About LipidBank

"LipidBank" is an open, publicly free database of natural lipids including fatty acids, glycerolipids, sphingolipids, steroids, and various vitamins.

The database contains more than 6000 unique molecular structures (ChemDraw cdx format, MDL MOL format), their lipid names (common name, IUPAC), spectral information (mass, UV, IR, NMR and others), and most importantly, literature information.

The database lists natural lipids only, and all molecular information is manually curated and approved by experts in lipid research (see Informant in each record).

LipidBank is the official database of the Japanese Conference on the Biochemistry of Lipids (JCBL).

Watanabe K., Yasugi E. and Oshima M. "How to search the glycolipid data in LIPIDBANK for Web: the newly developed lipid database in Japan" Trend Glycosci. and Glycotechnol. 12, 175-184, 2000. (PDF)


現在6000以上の天然物構造(ChemDraw cdx形式、MDL MOL形式)について、物質名(慣用名とIUPAC)、スペクトル情報(質量、UV, IR, NMRほか)に加えて、文献情報も掲載しています。


渡辺清博、八杉悦子、大島美恵子「糖脂質データを日本で新しく作成された生理活性脂質データベース[LIPIDBANK for Web]で検索してみよう」Trend Glycosci. and Glycotechnol. 12, 175-184, 2000.(PDF


日本脂質生化学会脂質データベース構築委員会 規約

第1条 本会を日本脂質生化学会脂質データベース構築委員会(以下、委員会という。)と称する。
第2条 委員会は、日本脂質生化学会が設置する。
第3条 委員会は、脂質データベース“LipidBank”の構築・維持・更新を目的とし、脂質データの集積・更新、データベースシステムの構築・維持、
第4条 委員会の委員は、脂質・バイオインフォマティクスに造詣の深い日本脂質生化学会会員で構成され、日本脂質生化学会会長が任命する。
 2 委員会には委員長を置くこととし、原則として日本脂質生化学会会長が兼務するが、委員の中から任命することができる。
 3 委員会に副委員長を置くことができ、日本脂質生化学会会長が任命する。
 4 委員会に顧問を置くことができ、日本脂質生化学会会長が任命する。
 5 顧問は委員会に出席し、意見を述べることができる。
第5条 委員会に、会務に関する事務をおこなうために事務局を置く。事務局長は委員長が指名する。
第6条 この規約に定めるもののほか、必要な事項は別に定める。



History (歴史)


The project was started as a database in Japanese around 1984 with Grant-in-Aid for scientific research publication (Akira Hayashi). This database was succeeded in 1989 under the committee of lipid information (President: Yoshitaka Nagai), organized by the members of The Japanese Conference on the Biochemistry of Lipids (JCBL). The actual construction of the database was managed by the JCBL committee of database construction (President: Akira Hayashi, Vice-president: Nobuo Ueta, Secretary: Kiyohiro Watanabe).

The database included 16 lipid classes: fatty acid, long chain aldehyde, long chain alcohol, long chain base, bile acid, glyceride, phospholipid, glycolipid, lipoprotein, lipopolysaccharide, steroid, prostanoid, ether type lipid, mycolic acid and wax.

Each record contained lipid name, biological activity, source, references, structure and spectra. About 2,700 records were collected and saved on floppy discs.

脂質情報データベース (1984? - 1997)

LipidBankの淵源は、1984年頃に獲得された科学研究費補助金(研究成果刊行費、代表者:林 陽)により構築が開始された日本語のデータベース「脂質情報データベース」である。1989年に、このデータベースは日本脂質生化学会(JCBL)により構成された脂質情報作成委員会(委員長:永井克孝)が立ち上げたプロジェクトに引き継がれ、構築が本格化した。実務は脂質情報データベース構築委員会(委員長:林 陽、副委員長:植田伸夫、システム構築と入力:渡邊清博)が担った。



LIPIDBANK for Web (1996 - 1999)

The initial three-year project started as a joint research between the International Medical Center of Japan (current National Center for Global Health and Medicine) (NCGM) and the Japan Science and Technology Corporation (JST).

A new executive committee was organized (President: Shoshichi Nojima, Vice-president: Mieko Oshima, Secretary: Kiyohiro Watanabe and Etsuko Yasugi).

The committee decided to collect the data on 27 lipid classes in English. Molecules in each class were collected independently under 27 team leaders and 122 data informants.

The database became publicly available from October 1999. The database server was placed at the University of Tokyo where the office of JCBL was located. The total number of molecules was about 5400.

生理活性脂質データベース (1996 - 1999)

3年間の本プロジェクトは、国立国際医療センター(現:国立国際医療研究センター)(NCGM) と科学技術振興機構 (JST) との共同研究として発足した。




Updating LIPIDBANK for Web (1999 - 2005)

After adding one lipid class (lipid peroxides), 28 lipid classes were reorganized into 17 lipid groups.

