瘍効果がみられます。α結合型の GlcCer および GalCer はNKT細胞に微量に存在します。
}}

<references/>

==Cerebrosides in Mammals==

====Lipids in Heart Muscle====

{| class="wikitable collapsible collapsed"
|-
!
! Lipid (% wet weight)
! Phospholipid (% dry weight)
! Phosphatidylethanolamine PE (% dry weight)
! Phosphatidylcholine PC (% dry weight)
! Sphingomyelin (% dry weight)
! '''Cerebroside''' (% dry weight)
! Total cholesterol (% dry weight)
|-
! Human
| 8.3
| 6.3 - 7.5
| 1.4 - 2.8
| 3.3 - 5.7
| 0.2 - 0.5
| -
| -
|-
! Cow
| 3.1 - 19.5
| 7.4 - 11.8
| 5.3
| 4
| 0.5
| 2
| 0.4 (free)
|-
! Rat
| 0.4 - 2.4
| 5 - 8
| 0.84 (% wet)
| 2 (% wet)
| 0.14 (% wet)
| 1.4
| 0.4 - 0.6
|-
|colspan="8"|生化学データブック[I] 14. 臓器・組織の成分、心臓　脂質 p1636 1981 日本生化学会編　東京化学同人　ISBN 978-4-807901-74-6
|}

====Lipids in Rat Testis====
{| class="wikitable collapsible collapsed"
|-
! Fraction
! Total Lipid (mg/mg protein)
! Phosphate (ug/mg protein)
! Phospholipid (% total lipid)
! Neutral Lipid (% total lipid)
! '''Cerebroside''' (% total lipid)
! Sulfated glycolipid (nmol/g total weight)
|-
! Total testis
| 0.40
| 62.88
| 62.9
| 34.6
| 2.5
| 556 ± 34
|-
! Golgi
| 1.26
| 18.49
| 58.3
| 39.4
| 2.3
| -
|-
! Remnant granule
| 0.60
| 19.67
| 29.5
| 68.0
| 2.5
| -
|-
! Microsome
| 0.63
| 53.21
| 83.8
| 14.5
| 1.7
| -
|-
! Lipid corpuscle
| > 19
| 12
| 1.5
| 98.5
| -
| -
|-
|colspan="7"| Keenan TW et al. "Lipid composition of subcellular fractions from rat testis"Biochim Biophys Acta 1972; 270:433-443, PMID 4340988 Suzuki A et al. "Decrease of seminolipid content in the testes of rats with vitamin A deficiency determined by high performance liquid chromatography"J Biochem 1977; 82:461-7 PMID 91479
|}

====Cerebroside and Sulfatide Ratio in Animal Brain ====

{| class="wikitable sortable collapsible collapsed"
|-
! Animal
! Kerasin (GalCer with straight fatty-acyl chain)
! Phrenosin (GalCer with hydroxy fatty-acyl chain)
! Sulfatide
|-
! Human cinerea (gray matter)
| 25
| 52
| 23
|-
! Human alba (white matter)
| 28
| 47
| 25
|-
! Cow cinerea
| 15
| 56
| 29
|-
! Cow alba
| 35
| 48
| 17
|-
! Dog
| 21
| 57
| 22
|-
! Cat
| 21
| 60
| 19
|-
! Mouse (4 weeks)
| 24
| 56
| 20
|-
! Rat (10 days)
| 35
| 42
| 23
|-
! Rat (35 days)
| 21
| 61
| 18
|-
! Rabbit
| 13
| 66
| 21
|-
! Guinea pig
| 28
| 54
| 18
|-
! Sheep
| 27
| 47
| 26
|-
! Chicken
| 44
| 37
| 19
|-
! Tuna
| 50
| 25
| 25
|-
! Shark
| 44
| 24
| 32
|-
| colspan="4" | (weight %) From: Yamakawa T, Nishimura S. "Cerebroside composition in animal brain" Jpn J Exp 1966; 36:101-2 PMID 5297247
|}

