Lipidbank wiki:Status2v1.39
動作していないがリストにないページや、対応済みとなっているが表示や動作がおかしいページがあれば、「mediawiki ver1.39への対応状況」やテーブルの「コメント」欄に追記してください。
wikiの書き方に慣れていなければ、この下の「コメント（自由記述）」に追記してください。
コメント(自由記述)
mediawiki ver1.39への対応状況
- 2023/01/31 要チェックリストを追加(Suwa)、Category:LBGAを再修正(Suwa)、全Volatileの修正が完了(Suwa)
- 2023/01/30 全Cateogryの修正が完了(Suwa)
- 2023/01/26 Cateogry:LBGAを修正(Suwa)
- 2023/01/25 このページを作成(Suwa)
対応状況
- 現在、35/48(うち1件保留)が完了。
- 現在、192件+αが要チェック。
- テーブルヘッダの「対応」セルをクリックして並べ替えることで、対応済み項目だけまとめて表示可能。
| 番号 | ページ | 対応 | 対応内容 | コメント |
|---|---|---|---|---|
| 1 | Category:LBS/Search | 2023/01/25対応 | ・HTMLForm extensionをv1.39に対応 ・javascriptが動くよう修正 ・Volatile機能をHTMLFormだけで実現 ・luaがmediawikiにバンドルされたので、そのluaで動くよう修正 ・Persistは動かないので、AllChainsへのページリンクだけ表示 ・Template:LBS/FormatSugarのluaをModule:LBSに移して使用(Template:LBS/FormatSugarは不要) ・defTempが使えないため、Template:GetIconを追加・ ・Search from Structureで「<sub>」がそのまま表示されている。 (追加)Module:LBS, Template:GetIcon (廃止)Template:LBS/FormatSugar |
(Category:LBS/Searchのコメントはここに記述) |
| 2 | Category:LBA | 不要 | Category:LBGAへのリダイレクトのため | (Category:LBAのコメントはここに記述) |
| 3 | Category:LBS | 2023/01/30対応 | ・luaをModule:LBSにFomatSugar()として移動 ・volatileの修正 ・volatileの機能修正により、引数をencodeが不要に |
(Category:LBSのコメントはここに記述) |
| 4 | Category:LBGAD | 2023/01/30対応 | ・Template:ListMolを修正 ・Template:FormatNameのluaをModule:Commonに移動 (追加)Module:Common |
(Category:LBGADのコメントはここに記述) |
| 5 | Category:LBGAC | 2023/01/30対応 | ・luaをModule:LBGAにGroupTable()として移動 | (Category:LBGACのコメントはここに記述) |
| 6 | Category:LBGA | 2023/01/26対応 2023/01/31追加修正 |
・luaプログラムをModule:LBGAに切り分け ・ ・volatileの表記を修正 (追加)Module:LBGA |
(Category:LBGAのコメントはここに記述) |
| 7 | Category:LBGAA | 2023/01/30対応 | ・volatileの表記を修正 | (Category:LBGAAのコメントはここに記述) |
| 8 | Category:LBG | 2023/01/30対応 | ・volatileの表記を修正 ・Template:MapLinkを修正 |
(Category:LBGのコメントはここに記述) |
| 9 | Category:LBF | 2023/01/30対応 | ・volatileの表記を修正 | (Category:LBFのコメントはここに記述) |
| 10 | Volatile:AuthorSummary | 2023/01/30対応 (グラフのみ保留) |
・luaをModule:AuthorSummaryへ移動 ・グラフ表示はどう対応するか検討 (追加)Module:AuthorSummary |
(Volatile:AuthorSummaryのコメントはここに記述) |
| 11 | Volatile:ClassMatrix | 2023/01/30対応 | ・luaをModule:ClassMatrixへ移動 ・Template:ClassMatrix/CreateRowのvolatileの表記を修正 (追加)Module:ClassMatrix |
(11のコメントはここに記述) |
| 12 | Volatile:JAS/Genes | 2023/01/31対応 | ・volatileの表記を修正 ・luaをModule:JASに移動 (追加)Module:JAS |
(12のコメントはここに記述) |
| 13 | Volatile:ListField | 2023/01/30対応 動作未確認 |
・luaをModule/ListFieldに移動 ・volatileの表記を修正 (ただし、どこからも呼び出されてないので動作検証できず) (追加)Module:ListField |
(13のコメントはここに記述) |
| 14 | Volatile:ListMol/LBS | 2023/01/30対応 | ・{{{1}}}を{{#get:1}}に変更 ・ |
