View source for Lipidbank wiki:Status2v1.39

動作していないがリストにないページや、対応済みとなっているが表示や動作がおかしいページがあれば、「mediawiki ver1.39への対応状況」やテーブルの「コメント」欄に追記してください。

wikiの書き方に慣れていなければ、この下の「コメント（自由記述）」に追記してください。

==コメント(自由記述)==


==mediawiki ver1.39への対応状況==

* 2023/01/31 要チェックリストを追加(Suwa)、Category:LBGAを再修正(Suwa)、全Volatileの修正が完了(Suwa)
* 2023/01/30 全Cateogryの修正が完了(Suwa)
* 2023/01/26 Cateogry:LBGAを修正(Suwa)
* 2023/01/25 このページを作成(Suwa)

==対応状況==

* 現在、<strong>61/73</strong>(うち7件保留)が完了。
* テーブルヘッダの「対応」セルをクリックして並べ替えることで、対応済み項目だけまとめて表示可能。
{{#def:c|1}}
{| class="wikitable sortable"
|-
! 番号 || ページ || 対応 || 対応内容 || コメント
|-
| {{#var:c}} || [[:Category:LBS/Search]] || 2023/01/25対応 ||・HTMLForm extensionをv1.39に対応<br />・javascriptが動くよう修正<br />・Volatile機能をHTMLFormだけで実現<br />・luaがmediawikiにバンドルされたので、そのluaで動くよう修正<br />・Persistは動かないので、AllChainsへのページリンクだけ表示<br />・Template:LBS/FormatSugarのluaをModule:LBSに移して使用(Template:LBS/FormatSugarは不要)<br />・defTempが使えないため、Template:GetIconを追加・<del><span style="color: red">「Search from Structure」のリンク先(Volatile:ListMol/LBS)にてアイコンが表示されていない問題は未対応<br />・Search from Structureで「&lt;sub&gt;」がそのまま表示されている。</span></del><hr />(追加)Module:LBS, Template:GetIcon<br />(廃止)Template:LBS/FormatSugar || (Category:LBS/Searchのコメントはここに記述)
|-{{#def:c|{{#expr:{{#var:c}}+1}}}}
| {{#var:c}} || [[:Category:LBA]] || 不要 || [[:Category:LBGA]]へのリダイレクトのため || (Category:LBAのコメントはここに記述)
|-{{#def:c|{{#expr:{{#var:c}}+1}}}}
| {{#var:c}} || [[:Category:LBS]] || 2023/01/30対応 ||・luaをModule:LBSにFomatSugar()として移動<br />・volatileの修正<br/ >・volatileの機能修正により、引数をencodeが不要に || (Category:LBSのコメントはここに記述)
|-{{#def:c|{{#expr:{{#var:c}}+1}}}}
| {{#var:c}} || [[:Category:LBGAD]] || 2023/01/30対応 ||・Template:ListMolを修正<br />・Template:FormatNameのluaをModule:Commonに移動<br /><hr />(追加)Module:Common || (Category:LBGADのコメントはここに記述)
|-{{#def:c|{{#expr:{{#var:c}}+1}}}}
| {{#var:c}} || [[:Category:LBGAC]] || 2023/01/30対応 ||・luaをModule:LBGAにGroupTable()として移動 || (Category:LBGACのコメントはここに記述)
|-{{#def:c|{{#expr:{{#var:c}}+1}}}}
| {{#var:c}} || [[:Category:LBGA]] || 2023/01/26対応<br />2023/01/31追加修正 ||・luaプログラムをModule:LBGAに切り分け<br />・<del><span style="color: red">「Species-Structure Relationship」テーブルのリンク先(Volatile:ListMolByReference)は未対応</span></del><br />・volatileの書き方を修正<hr />(追加)Module:LBGA|| (Category:LBGAのコメントはここに記述)
|-{{#def:c|{{#expr:{{#var:c}}+1}}}}
| {{#var:c}} || [[:Category:LBGAA]] || 2023/01/30対応 ||・volatileの書き方を修正 || (Category:LBGAAのコメントはここに記述)
|-{{#def:c|{{#expr:{{#var:c}}+1}}}}
| {{#var:c}} || [[:Category:LBG]] || 2023/01/30対応 ||・volatileの書き方を修正<br />・Template:MapLinkを修正 || (Category:LBGのコメントはここに記述)