====Fatty acid composition of bovine brains====

{| class="wikitable sortable collapsible collapsed"
|-
!colspan="5"| Nonhydroxy fatty acid (adjusted GC peak %)
!colspan="3"| Hydroxy fatty acid
|-
! fatty acid || Ceramide || Sphingomyelin || Cerebroside || Sulfatide || fatty acid || Cerebroside || Sulfatide
|-
|12:0
|colspan="4"| - || 12h:0 || 0.4 || 0.3
|-
|13:0
|colspan="4"| - || 13h:0 || 0.2 || 0.2
|-
| 14:0 || 0.6 || 0.3 || 0.2 || 0.8 || 14h:0 || 0.8 || 3.9
|-
| 15:0 || 0.2 || 0.1 || tr. || 0.3 || 15h:0 || tr. || 0.3
|-
| 16:0 || 4.5 || 5.9 || 3.5 || 4.1 || 16h:0 || 0.1 || 0.7
|-
| 16:1 || 0.4 || tr. || 0.1 || 0.7 || 16h:1 || tr. || 1.7
|-
| 17:0 || tr. || 0.3 || tr. || tr. || 17h:0 || 0.2 || 0.9
|-
| 18:0 || 35.2 || 40.1 || 5.8 || 3.3 || 18h:0 || 16.2 || 12.3
|-
| 18:1 || 2.1 || 0.7 || 2.7 || 5.2 || 18h:1 || - || -
|-
| 19:0 || 0.1 || 0.1 || 0.2 || 0.3 || 19h:0 || 0.4 || 0.3
|-
| 20:0 || 1.0 || 0.4 || 0.6 || 0.3 || 20h:0 || 0.5 || 0.7
|-
| 20:1 || 0.5 || tr. || 0.3 || 0.4 || 20h:1 || - || -
|-
| 21:0 || tr. || tr. || - || - || 21h:1 || - || -
|-
| 22:0 || 3.3 || 3.5 || 3.6 || 3.5 || 22h:0 || 5.8 || 7.7
|-
| 22:1 || 0.5 || 0.6 || 0.6 || 0.6 || 22h:1 || - || -
|-
| 23:0 || 3.7 || 2.8 || 5.2 || 3.1 || 23h:0 || 8.9 || 6.5
|-
| 23:1 || 1.0 || 1.0 || 1.2 || 0.8 || 23h:1 || - || -
|-
| 24:0 || 9.8 || 10.7 || 17.4 || 17.8 || 24h:0 || 30.1 || 26.0
|-
| 24:1 || 18.4 || 24.6 || 39.3 || 39.5 || 24h:1 || 14.6 || 16.7
|-
| 25:0 || 1.4 || 1.5 || 3.6 || 2.2 || 25h:0 || 7.0 || 4.5
|-
| 25:1 || 3.0 || 3.3 || 6.2 || 5.2 || 25h:1 || 3.0 || 2.8
|-
| 26:0 || 2.3 || 0.6 || 1.7 || 2.3 || 26h:0 || 3.9 || 3.8
|-
| 26:1 || 3.6 || 2.6 || 7.6 || 8.5 || 26h:1 || 6.3 || 6.5
|-
| 27:0 || 2.9 || - || - || - || 27h:0 || - || -
|-
| 27:1 || 1.8 || - || tr. || - || 27h:1 || - || -
|-
|colspan="8"| From: O'Brien JS, Rouser G "The fatty acid composition of brain sphingolipids: sphingomyelin, ceramide, cerebroside, and cerebroside sulfate"J Lipid Res1964; 5:339-342.PMID 5873370 Per cent of FA of each column. No PUFA, trace amount of hydroxy FA in ceramide, no hydroxy FA in sphingomyelin. The total ratio of nonhydroxy to hydroxy acids in cerebroside and sulfatide were 42:58 and 77:23, respectively (77:13 in the original paper). Human brain has a similar composition.
|}

