Category:LBG: Difference between revisions

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===Common Abbreviations <small>よく使う略称</small>===
===Common Abbreviations <small>よく使う略称</small>===
{|
{|
|-
| PE || Phosphatidylethanolamine || ホスファチジルエタノールアミン
|-
|-
| PC || PhosphatidylCholine || ホスファチジルコリン
| PC || PhosphatidylCholine || ホスファチジルコリン
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|-
|-
| PI || Phosphatidylinositol || ホスファチジルイノシトール
| PI || Phosphatidylinositol || ホスファチジルイノシトール
|-
| PE || Phosphatidylethanolamine || ホスファチジルエタノールアミン
|}
|}


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</center>
</center>
{{Twocolumn|
{{Twocolumn|
* ''n'' ... number of attached sugars(inositol is counted too, Glyceroglycolipid) or pola head group(Glycerophospholipid)  
* ''n'' ... code of pola head group(Glycerophospholipid) or number of attached sugars(Glyceroglycolipid)
* ''b1'' ... type of binding to Fatty acyl-1(LBF1)
* ''b1'' ... type of binding to Fatty acyl-1(LBF1)
* ''b2'' ... type of binding to Fatty acyl-2(LBF2)
* ''b2'' ... type of binding to Fatty acyl-2(LBF2)
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* ''c2'' ... serial number(LBF2)
* ''c2'' ... serial number(LBF2)
|
|
* ''n'' ... 修飾する糖の個数 (イノシトールも入れる, Glyceroglycolipid) もしくはポーラヘッドグループ(Glycerophospholipid)  
* ''n'' ... ポーラヘッドグループの記号(Glycerophospholipid) 、もしくは修飾する糖の個数 (Glyceroglycolipid)  
* ''b1'' ... 脂肪酸1(LBF1)の結合のタイプ
* ''b1'' ... 脂肪酸1(LBF1)の結合のタイプ
* ''b2'' ... 脂肪酸2(LBF1)の結合のタイプ
* ''b2'' ... 脂肪酸2(LBF1)の結合のタイプ
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==Classification by Chain Length <small>鎖長による分類</small>==
==Classification by pola head group or number of attached sugars <small>ポーラヘッドグループもしくは修飾する糖の個数による分類</small>==
{{Twocolumn|
{{Twocolumn|
Fatty acids are extended by polymerization of malonyl CoA, and have even chain length in general.
There are 2 digit of code of pola head group (Glycerophospholipid) or number of attached sugars (Glyceroglycolipid).
Phosphatidylinositol is treated as Glycerophospholipid.
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脂肪酸はマロニルCoAの重合によって伸張し、通常は炭素数が偶数です。長いものほど融点が高くなります。
GlycGlycerophospholipidに関してはポーラヘッドグループを2桁の記号でGlyceroglycolipidに関しては結合している糖の総数を2桁の数字で、記載してあります。
 
なお、Phosphatidylinositolについては、糖脂質ではありますがGlycerophospholipidとしての扱いとなるため、PIの記号が入ってます。
}}
}}
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{| class="wikitable" border="1" cellpadding="2" cellspacing="1" margin: 1em 1em 1em 1em"
{| class="wikitable" border="1" cellpadding="2" cellspacing="1" margin: 1em 1em 1em 1em"
|+ Table 1. Classification by Chain Length [[Image:LBF.png|120px]]
|+ Table 2. Classification by degree of unsaturation
|- valign="top"
|align="center"|Chain length =<7<br>[[:Category:BM|BMFY: Short-chain]]<br>短鎖<br><br><br>N.A.
|align="center"|Chain length =8<br>[[Volatile:ListMol|LBF08|LBF08: Octanoid]]<br>オクタノイド <br>[[Image:LBF08.png|85px]]{{LBF digit910Table|08}}
|align="center"|Chain length =9<br>[[Volatile:ListMol|LBF09|LBF09: Nonanoid]]<br>ノナノイド <br>[[Image:LBF09.png|85px]]{{LBF digit910Table|09}}
|align="center"|Chain length =10<br>[[Volatile:ListMol|LBF10|LBF10: Decanoid]]<br>デカノイド <br>[[Image:LBF10.png|85px]]{{LBF digit910Table|10}}
 
