Category:LBGAC - Revision history

Adm: /* {{Bilingual|カルドアーキオール|Caldarchaeol}} */

2013-07-18T06:28:54Z

← Older revision		Revision as of 15:28, 18 July 2013
Line 6:		Line 6:
	\|Caldarchaeol is glyceroldialkylglycerol tetraether (GDGT), i.e., two isopranyl chains of C40 are ether-attached to two glycerols at both ends. Its stereochemical configuration is usually symmetric but its regioisomer (isocaldarchaeol) coexists to some extent.		\|Caldarchaeol is glyceroldialkylglycerol tetraether (GDGT), i.e., two isopranyl chains of C40 are ether-attached to two glycerols at both ends. Its stereochemical configuration is usually symmetric but its regioisomer (isocaldarchaeol) coexists to some extent.

	In ''Sulfolobus'', methyl groups in the isopranyl chains may form cyclopentanes, and the number of cyclopentanes was found to increase as the growth temperature increases. The same effect was also observed in ''Thermoplasma'' <ref>Shimada et al. (2008) J Bacteriol 190, 5404 PMID 18539746</ref> but not in ''Candidatus Nitrososphaera gargensis.'' <ref>Pitcher A et al. (2010) ISME J 4, 542 [http://dx.doi.org/10.1038/ismej.2009.138 DOI]</ref> The existence of crenarchaeol ~~or pH may be related with~~ the ring synthesis.		In ''Sulfolobus'', methyl groups in the isopranyl chains may form cyclopentanes, and the number of cyclopentanes was found to increase as the growth temperature increases. The same effect was also observed in ''Thermoplasma'' <ref>Shimada et al. (2008) J Bacteriol 190, 5404 PMID 18539746</ref> but not in ''Candidatus Nitrososphaera gargensis.'' <ref>Pitcher A et al. (2010) ISME J 4, 542 [http://dx.doi.org/10.1038/ismej.2009.138 DOI]</ref> The existence of [[:Category:LBGAD\|crenarchaeol]] also suggests that the ring synthesis is not a direct consequence of high temperature.

	\|カルドアーキオールはグリセロジアルキルグリセロール　テトラエーテル（GDGT）のことで、二本のC40イソプラン鎖が両側でグリセロールにエーテル結合しています。通常は左右対称な結合様式ですが、グリセロールの向きが反転したイソ体も存在します。		\|カルドアーキオールはグリセロジアルキルグリセロール　テトラエーテル（GDGT）のことで、二本のC40イソプラン鎖が両側でグリセロールにエーテル結合しています。通常は左右対称な結合様式ですが、グリセロールの向きが反転したイソ体も存在します。

	イソプラン鎖のメチル基が複数の五員環を構成することが知られ、''Sulfolobus''では生育温度を上げると五員環の数も増えることが知られています。同様の効果は''Thermoplasma''でも観測されましたが、''Candidatus Nitrososphaera gargensis'' では観測されていません。		イソプラン鎖のメチル基が複数の五員環を構成することが知られ、''Sulfolobus''では生育温度を上げると五員環の数も増えることが知られています。同様の効果は''Thermoplasma''でも観測されましたが、''Candidatus Nitrososphaera gargensis'' では観測されていません。
	~~クレンアーキオールの存在や生育環境の pH が環の生成に関与しているのかもしれません。~~		[[:Category:LBGAD\|クレンアーキオール]]の存在も環構造の生成が単なる温度依存でないことを示しています。
	}}		}}

Adm at 05:06, 10 July 2013

2013-07-10T05:06:47Z

← Older revision		Revision as of 14:06, 10 July 2013
Line 35:		Line 35:
	}}		}}
	\|}		\|}

			=List=
			{{LBGA/GroupTable\|LBGAC}}

Adm: /* Subtype */

2013-07-10T03:58:53Z

Subtype

← Older revision		Revision as of 12:58, 10 July 2013
Line 26:		Line 26:
	}}		}}
	\|-		\|-
	\|~~[[File:EEL3006.png\|300px]]~~		\|
	:[[File:Arrow00r35.png]] [[File:LBGAC_4ring.png\|250px]]		:[[File:Arrow00r35.png]] [[File:LBGAC_4ring.png\|250px]]
	::[[File:Arrow00r35.png]] [[File:LBGAC_8ring.png\|250px]]		::[[File:Arrow00r35.png]] [[File:LBGAC_8ring.png\|250px]]

Adm at 01:44, 10 July 2013

2013-07-10T01:44:15Z

← Older revision		Revision as of 10:44, 10 July 2013
Line 35:		Line 35:
	}}		}}
	\|}		\|}

	~~=List=~~
	~~{{ListMol\|LBGAC}}~~

Adm at 01:39, 10 July 2013

2013-07-10T01:39:48Z

← Older revision		Revision as of 10:39, 10 July 2013
Line 13:		Line 13:
	クレンアーキオールの存在や生育環境の pH が環の生成に関与しているのかもしれません。		クレンアーキオールの存在や生育環境の pH が環の生成に関与しているのかもしれません。
	}}		}}