==Sphingolipids in All Kingdoms==

{{:Category:ScientificClassification/LBSC}}

==Biosynthesis==

{{Twocolumn|
In Mammalia, GlcCer is synthesized by ceramide glucosyltransferase (CGlcT) at the cytosolic membrane of the Golgi apparatus, and GalCer is synthesized by ceramide galactosyltransferase (CGalT) at the lumen of the endoplasmic reticulum (ER). These enzymes do not share any sequence similarity and CGlcT possesses its transmembrane region at the N-terminal (type III) whereas CGalT possesses it at the C-terminal (type I).<ref>Sprong H, Degroote S, Nilsson T, Kawakita M, Ishida N, van der Sluijs P, van Meer G "Association of the Golgi UDP-galactose transporter with UDP-galactose:ceramide galactosyltransferase allows UDP-galactose import in the endoplasmic reticulum" Mol Biol Cell. 2003;4:3482-93　PMID 12925779</ref>
|
哺乳動物では、ゴルジ装置の細胞質側に局在するグルコシルセラミド合成酵素（CGlcT）によって GlcCer が、小胞体の内腔側に局在するガラクトシルセラミド合成酵素（CGalT）によって GalCer が作られます。これらの酵素は配列相同性が無く、CGlcT は膜貫通領域が N 末端側（III型酵素）、CGalT は C 末端側（I型酵素）です。
}}

{| class="wikitable" style="text-align:center"
|-
!
! GlcCer || GalCer
|-
! Enzyme
| CGlcT (EC 2.4.1.80)
| CGalT (EC 2.4.1.45)
|-
! Reaction
| Ceramide + UDP-glucose → GlcCer + UDP
| Ceramide + UDP-galactose → GalCer + UDP
|-
! Location
| '''Golgi (outside)''' → flipflop → Golgi (inside)
| '''ER lumen'''
|}

{{Twocolumn|
Since all glycolipid synthesizing enzymes (except for CGlcT and CGalT) reside at the lumen of the Golgi apparatus, GlcCer must be flip-flopped from the cytosolic side to the lumen by an eyzyme called flippase.
To synthesize GalCer, UDP-galactose and ceramide must transport the ER membrane. UDP-galactose transporter 2 (UGT2) is considered to be responsible.

GalT can also work on glycerolipid, and synthsizes sulfated glyceroglycolipid in mammalian testis, called seminolipid.
|
CGlcT, CGalT 以外の糖脂質合成酵素はゴルジ装置の内腔側にあり、GlcCer はゴルジ膜の細胞質側から内腔側にフリッパーゼと呼ばれる酵素で移動（フリップフロップ）します。GalCer の場合は、UDPガラクトースとセラミドが小胞体膜を通過します。UDPガラクトーストランスポータ2 (UGT2) が関与するようです。

CGalTはグリセロ脂質にも作用し、精巣の硫酸化グリセロ糖脂質であるセミノリピドも合成します。
}}

<references/>

Category:LBSC

2023-05-18T05:11:20Z

Editor: /* Galactosylceramide (GalCer) */

Cerebroside
{{LB/Header}}
{{Hierarchy|{{PAGENAME}}}}
{|
|{{LBS/Cer|O-Glucose}} GlcCer
|{{LBS/Cer|O-Galactose}} GalCer
|-
|colspan=2|
{{Twocolumn|
Monoglycosylceramides (or cerebrosides) are glycosphingolipids where a single sugar is attached to the ceramide structure. Especially, glucopyranose-attached Glucosylceramide (GlcCer) and galactopyranose-attached Galactosylceramide (GalCer) are widely observed in all kingdoms.
GlcCer and GalCer are not registered in LipidBank. Instead, we summarize their distribution with bibliographic references with species information.

|
モノグリコシルセラミド (またはセレブロシド) はセラミドに糖が1個エステル結合したスフィンゴ糖脂質です。特にグルコース（ピラノース型）がβ結合したグルコシルセラミド (GlcCer) とガラクトース（ピラノース型）がβ結合したガラクトシルセラミド (GalCer) は生物界に広く分布します。データベース中には掲載せず、ここに解説と生物種ごとの報告例を掲載します。
}}
|}

