Template:Map/Glycerophospholipid: Difference between revisions

mNo edit summary
mNo edit summary
Line 2: Line 2:
グリセロリン脂質の生合成
グリセロリン脂質の生合成


{| style="margin:0 0 0 0"
{| style="margin:0 0 0 0; text-align:center;"
|-
|-
|
|
|style="text-align:center;"|phosphatidyl glycerol phosphate<br/>[[Image:LBGPGP.png]]
|phosphatidyl glycerol phosphate<br/>[[Image:LBGPGP.png]]
|style="text-align:center;"|
|
{|
{|
|{{Map/ReactionRight|H2O|Pi|[http://metabolomics.jp/wiki/Enzyme:3.1.3.27 3.1.3.27]<ref name="3.1.3.27">PGおよびカルジオリピン(CL)の合成酵素はミトコンドリアに局在。真核細胞ではPGとCDP-DGにより合成されるが、細菌では2分子のPGが縮合してできる。</ref>}}
|{{Map/ReactionRight|H2O|Pi|[http://metabolomics.jp/wiki/Enzyme:3.1.3.27 3.1.3.27]<ref name="3.1.3.27">PGおよびカルジオリピン(CL)の合成酵素はミトコンドリアに局在。真核細胞ではPGとCDP-DGにより合成されるが、細菌では2分子のPGが縮合してできる。</ref>}}
Line 24: Line 24:
|}
|}
|-
|-
|
|style="vertical-align:bottom"| ethanolamine<br/>[[Image:LBE.png]]
|{{Map/ReactionUpDown|PPi|CTP|[http://metabolomics.jp/wiki/Enzyme:2.7.7.41 2.7.7.41]<ref>Phosphatidate cytidylyltransferase (EC 2.7.7.41)は真核細胞ではミクロソームとミトコンドリアの両画分に存在。</ref>}}
|{{Map/ReactionUpDown|PPi|CTP|[http://metabolomics.jp/wiki/Enzyme:2.7.7.41 2.7.7.41]<ref>Phosphatidate cytidylyltransferase (EC 2.7.7.41)は真核細胞ではミクロソームとミトコンドリアの両画分に存在。</ref>}}
|style="text-align:center"| choline<br/>[[Image:LBC.png]]{{Map/ReactionDown35|ATP|[http://metabolomics.jp/wiki/Enzyme:2.7.1.32 2.7.1.32]}}
|style="text-align:center"| choline [[Image:LBC.png]]{{Map/ReactionDown35|ATP|[http://metabolomics.jp/wiki/Enzyme:2.7.1.32 2.7.1.32]}}
|-
|-
|style="text-align:center;"| ethanolamine<br/>[[Image:LBE.png]]{{Map/ReactionDown35|ATP|[http://metabolomics.jp/wiki/Enzyme:2.7.1.82 2.7.1.82]}}
| {{Map/ReactionDown35|ATP|[http://metabolomics.jp/wiki/Enzyme:2.7.1.82 2.7.1.82]}}
O-phospho ethanolamine<br/>[[Image:LBOPE.png]]
O-phospho ethanolamine<br/>[[Image:LBOPE.png]]
|style="text-align:center"|<font style="background-color:orange">phosphatidate</font><ref>PAは''sn''-グリセロール3リン酸のアシル化により''de-novo''合成される。真核細胞におけるアシル基の供与体はacyl-CoAである(細菌ではacyl carrier protein)。PAはDGのリン酸化によっても生成する。</ref>
| <font style="background-color:orange">phosphatidate</font><ref>PAは''sn''-グリセロール3リン酸のアシル化により''de-novo''合成される。真核細胞におけるアシル基の供与体はacyl-CoAである(細菌ではacyl carrier protein)。PAはDGのリン酸化によっても生成する。</ref>
PA({{#get:R1}}/{{#get:R2}})<br/>[[Image:LBGPA.png]]
PA({{#get:R1}}/{{#get:R2}})<br/>[[Image:LBGPA.png]]
|style="text-align:center"| O-phospho choline<br/>[[Image:LBOPC.png]]{{Map/ReactionDown35|CTP|[http://metabolomics.jp/wiki/Enzyme:2.7.7.15 2.7.7.15]}}
| O-phospho choline<br/>[[Image:LBOPC.png]]{{Map/ReactionDown35|CTP|[http://metabolomics.jp/wiki/Enzyme:2.7.7.15 2.7.7.15]}}