|-{{#def:c|{{#expr:{{#var:c}}+1}}}}
| {{#var:c}} || [[:Category:LBF]] || 2023/01/30対応 ||・volatileの書き方を修正 || (Category:LBFのコメントはここに記述)
|-{{#def:c|{{#expr:{{#var:c}}+1}}}}
| {{#var:c}} || [[Volatile:AuthorSummary]] || 2023/01/30対応<br />(グラフのみ保留) ||・luaをModule:AuthorSummaryへ移動<br />・<span style="color:red">グラフ表示はどう対応するか検討</span><hr />(追加)Module:AuthorSummary || (Volatile:AuthorSummaryのコメントはここに記述)
|-{{#def:c|{{#expr:{{#var:c}}+1}}}}
| {{#var:c}} || [[Volatile:ClassMatrix]] || 2023/01/30対応 ||・luaをModule:ClassMatrixへ移動<br />・Template:ClassMatrix/CreateRowのvolatileの書き方を修正<hr />(追加)Module:ClassMatrix || (11のコメントはここに記述)
|-{{#def:c|{{#expr:{{#var:c}}+1}}}}
| {{#var:c}} || [[Volatile:JAS/Genes]] || 2023/01/31対応 ||・volatileの書き方を修正<br />・luaをModule:JASに移動<hr />(追加)Module:JAS || (12のコメントはここに記述)
|-{{#def:c|{{#expr:{{#var:c}}+1}}}}
| {{#var:c}} || [[Volatile:ListField]] || 2023/01/30対応<br /><span style="color:red">動作未確認</span> ||・luaをModule/ListFieldに移動<br />・volatileの書き方を修正<br />(ただし、どこからも呼び出されてないので動作検証できず)<hr />(追加)Module:ListField || (13のコメントはここに記述)
|-{{#def:c|{{#expr:{{#var:c}}+1}}}}
| {{#var:c}} || [[Volatile:ListMol/LBS]] || 2023/01/30対応 || ・<nowiki>{{{1}}}を{{#get:1}}に変更</nowiki><br />・<del><span style="color:red">アイコン画像が表示されるよう対応予定</span></del>|| (14のコメントはここに記述)
|-{{#def:c|{{#expr:{{#var:c}}+1}}}}
| {{#var:c}} || [[Volatile:ListMol/LBStitle]] || 2023/01/30対応 ||・volatileの書き方を修正 || (15のコメントはここに記述)
|-{{#def:c|{{#expr:{{#var:c}}+1}}}}
| {{#var:c}} || [[Volatile:ListMolByField]] || 2023/01/30対応<br /><span style="color:red">動作未確認</span> ||・volatileの書き方を修正<br />(ただし、どこからも呼び出されてないので動作検証できず) || (16のコメントはここに記述)
|-{{#def:c|{{#expr:{{#var:c}}+1}}}}
| {{#var:c}} || [[Volatile:ListMolByReference]] || 2023/01/30対応 ||・luaをModule:CommonにListMolByReference()として移動 || (17のコメントはここに記述)
|-{{#def:c|{{#expr:{{#var:c}}+1}}}}
| {{#var:c}} || [[Volatile:ListPage]] || 2023/01/30対応 ||・volatileの書き方を修正 || (18のコメントはここに記述)
|-{{#def:c|{{#expr:{{#var:c}}+1}}}}
| {{#var:c}} || [[Volatile:ListRef]] || 2023/01/30対応 ||・volatileの書き方を修正 || (19のコメントはここに記述)
|-{{#def:c|{{#expr:{{#var:c}}+1}}}}
| {{#var:c}} || [[Volatile:ListRefOfID]] || 2023/01/31対応 ||・luaをModule:ListRefOfIDに移動<hr />(追加)Module:ListRefOfID || (20のコメントはここに記述)
|-{{#def:c|{{#expr:{{#var:c}}+1}}}}
| {{#var:c}} || [[Volatile:ListStructures]] || 不要 || || (21のコメントはここに記述)
|-{{#def:c|{{#expr:{{#var:c}}+1}}}}
| {{#var:c}} || [[Volatile:ShowField]] || 2023/01/30対応<br />2023/02/01修正 ||・<del>他の修正に連動して完了</del><br />・volatileの書き方を修正 || (22のコメントはここに記述)
|-{{#def:c|{{#expr:{{#var:c}}+1}}}}
