View source for Template:Map/Glycerophospholipid

=Biosynthesis of Glycerophospholipid=
グリセロリン脂質の生合成
{{Map/Instruction}}
{| style="margin:0 0 0 0; text-align:center;"
|-
|
|phosphatidyl glycerol phosphate<br/>[[Image:LBGPGP.png]]
|
{|
|{{Map/ReactionRight|H2O|Pi|[http://metabolomics.jp/wiki/Enzyme:3.1.3.27 3.1.3.27]<ref name="3.1.3.27">PGおよびカルジオリピン(CL)の合成酵素はミトコンドリアに局在。真核細胞ではPGとCDP-DGにより合成されるが、細菌では2分子のPGが縮合してできる。</ref>}}
|phosphatidyl glycerol<br/>[[Image:LBGPG.png]]
|}
|-
|
|{{Map/ReactionUp|CMP|GP|[http://metabolomics.jp/wiki/Enzyme:2.7.8.5 2.7.8.5]<ref name="3.1.3.27"/>}}
|style="text-align:center;vertical-align:top;"|{{Map/ReactionDown35|CDP-DG|}}cardiolipin<br/>[[Image:LBGDPG.png]]
|-
| colspan="2"|
{| style="text-align:center; float:right;"
|phosphatidyl inositol<ref>PI は全リン脂質の5-10%を占める。</ref><br/>
[[Image:LBGPI.png]]<br/>PI{{#if:{{#get:R1}}{{#get:R2}}|({{#get:R1}}/{{#get:R2}})}}
|{{Map/ReactionLeft|CMP|Inositol|[http://metabolomics.jp/wiki/Enzyme:2.7.8.11 2.7.8.11]<ref>この酵素は小胞体膜状に存在するとされていたが、形質膜にも類似の酵素が存在する。</ref>}}
|CDP-diacyl glycerol<br/>[[Image:LBCDPDG.png]]<br/>CDP-DG{{#if:{{#get:R1}}{{#get:R2}}|({{#get:R1}}/{{#get:R2}})}}
|}
|style="vertical-align:bottom"|'''The Kennedy Pathway'''<ref>ケネディ経路とはCholineからPCまでの経路。PC生成のおよそ70%を担う。[http://www.jbc.org/cgi/content/full/280/25/e22 Kennedy and Lehninger 179(2):957,1949 & Kennedy and Weiss 222(1):193,1956]</ref>
|-
|style="vertical-align:bottom"| ethanolamine<br/>[[Image:LBE.png]]
|{{Map/ReactionUpDown|PPi|CTP|[http://metabolomics.jp/wiki/Enzyme:2.7.7.41 2.7.7.41]<ref>Phosphatidate cytidylyltransferase (EC 2.7.7.41)は真核細胞ではミクロソームとミトコンドリアの両画分に存在。</ref>}}
|style="text-align:center"|　choline [[Image:LBC.png]]{{Map/ReactionDown35|ATP|[http://metabolomics.jp/wiki/Enzyme:2.7.1.32 2.7.1.32]}}
|-
| {{Map/ReactionDown35|ATP|[http://metabolomics.jp/wiki/Enzyme:2.7.1.82 2.7.1.82]}}
O-phospho ethanolamine<br/>[[Image:LBOPE.png]]
| {{Map/MetaboliteSource|phosphatidate}}<ref>PAは''sn''-グリセロール3リン酸のアシル化により''de-novo''合成される。真核細胞におけるアシル基の供与体はacyl-CoAである（細菌ではacyl carrier protein）。PAはDGのリン酸化によっても生成する。</ref>
PA{{#if:{{#get:R1}}{{#get:R2}}|({{#get:R1}}/{{#get:R2}})}}<br/>[[Image:LBGPA.png]]
| O-phospho choline<br/>[[Image:LBOPC.png]]{{Map/ReactionDown35|CTP|[http://metabolomics.jp/wiki/Enzyme:2.7.7.15 2.7.7.15]}}
|-
|{{Map/ReactionDown35|CTP|[http://metabolomics.jp/wiki/Enzyme:2.7.7.14 2.7.7.14]}}CDP-ethanolamine<br/>[[Image:LBCDPE.png]]
|
{|
|{{Map/ReactionUp|ADP|ATP|[http://metabolomics.jp/wiki/Enzyme:2.7.1.107 2.7.1.107]}}