|-
|{{Map/ReactionDown35|CTP|[http://metabolomics.jp/wiki/Enzyme:2.7.7.14 2.7.7.14]}}CDP-ethanolamine<br/>[[Image:LBCDPE.png]]
|
|
|style="text-align:center"|
|-
|style="text-align:center"|{{Map/ReactionDown35|CTP|[http://metabolomics.jp/wiki/Enzyme:2.7.7.14 2.7.7.14]}}CDP-ethanolamine<br/>[[Image:LBCDPE.png]]
|style="text-align:center"|
{|
{|
|{{Map/ReactionUp|ADP|ATP|[http://metabolomics.jp/wiki/Enzyme:2.7.1.107 2.7.1.107]}}
|{{Map/ReactionUp|ADP|ATP|[http://metabolomics.jp/wiki/Enzyme:2.7.1.107 2.7.1.107]}}
|{{Map/ReactionDown|H2O|Pi|[http://metabolomics.jp/wiki/Enzyme:3.1.3.4 3.1.3.4]<ref>PA phosphataseはすべての生物に存在。動物組織では膜たんぱく質と可溶性たんぱく質が存在。</ref>}}
|{{Map/ReactionDown|H2O|Pi|[http://metabolomics.jp/wiki/Enzyme:3.1.3.4 3.1.3.4]<ref>PA phosphataseはすべての生物に存在。動物組織では膜たんぱく質と可溶性たんぱく質が存在。</ref>}}
|}
|}
|style="text-align:center"|CDP-choline<br/>[[Image:LBCDPC.png]]
|CDP-choline<br/>[[Image:LBCDPC.png]]
|-
|{{Map/ReactionDownFromRight|CMP|[http://metabolomics.jp/wiki/Enzyme:2.7.8.1 2.7.8.1]<ref>Choホスホトランスフェラーゼはミクロソームに局在する膜たんぱく質で逆反応も触媒。</ref>}}
|diacyl glycerol<br/>DG({{#get:R1}}/{{#get:R2}}) &rarr; [[Template:Map/Ether_phospholipid|<font style="background-color:skyblue">Ether PL</font>]]<br/>[[Image:LBDG.png]]
|{{Map/ReactionDownFromLeft|CMP|[http://metabolomics.jp/wiki/Enzyme:2.7.8.2 2.7.8.2]<ref>EthlAmineホスホトランスフェラーゼはミクロソームに局在する膜たんぱく質。</ref>}}
|-
|-
|
|
{{Map/ReactionDownFromRight|CMP|[http://metabolomics.jp/wiki/Enzyme:2.7.8.1 2.7.8.1]<ref>Choホスホトランスフェラーゼはミクロソームに局在する膜たんぱく質で逆反応も触媒。</ref>}}
|style="text-align:center"|diacyl glycerol<br/>DG({{#get:R1}}/{{#get:R2}}) &rarr; [[Template:Map/Ether_phospholipid|<font style="background-color:skyblue">Ether PL</font>]]<br/>[[Image:LBDG.png]]
|
{{Map/ReactionDownFromLeft|CMP|[http://metabolomics.jp/wiki/Enzyme:2.7.8.2 2.7.8.2]<ref>EthlAmineホスホトランスフェラーゼはミクロソームに局在する膜たんぱく質。</ref>}}
|-
|style="text-align:center"|
{|
{|
|-
|-
Line 58: Line 54:
[[Image:LBGPE.png]]<br/>PE({{#get:R1}}/{{#get:R2}})
[[Image:LBGPE.png]]<br/>PE({{#get:R1}}/{{#get:R2}})
|style="text-align:center"|methylation x 3<br/>{{Map/ReactionRight|3SAM|3SAH|[http://metabolomics.jp/wiki/Enzyme:2.1.1.17 2.1.1.17]<ref>多くの細菌はこの酵素を持たないが、一部のグラム陰性菌から脊椎動物まで幅広く保存されている。脊椎動物では肝臓で発現。</ref>}}
|style="text-align:center"|methylation x 3<br/>{{Map/ReactionRight|3SAM|3SAH|[http://metabolomics.jp/wiki/Enzyme:2.1.1.17 2.1.1.17]<ref>多くの細菌はこの酵素を持たないが、一部のグラム陰性菌から脊椎動物まで幅広く保存されている。脊椎動物では肝臓で発現。</ref>}}
|style="text-align:center"|
|
{|
{|
|-
|-
Line 117: Line 113:
|}
|}
|-
|-
|style="text-align:center"|
|
{|
{|
|-
|-