==Glucosylceramide (GlcCer)==

{{Twocolumn|
GlcCer is widely observed not only in Animal, Plant or Fungi kingdoms, but also in Protozoa Kingdom<ref>Tan RX, Chen JH. "The cerebrosides" Nat Prod Rep. 2003;20:509-34.PMID 14620845, Yu R.K. Yanagisawa M. Ariga T. Glycosphingolipid Structures,in Comprehensive Glycoscience Vol.1,pp. 73-122,doi 10.1016/B978-044451967-2/00003-9, Itonori S, Sugita M. Glycophylogenetic Aspects of Lower Animals. in Comprehensive Glycoscience Vol.3, pp. 253-84, doi 10.1016/B978-044451967-2/00050-7 (J.P. Kamerling, ed.) Elsevier, Oxford (UK). (2007)</ref>. Ceramide structures (hydrocarbon chain length, the number and position of double bonds, existence of hydroxy and other modification groups) may vary, and become complex especially in Plant and Fungi Kingdoms, and Protostomia <ref>Sphingoid base chain may terminate with an isopropyl group in spongia, annelida, echinodermata, and bacteria. Terminal isobutyl or sec-pentyl group has been found only in echinodermata. Methylated or cyclopropane-containing sphingoid base is found in spongia, echinodermata, protochordata, and fungi.</ref>.
In Animal Kingdom, GlcCer is the basic structure for different derivative series such as Globo, Lacto, and Ganglio Series. In Protostomia, GlcCer is the major ceramide in its nerve tissue, e.g. shrimp brain <ref>Okamura N, Stoskopf M, Hendricks F, Kishimoto Y. "Phylogenetic dichotomy of nerve glycosphingolipids" Proc Natl Acad Sci, 1985 82:6779-6782 PMID 3863128 </ref>, and its amide-linked fatty acids do not contain hydroxy groups. GlcCer in plants contains many α-hydroxy fatty acids. In some cold-resistant plants ω9-unsaturated fatty acids are detected. In Mammalia (of Deuterostomia), GlcCer is major in the spleen, blood, and skin.

Gaucher's disease is an inborn metabolic disorder in which GlcCer accumulates in the liver and spleen because of the deficiency of the enzyme glucocerebrosidase to dissociate glucose from the ceramide structure <ref> Brady RO, Kanfer JN, Shapiro D. "Metabolism of glucocerebrosides. II. Evidence of an enzymatic deficiency in Gaucher's desease" Biochem Biophys Res Commun. 1965;18:221-5 PMID 14282020 </ref>.
|
'''GlcCer'''は系統発生的にみると動物の各組織に広く分布するだけでなく、植物界や菌界、原生生物界にも含まれます。セラミド構造（炭化水素の鎖長、二重結合の数と位置、水酸基の有無、修飾基の有無など）の組み合わせは多岐にわたり、特に植物界や菌界、旧口動物のセラミドは複雑です。動物界において、GlcCerはさまざまな糖鎖を持つ糖脂質の基本構造になり、グロボ系列、ラクト系列、ガングリオ系列などが生成されます。旧口（前口）動物の神経系にはGlcCerが多く含まれ（例えばエビ）、セラミド骨格の脂肪酸に水酸基を含みません。対して、植物は α-水酸化の脂肪酸が多く、耐冷性植物の一部からは ω9-不飽和の脂肪酸も見いだされます。後口動物の哺乳綱において、GlcCerは、脾臓、血液、皮膚などに多く含まれます。

先天性代謝異常症であるゴーシェ (Gaucher) 病は、GlcCerを分解するグルコセレブロシダーゼが欠損し、肝臓や脾臓にGlcCerが蓄積して発症します。
}}

==Galactosylceramide (GalCer)==
{{Twocolumn|
GalCer has been observed in Eubacterial Domain, but not in Protozoa, Plant, or Fungi (except Ascomycota). It is widely observed in Animal Kingdom, but not in Ecdysozoa (cuticle-shedding animals) of Protostomia. Its ceramide structure differs widely as in GlcCer but not so complex as GlcCer in Plant and Fungi. GalCer is the basic structure for sulfatide (3-O-sulfogalactosylceramide or SM4) and Gala Series often found in Annelida (segmented worm). In Mammalia (of Deuterostomia), GalCer is major in the nerve tissue, especially myelin sheath, whose amido-linked fatty acids are hydroxylated at the C-2 position for more than 50%.

