MediaWiki:LipoqualitySearch.js - Revision history

Jcblmaster at 01:43, 23 March 2020

2020-03-23T01:43:25Z

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Jcblmaster at 04:55, 20 January 2020

2020-01-20T04:55:46Z

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Jcblmaster at 04:42, 20 January 2020

2020-01-20T04:42:50Z

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Jcblmaster at 01:56, 20 January 2020

2020-01-20T01:56:40Z

← Older revision		Revision as of 10:56, 20 January 2020
Line 1:		Line 1:
	// Last-update: 2020/01/07		// Last-update: 2020/01/20
	// 対象項目からデータを検索する ////////////////////////////////////////////////////////		// 対象項目からデータを検索する ////////////////////////////////////////////////////////
	// param sampleSource - sample source		// param sampleSource - sample source
Line 39:		Line 39:
	if(found){		if(found){
	result[i] = [];		result[i] = [];
	result[i]["title"] = key + " / " + gAllData[key][j]["Sample name"] + " / " + /gAllData[key][j]["SampleType"] + " / " +/ lipidClass;		result[i]["title"] = key + " / " + gAllData[key][j]["Sample name"] + " / " + /gAllData[key][j]["SampleType"] + " / " +/ lipidClass + " / " + gAllData[key][j]["ID"];
	result[i]["Method link"] = gAllData[key][j]["Method link"];		result[i]["Method link"] = gAllData[key][j]["Method link"];
	i ++;		i ++;
Line 70:		Line 70:
	// var sampleType = w[2];		// var sampleType = w[2];
	var lipidclass = w[2];		var lipidclass = w[2];
			var uniqid = w[3];

	result.map[index] = {}; // 通常チャート用		result.map[index] = {}; // 通常チャート用
Line 81:		Line 82:
	for(var j = 0; j < gAllData[key].length; j ++){ // sample category		for(var j = 0; j < gAllData[key].length; j ++){ // sample category
	if(sampleName != gAllData[key][j]["Sample name"])		if(sampleName != gAllData[key][j]["Sample name"])
			continue;
			if(uniqid != gAllData[key][j]["ID"])
	continue;		continue;
	// if(sampleType != gAllData[key][j]["SampleType"])		// if(sampleType != gAllData[key][j]["SampleType"])
Line 116:		Line 119:

	if(lc == lipidclass){ // lipid classが対象のものなら、通常チャート用にデータを格納する		if(lc == lipidclass){ // lipid classが対象のものなら、通常チャート用にデータを格納する
	result.map[index].title = sampleCategory + " / " + sampleName + " / "/* + sampleType + "/"*/ + lipidclass;		result.map[index].title = sampleCategory + " / " + sampleName + " / "/* + sampleType + "/"*/ + lipidclass + " / " + uniqid;
	result.map[index].meta = {};		result.map[index].meta = {};
	for(meta in gAllData[key][j]){// 全メタ情報		for(meta in gAllData[key][j]){// 全メタ情報

Jcblmaster at 03:54, 7 January 2020

2020-01-07T03:54:27Z

← Older revision		Revision as of 12:54, 7 January 2020
Line 1:		Line 1:
	// Last-update: 2020/01/05		// Last-update: 2020/01/07
	// 対象項目からデータを検索する ////////////////////////////////////////////////////////		// 対象項目からデータを検索する ////////////////////////////////////////////////////////
	// param sampleSource - sample source		// param sampleSource - sample source
Line 238:		Line 238:
	{		{
	// sample sourceとsample typeはAllがあるため、正規表現を用いてマッチングを行う		// sample sourceとsample typeはAllがあるため、正規表現を用いてマッチングを行う
	// var ssReg = new RegExp(translateForReg(samplesource));		var ssReg = new RegExp(translateForReg(samplesource));
	// var stReg = new RegExp(translateForReg(sampletype));		var stReg = new RegExp(translateForReg(sampletype));
	var snReg = new RegExp(translateForReg(samplename), "i");		// var snReg = new RegExp(translateForReg(samplename), "i");

	var result = {};		var result = {};
Line 258:		Line 258:
	quantification = "";		quantification = "";
	for(key in gAllData){		for(key in gAllData){
	// if(!ssReg.test(key)) // sample sourceが合致するか		if(!ssReg.test(key)) // sample sourceが合致するか
	// continue;		continue;

	for(var j = 0; j < gAllData[key].length; j ++){		for(var j = 0; j < gAllData[key].length; j ++){
	// if(!~~stReg~~.test(gAllData[key][j]["Sample name"])) // ~~sample typeが合致するか~~		if(!stReg.test(gAllData[key][j]["Sample name"])) // sample typeが合致するか
			continue;
			// if(!snReg.test(gAllData[key][j]["Sample name"])) // samplenameが合致するか
	// continue;		// continue;
	~~if(!snReg.test(gAllData[key][j]["Sample name"])) // samplenameが合致するか~~
	~~continue;~~