| {{#var:c}} || [[Volatile:StructureSearch]] || 2023/01/30対応<br /><span style="color:red">動作未確認</span> ||・volatileの書き方を修正 || (23のコメントはここに記述)
|-{{#def:c|{{#expr:{{#var:c}}+1}}}}
| {{#var:c}} || [[Volatile:VolatileTest]] || 不要 || || (24のコメントはここに記述)
|-{{#def:c|{{#expr:{{#var:c}}+1}}}}
| {{#var:c}} || [[MediaWiki:AdvancedLBSSearch.js]] || 未使用のため保留 || || (25のコメントはここに記述)
|-{{#def:c|{{#expr:{{#var:c}}+1}}}}
| {{#var:c}} || [[MediaWiki:CalculateMass.js]] || 未使用のため保留 || || (26のコメントはここに記述)
|-{{#def:c|{{#expr:{{#var:c}}+1}}}}
| {{#var:c}} || [[MediaWiki:Common.css]] || 2023/01/25対応 || ・volatileリンクの見た目のスタイルを追加 || (27のコメントはここに記述)
|-{{#def:c|{{#expr:{{#var:c}}+1}}}}
| {{#var:c}} || [[MediaWiki:Common.js]] || 2023/01/25対応 || ・現在の構成で動作するよう修正 || (28のコメントはここに記述)
|-{{#def:c|{{#expr:{{#var:c}}+1}}}}
| {{#var:c}} || [[MediaWiki:GlycosphingolipidMassCalculator.js]] || 2023/01/25対応 || ・クラス化して、現在の構成で動作するよう修正 || (29のコメントはここに記述)
|-{{#def:c|{{#expr:{{#var:c}}+1}}}}
| {{#var:c}} || [[MediaWiki:GlyphEditor.js]] || 2023/02/01対応 ||・javascriptを修正(MediaWiki:Common.js, MediaWiki:GlyphEditor.js, Template:GlyphEditor, StructureSearch) || (30のコメントはここに記述)
|-{{#def:c|{{#expr:{{#var:c}}+1}}}}
| {{#var:c}} || [[MediaWiki:GoogleAPI.js]] || 未使用のため保留 || || (31のコメントはここに記述)
|-{{#def:c|{{#expr:{{#var:c}}+1}}}}
| {{#var:c}} || [[MediaWiki:JBrowse.js]] || || || (32のコメントはここに記述)
|-{{#def:c|{{#expr:{{#var:c}}+1}}}}
| {{#var:c}} || [[MediaWiki:LBSSearch.js]] || 2023/01/25対応 || ・クラス化して、現在の構成で動くよう修正 || (33のコメントはここに記述)
|-{{#def:c|{{#expr:{{#var:c}}+1}}}}
| {{#var:c}} || [[MediaWiki:Lipoquality.js]] || 保留 || || (34のコメントはここに記述)
|-{{#def:c|{{#expr:{{#var:c}}+1}}}}
| {{#var:c}} || [[MediaWiki:LipoqualityChart.js]] || 保留 || || (35のコメントはここに記述)
|-{{#def:c|{{#expr:{{#var:c}}+1}}}}
| {{#var:c}} || [[MediaWiki:LipoqualityCommon.js]] || 保留 || || (36のコメントはここに記述)
|-{{#def:c|{{#expr:{{#var:c}}+1}}}}
| {{#var:c}} || [[MediaWiki:LipoqualityGet.js]] || 保留 || || (37のコメントはここに記述)
|-{{#def:c|{{#expr:{{#var:c}}+1}}}}
| {{#var:c}} || [[MediaWiki:LipoqualitySearch.js]] || 保留 || || (38のコメントはここに記述)
|-{{#def:c|{{#expr:{{#var:c}}+1}}}}
| {{#var:c}} || [[MediaWiki:PathwayEditor.js]] || || || (39のコメントはここに記述)
|-{{#def:c|{{#expr:{{#var:c}}+1}}}}
| {{#var:c}} || [[MediaWiki:PathwayEditorHandler.js]] || || || (40のコメントはここに記述)
|-{{#def:c|{{#expr:{{#var:c}}+1}}}}
| {{#var:c}} || [[Template:MapLink]] || 2023/01/30対応 ||・volatileの書き方を修正 || (Template:MapLinのコメントはここに記述)
|-{{#def:c|{{#expr:{{#var:c}}+1}}}}
| {{#var:c}} || [[Template:LBGA/GroupTable]] || 2023/01/30対応 ||・luaをModule:LBGAへ移動 || (Template:LBGA/GroupTableのコメントはここに記述)