Krabbe disease (globoid cell leukodystrophy) is an inborn metabolic disorder in which a small amount of psychosine (galactosylsphingosine, i.e., the lyso form of GalCer) induces demyelination because of the deficiency of the enzyme galactosylceramidase <ref>Suzuki K. "Globoid cell leukodystrophy (Krabbe's disease): update" J Child Neurol. 2003;18:595-603.PMID 14572137, Suzuki K. "Evolving concept of the pathogenesis of globoid cell leukodystrophy (Krabbe disease)" Proc Jpn Acad Ser B Phys Biol Sci 2003; 79:1-8</ref>. α-GalCer, found from Porifera (marine sponge), in which galactose is α-bonded to ceramide (not the usual β-bond), uniquely binds to human or mouse NKT cells and is considered a potent anti-tumor agent.<ref>Kitamura H, Iwakabe K, Yahata T, Nishimura S, Ohta A, Ohmi Y, Sato M, Takeda K, Okumura K, Van Kaer L, Kawano T, Taniguchi M, Nishimura T. "The natural killer T (NKT) cell ligand alpha-galactosylceramide demonstrates its immunopotentiating effect by inducing interleukin (IL)-12 production by dendritic cells and IL-12 receptor expression on NKT cells" J Exp Med. 1999; 5;189(7):1121-8. PMID 10190903 </ref> Recently, α-linked GlcCer and GalCer were reported in NKT cells in trace amount<ref>Kain L et al. Immunity 41(4), 543-554, 2014</ref>.
|
'''GalCer'''は真正細菌に存在しますが、原生生物界、植物界、菌界（子嚢菌を除く）では報告がありません。動物界に広く分布しますが旧口動物である脱皮動物には確認されていません。セラミド構造は、GlcCerと同様に多様ですが、植物や菌類のGlcCerほど複雑ではありません。GalCerはスルファチド (3-O-硫酸化ガラクトシルセラミドまたはSM4) や環形動物門に多く含まれるガラ系列の基本構造です。
後口動物である哺乳綱では神経系、特にミエリン鞘にGalCerが多く含まれ、その脂肪酸の50%以上は、C2位が水酸化されています。

クラッベ病（グロボイド細胞ロイコジストロフィー; GLD）はガラクトシルセラミダーゼの欠損により微量のサイコシン（ガラクトシルスフィンゴシン、つまり GalCer のリゾ体）が蓄積して脱髄（ミエリンの破壊）を起こす遺伝性疾患です。また、海綿動物門に発見されたα-GalCerは、ガラクトースがセラミドに（通常のβでなく）α結合しており、ヒトやマウスのナチュラルキラーT (NKT) 細胞に特異的に結合し抗腫瘍効果がみられます。α結合型の GlcCer および GalCer はNKT細胞に微量に存在します。
}}

<references/>

==Cerebrosides in Mammals==

====Lipids in Heart Muscle====

{| class="wikitable collapsible collapsed"
|-
!
! Lipid (% wet weight)
! Phospholipid (% dry weight)
! Phosphatidylethanolamine PE (% dry weight)
! Phosphatidylcholine PC (% dry weight)
! Sphingomyelin (% dry weight)
! '''Cerebroside''' (% dry weight)
! Total cholesterol (% dry weight)
|-
! Human
| 8.3
| 6.3 - 7.5
| 1.4 - 2.8
| 3.3 - 5.7
| 0.2 - 0.5
| -
| -
|-
! Cow
| 3.1 - 19.5
| 7.4 - 11.8
| 5.3
| 4
| 0.5
| 2
| 0.4 (free)
|-
! Rat
| 0.4 - 2.4
| 5 - 8
| 0.84 (% wet)
| 2 (% wet)
| 0.14 (% wet)
| 1.4
| 0.4 - 0.6
|-
|colspan="8"|生化学データブック[I] 14. 臓器・組織の成分、心臓　脂質 p1636 1981 日本生化学会編　東京化学同人　ISBN 978-4-807901-74-6
|}

====Lipids in Rat Testis====
{| class="wikitable collapsible collapsed"
|-
! Fraction
! Total Lipid (mg/mg protein)
! Phosphate (ug/mg protein)
! Phospholipid (% total lipid)
! Neutral Lipid (% total lipid)
! '''Cerebroside''' (% total lipid)
! Sulfated glycolipid (nmol/g total weight)
|-
! Total testis
| 0.40
| 62.88
| 62.9
| 34.6
| 2.5
| 556 ± 34
|-
! Golgi
| 1.26
| 18.49
| 58.3
| 39.4
| 2.3
| -
|-
! Remnant granule
| 0.60
| 19.67
| 29.5
| 68.0
| 2.5
| -
|-
! Microsome
| 0.63
| 53.21
| 83.8
| 14.5
| 1.7
| -
|-
! Lipid corpuscle
| > 19
| 12
| 1.5
| 98.5
| -
| -
|-
|colspan="7"| Keenan TW et al. "Lipid composition of subcellular fractions from rat testis"Biochim Biophys Acta 1972; 270:433-443, PMID 4340988 Suzuki A et al. "Decrease of seminolipid content in the testes of rats with vitamin A deficiency determined by high performance liquid chromatography"J Biochem 1977; 82:461-7 PMID 91479
|}