Revision as of 13:19, 4 July 2009

Biosynthesis of Glycerophospholipid

グリセロリン脂質の生合成

phosphatidyl glycerol phosphate
LBGPGP.png
3.1.3.27[1]
Arrow3rr.png
H2O   Pi
phosphatidyl glycerol
LBGPG.png
CMP
2.7.8.5[1]
GP
Arrow3lu.png
Arrow1ld35.png CDP-DG
cardiolipin
LBGDPG.png
phosphatidyl inositol[2]

LBGPI.png
PI( / )

2.7.8.11[3]
Arrow3ll.png
CMP   Inositol
CDP-diacyl glycerol
LBCDPDG.png
CDP-DG( / )
ethanolamine
LBE.png
Arrow6rv.png
PPi

2.7.7.41[4]
CTP

 choline LBC.png
Arrow1ld35.png ATP
Arrow1ld35.png ATP

O-phospho ethanolamine
LBOPE.png

phosphatidate[5]

PA( / )
LBGPA.png

O-phospho choline
LBOPC.png
Arrow1ld35.png CTP
Arrow1ld35.png CTP
CDP-ethanolamine
LBCDPE.png
ADP
2.7.1.107
ATP
Arrow3lu.png
Arrow3ld.png
H2O
3.1.3.4[6]
Pi
CDP-choline
LBCDPC.png

2.7.8.1[7]
CMP
Arrow4rda.png
diacyl glycerol
DG( / ) → Ether PL
LBDG.png
Arrow4lda.png
2.7.8.2[8]
CMP
phosphatidyl ethanolamine
0 5 10 27 (days)

LBGPE.png
PE( / )

methylation x 3
2.1.1.17[9]
Arrow3rr.png
3SAM   3SAH
phosphatidyl choline (or lecithin)
0 5 10 27 (days)

LBGPC.png
PC( / )

CO2
Arrow3lu.png
Arrow3ld.png
Ser
[10]
ethanolamine
Structure Specification

Set the R1 moiety to .
Set the R2 moiety to .
phosphatidyl serine
0 5 10 27 (days)

LBGPS.png
PS( / )

  1. 1.0 1.1 PGおよびカルジオリピン(CL)の合成酵素はミトコンドリアに局在。真核細胞ではPGとCDP-DGにより合成されるが、細菌では2分子のPGが縮合してできる。
  2. PI は全リン脂質の5-10%を占める。
  3. この酵素は小胞体膜状に存在するとされていたが、形質膜にも類似の酵素が存在する。
  4. Phosphatidate cytidylyltransferase (EC 2.7.7.41)は真核細胞ではミクロソームとミトコンドリアの両画分に存在。
  5. PAはsn-グリセロール3リン酸のアシル化によりde-novo合成される。真核細胞におけるアシル基の供与体はacyl-CoAである(細菌ではacyl carrier protein)。PAはDGのリン酸化によっても生成する。
  6. PA phosphataseはすべての生物に存在。動物組織では膜たんぱく質と可溶性たんぱく質が存在。
  7. Choホスホトランスフェラーゼはミクロソームに局在する膜たんぱく質で逆反応も触媒。
  8. EthlAmineホスホトランスフェラーゼはミクロソームに局在する膜たんぱく質。
  9. 多くの細菌はこの酵素を持たないが、一部のグラム陰性菌から脊椎動物まで幅広く保存されている。脊椎動物では肝臓で発現。
  10. 動物細胞ではPSはPCおよびPEから転移酵素によって生じる。細菌や酵母ではPSはCDP-DGとセリンから合成される。どの細胞でもPSが脱炭酸してPEを生じる。