Category:LBS: Difference between revisions

Revision as of 15:15, 12 December 2008

Sphingolipid (スフィンゴ脂質)

Upper classes: LB

Class Overview

Sphingosine is synthesized from decarboxylating condensation of palmitoyl CoA with serine. It is a 18-carbon amino alcohol (16 carbons from palmitic acid and 2 from serine) with one unsaturated bond (2-amino-4-octadecene-1,3-diol). Sphingosine is further acylated to form ceramide, an important component of cell membranes.
The Sphingolipid category (LBS) includes glycosphingolipid, phosphosphingolipid, and ceramide.

スフィンゴシンはパルミトイルCoAがアミノ酸セリンと脱炭酸縮合して生成します。炭素を18個含むアミノアルコール(16個がパルミチン酸、2個がセリン由来)で不飽和結合を1つ含んでいます (2-amino-4-octadecene-1,3-diol)。スフィンゴシンがアシル化したものが、細胞膜の重要な成分であるセラミドです。
スフィンゴ脂質カテゴリー (LBS)には、スフィンゴ糖脂質 (glycosphingolipid)、スフィンゴリン脂質 (phosphosphingolipid) 、セラミド (ceramide)が含まれています。

Common Abbreviations よく使う略称

Cer	Ceramides	セラミド
Sph	Sphingosine	スフィンゴシン

Design of Sphingolipid identifiers ID番号の設計

25-DIGIT(5+9+9+2)

L

B

S

a

:

x1

y1

z1

w1

c1

:

x2

y2

z2

w2

c2

a ... the number of attached sugars　(glycosphingolipid) or the code of phosphorylation (PP: phosphosphingolipid)

x1 ... carbon chain length (sphingoid base)
y1 ... degree of unsaturation (sphingoid base)
z1 ... position of n－z (n minus z; also ω－z or omega-z) nomenclature (sphingoid base)
w1 ... structure type (sphingoid base)
c1 ... serial number (sphingoid base)

x2 ... carbon chain length (acyl chain)
y2 ... degree of unsaturation (acyl chain)
z2 ... position of n－z (n minus z; also ω－z or omega-z) nomenclature (acyl chain)
w2 ... structure type (acyl chain)
c2 ... serial number (acyl chain)

a ... 修飾する糖の個数 (glycosphingolipid) もしくはリン酸化修飾を示す記号 (PP: phosphosphingolipid)

x1 ... 炭素鎖長 (スフィンゴイド塩基)
y1 ... 不飽和度 (スフィンゴイド塩基)
z1 ... n－z (またはω－zやomega-z)　における数 (スフィンゴイド塩基)
w1 ... 骨格のタイプ (スフィンゴイド塩基)
c1 ... 通し番号 (スフィンゴイド塩基)

x2 ... 炭素鎖長 (アシル基)
y2 ... 不飽和度 (アシル基)
z2 ... n－z (またはω－zやomega-z)　における数(脂肪酸)
w2 ... 骨格のタイプ (アシル基)
c2 ... 通し番号 (アシル基)

Classification by the Number of Sugars 糖の個数もしくはリン酸化修飾による分類

For glycosphingolipid, 2 digits following LBS stand for the number of attached sugars. For phosphosphingolipid, the code of phosphorylation, PP.

スフィンゴ糖脂質は結合している糖の総数をLBSに続く2桁の数字で、スフィンゴリン脂質は数字の代わりにリン酸化修飾を示す記号PPで分類しています。

Table 1. Classification by number of sugars or phosphorylation
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Subcategories

This category has the following 4 subcategories, out of 4 total.

L

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 {{Twocolumn|
-Sphingosine is synthesized from condensation of palmitoyl CoA with serine through decarboxylation.  It is a 18-carbon amino alcohol (16 carbons from palmitic acid and 2 from serine) with one unsaturated bond (2-amino-4-octadecene-1,3-diol).  Sphingosine is further acylated to form ceramide, an important component of cell membranes.
+Sphingosine is synthesized from decarboxylating condensation of palmitoyl CoA with serine.  It is a 18-carbon amino alcohol (16 carbons from palmitic acid and 2 from serine) with one unsaturated bond (2-amino-4-octadecene-1,3-diol).  Sphingosine is further acylated to form ceramide, an important component of cell membranes.
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 The Sphingolipid category (LBS) includes glycosphingolipid, phosphosphingolipid, and ceramide.
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-スフィンゴシンはパルミトイルCoAがアミノ酸セリンと脱カルボキシル縮合して生成します。炭素を18個含むアミノアルコール(16個がパルミチン酸、2個がセリン由来)で不飽和結合を1つ含んでいます (2-amino-4-octadecene-1,3-diol)。
+スフィンゴシンはパルミトイルCoAがアミノ酸セリンと脱炭酸縮合して生成します。炭素を18個含むアミノアルコール(16個がパルミチン酸、2個がセリン由来)で不飽和結合を1つ含んでいます (2-amino-4-octadecene-1,3-diol)。
-スフィンゴシンがアシル化すると、細胞膜の重要な成分であるセラミドになる。
+スフィンゴシンがアシル化したものが、細胞膜の重要な成分であるセラミドです。
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 スフィンゴ脂質カテゴリー (LBS)には、スフィンゴ糖脂質 (glycosphingolipid)、スフィンゴリン脂質 (phosphosphingolipid) 、セラミド (ceramide)が含まれています。
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-==Classification by the Number of Sugars or Phosphorylation<small>糖の個数もしくはリン酸化修飾による分類</small>==
+==Classification by the Number of Sugars<small> 糖の個数もしくはリン酸化修飾による分類</small>==
 {{Twocolumn|
-For glycosphingolipid, 2 digits stand for the number of attached sugars. For phosphosphingolipid, the code of phosphorylation, PP.
+For glycosphingolipid, 2 digits following LBS stand for the number of attached sugars. For phosphosphingolipid, the code of phosphorylation, PP.
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-スフィンゴ糖脂質は結合している糖の総数を2桁の数字、スフィンゴリン脂質はリン酸化修飾を示す記号PPで示します。
+スフィンゴ糖脂質は結合している糖の総数をLBSに続く2桁の数字で、スフィンゴリン脂質は数字の代わりにリン酸化修飾を示す記号PPで分類しています。
 }}