====Cerebroside and Sulfatide Ratio in Animal Brain ====

{| class="wikitable sortable collapsible collapsed"
|-
! Animal
! Kerasin (GalCer with straight fatty-acyl chain)
! Phrenosin (GalCer with hydroxy fatty-acyl chain)
! Sulfatide
|-
! Human cinerea (gray matter)
| 25
| 52
| 23
|-
! Human alba (white matter)
| 28
| 47
| 25
|-
! Cow cinerea
| 15
| 56
| 29
|-
! Cow alba
| 35
| 48
| 17
|-
! Dog
| 21
| 57
| 22
|-
! Cat
| 21
| 60
| 19
|-
! Mouse (4 weeks)
| 24
| 56
| 20
|-
! Rat (10 days)
| 35
| 42
| 23
|-
! Rat (35 days)
| 21
| 61
| 18
|-
! Rabbit
| 13
| 66
| 21
|-
! Guinea pig
| 28
| 54
| 18
|-
! Sheep
| 27
| 47
| 26
|-
! Chicken
| 44
| 37
| 19
|-
! Tuna
| 50
| 25
| 25
|-
! Shark
| 44
| 24
| 32
|-
| colspan="4" | (weight %) From: Yamakawa T, Nishimura S. "Cerebroside composition in animal brain" Jpn J Exp 1966; 36:101-2 PMID 5297247
|}

====Fatty acid composition of bovine brains====

{| class="wikitable sortable collapsible collapsed"
|-
!colspan="5"| Nonhydroxy fatty acid (adjusted GC peak %)
!colspan="3"| Hydroxy fatty acid
|-
! fatty acid || Ceramide || Sphingomyelin || Cerebroside || Sulfatide || fatty acid || Cerebroside || Sulfatide
|-
|12:0
|colspan="4"| - || 12h:0 || 0.4 || 0.3
|-
|13:0
|colspan="4"| - || 13h:0 || 0.2 || 0.2
|-
| 14:0 || 0.6 || 0.3 || 0.2 || 0.8 || 14h:0 || 0.8 || 3.9
|-
| 15:0 || 0.2 || 0.1 || tr. || 0.3 || 15h:0 || tr. || 0.3
|-
| 16:0 || 4.5 || 5.9 || 3.5 || 4.1 || 16h:0 || 0.1 || 0.7
|-
| 16:1 || 0.4 || tr. || 0.1 || 0.7 || 16h:1 || tr. || 1.7
|-
| 17:0 || tr. || 0.3 || tr. || tr. || 17h:0 || 0.2 || 0.9
|-
| 18:0 || 35.2 || 40.1 || 5.8 || 3.3 || 18h:0 || 16.2 || 12.3
|-
| 18:1 || 2.1 || 0.7 || 2.7 || 5.2 || 18h:1 || - || -
|-
| 19:0 || 0.1 || 0.1 || 0.2 || 0.3 || 19h:0 || 0.4 || 0.3
|-
| 20:0 || 1.0 || 0.4 || 0.6 || 0.3 || 20h:0 || 0.5 || 0.7
|-
| 20:1 || 0.5 || tr. || 0.3 || 0.4 || 20h:1 || - || -
|-
| 21:0 || tr. || tr. || - || - || 21h:1 || - || -
|-
| 22:0 || 3.3 || 3.5 || 3.6 || 3.5 || 22h:0 || 5.8 || 7.7
|-
| 22:1 || 0.5 || 0.6 || 0.6 || 0.6 || 22h:1 || - || -
|-
| 23:0 || 3.7 || 2.8 || 5.2 || 3.1 || 23h:0 || 8.9 || 6.5
|-
| 23:1 || 1.0 || 1.0 || 1.2 || 0.8 || 23h:1 || - || -
|-
| 24:0 || 9.8 || 10.7 || 17.4 || 17.8 || 24h:0 || 30.1 || 26.0
|-
| 24:1 || 18.4 || 24.6 || 39.3 || 39.5 || 24h:1 || 14.6 || 16.7
|-
| 25:0 || 1.4 || 1.5 || 3.6 || 2.2 || 25h:0 || 7.0 || 4.5
|-
| 25:1 || 3.0 || 3.3 || 6.2 || 5.2 || 25h:1 || 3.0 || 2.8
|-
| 26:0 || 2.3 || 0.6 || 1.7 || 2.3 || 26h:0 || 3.9 || 3.8
|-
| 26:1 || 3.6 || 2.6 || 7.6 || 8.5 || 26h:1 || 6.3 || 6.5
|-
| 27:0 || 2.9 || - || - || - || 27h:0 || - || -
|-
| 27:1 || 1.8 || - || tr. || - || 27h:1 || - || -
|-
|colspan="8"| From: O'Brien JS, Rouser G "The fatty acid composition of brain sphingolipids: sphingomyelin, ceramide, cerebroside, and cerebroside sulfate"J Lipid Res1964; 5:339-342.PMID 5873370 Per cent of FA of each column. No PUFA, trace amount of hydroxy FA in ceramide, no hydroxy FA in sphingomyelin. The total ratio of nonhydroxy to hydroxy acids in cerebroside and sulfatide were 42:58 and 77:23, respectively (77:13 in the original paper). Human brain has a similar composition.
|}