|{{Map/ReactionDown|H2O|Pi|[http://metabolomics.jp/wiki/Enzyme:3.1.3.4 3.1.3.4]<ref>PA phosphataseはすべての生物に存在。動物組織では膜たんぱく質と可溶性たんぱく質が存在。</ref>}}
|}
|CDP-choline<br/>[[Image:LBCDPC.png]]
|-
|colspan="3"|
{| style="margin:auto;"
|{{Map/ReactionDownFromRight|CMP|[http://metabolomics.jp/wiki/Enzyme:2.7.8.1 2.7.8.1]<ref>Choホスホトランスフェラーゼはミクロソームに局在する膜たんぱく質で逆反応も触媒。</ref>}}
|style="width:16em"| diacyl glycerol<br/>DG{{#if:{{#get:R1}}{{#get:R2}}|({{#get:R1}}/{{#get:R2}})}} {{Map/MetaboliteSink|Ether PL|Template:Map/Ether_phospholipid}} <br/>[[Image:LBDG.png]]
|{{Map/ReactionDownFromLeft|CMP|[http://metabolomics.jp/wiki/Enzyme:2.7.8.2 2.7.8.2]<ref>EthlAmineホスホトランスフェラーゼはミクロソームに局在する膜たんぱく質。</ref>}}
|}
|-
|
{|
|-
|phosphatidyl ethanolamine
|{{Map/Glycerophospholipid/GetValues|head=PE|R1={{#get:R1}}|R2={{#get:R2}}}}
|}
[[Image:LBGPE.png]]<br/>PE{{#if:{{#get:R1}}{{#get:R2}}|({{#get:R1}}/{{#get:R2}})}}
|style="text-align:center"|methylation x 3<br/>{{Map/ReactionLongRight|3SAM|3SAH|[http://metabolomics.jp/wiki/Enzyme:2.1.1.17 2.1.1.17]<ref>多くの細菌はこの酵素を持たないが、一部のグラム陰性菌から脊椎動物まで幅広く保存されている。脊椎動物では肝臓で発現。</ref>}}
'''PEMT Pathway'''<ref>PC生成のおよそ30%はPEMT経路。この経路がないと細胞質のホモシステインは半減する。</ref>
|
{|
|-
|phosphatidyl choline<br/>(lecithin) {{Map/MetaboliteSink|PL degradation|Template:Map/Phospholipid_degradation}}
|{{Map/Glycerophospholipid/GetValues|head=PC|R1={{#get:R1}}|R2={{#get:R2}}}}
|}
[[Image:LBGPC.png]]<br/>PC{{#if:{{#get:R1}}{{#get:R2}}|({{#get:R1}}/{{#get:R2}})}}
|-
|
{| style="margin:auto;"
|{{Map/ReactionUp|CO2||}}
|{{Map/ReactionDown|Ser|ethanolamine|<ref>動物細胞ではPSはPCおよびPEから転移酵素によって生じる。細菌や酵母ではPSはCDP-DGとセリンから合成される。どの細胞でもPSが脱炭酸してPEを生じる。</ref>}}
|}
|colspan="4" rowspan="3"|
{| class="wikitable" style="margin:auto;"
! style="text-align:center"| Structure Specification
|-
|
<big> {{#formtag:form|action="/wiki/Template:Map/Glycerophospholipid"|
<!-----
Set the expression data for {{#formtag:select|name="GPLData"|
  {{#formtag:option|value="P0"|Day 0}}
  {{#formtag:option|value="P3"|Day 4}}
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}}.---->
Set the R1 moiety to {{#formtag:select|name="R1"|
  {{#formtag:option|value="-"|-}}
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 }}. <br/>Set the R2 moiety to {{#formtag:select|name="R2"|
  {{#formtag:option|value="-"|-}}
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|}
|-
|
{|
|-
|phosphatidyl serine
|{{Map/Glycerophospholipid/GetValues|head=PS|R1={{#get:R1}}|R2={{#get:R2}}}}
|}
[[Image:LBGPS.png]]<br/>PS{{#if:{{#get:R1}}{{#get:R2}}|({{#get:R1}}/{{#get:R2}})}}
|}

<references/>