Category:LBS: Difference between revisions

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複合脂質は、一般的にグリセロールを含む脂質（グリセロ脂質）とスフィンゴイドを含む脂質（スフィンゴ脂質）に大別されます。
複合脂質は、一般的にグリセロールを含む脂質（グリセロ脂質）とスフィンゴイドを含む脂質（スフィンゴ脂質）に大別されます。
<br>スフィンゴ脂質カテゴリー（LBS）には、スフィンゴ糖脂質 (Sphingoglycolipid)、スフィンゴリン脂質 (Sphingophospholipid) 、セラミド（Ceramide）などの分子が含まれています。セラミドはスフィンゴシン（Sphingosine）と脂肪酸がアミド結合した化合物です。
<br>スフィンゴ脂質カテゴリー（LBS）には、スフィンゴ糖脂質 (Sphingoglycolipid)、スフィンゴリン脂質 (Sphingophospholipid) 、セラミド（Ceramide）などの分子が含まれています。セラミドはスフィンゴシン（Sphingosine）と脂肪酸がアミド結合した化合物です。
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==Design of Glycerolipid identifiers <small>ID番号の設計</small>==
==Design of Sphingolipid identifiers <small>ID番号の設計</small>==
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26-DIGIT(6+9+9+2)
25-DIGIT(5+9+9+2)
<table border=1>
<table border=1>
<tr>
<tr>
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<td style="background-color:gray;" width=15px align="center"><big>'':''</big>
<td style="background-color:tomato; color:white" width=15px align="center"><big>''x1''</big>
<td style="background-color:tomato; color:white" width=15px align="center"><big>''x1''</big>
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{{Twocolumn|
{{Twocolumn|
* ''p'' ... number of attached sugars(Glyceroglycolipid) or code of pola head group(Glycerophospholipid)
* ''a'' ... number of attached sugars(Sphingoglycolipid) or code of phosphorylation: PP (Sphingophospholipid)
* ''b1'' ... type of binding to Fatty acyl-1(LBF1)
* ''b2'' ... type of binding to Fatty acyl-2(LBF2)


* ''x1'' ... carbon chain length(LBF1)
* ''x1'' ... carbon chain length(Sphingoid base)
* ''y1'' ... degree of unsaturation(LBF1)
* ''y1'' ... degree of unsaturation(Sphingoid base)
* ''z1'' ... position of n－''z'' (n minus z; also ω－z or omega-z) nomenclature(LBF1)
* ''z1'' ... position of n－''z'' (n minus z; also ω－z or omega-z) nomenclature(Sphingoid base)
* ''w1'' ... structure type(LBF1)
* ''w1'' ... structure type(Sphingoid base)
* ''c1'' ... serial number(LBF1)
* ''c1'' ... serial number(Sphingoid base)


* ''x2'' ... carbon chain length(LBF2)
* ''x2'' ... carbon chain length(fatty acid)
* ''y2'' ... degree of unsaturation(LBF2)
* ''y2'' ... degree of unsaturation(fatty acid)
* ''z2'' ... position of n－''z'' (n minus z; also ω－z or omega-z) nomenclature(LBF2)
* ''z2'' ... position of n－''z'' (n minus z; also ω－z or omega-z) nomenclature(fatty acid)
* ''w2'' ... structure type(LBF2)
* ''w2'' ... structure type(fatty acid)
* ''c2'' ... serial number(LBF2)
* ''c2'' ... serial number(fatty acid)
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* ''p'' ... 修飾する糖の個数 (Glyceroglycolipid)もしくはポーラヘッドグループの記号(Glycerophospholipid)
* ''a'' ... 修飾する糖の個数 (Sphingoglycolipid)もしくはリン酸化修飾を示す記号PP (Sphingophospholipid)
* ''b1'' ... 脂肪酸1(LBF1)の結合のタイプ
* ''b2'' ... 脂肪酸2(LBF2)の結合のタイプ