			<references/>

			==Subtype==
	{\|		{\|
			\|-
			!Caldarchaeol (GDGT) [[Image:LBGAC.png]]<br/>
			Isocaldarchaeol [[Image:LBGAI.png]]
			\|{{Twocolumn
			\|A geometric isomer of caldarchaeol where the alkanediols connect sn-2 and sn-2 (and sn-3 and sn-3) positions. [[Reference:Graether O:Arigoni D:,J. Chem. Soc. Chem. Commun.,1995,4,405\|Gräther et al.]] first found this regioisomer in ''Methanothermobacter marburgensis''. It was also found in ''Thermoplasma acidophilum'' and ''Sulfolobus solfataricus''.
			\|片方のグリセロールがCaldarchaeolと向きの違う異性体。Gräther らが''Methanothermobacter marburgensis''より見つけ、''Thermoplasma acidophilum'' や ''Sulfolobus solfataricus'' でも確認されました。
			}}
			\|-
	\|[[File:EEL3006.png\|300px]]		\|[[File:EEL3006.png\|300px]]
	:[[File:Arrow00r35.png]] [[File:LBGAC_4ring.png\|250px]]		:[[File:Arrow00r35.png]] [[File:LBGAC_4ring.png\|250px]]
	::[[File:Arrow00r35.png]] [[File:LBGAC_8ring.png\|250px]]		::[[File:Arrow00r35.png]] [[File:LBGAC_8ring.png\|250px]]
	\|		\| '''Caldarchaeol with cyclopentanes'''
	{{Twocolumn		{{Twocolumn
	\|The biosynthesis starts from the core lipid with no cyclopentane, and the number of cyclopentanes increases one by one up to eight. The composition depends on the species and their culture conditions, and we do not register the ring variations within the same species in this database.		\|The biosynthesis starts from the core lipid with no cyclopentane, and the number of cyclopentanes increases one by one up to eight. The composition depends on the species and their culture conditions, and we do not register the ring variations within the same species in this database.
Line 23:		Line 35:
	}}		}}
	\|}		\|}

	~~<references/>~~

	=List=		=List=
	{{ListMol\|LBGAC}}		{{ListMol\|LBGAC}}

Adm: /* {{Bilingual|カルドアーキオール|Caldarchaeol}} */

2013-07-08T02:04:52Z

← Older revision		Revision as of 11:04, 8 July 2013
Line 26:		Line 26:
	<references/>		<references/>

	==List==		=List=
	{{ListMol\|LBGAC}}		{{ListMol\|LBGAC}}

Adm at 02:04, 8 July 2013

2013-07-08T02:04:19Z

← Older revision		Revision as of 11:04, 8 July 2013
Line 1:		Line 1:
	{{#def:LANG\|{{#getenv:LANG}}}}		{{#def:LANG\|{{#getenv:LANG}}}}
	~~{{Huge\|~~{{Bilingual\|カルドアーキオール\|Caldarchaeol}}}}		={{Bilingual\|カルドアーキオール\|Caldarchaeol}}=
	{{Hierarchy\|{{PAGENAME}}}}		{{Hierarchy\|{{PAGENAME}}}}

Adm at 01:41, 8 July 2013

2013-07-08T01:41:09Z

← Older revision		Revision as of 10:41, 8 July 2013
Line 6:		Line 6:
	\|Caldarchaeol is glyceroldialkylglycerol tetraether (GDGT), i.e., two isopranyl chains of C40 are ether-attached to two glycerols at both ends. Its stereochemical configuration is usually symmetric but its regioisomer (isocaldarchaeol) coexists to some extent.		\|Caldarchaeol is glyceroldialkylglycerol tetraether (GDGT), i.e., two isopranyl chains of C40 are ether-attached to two glycerols at both ends. Its stereochemical configuration is usually symmetric but its regioisomer (isocaldarchaeol) coexists to some extent.

	In ''Sulfolobus'', methyl groups in the isopranyl chains may form cyclopentanes, and the number of cyclopentanes was found to increase as the growth temperature increases. The same effect was observed in ''Thermoplasma''.<ref>Shimada et al. (2008) J Bacteriol 190, 5404 PMID 18539746</ref>		In ''Sulfolobus'', methyl groups in the isopranyl chains may form cyclopentanes, and the number of cyclopentanes was found to increase as the growth temperature increases. The same effect was also observed in ''Thermoplasma'' <ref>Shimada et al. (2008) J Bacteriol 190, 5404 PMID 18539746</ref> but not in ''Candidatus Nitrososphaera gargensis.'' <ref>Pitcher A et al. (2010) ISME J 4, 542 [http://dx.doi.org/10.1038/ismej.2009.138 DOI]</ref> The existence of crenarchaeol or pH may be related with the ring synthesis.