(14のコメントはここに記述) |
| 15 | Volatile:ListMol/LBStitle | 2023/01/30対応 | ・volatileの表記を修正 | (15のコメントはここに記述) |
| 16 | Volatile:ListMolByField | 2023/01/30対応 動作未確認 |
・volatileの表記を修正 (ただし、どこからも呼び出されてないので動作検証できず) |
(16のコメントはここに記述) |
| 17 | Volatile:ListMolByReference | 2023/01/30対応 | ・luaをModule:CommonにListMolByReference()として移動 | (17のコメントはここに記述) |
| 18 | Volatile:ListPage | 2023/01/30対応 | ・volatileの表記を修正 | (18のコメントはここに記述) |
| 19 | Volatile:ListRef | 2023/01/30対応 | ・volatileの表記を修正 | (19のコメントはここに記述) |
| 20 | Volatile:ListRefOfID | 2023/01/31対応 | ・luaをModule:ListRefOfIDに移動 (追加)Module:ListRefOfID |
(20のコメントはここに記述) |
| 21 | Volatile:ListStructures | 不要 | (21のコメントはここに記述) | |
| 22 | Volatile:ShowField | 2023/01/30対応 | ・他の修正に連動して完了 | (22のコメントはここに記述) |
| 23 | Volatile:StructureSearch | 2023/01/30対応 動作未確認 |
・volatileの表記を修正 | (23のコメントはここに記述) |
| 24 | Volatile:VolatileTest | 不要 | (24のコメントはここに記述) | |
| 25 | MediaWiki:AdvancedLBSSearch.js | (25のコメントはここに記述) | ||
| 26 | MediaWiki:CalculateMass.js | (26のコメントはここに記述) | ||
| 27 | MediaWiki:Common.css | 2023/01/25対応 | ・volatileリンクの見た目のスタイルを追加 | (27のコメントはここに記述) |
| 28 | MediaWiki:Common.js | 2023/01/25対応 | ・現在の構成で動作するよう修正 | (28のコメントはここに記述) |
| 29 | MediaWiki:GlycosphingolipidMassCalculator.js | 2023/01/25対応 | ・クラス化して、現在の構成で動作するよう修正 | (29のコメントはここに記述) |
| 30 | MediaWiki:GlyphEditor.js | (30のコメントはここに記述) | ||
| 31 | MediaWiki:GoogleAPI.js | (31のコメントはここに記述) | ||
| 32 | MediaWiki:JBrowse.js | (32のコメントはここに記述) | ||
| 33 | MediaWiki:LBSSearch.js | 2023/01/25対応 | ・クラス化して、現在の構成で動くよう修正 | (33のコメントはここに記述) |
| 34 | MediaWiki:Lipoquality.js | (34のコメントはここに記述) | ||
| 35 | MediaWiki:LipoqualityChart.js | (35のコメントはここに記述) | ||
| 36 | MediaWiki:LipoqualityCommon.js | (36のコメントはここに記述) | ||
| 37 | MediaWiki:LipoqualityGet.js | (37のコメントはここに記述) | ||
| 38 | MediaWiki:LipoqualitySearch.js | (38のコメントはここに記述) | ||
| 39 | MediaWiki:PathwayEditor.js | (39のコメントはここに記述) | ||
| 40 | MediaWiki:PathwayEditorHandler.js | (40のコメントはここに記述) | ||
| 41 | Template:MapLink | 2023/01/30対応 | ・volatileの表記を修正 | (41のコメントはここに記述) |
| 42 | Template:LBGA/GroupTable | 2023/01/30対応 | ・luaをModule:LBGAへ移動 | (42のコメントはここに記述) |
| 43 | Template:Glycolipid/distribution | 2023/01/30対応 | ・defTempが使えないため、Template:GetIconを作成 (追加)Template:GetIcon |
(43のコメントはここに記述) |
| 44 | Template:FormatName | 2023/01/30対応 | ・luaをModule:Commonに移動 | (44のコメントはここに記述) |
| 45 | Template:ClassMatrix/CreateRow | 2023/01/30対応 | ・volatileの表記を修正 | (45のコメントはここに記述) |
| 46 | Template:JournalTitle/TableRow3 | (46のコメントはここに記述) | ||
| 47 | Template:JAS/MutationStat | 2023/01/31対応 | ・luaをModule:JASへ移動 | (47のコメントはここに記述) |