The DERIVED LIPIDS group now includes fatty acid, long chain alcohol, long chain aldehyde, and long chain base and ceramide. The FAT-SOLUBLE VITAMIN group includes carotenoid, coenzyme Q, vitamin A, vitamin D, vitamin E, and vitamin K. The GLYCOLIPID group includes glycosphingolipid, glycoglycerolipid and others. The PHOSPHOLIPID group includes glycerophospholipid, PAF, and sphingophospholipid.

In 2004, JCBL officially established an executive committee (President: Yousuke Seyama, Secretary: Etsuko Yasugi) for updating the database.

生理活性脂質データベースの維持・更新(1999 - 2005)




Renovating LIPIDBANK for Web (2006-2007)

LIPIDBANK for Web became the official database of JCBL, to which all rights were delegated from NCGM and JST. The name of database changed to "LipidBank".

The Hopanoid group was removed and the number of category is now 16. The database system and its contents were updated and reorganized by the JCBL committee members (President: Masahiro Nishijima).

生理活性脂質データベースの刷新(2006 - 2007)



Linking with the Wiki version (2017-2022)

With financial support from the AMED program "Studies on Specific Activities and Functions of Lipid Molecules to Develop Innovative Medical Technologies" (PS: YOKOYAMA Shinji), wiki-based database was updated for glycosphingolipid and others.

Categories in the original LipidBank were translated into static HTML pages due to security issues.

LipidBank Wiki との連携 (2017-2022)

AMED革新的先端研究開発支援事業 「画期的医薬品等の創出をめざす脂質の生理活性と機能の解明」(総括:横山信治)より支援を受け、スフィンゴ糖脂質を中心に情報を整理、更新。


Contact Address

If you have questions or suggestions, please contact with:

Masanori Arita
National Institute of Genetics



Members of Executive Committee of Lipid Database (脂質データベース構築委員会メンバー)

2019年 2月 27日

委員長: 和泉 孝志 (Takashi Izumi)
青木 淳賢 (Junken Aoki) 有田 誠 (Makoto Arita) 有田 正規 (Masanori Arita)
糸乗 前 (Saki Itonori) 今井 博之 (Hiroyuki Imai) 笠間 健嗣 (Takeshi Kasama)
北 芳博 (Yoshihiro Kita) 小林 哲幸 (Tetsuyuki Kobayashi) 酒井 祥太 (Shota Sakai)
清水 孝雄 (Takao Shimizu) 中村 和生 (Kazuo Nakamura) 八杉 悦子 (Etsuko Yasugi)
横山 和明 (Kazuaki Yokoyama)
大島 美恵子(Mieko Oshima) 脊山 洋右(Yousuke Seyama) 西島 正弘(Masahiro Nishijima)

Funding (資金)

1989 - 1997
LIPID INFORMATION SERVICE was funded by a Grant-in-Aid for Scientific Research (Grant-in-Aid for Publication of Scientific Research Results) from the Japan Society for the Promotion of Science. LIPID INFORMATION SERVICEが日本学術振興会(JSPS)科学研究費に採択される。
1996 - 2002
LIPIDBANK for Web was funded by the Database Development Program of the Japan Science and Technology Agency (JST). LIPIDBANK for Webが科学技術振興機構(JST)に採択される。
2003 - 2006, 2009 - 2016
LIPIDBANK for Web was funded by a Grant-in-Aid for Scientific Research (Grant-in-Aid for Publication of Scientific Research Results) from the Japan Society for the Promotion of Science. 日本学術振興会(JSPS)科学研究費の研究成果公開促進費データベース事業による更新。
2017 - 2022
LIPIDBANK was funded by AMED-CREST in "Studies on Specific Activities and Functions of Lipid Molecules to Develop Innovative Medical Technologies". AMED革新的先端研究開発支援事業 「画期的医薬品等の創出をめざす脂質の生理活性と機能の解明」(総括:横山信治)による更新。


第1回 1997年1月8日 国立国際医療センター研究所 生理活性脂質データベース構築委員会
第10回 2004年3月25日 学士会分館 脂質情報データベース推進委員会
第20回 2007年3月8日 東京大学 医学部 脂質データベース構築委員会
第30回 2015年5月29日 東京大学 薬学部 脂質データベース構築委員会
第34回 2019年7月5日 北海道大学 脂質データベース構築委員会
2020-2022 年はCOVID-19のために中止。JCBLホームページを2010-2021年まで本サーバで維持管理してきたが、2021年より新サイト ( に移行。