|- valign="top"
|align="center"|Chain length =11<br>[[Volatile:ListMol|LBF11|LBF11: Undecanoid]]<br>アンデカノイド <br>[[Image:LBF11.png|85px]]{{LBF digit910Table|11}}
|align="center"|Chain length =12<br>[[Volatile:ListMol|LBF12|LBF12: Dodecanoid]]<br>ドデカノイド <br>[[Image:LBF12.png|85px]]{{LBF digit910Table|12}}
|align="center"|Chain length =13<br>[[Volatile:ListMol|LBF13|LBF13: Tridecanoid]]<br>トリデカノイド <br>[[Image:LBF13.png|85px]]{{LBF digit910Table|13}}
|align="center"|Chain length =14<br>[[Volatile:ListMol|LBF14|LBF14: Tetradecanoid]]<br>テトラデカノイド <br>[[Image:LBF14.png|85px]]{{LBF digit910Table|14}}
 
|- valign="top"
|align="center"|Chain length =15<br>[[Volatile:ListMol|LBF15|LBF15: Pentadecanoid]]<br>ペンタデカノイド <br>[[Image:LBF15.png|85px]]{{LBF digit910Table|15}}
|align="center"|Chain length =16<br>[[Volatile:ListMol|LBF16|LBF16: Hexadecanoid]]<br>ヘキサデカノイド <br>[[Image:LBF16.png|85px]]{{LBF digit910Table|16}}
|align="center"|Chain length =17<br>[[Volatile:ListMol|LBF17|LBF17: Heptadecanoid]]<br>ヘプタデカノイド <br>[[Image:LBF17.png|85px]]{{LBF digit910Table|17}}
|align="center"|Chain length =18<br>[[Volatile:ListMol|LBF18|LBF18: Octadecanoid]]<br>オクタデカノイド <br>[[Image:LBF18.png|85px]]{{LBF digit910Table|18}}
 
|- valign="top"
|align="center"|Chain length =19<br>[[Volatile:ListMol|LBF19|LBF19: Nonadecanoid]]<br>ノナデカノイド <br>[[Image:LBF19.png|85px]]{{LBF digit910Table|19}}
|align="center"|Chain length =20<br>[[Volatile:ListMol|LBF20|LBF20: Eicosanoid]]<br>エイコサノイド <br>[[Image:LBF20.png|85px]]{{LBF digit910Table|20}}
|align="center"|Chain length =21<br>[[Volatile:ListMol|LBF21|LBF21: Uncosanoid]]<br>アンコサノイド <br>[[Image:LBF21.png|85px]]{{LBF digit910Table|21}}
|align="center"|Chain length =22<br>[[Volatile:ListMol|LBF22|LBF22: Docosanoid]]<br>ドコサノイド <br>[[Image:LBF22.png|85px]]{{LBF digit910Table|22}}
 
|- valign="top"
|align="center"|Chain length =23<br>[[Volatile:ListMol|LBF23|LBF23: Tricosaoid]]<br>トリコサノイド <br>[[Image:LBF23.png|85px]]{{LBF digit910Table|23}}
|align="center"|Chain length =24<br>[[Volatile:ListMol|LBF24|LBF24: Tetracosanoid]]<br>テトラコサノイド <br>[[Image:LB24.png|85px]]{{LBF digit910Table|24}}
|align="center"|Chain length =25<br>[[Volatile:ListMol|LBF25|LBF25: Pentacosanoid]]<br>ペンタコサノイド <br>[[Image:LBF25.png|85px]]{{LBF digit910Table|25}}
|align="center"|Chain length =26<br>[[Volatile:ListMol|LBF26|LBF26: Hexacosanoid]]<br>ヘキサコサノイド <br>[[Image:LBF26.png|85px]]{{LBF digit910Table|26}}
 
|- valign="top"
|align="center"|Chain length =27<br>[[Volatile:ListMol|LBF27|LBF27: Heptacosanoid]]<br>ヘプタコサノイド <br>[[Image:LBF27.png|85px]]{{LBF digit910Table|27}}
|align="center"|Chain length =28<br>[[Volatile:ListMol|LBF28|LBF28: Octacosanoid]]<br>オクタコサノイド <br>[[Image:LBF28.png|85px]]{{LBF digit910Table|28}}
|align="center"|Chain length =29<br>[[Volatile:ListMol|LBF29|LBF29: Nonacosanoid]]<br>ノナコサノイド <br>[[Image:LBF29.png|85px]]{{LBF digit910Table|29}}
|align="center"|Chain length =30<br>[[Volatile:ListMol|LBF30|LBF30: Triacontanoid]]<br>トリアコンタノイド <br>[[Image:LBF30.png|85px]]{{LBF digit910Table|30}}
 