	// 特定のlipid class, lipid chainのみを対象とする		// 特定のlipid class, lipid chainのみを対象とする
Line 285:		Line 284:
	legend = gAllData[key][j]["SampleType"];		legend = gAllData[key][j]["SampleType"];
	else*/		else*/
	legend = gAllData[key][j]["~~Category~~"];		legend = gAllData[key][j]["Sample name"];

	if(!legends[legend] && lipidType == chain){ // legend名が複数回被る可能性があるので、すでに格納済みのlegendは処理しない		if(!legends[legend] && lipidType == chain){ // legend名が複数回被る可能性があるので、すでに格納済みのlegendは処理しない
Line 295:		Line 294:

	if(quantification.length == 0)		if(quantification.length == 0)
	quantification = gAllData[key][j]["Quantification"];		quantification = gAllData[key][j]["Quantification unit"];
	else if(quantification != gAllData[key][j]["Quantification"])		else if(quantification != gAllData[key][j]["Quantification unit"])
	quantification = "?";		quantification = "?";

Line 318:		Line 317:
	function getLipidType(array)		function getLipidType(array)
	{		{
	~~return~~ array["Total chain"];		// SN1からSN4までのchainを連結させる
			var lipidType = array["SN1 chain"];
			for(var l = 2; l <= 4; l ++){
			if(array["SN" + l + " chain"].length > 0)
			lipidType += "/" + array["SN" + l + " chain"];
			else
			break;
			}
			// SN1が空だった場合はTotalChainを使用する
			if(lipidType.length == 0)
			lipidType = array["Total chain"];
			return lipidType;
	}		}

Jcblmaster at 06:21, 6 January 2020

2020-01-06T06:21:07Z

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Jcblmaster at 00:47, 1 November 2018

2018-11-01T00:47:41Z

← Older revision		Revision as of 09:47, 1 November 2018
Line 1:		Line 1:
	// Last-update: 2018/10/30		// Last-update: 2018/11/01
	// 対象項目からデータを検索する ////////////////////////////////////////////////////////		// 対象項目からデータを検索する ////////////////////////////////////////////////////////
	// param sampleSource - sample source		// param sampleSource - sample source
Line 285:		Line 285:
	legend = gAllData[key][j]["Sample type"];		legend = gAllData[key][j]["Sample type"];
	else		else
	legend = ~~key + "/" +~~ gAllData[key][j]["Sample name"];		legend = gAllData[key][j]["Sample name"];

	if(!legends[legend] && lipidType == chain){ // legend名が複数回被る可能性があるので、すでに格納済みのlegendは処理しない		if(!legends[legend] && lipidType == chain){ // legend名が複数回被る可能性があるので、すでに格納済みのlegendは処理しない

Jcblmaster at 02:24, 30 October 2018

2018-10-30T02:24:40Z

← Older revision		Revision as of 11:24, 30 October 2018
Line 1:		Line 1:
	// Last-update: 2018/10/11		// Last-update: 2018/10/30
	// 対象項目からデータを検索する ////////////////////////////////////////////////////////		// 対象項目からデータを検索する ////////////////////////////////////////////////////////
	// param sampleSource - sample source		// param sampleSource - sample source
Line 284:		Line 284:
	else if(gAllData[key][j]["Sample source"] == "Cell")		else if(gAllData[key][j]["Sample source"] == "Cell")
	legend = gAllData[key][j]["Sample type"];		legend = gAllData[key][j]["Sample type"];
			else
			legend = key + "/" + gAllData[key][j]["Sample name"];

	if(!legends[legend] && lipidType == chain){ // legend名が複数回被る可能性があるので、すでに格納済みのlegendは処理しない		if(!legends[legend] && lipidType == chain){ // legend名が複数回被る可能性があるので、すでに格納済みのlegendは処理しない