* ''x1'' ... 炭素鎖長(LBF1)
* ''x1'' ... 炭素鎖長(スフィンゴイド塩基)
* ''y1'' ... 不飽和度(LBF1)
* ''y1'' ... 不飽和度(スフィンゴイド塩基)
* ''z1'' ... n－''z'' (またはω－zやomega-z)　における数(LBF1)
* ''z1'' ... n－''z'' (またはω－zやomega-z)　における数(スフィンゴイド塩基)
* ''w1'' ... 骨格のタイプ(LBF1)
* ''w1'' ... 骨格のタイプ(スフィンゴイド塩基)
* ''c1'' ... 通し番号(LBF1)
* ''c1'' ... 通し番号(スフィンゴイド塩基)


* ''x2'' ... 炭素鎖長(LBF2)
* ''x2'' ... 炭素鎖長(脂肪酸)
* ''y2'' ... 不飽和度(LBF2)
* ''y2'' ... 不飽和度(脂肪酸)
* ''z2'' ... n－''z'' (またはω－zやomega-z)　における数(LBF2)
* ''z2'' ... n－''z'' (またはω－zやomega-z)　における数(脂肪酸)
* ''w2'' ... 骨格のタイプ(LBF2)
* ''w2'' ... 骨格のタイプ(脂肪酸)
* ''c2'' ... 通し番号(LBF2)
* ''c2'' ... 通し番号(脂肪酸)
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}}




==Classification by number of sugars or pola head group<small>糖の個数もしくはポーラヘッドグループによる分類</small>==
==Classification by number of sugars or phosphorylation<small>糖の個数もしくはリン酸化修飾による分類</small>==
{{Twocolumn|
{{Twocolumn|
There are 2 digit of number of attached sugars (Glyceroglycolipid) or code of pola head group (Glycerophospholipid) .
There are 2 digit of number of attached sugars (Sphingoglycolipid) or code of phosphorylation: PP (Sphingophospholipid).
Phosphatidylinositol is treated as Glycerophospholipid.
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Glyceroglycolipidに関しては結合している糖の総数を2桁の数字で、Glycerophospholipidに関してはポーラヘッドグループを2桁の記号で記載してあります。
Sphingoglycolipidに関しては結合している糖の総数を2桁の数字で、Sphingophospholipidに関してはリン酸化修飾を示す記号PPを記載してあります。
なお、Phosphatidylinositolについては、糖脂質ではありますがGlycerophospholipidとしての扱いとなるため、PIの記号が入ってます。
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{| class="wikitable" border="1" cellpadding="2" cellspacing="1" margin: 1em 1em 1em 1em"
{| class="wikitable" border="1" cellpadding="2" cellspacing="1" margin: 1em 1em 1em 1em"
|+ Table 1. Classification by number of sugars or pola head group
|+ Table 1. Classification by number of sugars or phosphorylation
|- valign="top"
|- valign="top"
|align="center"| {{MapLink|ListMol|LBG01|01: 糖の数1<br>}}<br>[[Image:LBG01.png|100px]]
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|align="center"|
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==Classification by type of binding to Fatty acyl-1 <small>脂肪酸1の結合のタイプによる分類</small>==
{{Twocolumn|
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{| class="wikitable" border="1" cellpadding="2" cellspacing="1" margin: 1em 1em 1em 1em"
|+ Table 2. Classification by type of binding to Fatty acyl-1
|- valign="top"
|align="center"| {{MapLink|ListMol|LBG..C|C: Acyl <br>group<br>}}<br><br>[[Image:LBG--C.png|110px]]
|align="center"| {{MapLink|ListMol|LBG..K|K: Alkyl <br>group<br>}}<br><br>[[Image:LBG--K.png|110px]]
|align="center"| {{MapLink|ListMol|LBG..N|N: Alkenyl <br>group<br>}}<br><br>[[Image:LBG--N.png|110px]]
|align="center"| {{MapLink|ListMol|LBG..G|G: Glycosyl <br>group<br>}}<br><br>[[Image:LBG--G.png|100px]]
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==Classification by type of binding to Fatty acyl-2 <small>脂肪酸2の結合のタイプによる分類</small>==
{{Twocolumn|
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{| class="wikitable" border="1" cellpadding="2" cellspacing="1" margin: 1em 1em 1em 1em"
|+ Table 3. Classification by type of binding to Fatty acyl-2
|- valign="top"
|align="center"| {{MapLink|ListMol|LBG...C|C: Acyl <br>group<br>}}<br>[[Image:LBG---C.png|110px]]
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Revision as of 03:11, 12 December 2008

