Category:LBGA
Archaeal Lipid
Class Overview
Archaeal lipid is composed of sn-glycerol 1-phosphate and ether-linked isoprenoids. This composition is different from lipid in eubacteria and eukaryotes, which comprises of sn-glycerol 3-phosphate and ester-linked fatty acids. Responsible biosynthetic enzymes are also non-homologous. Archaea also contains tetraether lipids in which two isoprenes are ether-linked with two glycerols at both ends (caldarchaeol). |
アーキア[1]の脂質は、 sn-グリセロール1リン酸にイソプレン骨格がエーテル結合しています。 これは、グリセロール3リン酸と脂肪酸を利用する真性細菌や真核生物と全く異なる構造で、生合成をおこなう酵素も相同ではありません。またテトラエーテル型と呼ばれるイソプレン骨格が末端で2分子のグリセロールとエーテル結合した環状脂質(カルドアーキオール)も広く存在します。 |
- ↑ 古細菌と呼ばれることが多いのですが、真性細菌と明確に区別するためにここではアーキアと記します。
Phylogeny
Archaea are separated into two phyla which show three different characters (Table 1). |
アーキアはcrenarchaeotaとeuryarchaetaに分かれますが、 特徴からみると三通りになります(表1)。 |
Phyrum (綱) | Order (目) | Family (科) | Character |
---|---|---|---|
crenarchaeota | desulfurococcales | desulfurococcaceae, pyrodictiaceae | Non-methanogenic (hyper) thermophils |
sulfolobales | sulfolobaceae | ||
thermoproteales | thermoproteaceae | ||
euryarchaeota | thermococcales | thermococcaceae | |
thermoplasmatales | thermoplasmataceae | ||
halobacteriales | halobacteriaceae | Halophils | |
methanobacteriales | methanobacteriaceae, methanothermaceae | Methanogens | |
methanococcales | methanococcaceae, methanocaldococcaceae | ||
methanomicrobiales | methanomicrobiaceae, methanospirillaceae | ||
methanopyrales | methanopyraceae | ||
methanosarcinales | methanosarcinaceae, methanosaetaceae |
Nomenclature
Much of archaeal lipid were named by a Japanese research group[1]. |
アーキア脂質の名称の多くは日本人によって名付けられました。 |
Archaeol (= 2,3-di-O-alkyl sn-glycerol diether) |
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Caldarchaeol |
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Isocaldarchaeol |
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Calditocaldarchaeol |
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- ↑ Nishihara M, Morii H, Koga Y (1987) "Structure determination of a quartet of novel tetraether lipids from Methanobacterium thermoautotrophicum", Journal of Biochemistry 101:1007-1015
- ↑ Bleriot Y, Untersteller E, Fritz B, Sinay P (2002) "Total Synthesis of calditol: Structural clarification of this typical component of archaea order Sulfolobales", Chemistry, 8(1):240-246
Design of Fat acyl Page Titles
Archaeal lipid is categorized in glycerolipid (LBG). Each ID contains information on backbone type, chemical modification of polar head, and attached sugars. |
古細菌の脂質はグリセロ脂質 (LBG) に含まれます。各分子のページIDは基本骨格、極性基のタイプ、糖のタイプがコード化されています。 |
10-DIGIT
L | B | G | A | x | y | z | w | c | c |
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Classification 分類
Backbone Structure 基本構造
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Order | Backbone | Polar-head | Sugar | ||||||
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ArOH | CArOH | others | None | Ino | others | Glc,Gal | Gro etc | others | |
}} |