Jcblmaster at 06:50, 25 October 2018

2018-10-25T06:50:38Z

← Older revision		Revision as of 15:50, 25 October 2018
Line 1:		Line 1:
	// Last-update: 2018/08/01		// Last-update: 2018/10/11
	// 対象項目からデータを検索する ////////////////////////////////////////////////////////		// 対象項目からデータを検索する ////////////////////////////////////////////////////////
	// param sampleSource - sample source		// param sampleSource - sample source
Line 229:		Line 229:
	}		}
	// chainグラフ用データの取得 ///////////////////////////////////////////////		// chainグラフ用データの取得 ///////////////////////////////////////////////
	// param ~~species~~ - ~~species~~		// param samplename - Sample Name
	// param samplesource - Sample Source		// param samplesource - Sample Source
	// param sampletype - Sample Type		// param sampletype - Sample Type
Line 235:		Line 235:
	// param chain - Lipid chain		// param chain - Lipid chain
	// return 対象データ		// return 対象データ
	function retrieveChainData(~~species~~, samplesource, sampletype, lipidclass, chain)		function retrieveChainData(samplename, samplesource, sampletype, lipidclass, chain)
	{		{
	// sample sourceとsample typeはAllがあるため、正規表現を用いてマッチングを行う		// sample sourceとsample typeはAllがあるため、正規表現を用いてマッチングを行う
	// var ssReg = new RegExp(translateForReg(samplesource));		// var ssReg = new RegExp(translateForReg(samplesource));
	// var stReg = new RegExp(translateForReg(sampletype));		// var stReg = new RegExp(translateForReg(sampletype));
	var ~~spReg~~ = new RegExp(translateForReg(~~species~~), "i");		var snReg = new RegExp(translateForReg(samplename), "i");

	var result = {};		var result = {};
Line 264:		Line 264:
	// if(!stReg.test(gAllData[key][j]["Sample name"])) // sample typeが合致するか		// if(!stReg.test(gAllData[key][j]["Sample name"])) // sample typeが合致するか
	// continue;		// continue;
	if(!~~spReg~~.test(gAllData[key][j]["Sample source"])) // ~~speciesが合致するか~~		if(!snReg.test(gAllData[key][j]["Sample source"])) // samplenameが合致するか
	continue;		continue;

Jcblmaster at 04:39, 1 August 2018

2018-08-01T04:39:13Z

← Older revision		Revision as of 13:39, 1 August 2018
Line 1:		Line 1:
			// Last-update: 2018/08/01
	// 対象項目からデータを検索する ////////////////////////////////////////////////////////		// 対象項目からデータを検索する ////////////////////////////////////////////////////////
	// param sampleSource - sample source		// param sampleSource - sample source
Line 220:		Line 221:

	// Allはすべてが対象		// Allはすべてが対象
	if(str == "All")		if(str == "All" \|\| str.length == 0)
	str = ".*";		str = ".*";
	else		else
Line 228:		Line 229:
	}		}
	// chainグラフ用データの取得 ///////////////////////////////////////////////		// chainグラフ用データの取得 ///////////////////////////////////////////////
			// param species - species
	// param samplesource - Sample Source		// param samplesource - Sample Source
	// param sampletype - Sample Type		// param sampletype - Sample Type
Line 233:		Line 235:
	// param chain - Lipid chain		// param chain - Lipid chain
	// return 対象データ		// return 対象データ
	function retrieveChainData(samplesource, sampletype, lipidclass, chain)		function retrieveChainData(species, samplesource, sampletype, lipidclass, chain)
	{		{
	// sample sourceとsample typeはAllがあるため、正規表現を用いてマッチングを行う		// sample sourceとsample typeはAllがあるため、正規表現を用いてマッチングを行う
	var ssReg = new RegExp(translateForReg(samplesource));		// var ssReg = new RegExp(translateForReg(samplesource));
	var stReg = new RegExp(translateForReg(sampletype));		// var stReg = new RegExp(translateForReg(sampletype));
			var spReg = new RegExp(translateForReg(species), "i");

	var result = {};		var result = {};
Line 255:		Line 258:
	quantification = "";		quantification = "";
	for(key in gAllData){		for(key in gAllData){
	if(!ssReg.test(key)) // sample sourceが合致するか		// if(!ssReg.test(key)) // sample sourceが合致するか
	continue;		// continue;

	for(var j = 0; j < gAllData[key].length; j ++){		for(var j = 0; j < gAllData[key].length; j ++){
	if(!stReg.test(gAllData[key][j]["Sample name"])) // sample typeが合致するか		// if(!stReg.test(gAllData[key][j]["Sample name"])) // sample typeが合致するか
			// continue;
			if(!spReg.test(gAllData[key][j]["Sample source"])) // speciesが合致するか
	continue;		continue;