|-{{#def:c|{{#expr:{{#var:c}}+1}}}}
| {{#var:c}} || [[Template:Glycolipid/distribution]] || 2023/01/30対応 ||・defTempが使えないため、Template:GetIconを作成<hr />(追加)Template:GetIcon|| (Template:Glycolipid/distributionのコメントはここに記述)
|-{{#def:c|{{#expr:{{#var:c}}+1}}}}
| {{#var:c}} || [[Template:FormatName]] || 2023/01/30対応 ||・luaをModule:Commonに移動 || (Template:FormatNameのコメントはここに記述)
|-{{#def:c|{{#expr:{{#var:c}}+1}}}}
| {{#var:c}} || [[Template:ClassMatrix/CreateRow]] || 2023/01/30対応 ||・volatileの書き方を修正  || (Template:ClassMatrix/CreateRowのコメントはここに記述)
|-{{#def:c|{{#expr:{{#var:c}}+1}}}}
| {{#var:c}} || [[Template:JournalTitle/TableRow3]] || 2023/01/30対応 ||・volatileの書き方を修正 || (Template:JournalTitle/TableRow3のコメントはここに記述)
|-{{#def:c|{{#expr:{{#var:c}}+1}}}}
| {{#var:c}} || [[Template:JAS/MutationStat]] || 2023/01/31対応 ||・luaをModule:JASへ移動 || (Template:JAS/MutationStatのコメントはここに記述)
|-{{#def:c|{{#expr:{{#var:c}}+1}}}}
| {{#var:c}} || [[Template:JAS/AllMutation]] || 2023/01/31対応 ||・luaをModule:JASへ移動 || (Template:JAS/AllMutationのコメントはここに記述)
|-{{#def:c|{{#expr:{{#var:c}}+1}}}}
| {{#var:c}} || [[Template:AuthorSummary]] || 2023/01/31対応 ||・volatileの書き方を修正 || (Template:AuthorSummaryのコメントはここに記述)
|-{{#def:c|{{#expr:{{#var:c}}+1}}}}
| {{#var:c}} || [[Index:LBGA]] || || || (Index:LBGAのコメントはここに記述)
|-{{#def:c|{{#expr:{{#var:c}}+1}}}}
| {{#var:c}} || [[JAS:Home]] || 2023/02/01対応 ||・template:JAS/GeneList/Rowの修正により完了 || (JAS:Homeのコメントはここに記述)
|-{{#def:c|{{#expr:{{#var:c}}+1}}}}
| {{#var:c}} || [[Template:ClassMatrix]] || 2023/01/31対応 ||・luaをModule:ClassMatrixから使用(ただし、初期のテンプレートで、今は使われていないと思われる) || (Template:ClassMatrixのコメントはここに記述)
|-{{#def:c|{{#expr:{{#var:c}}+1}}}}
| {{#var:c}} || [[Template:CountryTable]] || 未使用のため保留 || || (Template:CountryTableのコメントはここに記述)
|-{{#def:c|{{#expr:{{#var:c}}+1}}}}
| {{#var:c}} || [[Template:Glycolipid]] || 2023/02/01対応 ||・volatileの書き方を修正<br />・<span style="color: red"><nowiki>{{#googleapi:}}が各ページに書き込まれているので、あとでダミーを作って非表示にする</nowiki></span> || (Template:Glycolipidのコメントはここに記述)
|-{{#def:c|{{#expr:{{#var:c}}+1}}}}
| {{#var:c}} || [[Template:JAS/GeneList/LinkPage]] || 2023/02/01対応 ||・volatileの書き方を修正 || (Template:JAS/GeneList/LinkPageのコメントはここに記述)
|-{{#def:c|{{#expr:{{#var:c}}+1}}}}
| {{#var:c}} || [[Template:ListAllChains]] || ・2023/02/01対応 ||・luaをModule:ListAllChainsに移動<hr />(追加)Module:ListAllChains || (Template:ListAllChainsのコメントはここに記述)
|-{{#def:c|{{#expr:{{#var:c}}+1}}}}
| {{#var:c}} || [[Template:ListPage]] ||・2023/02/01対応 ||・volatileの書き方を修正 || (Template:ListPageのコメントはここに記述)