| 48 | Template:JAS/AllMutation | 2023/01/31対応 | ・luaをModule:JASへ移動 | (48のコメントはここに記述) |
| 49 | Index:LBGA | (Index:LBGAのコメントはここに記述) | ||
| 50 | JAS:Home | (JAS:Homeのコメントはここに記述) |
開発用メモ
- volatileは以下のように記述方法を変更
- リンク元での書き方
[[volatile:volatileページ|引数群|リンク表示名}}
↓
{{#volatile:volatileページ|リンク表示名|引数1|引数2|...|引数N}}
e.g. {{#volatile:ListMol/LBS|Blood group A|Structure=GalNAca1-3\(Fuca1-2\)Galb1-3GlcNAcb1-3}}
- リンク先での書き方
{{{1}}}
↓
{{#get:1}}
- luaについて
- luaがmediawikiにバンドルされたので、すぐに使える状態になっている。
- スクリプトはModule名前空間に記述する
- Module名前空間のコンテンツモデルを「Scribunto」に変更する必要がある。
- 基本構文は以下の通り(一番目の引数を返すだけの関数)
local getArgs = require('Module:Arguments').getArgs; -- 引数を受け取るための機能呼び出し
local defArgs = require('Module:Arguments').defaultArgs; -- 引数のnil確認からデフォルト引数の処理を行う
local lbs = {}; -- lbsとしているが、この名前は何でも良い。
function lbs.FormatSugar( frame ) -- 関数を定義
local args = defArgs(getArgs(frame), 1, ""); -- 引数を取得(defArgs(getArgs(frame), 必要な引数の個数, 引数1のデフォルト値, 引数2のデフォルト値, ..., 引数Nのデフォルト値)
return args[1] -- 出力したい文字列を返す
end
return lbs; -- 関数定義したモジュールを返す
- 呼び出し方は以下の通り
{{#invoke:Module名前空間のページ|関数名|引数1|引数2|...|引数3}}
e.g. {{#invoke:LBS|FormatSugar|GalNAca1-3(Fuca1-2)Galb1-3GlcNAcb1-3-R}}
要チェック
- Template:Archaea
- Template:AuthorSummary
- Template:AuthorSummary/RefLink
- Template:AuthorSummary/affiliation
- Template:Bilingual
- Template:CheckAuthorExistence
- Template:CheckCountryLine
- Template:CheckRefExistence
- Template:ClassMatrix
- Template:ClassMatrix/CreateHeader
- Template:ClassMatrix/CreateRows
- Template:ClassifiedTable
- Template:CountryTable
- Template:Cutirubrum2Salinarum
- Template:DOI
- Template:EditButton
- Template:EditButton/CheckList
- Template:Element
- Template:Element/Isotope
- Template:Extension
- Template:FL digit56
- Template:FL digit56/Item
- Template:FL digit56with78
- Template:FL digit78
- Template:Font/Huge
- Template:Font/Large
- Template:GetIcon
- Template:GetMetaboliteID
- Template:Glycolipid
- Template:Glycolipid/OldLBLink
- Template:GlyphEditor
- Template:Hierarchy
- Template:Hierarchy/Item
- Template:Huge
- Template:Image200
- Template:IncorrectReference
- Template:Index/author
- Template:Index/formula
- Template:Index/mass
- Template:Index/name
- Template:Index/persist
- Template:IndexTable
- Template:IndexTable/IDitem
- Template:InternalMolLink
- Template:InternalMolLink/LBS
- Template:InternalMolLink/LBStitle
- Template:InternalMolLink2
- Template:InternalRefLink
- Template:InternalRefLinkJAS
- Template:JAS/Error/NonJapanese
- Template:JAS/GeneList/LinkPage
- Template:JAS/GeneList/Row