	\|カルドアーキオールはグリセロジアルキルグリセロール　テトラエーテル（GDGT）のことで、二本のC40イソプラン鎖が両側でグリセロールにエーテル結合しています。通常は左右対称な結合様式ですが、グリセロールの向きが反転したイソ体も存在します。		\|カルドアーキオールはグリセロジアルキルグリセロール　テトラエーテル（GDGT）のことで、二本のC40イソプラン鎖が両側でグリセロールにエーテル結合しています。通常は左右対称な結合様式ですが、グリセロールの向きが反転したイソ体も存在します。

	イソプラン鎖のメチル基が複数の五員環を構成することが知られ、''Sulfolobus''~~では生育温度を上げると五員環の数も増えることが知られています。同様の効果が~~''Thermoplasma''~~でも観測されています。~~		イソプラン鎖のメチル基が複数の五員環を構成することが知られ、''Sulfolobus''では生育温度を上げると五員環の数も増えることが知られています。同様の効果は''Thermoplasma''でも観測されましたが、''Candidatus Nitrososphaera gargensis'' では観測されていません。
			クレンアーキオールの存在や生育環境の pH が環の生成に関与しているのかもしれません。
	}}		}}
	{\|		{\|
	\|[[File:EEL3006.png\|300px]]		\|[[File:EEL3006.png\|300px]]
	:[[File:Arrow00r35.png]] [[File:LBGAC_4ring.png\|~~300px~~]]		:[[File:Arrow00r35.png]] [[File:LBGAC_4ring.png\|250px]]
	::::[[File:Arrow00r35.png]] [[File:LBGAC_8ring.png\|~~300px~~]]		::[[File:Arrow00r35.png]] [[File:LBGAC_8ring.png\|250px]]
	\|~~このデータベースでは五員環数のバリエーションは個別の構造して登録していません。~~		\|
			{{Twocolumn
			\|The biosynthesis starts from the core lipid with no cyclopentane, and the number of cyclopentanes increases one by one up to eight. The composition depends on the species and their culture conditions, and we do not register the ring variations within the same species in this database.
			\|生合成はコア構造である五員環の無いタイプから、１つずつ環を増やして 8 個含むものまでが存在します。それらの組成は生物種や培養条件にも依存するので、このデータベースでは五員環数のバリエーションを個別に登録していません。
			}}
	\|}		\|}

Adm at 03:16, 5 July 2013

2013-07-05T03:16:02Z

← Older revision		Revision as of 12:16, 5 July 2013
Line 16:		Line 16:
	::::[[File:Arrow00r35.png]] [[File:LBGAC_8ring.png\|300px]]		::::[[File:Arrow00r35.png]] [[File:LBGAC_8ring.png\|300px]]
	\|このデータベースでは五員環数のバリエーションは個別の構造して登録していません。		\|このデータベースでは五員環数のバリエーションは個別の構造して登録していません。
	}}		\|}

	<references/>		<references/>

Adm: Created page with "{{#def:LANG|{{#getenv:LANG}}}} {{Huge|{{Bilingual|カルドアーキオール|Caldarchaeol}}}} {{Hierarchy|{{PAGENAME}}}} {{Twocolumn |Caldarchaeol is glyceroldialkylglycerol..."

2013-07-05T03:15:28Z

Created page with "{{#def:LANG|{{#getenv:LANG}}}} {{Huge|{{Bilingual|カルドアーキオール|Caldarchaeol}}}} {{Hierarchy|{{PAGENAME}}}} {{Twocolumn |Caldarchaeol is glyceroldialkylglycerol..."

New page

{{#def:LANG|{{#getenv:LANG}}}}
{{Huge|{{Bilingual|カルドアーキオール|Caldarchaeol}}}}
{{Hierarchy|{{PAGENAME}}}}

{{Twocolumn
|Caldarchaeol is glyceroldialkylglycerol tetraether (GDGT), i.e., two isopranyl chains of C40 are ether-attached to two glycerols at both ends. Its stereochemical configuration is usually symmetric but its regioisomer (isocaldarchaeol) coexists to some extent.

In ''Sulfolobus'', methyl groups in the isopranyl chains may form cyclopentanes, and the number of cyclopentanes was found to increase as the growth temperature increases. The same effect was observed in ''Thermoplasma''.<ref>Shimada et al. (2008) J Bacteriol 190, 5404 PMID 18539746</ref>
|カルドアーキオールはグリセロジアルキルグリセロール　テトラエーテル（GDGT）のことで、二本のC40イソプラン鎖が両側でグリセロールにエーテル結合しています。通常は左右対称な結合様式ですが、グリセロールの向きが反転したイソ体も存在します。

イソプラン鎖のメチル基が複数の五員環を構成することが知られ、''Sulfolobus''では生育温度を上げると五員環の数も増えることが知られています。同様の効果が''Thermoplasma''でも観測されています。
}}
{|
|[[File:EEL3006.png|300px]]
:[[File:Arrow00r35.png]] [[File:LBGAC_4ring.png|300px]]
::::[[File:Arrow00r35.png]] [[File:LBGAC_8ring.png|300px]]
|このデータベースでは五員環数のバリエーションは個別の構造して登録していません。
}}

<references/>

==List==
{{ListMol|LBGAC}}