|-{{#def:c|{{#expr:{{#var:c}}+1}}}}
| {{#var:c}} || [[Template:Map/Glycerophospholipid]] || 不要 ||・Template:Map/Glycerophospholipid/Expressionの対応により完了 || (Template:Map/Glycerophospholipidのコメントはここに記述)
|-{{#def:c|{{#expr:{{#var:c}}+1}}}}
| {{#var:c}} || [[Template:Map/Glycerophospholipid/Expression]] || 2023/02/02対応 ||・luaでmaxを取得した物を{{#max:}}に変更 || (Template:Map/Glycerophospholipid/Expressionのコメントはここに記述)
|-{{#def:c|{{#expr:{{#var:c}}+1}}}}
| {{#var:c}} || [[Template:Map/Glycerophospholipid/GetValues]] || 不要 ||・Template:Map/Glycerophospholipid/Expressionの対応により完了 || (Template:Map/Glycerophospholipid/GetValuesのコメントはここに記述)
|-{{#def:c|{{#expr:{{#var:c}}+1}}}}
| {{#var:c}} || [[Template:Metabolite]] || || || (Template:Metaboliteのコメントはここに記述)
|-{{#def:c|{{#expr:{{#var:c}}+1}}}}
| {{#var:c}} || [[Template:Reference/AuthorLink]] || || || (Template:Reference/AuthorLinkのコメントはここに記述)
|-{{#def:c|{{#expr:{{#var:c}}+1}}}}
| {{#var:c}} || [[Template:RelationTable]] || 2023/02/01対応 ||・defTempをテンプレートページに移動<hr />(追加)Template:RelationTable/Row2, Template:RelationTable/Row3 || (Template:RelationTableのコメントはここに記述)
|-{{#def:c|{{#expr:{{#var:c}}+1}}}}
| {{#var:c}} || [[Template:TableRow3]] || || || (Template:TableRow3のコメントはここに記述)
|-{{#def:c|{{#expr:{{#var:c}}+1}}}}
| {{#var:c}} || [[Template:TableRow3/Country]] || || || (Template:TableRow3/Countryのコメントはここに記述)
|-{{#def:c|{{#expr:{{#var:c}}+1}}}}
| {{#var:c}} || [[Template:TableRow6/author]] || || || (Template:TableRow6/authorのコメントはここに記述)
|-{{#def:c|{{#expr:{{#var:c}}+1}}}}
| {{#var:c}} || [[Template:TableRow6/authorSub]] || || || (Template:TableRow6/authorSubのコメントはここに記述)
|-{{#def:c|{{#expr:{{#var:c}}+1}}}}
| {{#var:c}} || [[Template:Taguchi/LinkItem]] || || || (Template:Taguchi/LinkItemのコメントはここに記述)
|-{{#def:c|{{#expr:{{#var:c}}+1}}}}
| {{#var:c}} || [[Template:Taguchi/LinkItems]] || || || (Template:Taguchi/LinkItemsのコメントはここに記述)
|-{{#def:c|{{#expr:{{#var:c}}+1}}}}
| {{#var:c}} || [[Template:Toyama/Matrix]] || || || (Template:Toyama/Matrixのコメントはここに記述)
|-{{#def:c|{{#expr:{{#var:c}}+1}}}}
| {{#var:c}} || [[Template:LBS/FormatSugar]] || 2023/02/01対応 ||・luaをModule:LBSから呼び出すよう修正 || (Template:LBS/FormatSugarのコメントはここに記述)
|-{{#def:c|{{#expr:{{#var:c}}+1}}}}
| {{#var:c}} || [[Template:Glycolipid/OldLBLink]] || 2023/02/01対応 ||・httpをhttpsに変更</br />・cgi-binで各ページに飛ばしていたが、現在はカテゴリ毎に一ページになったため、ページへジャンプするよう修正 || (Template:Glycolipid/OldLBLinkのコメントはここに記述)
|-{{#def:c|{{#expr:{{#var:c}}+1}}}}
| {{#var:c}} || [[Template:GlyphEditor]] || 2023/01/31対応 ||・javascriptの呼び出し方を変更 || (Template:GlyphEditorのコメントはここに記述)
|}