- Template:JAS/MutationTable
- Template:JAS/MutationTable/Row2
- Template:JAS/MutationTable/Row3
- Template:JASReference
- Template:JCBL/Header
- Template:LB/Header
- Template:LBFA digit910Table/Row
- Template:LBF digit910Table
- Template:LBF digit910Table/Row
- Template:LBGAC/Table
- Template:LBGPC
- Template:LBS/6HCer
- Template:LBS/6HSph
- Template:LBS/AbbrevRow
- Template:LBS/AbbrevTable/Row
- Template:LBS/Cer
- Template:LBS/DHCer
- Template:LBS/DHSph
- Template:LBS/FormatSugar
- Template:LBS/PhytoCer
- Template:LBS/PhytoSph
- Template:LBS/Sph
- Template:LambdaTest
- Template:Large
- Template:LinkCategoryPage
- Template:Lipid/Footer
- Template:Lipid/Header
- Template:ListAllChains
- Template:ListItem
- Template:ListMainchain
- Template:ListMol
- Template:ListMol2
- Template:ListPage
- Template:ListPage/Link
- Template:ListRefOfID
- Template:List Country
- Template:List Country/CountAuthor
- Template:List Country/inst rank
- Template:List Country/rank
- Template:List Country/sub
- Template:List Country/sub2
- Template:List Description
- Template:List Description/Body
- Template:List Description/SetAnchor
- Template:List Image
- Template:List Image/Body
- Template:List Image/NameList
- Template:List Links
- Template:List Links/Body
- Template:List Usage
- Template:List Usage/Body
- Template:List item
- Template:Map/Ether phospholipid
- Template:Map/Glycerophospholipid
- Template:Map/Glycerophospholipid/Expression
- Template:Map/Glycerophospholipid/GetValues
- Template:Map/Instruction
- Template:Map/MetaboliteSink
- Template:Map/MetaboliteSource
- Template:Map/Phospholipid degradation
- Template:Map/Reaction/Down
- Template:Map/ReactionDown
- Template:Map/ReactionDown35
- Template:Map/ReactionDown35inout
- Template:Map/ReactionDownFromLeft
- Template:Map/ReactionDownFromRight
- Template:Map/ReactionLeft
- Template:Map/ReactionLeftDown
- Template:Map/ReactionLeftDown2
- Template:Map/ReactionLeftRight
- Template:Map/ReactionLongLeft
- Template:Map/ReactionLongRight
- Template:Map/ReactionRight
- Template:Map/ReactionRightDown
- Template:Map/ReactionUp
- Template:Map/ReactionUpDown
- Template:Map/Sphingolipid
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- Template:MassbankSpectrum
- Template:Matrix/Row5
- Template:Metabolite
- Template:Metabolite/Item
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- Template:Reference
- Template:Reference/AuthorLink
- Template:Reference/Link
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- Template:Twocolumn
- Template:WrittenBy
- Lipoquality名前空間