|- valign="top"
|- valign="top"
|align="center"|Chain length =31<br>[[Volatile:ListMol|LBF31|LBF31: Hentriacontanoid]]<br>ヘントリアコンタノイド <br>[[Image:LBF31.png|85px]]{{LBF digit910Table|31}}
|align="center"| {{MapLink|ListMol|LBGPC|PC: Phosphocholine<br>}}<br>[[Image:LBGPC.png|200px]]
|align="center"|Chain length =32<br>[[Volatile:ListMol|LBF32|LBF32: Dotriacontanoid]]<br>ドトリアコンタノイド <br>[[Image:LBF32.png|85px]]{{LBF digit910Table|32}}
|align="center"| {{MapLink|ListMol|LBGPS|PS: Phosphatidylserine<br>}}<br>[[Image:LBGPS.png|200px]]
|align="center"|Chain length =33<br>[[Volatile:ListMol|LBF33|LBF33: Tritriacontanoid]]<br>トリトリアコンタノイド <br>[[Image:LBF33.png|85px]]{{LBF digit910Table|33}}
|align="center"| {{MapLink|ListMol|LBGPI|PI: Phosphatidylinositol<br>}}<br>[[Image:LBGPI.png|200px]]
|align="center"|Chain length =34<br>[[Volatile:ListMol|LBF34|LBF34: Tetratriacontanoid]]<br>テトラトリアコンタノイド <br>[[Image:LBF34.png|85px]]{{LBF digit910Table|34}}
|align="center"| {{MapLink|ListMol|LBGPE|PE: Phosphatidylethanolamine<br>}}<br>[[Image:LBGPE.png|200px]]
|align="center"| {{MapLink|ListMol|LBGPx|Px: other Glycerophospholipid<br>}}<br>[[Image:LBGPx.png|200px]]


|- valign="top"
|- valign="top"
|align="center"|Chain length =35<br>[[Volatile:ListMol|LBF35|LBF35: Pentatriacontanoid]]<br>ペンタトリアコンタノイド <br>[[Image:LBF35.png|85px]]{{LBF digit910Table|35}}
|align="center"| {{MapLink|ListMol|LBG01|01: 糖の数1<br>}}<br>[[Image:LBG01.png|200px]]
|align="center"|Chain length =36<br>[[Volatile:ListMol|LBF36|LBF36: Hexatriacontanoid]]<br>ヘキサトリアコンタノイド <br>[[Image:LBF36.png|85px]]{{LBF digit910Table|36}}
|align="center"| {{MapLink|ListMol|LBG02|02: 糖の数2<br>}}<br>[[Image:LBG02.png|200px]]
|align="center"|Chain length =37<br>[[Volatile:ListMol|LBF37|LBF37: Heptatriacontanoid]]<br>ヘプタトリアコンタノイド <br>[[Image:LBF37.png|85px]]{{LBF digit910Table|37}}
|align="center"| {{MapLink|ListMol|LBG03|03: 糖の数3<br>}}<br>[[Image:LBG03.png|200px]]
|align="center"|Chain length =38<br>[[Volatile:ListMol|LBF38|LBF38: Octatriacontanoid]]<br>オクタトリアコンタノイド <br>[[Image:LBF38.png|85px]]{{LBF digit910Table|38}}
|align="center"| {{MapLink|ListMol|LBG04|04: 糖の数4<br>}}<br>[[Image:LBG04.png|200px]]
|align="center"| {{MapLink|ListMol|LBG05|05: 糖の数5<br>}}<br>[[Image:LBG05.png|200px]]


|- valign="top"
|- valign="top"
|align="center"|Chain length =46<br>[[Volatile:ListMol|LBF46|LBF46: HexaTetracontanoid]]<br>ヘキサテトラコンタノイド <br>[[Image:LBF46.png|85px]]{{LBF digit910Table|46}}
|align="center"| {{MapLink|ListMol|LBG06|06: 糖の数6<br>}}<br>[[Image:LBG06.png|200px]]
|align="center"|
|align="center"| {{MapLink|ListMol|LBG25|25: 糖の数25<br>}}<br>[[Image:LBG25.png|200px]]
|align="center"|
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==Classification by degree of unsaturation <small>不飽和度による分類</small>==
==Classification by Chain Length <small>修飾する糖の個数もしくはポーラヘッドグループによる分類</small>==
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{{Twocolumn|
 
