Crenarchaeol, Calditocaldarchaeol, H-shaped etc.
Upper classes:
LB
LBG
LBGA
This category includes irregular caldarchaeols such as crenarchaeol, calditocaldarchaeol, and H-shaped caldarchaeol.
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このカテゴリーにはカルドアーキオールのうち、変則的な形を持つものが入っています。
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SubType
Calditocaldarchaeol
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Thermoacidophilic archaea in the order Sulfolobales have caldoarchaeols ether-linked with calditol as its major membrane lipid. The caldoarchaeol core may have multiple five-membered rings in its isoprenyl chains, whose number correlates with the growth temperature. The ring number can be detected by mass spectrometry[1]
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強酸性高温下で生育するSulfolobales目に属する菌はカルドアーキオールの片側にカルジトールがエーテル結合した骨格を主要な膜脂質としています。カルドアーキオール骨格は温度に応じて複数の5員環構造を作り、その数を質量分析計で同定する方法も知られています。
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Crenarchaeol
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Crenarchaeol is a glycerol dialkyl glycerol tetraether (GDGT) with a unique cyclohexane moiety. It is used as a biomarker for ammonia-oxidizing archaea (AOA) such as Nitrosopumilus maritimus and 'Candidatus Nitrosocaldus yellowstonii'. It is abundant in tropical ocean water and certain soils including marine sediments.
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クレンアーキオールは変わったシクロヘキサン骨格を持つGDGTで、Nitrosopumilus maritimus や 'Candidatus Nitrosocaldus yellowstonii' のようなアンモニア酸化アーキアに特徴的(バイオマーカー)と考えられています。
海水や地底に多く存在しています。
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Trialkyl caldarchaeol
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Trialkyl type is considered a precursor of caldarchaeol, before forming a C-C bond between the isopranyl chains of two archaeols. It is observed in only several species and its biosynthesis is still unclear.
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トリアルキル型はカルドアーキオールの前駆体、二分子のアーキオールの間で C-C 結合が完成する前の状態、と考えられています。しかし限られた菌でしか見つかっておらず、具体的な生合成経路はわかっていません。
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H-shaped caldarchaeol
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H-shaped type is found in hyperthermophils such as Methanothermus fervidus(85 C), Pyrococcus horikoshii (95 C), and Thermococcus waiotapuensis (85 C). The bridging is considered to strengthen membrane stability.
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H型はMethanothermus fervidus(85 C), Pyrococcus horikoshii (95 C), and Thermococcus waiotapuensis (85 C)などの超高熱菌に見つかっています。H型の架橋は膜構造の強度を増すためと考えられています。
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- ↑ Murae T et al.(2002) J Mass Spectrom 37(2):209 PMID 11857765
List
Showing below 11 results of search LBGAD.
- LBGADB0N01: calditocaldarchaeol dibiphytanylglycerol-calditoltetraether calditoglycero-caldarchaeol calditoglycerocaldarchaeol GDNT
- LBGADB0N02: H-shaped caldarchaeol
- LBGADB0N03: crenarchaeol
- LBGADB0N04: trialkylcaldarchaeol caldarchaeol (trialkyl-type)
- LBGADG0N01: trialkylcaldarchaetidylglycerol trialkylcaldarchaetidyl-glycerol caldarchaetidylglycerol (trialkyl-type) caldarchaetidyl-glycerol (trialkyl-type)
- LBGADI1N01: trialkylcaldarchaetidyl-myo-inositol
- LBGADI2G01: glucopyranosyl-β-calditocaldarchaetidyl-myo-inositol
- LBGADI2N01: myo-inositolphosphoric-trialkylcaldarchaetidyl-myo-inositol
- LBGADI2S01: HSO3-glucopyranosyl-β-calditocaldarchaetidyl-myo-inositol
- LBGADN1G01: glucopyranosyl-β-calditocaldarchaeol
- LBGADN1S01: HSO3-glucopyranosyl-β-calditocaldarchaeol
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