==Sphingolipids in All Kingdoms==

{{:Category:ScientificClassification/LBSC}}

==Biosynthesis==

{{Twocolumn|
In Mammalia, GlcCer is synthesized by ceramide glucosyltransferase (CGlcT) at the cytosolic membrane of the Golgi apparatus, and GalCer is synthesized by ceramide galactosyltransferase (CGalT) at the lumen of the endoplasmic reticulum (ER). These enzymes do not share any sequence similarity and CGlcT possesses its transmembrane region at the N-terminal (type III) whereas CGalT possesses it at the C-terminal (type I).<ref>Sprong H, Degroote S, Nilsson T, Kawakita M, Ishida N, van der Sluijs P, van Meer G "Association of the Golgi UDP-galactose transporter with UDP-galactose:ceramide galactosyltransferase allows UDP-galactose import in the endoplasmic reticulum" Mol Biol Cell. 2003;4:3482-93　PMID 12925779</ref>
|
哺乳動物では、ゴルジ装置の細胞質側に局在するグルコシルセラミド合成酵素（CGlcT）によって GlcCer が、小胞体の内腔側に局在するガラクトシルセラミド合成酵素（CGalT）によって GalCer が作られます。これらの酵素は配列相同性が無く、CGlcT は膜貫通領域が N 末端側（III型酵素）、CGalT は C 末端側（I型酵素）です。
}}

{| class="wikitable" style="text-align:center"
|-
!
! GlcCer || GalCer
|-
! Enzyme
| CGlcT (EC 2.4.1.80)
| CGalT (EC 2.4.1.45)
|-
! Reaction
| Ceramide + UDP-glucose → GlcCer + UDP
| Ceramide + UDP-galactose → GalCer + UDP
|-
! Location
| '''Golgi (outside)''' → flipflop → Golgi (inside)
| '''ER lumen'''
|}

{{Twocolumn|
Since all glycolipid synthesizing enzymes (except for CGlcT and CGalT) reside at the lumen of the Golgi apparatus, GlcCer must be flip-flopped from the cytosolic side to the lumen by an eyzyme called flippase.
To synthesize GalCer, UDP-galactose and ceramide must transport the ER membrane. UDP-galactose transporter 2 (UGT2) is considered to be responsible.

GalT can also work on glycerolipid, and synthsizes sulfated glyceroglycolipid in mammalian testis, called seminolipid.
|
CGlcT, CGalT 以外の糖脂質合成酵素はゴルジ装置の内腔側にあり、GlcCer はゴルジ膜の細胞質側から内腔側にフリッパーゼと呼ばれる酵素で移動（フリップフロップ）します。GalCer の場合は、UDPガラクトースとセラミドが小胞体膜を通過します。UDPガラクトーストランスポータ2 (UGT2) が関与するようです。

CGalTはグリセロ脂質にも作用し、精巣の硫酸化グリセロ糖脂質であるセミノリピドも合成します。
}}

<references/>