Fatty acids are extended by polymerization of malonyl CoA, and have even chain length in general.
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Glyceroglycolipidに関しては結合している糖の総数を2桁の数字で、Glycerophospholipidに関してはポーラヘッドグループを2桁の記号で記載してあります。
なお、Phosphatidylinositolについては、糖脂質ではありますがGlycerophospholipidとしての扱いとなるため、PIの記号が入ってます。
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==Classification by position of n－z nomenclature <small>二重結合の位置（n－z）による分類</small>==
==Classification by position of n－z nomenclature <small>二重結合の位置（n－z）による分類</small>==

Revision as of 07:29, 11 December 2008

Glycerolipid (グリセロ脂質)


Upper classes: LB

Class Overview

（英文説明・仮） Complex lipid is the main structural component of biological membrane, is a form of lipid bilayer, and broadly classified into Glycerolipid and Sphingolipid. The Glycerolipid category （LBG） includes Glycerophospholipid and Glyceroglycolipid.

（和文説明・仮） リン酸や糖などを含む脂質は複合脂質と呼ばれ、細胞膜の脂質二重層の主要な構成要素です。 複合脂質は、一般的にグリセロールを含む脂質（グリセロ脂質）とスフィンゴイドを含む脂質（スフィンゴ脂質）に大別されます。
グリセロ脂質カテゴリー（LBG）には、グリセロリン脂質 (Glycerophospholipid) 、グリセロ糖脂質 (Glyceroglycolipid) などの、グリセロール骨格を共通構造とする分子が含まれています。

Common Abbreviations よく使う略称

PC PhosphatidylCholine ホスファチジルコリン
PS Phosphatidylserine ホスファチジルセリン
PI Phosphatidylinositol ホスファチジルイノシトール
PE Phosphatidylethanolamine ホスファチジルエタノールアミン


Design of Glycerolipid identifiers ID番号の設計

26-DIGIT(6+9+9+2)

L B G n n b1 b2 : x1 x1 y1 z1 z1 w1 w1 c1 c1 : x2 x2 y2 z2 z2 w2 w2 c2 c2

  • n ... code of pola head group(Glycerophospholipid) or number of attached sugars(Glyceroglycolipid)
  • b1 ... type of binding to Fatty acyl-1(LBF1)
  • b2 ... type of binding to Fatty acyl-2(LBF2)
  • x1 ... carbon chain length(LBF1)
  • y1 ... degree of unsaturation(LBF1)
  • z1 ... position of n－z (n minus z; also ω－z or omega-z) nomenclature(LBF1)
  • w1 ... structure type(LBF1)
  • c1 ... serial number(LBF1)
  • x2 ... carbon chain length(LBF2)
  • y2 ... degree of unsaturation(LBF2)
  • z2 ... position of n－z (n minus z; also ω－z or omega-z) nomenclature(LBF2)
  • w2 ... structure type(LBF2)
  • c2 ... serial number(LBF2)

  • n ... ポーラヘッドグループの記号(Glycerophospholipid) 、もしくは修飾する糖の個数 (Glyceroglycolipid)
  • b1 ... 脂肪酸1(LBF1)の結合のタイプ
  • b2 ... 脂肪酸2(LBF1)の結合のタイプ
  • x1 ... 炭素鎖長(LBF1)
  • y1 ... 不飽和度(LBF1)
  • z1 ... n－z (またはω－zやomega-z)　における数(LBF1)
  • w1 ... 骨格のタイプ(LBF1)
  • c1 ... 通し番号(LBF1)
  • x2 ... 炭素鎖長(LBF2)
  • y2 ... 不飽和度(LBF2)
  • z2 ... n－z (またはω－zやomega-z)　における数(LBF2)
  • w2 ... 骨格のタイプ(LBF2)
  • c2 ... 通し番号(LBF2)


Classification by pola head group or number of attached sugars ポーラヘッドグループもしくは修飾する糖の個数による分類

There are 2 digit of code of pola head group (Glycerophospholipid) or number of attached sugars (Glyceroglycolipid). Phosphatidylinositol is treated as Glycerophospholipid.