Sphingolipid (スフィンゴ脂質)


Upper classes: LB

Class Overview

Complex lipid is the main structural component of biological membrane, is a form of lipid bilayer, and broadly classified into Glycerolipid and Sphingolipid. The Sphingolipid category （LBS） includes Sphingoglycolipid and Sphingophospholipid, and Ceramide. Ceramides are amides of fatty acids with Sphingosine.

リン酸や糖などを含む脂質は複合脂質と呼ばれ、細胞膜の脂質二重層の主要な構成要素です。 複合脂質は、一般的にグリセロールを含む脂質（グリセロ脂質）とスフィンゴイドを含む脂質（スフィンゴ脂質）に大別されます。
スフィンゴ脂質カテゴリー（LBS）には、スフィンゴ糖脂質 (Sphingoglycolipid)、スフィンゴリン脂質 (Sphingophospholipid) 、セラミド（Ceramide）などの分子が含まれています。セラミドはスフィンゴシン（Sphingosine）と脂肪酸がアミド結合した化合物です。

Common Abbreviations よく使う略称

Cer Ceramides セラミド
Sph Sphingosine スフィンゴシン


Design of Sphingolipid identifiers ID番号の設計

25-DIGIT(5+9+9+2)

L B G a a : x1 x1 y1 z1 z1 w1 w1 c1 c1 : x2 x2 y2 z2 z2 w2 w2 c2 c2

  • a ... number of attached sugars(Sphingoglycolipid) or code of phosphorylation: PP (Sphingophospholipid)
  • x1 ... carbon chain length(Sphingoid base)
  • y1 ... degree of unsaturation(Sphingoid base)
  • z1 ... position of n－z (n minus z; also ω－z or omega-z) nomenclature(Sphingoid base)
  • w1 ... structure type(Sphingoid base)
  • c1 ... serial number(Sphingoid base)
  • x2 ... carbon chain length(fatty acid)
  • y2 ... degree of unsaturation(fatty acid)
  • z2 ... position of n－z (n minus z; also ω－z or omega-z) nomenclature(fatty acid)
  • w2 ... structure type(fatty acid)
  • c2 ... serial number(fatty acid)

  • a ... 修飾する糖の個数 (Sphingoglycolipid)もしくはリン酸化修飾を示す記号PP (Sphingophospholipid)
  • x1 ... 炭素鎖長(スフィンゴイド塩基)
  • y1 ... 不飽和度(スフィンゴイド塩基)
  • z1 ... n－z (またはω－zやomega-z)　における数(スフィンゴイド塩基)
  • w1 ... 骨格のタイプ(スフィンゴイド塩基)
  • c1 ... 通し番号(スフィンゴイド塩基)
  • x2 ... 炭素鎖長(脂肪酸)
  • y2 ... 不飽和度(脂肪酸)
  • z2 ... n－z (またはω－zやomega-z)　における数(脂肪酸)
  • w2 ... 骨格のタイプ(脂肪酸)
  • c2 ... 通し番号(脂肪酸)


Classification by number of sugars or phosphorylation糖の個数もしくはリン酸化修飾による分類

There are 2 digit of number of attached sugars (Sphingoglycolipid) or code of phosphorylation: PP (Sphingophospholipid).

Sphingoglycolipidに関しては結合している糖の総数を2桁の数字で、Sphingophospholipidに関してはリン酸化修飾を示す記号PPを記載してあります。

Table 1. Classification by number of sugars or phosphorylation
 
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(58 pages)
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Subcategories

This category has the following 4 subcategories, out of 4 total.

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