==開発用メモ==
* volatileは以下のように記述方法を変更
- リンク元での書き方
 [[volatile:volatileページ|引数群|リンク表示名}}
 ↓
 <nowiki>{{#volatile:volatileページ|リンク表示名|引数1|引数2|...|引数N}}</nowiki>
 
 <nowiki>e.g. {{#volatile:ListMol/LBS|Blood group A|Structure=GalNAca1-3\(Fuca1-2\)Galb1-3GlcNAcb1-3}}</nowiki>
- リンク先での書き方
 {{{1}}}
 ↓
 <nowiki>{{#get:1}}</nowiki>

* luaについて
- luaがmediawikiにバンドルされたので、すぐに使える状態になっている。

- スクリプトはModule名前空間に記述する

- Module名前空間のコンテンツモデルを「Scribunto」に変更する必要がある。

- 基本構文は以下の通り(一番目の引数を返すだけの関数)
 local getArgs = require('Module:Arguments').getArgs; -- 引数を受け取るための機能呼び出し
 local defArgs = require('Module:Arguments').defaultArgs; -- 引数のnil確認からデフォルト引数の処理を行う
 local lbs = {}; -- lbsとしているが、この名前は何でも良い。
 
 function lbs.FormatSugar( frame ) -- 関数を定義
  local args = defArgs(getArgs(frame), 1, ""); -- 引数を取得(defArgs(getArgs(frame), 必要な引数の個数, 引数1のデフォルト値, 引数2のデフォルト値, ...,  引数Nのデフォルト値)
 
   return args[1] -- 出力したい文字列を返す
 end
 
 return lbs; -- 関数定義したモジュールを返す

- 呼び出し方は以下の通り
 <nowiki>{{#invoke:Module名前空間のページ|関数名|引数1|引数2|...|引数3}}</nowiki>
 
 <nowiki>e.g. {{#invoke:LBS|FormatSugar|GalNAca1-3(Fuca1-2)Galb1-3GlcNAcb1-3-R}}</nowiki>

==要対応==
# [[Template:ListRefOfID]] -> Module:ListReOfIDと一緒？

# [[Template:FL digit56]] -> Module:FL_digit
# [[Template:FL digit56with78]]
# [[Template:FL digit78]]

# [[Template:LBFA digit910Table/Row]]
# [[Template:LBF digit910Table]]
# [[Template:LBF digit910Table/Row]]

# [[Template:JCBL/Header]]

==要確認==
# [[Template:Index/author]]
# [[Template:Index/formula]]
# [[Template:Index/mass]]
# [[Template:Index/name]]
# [[Template:Index/persist]]
# [[Template:Percent2Color]]
# [[Template:Search/Checkbox]]

==未使用==
# [[Template:LBS/AbbrevTable/Row]](LBS/FormatSugarを呼び出してる)
# [[Template:EditButton]]
# [[Template:EditButton/CheckList]]
# [[Template:LambdaTest]]

==修正の必要はないが、エラーで表示できない==
# [[Template:List Description/Body]]
# [[Template:List Description/SetAnchor]]
# [[Template:List Image/Body]]
# [[Template:List Image/NameList]]
# [[Template:List Links]]
# [[Template:Metabolite/NameList]]
# [[Template:Metabolite/SpeciesLink]]
# [[Template:Reference/RefAbbrev]]
# [[Template:RelationTable/GetNames]]
# [[Template:TreeClass/ListSpecies]]

==要チェック==
# Lipoquality名前空間