GlycGlycerophospholipidに関してはポーラヘッドグループを2桁の記号でGlyceroglycolipidに関しては結合している糖の総数を2桁の数字で、記載してあります。 なお、Phosphatidylinositolについては、糖脂質ではありますがGlycerophospholipidとしての扱いとなるため、PIの記号が入ってます。

Table 2. Classification by degree of unsaturation
 
(425 pages)
LBGPC.png 		 
(51 pages)
LBGPS.png 		 
(58 pages)
LBGPI.png 		 
(267 pages)
LBGPE.png 		 
(58 pages)
LBGPx.png
 
(37 pages)
LBG01.png 		 
(37 pages)
LBG02.png 		 
(18 pages)
LBG03.png 		 
(6 pages)
LBG04.png 		 
(2 pages)
LBG05.png
 
(4 pages)
LBG06.png 		 
(0 pages)
LBG25.png


Classification by Chain Length 修飾する糖の個数もしくはポーラヘッドグループによる分類

Fatty acids are extended by polymerization of malonyl CoA, and have even chain length in general.

Glyceroglycolipidに関しては結合している糖の総数を2桁の数字で、Glycerophospholipidに関してはポーラヘッドグループを2桁の記号で記載してあります。 なお、Phosphatidylinositolについては、糖脂質ではありますがGlycerophospholipidとしての扱いとなるため、PIの記号が入ってます。

Table 2. Classification by degree of unsaturation
 
(269 pages)
LBF--0.png 		 
(195 pages)
LBF--1.png 		 
(149 pages)
LBF--2.png
 
(93 pages)
LBF--3.png 		 
(149 pages)
LBF--4.png 		 
(25 pages)
LBF--5.png
 
(6 pages)
LBF--6.png 		 
(0 pages)
LBF--7.png 		 
(0 pages)
LBF--8.png

Classification by position of n－z nomenclature 二重結合の位置（n－z）による分類

Table 3. Classification by position of n－z nomenclature
 
(269 pages)
LBF---00.png 		 
(13 pages)
LBF---01.png 		 
(19 pages)
LBF---02.png 		 
(75 pages)
LBF---03.png
 
(20 pages)
LBF---04.png 		 
(13 pages)
LBF---05.png 		 
(199 pages)
LBF---06.png 		 
(150 pages)
LBF---07.png
 
(31 pages)
LBF---08.png 		 
(42 pages)
LBF---09.png 		 
(10 pages)
LBF---10.png 		 
(8 pages)
LBF---11.png
 
(5 pages)
LBF---12.png 		 
(2 pages)
LBF---13.png 		 
(3 pages)
LBF---14.png 		 
(8 pages)
LBF---15.png
 
(2 pages)
LBF---16.png 		 
(2 pages)
LBF---17.png 		 
(2 pages)
LBF---18.png 		 
(1 pages)
LBF---22.png


Classification by Structure 骨格による分類

Table 4. Classification by Structure
 
(200 pages)

LBF-----SC.png 		 
(120 pages)
LBF-----BC.png 		 
(62 pages)
LBF-----HP.png 		 
(170 pages)
LBF-----HO.png 		 
(60 pages)

LBF-----OX.png
 
(16 pages)

LBF-----EO.png 		 
(6 pages)
LBF-----MO.png 		 
(2 pages)

LBF-----CA.png 		 
(0 pages)

LBF-----AL.png 		 
(0 pages)

LBF-----KT.png
 
(0 pages)

LBF-----ES.png 		 
(0 pages)

LBF-----ET.png 		 
(0 pages)
LBF-----SF.png 		 
(1 pages)

LBF-----PH.png 		 
(0 pages)
LBF-----AN.png
 
(54 pages)

LBF-----AM.png 		 
(0 pages)
LBF-----OP.png 		 
(2 pages)
LBF-----JA.png 		 
(128 pages)
LBF-----PG.png 		 
(22 pages)

LBF-----LT.png
 
(6 pages)
LBF-----TX.png 		 
(2 pages)
LBF-----LX.png 		 
(4 pages)
LBF-----HX.png 		 
(0 pages)
LBF-----LG.png 		 
(23 pages)
LBF-----CV.png
 
(8 pages)
LBF-----XX.png

Classification by Structure 骨格による分類

Table 1. Classification of Glycerolipid LBS.png
Glycolipid
(incl. phospho)
LBG##***--|LBG##***--:
？ 		Phospholipid
LBGP****##|LBGP****##:
? 		Others
LBG*******|LBS*******:
?

Subcategories

This category has only the following subcategory.

L

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